Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 LST1 Gene 0 0.56 1.47 0.42 2.93 0.31 0.78 0.00 2 376111 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 376102 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 4 357458 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 5 376100 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 6 396121 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 7 376110 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 8 376099 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 9 376096 Transcript 0 0.82 0.00 0.00 1.68 0.00 2.01 0.00 10 339530 Transcript 0 0.26 0.00 0.00 0.43 0.17 0.00 0.00 11 211921 Transcript 0 0.30 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 396107 Transcript 0 0.38 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 13 376090 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 14 396117 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 15 376089 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 16 396114 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 17 303757 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 396112 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 19 376086 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 20 376093 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 21 376092 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 396101 Transcript 0 0.00 0.00 0.41 0.31 0.00 0.00 0.00 23 IG15_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 3.66 1.85 5.50 17.10 1.77 0.00 0.22 24 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 E1_Ad KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.10 0.00 26 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 27 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 ER1d ExonRegion 0 0.00 1.19 0.00 2.75 0.00 0.18 0.00 29 E1a_E4h KnownJunction 0 0.00 1.34 0.00 1.16 0.00 1.21 0.00 30 ER2a ExonRegion 0 0.51 0.00 0.00 0.87 0.35 0.00 0.00 31 E2a_E4h KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER3a ExonRegion 0 0.60 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 E3a_E4h KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER4a ExonRegion 0 0.38 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.00 35 ER4b ExonRegion 0 0.77 0.00 0.00 1.25 0.00 0.00 0.00 36 ER4c ExonRegion 0 0.77 1.14 0.00 1.25 1.17 0.00 0.00 37 E4_Ad KnownBoundary 0 0.95 0.00 0.00 1.68 2.35 0.00 0.00 38 E4_Ae KnownBoundary 0 0.00 3.15 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER4d ExonRegion 0 0.77 2.43 0.00 2.49 1.62 0.96 0.00 40 ER4e ExonRegion 0 0.50 2.43 0.00 2.49 1.19 1.23 0.00 41 E4_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 42 E4_Ag KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 43 E4a_E4h KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 44 ER4f ExonRegion 0 0.00 2.43 0.00 1.25 0.00 1.23 0.00 45 ER4g ExonRegion 0 0.00 2.43 0.00 1.25 0.00 1.23 0.00 46 ER4h ExonRegion 0 0.57 2.87 0.00 1.68 0.00 1.51 0.00 47 E4_Ah KnownBoundary 0 1.54 3.86 0.00 2.95 0.00 3.32 0.00 48 ER4i ExonRegion 0 1.01 3.62 1.31 7.46 0.22 2.81 0.00 49 E4b_E6b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 50 E4b_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 E4b_E8b KnownJunction 0 0.67 2.84 0.00 4.47 1.15 0.00 0.00 52 E4b_E8d KnownJunction 0 0.82 0.00 0.00 1.68 0.00 2.01 0.00 53 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.14 0.00 0.00 0.00 0.00 54 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.68 0.62 0.00 0.00 0.00 55 ER6b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.71 2.01 0.45 0.00 0.00 56 E6a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 E6a_E8b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 E7a_E8d KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 ER7a ExonRegion 0 0.03 0.00 0.71 1.14 0.04 2.40 0.00 60 ER8a ExonRegion 0 0.07 0.17 0.06 2.38 0.07 0.06 0.00 61 ER8b ExonRegion 0 1.54 2.43 1.35 8.73 1.62 1.23 0.00 62 ER8c ExonRegion 0 1.55 3.06 2.02 8.79 1.12 1.28 0.00 63 E8_Ad KnownBoundary 0 1.87 2.94 2.50 7.12 0.00 1.07 0.00 64 ER8d ExonRegion 0 0.74 4.14 0.88 8.27 1.13 1.80 0.00 65 E8_Da KnownBoundary 0 1.03 1.23 0.83 5.04 0.00 2.39 0.00 66 ER8e ExonRegion 0 0.99 1.49 0.52 2.29 0.00 0.61 0.00 67 E8_Db KnownBoundary 0 0.80 0.00 0.00 1.68 0.00 0.00 0.00 68 ER8f ExonRegion 0 0.46 0.00 0.00 0.51 0.00 0.00 0.00 69 ER8g ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00