Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 SAMSN1 Gene 0 0.21 0.44 1.29 0.98 1.18 2.49 0.90 2 389438 Transcript 0 0.27 0.18 1.28 0.66 0.89 0.96 0.00 3 285670 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 400566 Transcript 0 0.00 0.00 0.45 0.00 0.00 0.00 0.35 5 400564 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 389440 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 IG48_SR3 SilentIntergenicRegion 0 0.18 0.00 0.04 0.12 9.52 0.49 0.13 8 IG48_AR2 ActiveIntergenicRegion 0 0.00 0.00 0.32 0.00 7.57 0.00 0.00 9 ER1a ExonRegion 0 0.15 0.73 1.69 1.32 2.39 0.55 0.00 10 E1a_E3a KnownJunction 0 0.92 0.00 3.45 1.33 1.18 3.19 0.00 11 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER3a ExonRegion 0 0.44 0.78 1.56 0.84 1.45 4.02 0.00 14 E3a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.14 2.76 0.00 0.00 0.00 15 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER4b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.21 0.00 0.30 0.00 1.60 17 E4a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.89 0.00 0.00 0.00 0.70 18 E4a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER7a ExonRegion 0 0.48 0.00 1.35 2.63 0.38 0.37 1.93 22 E7a_E8a KnownJunction 0 1.03 0.00 0.00 4.90 2.93 1.42 3.07 23 ER8a ExonRegion 0 0.55 0.56 0.96 0.68 2.72 1.06 1.33 24 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 1.00 0.68 0.00 1.18 0.00 0.63 25 ER9a ExonRegion 0 0.43 0.87 1.07 0.50 2.42 3.47 0.07 26 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 2.84 2.31 1.49 1.11 5.33 0.00 27 ER10a ExonRegion 0 0.02 1.71 1.55 1.90 1.25 7.13 1.27 28 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.75 4.66 0.92 3.73 0.69 29 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.45 1.84 3.23 0.74 2.91 1.80 30 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.41 3.28 2.07 0.00 1.75 31 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.68 1.97 1.57 3.45 0.99 32 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.49 1.00 2.21 1.45 3.37 33 E12b_E13b KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER12b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 0.00 35 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.10 0.25 1.67 2.37 2.59 36 ER13b ExonRegion 0 0.00 0.00 1.86 1.10 1.24 3.47 1.81 37 E13_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.37 0.00 1.06 0.00 0.89 38 ER13c ExonRegion 0 0.26 0.27 1.16 0.28 0.74 1.79 0.86