##fileformat=VCFv4.3 ##fileDate=20230117 ##source=nanomonsv-0.5.0 ##reference=/projects/jfan_prj/jfan_prj/Nanopore_Testing/2021_nanopore_sv_testing/scratch/depth_testing/POG/COLO829/hg38_no_alt.fa ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##contig= ##FILTER= ##FILTER= ##FILTER= ##FILTER= ##FILTER= ##FILTER= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##INFO= ##ALT= ##ALT= ##ALT= ##FORMAT= ##FORMAT= #CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT TUMOR CONTROL chr1 97717508 r_14_0 G ]chr2:197004255]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_14_1 TR:VR 55:4 30:0 chr2 197004255 r_14_1 A A[chr1:97717508[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_14_0 TR:VR 55:4 30:0 chr10 124812660 r_130_0 T [chr22:21901777[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_130_1 TR:VR 163:13 28:0 chr22 21901777 r_130_1 G [chr10:124812660[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_130_0 TR:VR 163:13 28:0 chr10 83907612 r_73 T . PASS END=96792352;SVTYPE=DEL;SVLEN=-12884740;SVINSLEN=167;SVINSSEQ=GGCTGTCATTATTCTTATAGTCACAATATGTCTATTATAGTATACTATAATCTAAGCTGTTCTTGTAAGGGGAAGCTTTATTTTAAGGTTCATGATAGTTGGATCTGTGCTGAGGTGGTCTTGCCTCCTGGAAATCTCCAGTCTAGGCTGCATGACACTGCTAAGTG TR:VR 78:31 42:0 chr13 32444505 r_214 G . PASS END=58067153;SVTYPE=DEL;SVLEN=-25622648 TR:VR 65:17 27:0 chr2_KI270715v1_random 114456 i_755 C . PASS END=114456;SVTYPE=INS;SVINSLEN=341;SVINSSEQ=AGGTTTGAAACACTCTTTTTGTAGTATCTGGAAGTGGACATTTGGAGCGCTCTCAGGACTACGGTGAAAAAGGAAATATCTTCCAATAAAAGCTAGATAGAAGCAATGTCAGAAACTTTTTCATGATGTATCTACTCAGCTAACAGAGTTGAAACTTTCTATTGAGAGAGCAGTTTTGAAACACTCTTTTTGTGGAATCTGCAAGTGGATATTTGTCTAGCTTTGAGGATTTCGTTGGAAACGGGATTACAAATATAAAAAGCAGACAGCAGCATTCCCAGTAACTTCTTTGTGATGTTTGCATTCAAGTCACAGAGTTGAACATTCCCTTTCATAGAGTA TR:VR 37:3 11:0 chr1 101254655 r_18 T . PASS END=106341895;SVTYPE=DEL;SVLEN=-5087240 TR:VR 51:13 25:0 chr10 124832550 r_131_0 G GTGAAAC[chr13:24938048[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_131_1;SVINSLEN=6;SVINSSEQ=TGAAAC TR:VR 164:3 30:0 chr13 24938048 r_131_1 A ]chr10:124832550]GTTTCAA . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_131_0;SVINSLEN=6;SVINSSEQ=GTTTCA TR:VR 164:3 30:0 chr10 89091759 r_74_0 G [chr10:89093609[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_74_1 TR:VR 34:15 16:0 chr10 89093609 r_74_1 T [chr10:89091759[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_74_0 TR:VR 34:15 16:0 chr13 36986917 r_215_0 T [chr13:36987120[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_215_1 TR:VR 43:9 20:0 chr13 36987120 r_215_1 A [chr13:36986917[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_215_0 TR:VR 43:9 20:0 chr6 124558670 d_1073 G . PASS END=124558903;SVTYPE=DEL;SVLEN=-233 TR:VR 36:9 14:0 chr1 98037048 r_15_0 T [chr1:98054918[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_15_1 TR:VR 73:11 21:0 chr1 98054918 r_15_1 A [chr1:98037048[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_15_0 TR:VR 73:11 21:0 chr10 90671786 r_75_0 C [chr10:96961972[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_75_1 TR:VR 102:26 26:0 chr10 96961972 r_75_1 T [chr10:90671786[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_75_0 TR:VR 102:26 26:0 chr21 43337074 i_712 C . Too_low_VAF