Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	AC133561.4	Gene	0	0.03	0.21	1.89	3.86	0.08	2.36	0.04
2	359871	Transcript	0	0.04	0.12	0.24	0.62	0.10	0.48	0.02
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00
6	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.64	0.21	0.76	0.00	0.37	0.00
8	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER4a	ExonRegion	0	0.00	1.07	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E4_Da	NovelBoundary	0	57.36	402.24	165.00	411.73	274.10	170.29	463.58
11	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.56	7.36	4.30	8.58	2.46	3.53	4.11
13	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.70	0.72	0.56	0.00	0.00
16	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.83	0.77	0.41	0.90	0.38
18	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.76	0.63	0.00	0.09
20	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E10_Aa	NovelBoundary	0	22.25	207.44	70.83	222.47	318.06	90.93	258.52
24	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.62	0.00
25	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	1.40	0.00
27	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	0.00
28	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.31	0.11	0.50	0.00
29	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.90	1.23	0.00	2.95	0.90	0.00	0.00
30	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.19	1.00	0.18	1.84	0.00
31	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER14a	ExonRegion	0	0.08	0.30	4.22	8.53	0.03	4.96	0.07