Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	SEC14L3	Gene	0	0.34	0.28	0.16	0.37	0.44	0.72	0.63
2	215812	Transcript	0	0.34	0.00	0.06	0.20	0.00	0.23	0.25
3	403066	Transcript	0	0.17	0.22	0.16	0.37	0.37	0.61	0.34
4	401751	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
5	402286	Transcript	0	0.11	0.00	0.00	0.00	0.08	0.37	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.37	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	2582.72	1553.85	1685.73	1314.24	755.42	1179.54	1553.74
13	ER2a	ExonRegion	0	0.74	0.00	0.65	0.00	10.93	0.00	0.00
14	E2_Da	NovelBoundary	0	8620.44	5042.88	6021.00	4062.74	3734.05	4179.42	3690.07
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.00	0.00
17	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00
21	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER6a	ExonRegion	0	0.34	0.00	0.00	0.00	0.24	1.10	0.00
24	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER7a	ExonRegion	0	0.31	0.49	0.00	0.00	0.22	1.87	0.27
26	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER11a	ExonRegion	0	0.37	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.96
34	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.67	0.73
36	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30
38	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E13a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER14a	ExonRegion	0	0.51	0.29	0.00	0.33	0.00	0.29	1.37
41	E14_Da	KnownBoundary	0	0.78	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00
42	ER14b	ExonRegion	0	1.02	0.00	0.18	0.59	0.00	0.68	0.75
43	ER15a	ExonRegion	0	0.34	0.43	0.31	0.74	0.74	1.23	0.68