Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	RP11-20F24.3	Gene	0	181.68	73.51	0.98	0.52	0.00	1.03	0.00
2	407974	Transcript	0	167.41	72.59	0.91	0.23	0.00	1.21	0.00
3	IG35	Intergenic	0	195.21	23.30	1.15	0.25	0.00	0.23	0.00
4	IG35_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	397.47	58.09	2.59	0.68	0.00	0.66	0.00
5	IG35_SR2	SilentIntergenicRegion	0	304.83	32.64	1.73	0.26	0.00	0.24	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	176.76	63.71	0.70	0.77	0.00	0.00	0.00
7	E1_Da	NovelBoundary	0	226.82	101.64	3.99	0.00	0.00	1.15	0.00
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	56.03	30.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1	Intron	0	42.24	4.47	0.18	0.03	0.00	0.00	0.06
10	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	131.82	37.82	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	63.71	6.61	0.29	0.54	0.00	0.00	0.00
12	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	72.75	5.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	83.43	5.28	0.00	0.92	0.00	0.00	0.00
14	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	74.38	5.39	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00
15	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	52.95	1.28	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	44.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	147.21	73.24	0.62	0.00	0.00	2.21	0.00
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	218.09	95.37	0.72	0.00	0.00	4.21	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	327.58	130.95	1.50	0.00	0.00	3.10	0.00
20	E3a_E4a	KnownJunction	0	318.91	148.49	3.29	0.00	0.00	1.58	0.00
21	ER4a	ExonRegion	0	239.49	126.84	1.22	0.88	0.00	2.22	0.00
22	E4a_E5a	KnownJunction	0	117.86	63.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E4a_E6a	NovelJunction	0	24.10	10.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	I4	Intron	0	55.98	1.86	0.39	0.03	0.00	0.05	0.00
25	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	62.07	2.09	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00
26	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	38.56	11.39	0.08	0.33	0.00	0.00	0.00
27	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	55.32	3.15	0.28	0.09	0.00	0.23	0.00
28	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	63.75	2.16	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00
29	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	36.95	0.48	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I4_SR3	SilentIntronRegion	0	56.22	1.02	0.44	0.00	0.00	0.02	0.00
31	I4	Intron	0	132.23	3.99	0.78	0.02	0.00	0.03	0.00
32	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	119.35	5.52	0.59	0.00	0.00	0.04	0.00
33	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	127.42	6.48	0.64	0.42	0.00	0.00	0.00
34	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	127.76	5.31	0.68	0.00	0.00	0.18	0.00
35	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	166.31	2.76	0.96	0.00	0.00	0.00	0.00
36	I4_SR3	SilentIntronRegion	0	141.90	2.54	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	88.90	10.47	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00
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39	I4_SR4	SilentIntronRegion	0	146.88	2.57	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00
40	I4_SR5	SilentIntronRegion	0	149.59	2.40	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00
41	I4_AR5	ActiveIntronRegion	0	72.02	1.50	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00
42	E5_Aa	NovelBoundary	0	127.79	2.34	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER5a	ExonRegion	0	119.39	37.15	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E5_Da	NovelBoundary	0	74.17	20.65	2.37	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
46	I5_AR4	ActiveIntronRegion	0	47.62	3.44	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00
47	ER6a	ExonRegion	0	119.56	28.61	0.81	0.86	0.00	0.00	0.00