Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	RGS20	Gene	0	0.66	2.48	1.77	2.11	2.15	1.39	70.50
2	297313	Transcript	0	0.00	0.10	0.41	0.25	0.37	0.00	0.75
3	344277	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	276500	Transcript	0	0.00	0.68	0.13	0.23	0.47	0.00	5.83
5	396766	Transcript	0	0.00	0.10	0.23	0.10	0.07	0.00	5.62
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00
12	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	0.00	1.36	0.25	0.47	0.00	0.00	5.10
14	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	6.56
15	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.22	0.18	0.39	0.88	0.61	0.12	16.98
16	I3_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.30	0.33	0.49	0.48	1.16	0.40	28.14
17	I3_SR4	SilentIntronRegion	0	0.14	0.30	0.31	1.04	0.48	0.19	16.00
18	I3_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.13	0.16	0.83	0.37	2.29	20.67
19	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	I4	Intron	0	3.67	5.88	3.10	13.20	0.40	11.24	14.67
21	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	3.67	5.89	3.10	13.21	0.40	11.26	14.69
22	ER5a	ExonRegion	0	0.26	2.16	0.66	3.09	0.23	2.50	29.87
23	E5_Da	NovelBoundary	0	1.80	10.61	0.89	8.89	0.00	5.01	5.37
24	E5a_E7b	KnownJunction	0	0.00	1.63	3.55	1.14	0.90	0.00	58.80
25	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.30	0.68	0.31	0.20	0.00	16.86
27	ER7b	ExonRegion	0	0.88	2.18	1.81	1.53	2.03	1.17	93.26
28	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.83	2.86	1.78	3.31	1.96	0.00	107.67
29	ER8a	ExonRegion	0	1.77	4.63	2.91	3.32	4.36	2.17	149.16
30	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.88	3.84	1.88	1.68	2.33	1.66	160.97
31	ER9a	ExonRegion	0	0.99	3.83	3.06	3.36	3.57	2.21	113.47
32	ER9b	ExonRegion	0	0.00	0.52	2.03	1.25	1.50	0.00	3.76
33	IG24_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	2.60	3.25	6.31	5.64	19.40	5.91	11.39