END=43337074;SVTYPE=INS;SVINSLEN=406;SVINSSEQ=ATCATCACCACCAGCATCACCACCACCACCACCACCACCACCATTACCACCTCTATCACCACCACTATCACCACCATCATCACTGCCACCACCACTGCACCAGTACCATCATCACCACCACCATCACCCCACCCTGATCGCTATTCCTATTATTTCCTGGCCACCATCAGTGCCAGCCTCCACGTGCTACCACCTTCATTTATTTTCACCATTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGTGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTAGAAGGCAGTGGCACGATCTCAGCTCACTGCAGCCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGTGATTCTCTTGTCTCGGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCATCACTATCATCACCACCACCATC TR:VR 199:4 95:1 chr5 234119 d_969 T . PASS END=234435;SVTYPE=DEL;SVLEN=-316 TR:VR 67:4 16:0 chr6 55627881 i_981 T . PASS END=55627881;SVTYPE=INS;SVINSLEN=316;SVINSSEQ=TGCCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGATATATATATATATATATATAGTATATATACTATATATATTATATATAGTATATATACTATATATAATATATATATATATAGTATATATACTATATATATAATATATAGTATAT TR:VR 36:5 17:0 chr1 111203557 r_19 G . PASS END=113192964;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1989407 TR:VR 54:15 38:0 chr1 98113098 r_16_0 C C]chr1:98117237] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_16_1 TR:VR 35:4 19:0 chr1 98117237 r_16_1 A A]chr1:98113098] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_16_0 TR:VR 35:4 19:0 chr10 125356998 r_132_0 A [chr12:57511798[TAACTTATTTATTCAGTAAT . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_132_1;SVINSLEN=19;SVINSSEQ=TAACTTATTTATTCAGTAA TR:VR 181:7 32:0 chr12 57511798 r_132_1 T [chr10:125356998[TTACTGAATAAATAAGTTAT . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_132_0;SVINSLEN=19;SVINSSEQ=TTACTGAATAAATAAGTTA TR:VR 181:7 32:0 chr10 92880794 r_76_0 C C]chr10:105819404] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_76_1 TR:VR 70:26 36:0 chr10 105819404 r_76_1 T T]chr10:92880794] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_76_0 TR:VR 70:26 36:0 chr11 80336277 r_167 A . PASS END=80353132;SVTYPE=DUP;SVLEN=16855 TR:VR 77:8 32:0 chr13 36987453 r_217_0 G GGTGTATTTGTTCTGGTCTGCAATCGCTCTT]chr13:85945311] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_217_1;SVINSLEN=30;SVINSSEQ=GTGTATTTGTTCTGGTCTGCAATCGCTCTT TR:VR 72:9 42:0 chr13 85945311 r_217_1 T TAAGAGCGATTGCAGACCAGAACAAATACAC]chr13:36987453] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_217_0;SVINSLEN=30;SVINSSEQ=AAGAGCGATTGCAGACCAGAACAAATACAC TR:VR 72:9 42:0 chr17 26774853 d_502 C . PASS END=26774947;SVTYPE=INS;SVINSLEN=128;SVINSSEQ=TGACCGCCGCGGGTTTTGGCCGCCGGTGCTTTTTGCGCCCGCTGCTGCAGGTTTTGCCAACGCGGCTTTTGCTTCCCGCCACCGCCCCTTTTTGTCCCCGCCGCCGCGGCTTTTTGCCGCCGCGGTTT TR:VR 42:5 13:0 chr9 28352460 d_1186 C . PASS END=28352529;SVTYPE=DEL;SVLEN=-69 TR:VR 24:21 17:0 chr10 102417902 r_82_0 T [chr10:103689199[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_82_1 TR:VR 75:12 26:0 chr10 103689199 r_82_1 C [chr10:102417902[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_82_0 TR:VR 75:12 26:0 chr10 125357206 r_133_0 A ]chr13:62158404]G . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_133_1 TR:VR 185:4 37:0 chr13 62158404 r_133_1 G G[chr10:125357206[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_133_0 TR:VR 185:4 37:0 chr10 42165849 i_84 T . PASS END=42165849;SVTYPE=INS;SVINSLEN=51;SVINSSEQ=GGAATGGAATGGAATGGAATAGAATGGAATGGAATGGAATTCAATGGAACT TR:VR 59:4 26:0 chr10 93004907 r_77 T . PASS END=130389133;SVTYPE=DUP;SVLEN=37384226 TR:VR 49:9 34:0 chr12 47338102 d_223 G . PASS END=47338155;SVTYPE=DEL;SVLEN=-53;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=A TR:VR 29:13 23:0 chr13 36989534 r_218_0 G [chr13:36991786[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_218_1 TR:VR 50:11 25:0 chr13 36991786 r_218_1 G [chr13:36989534[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_218_0 TR:VR 50:11 25:0 chr3 51857063 r_327_0 A ATCCGAACATCAGAAGGAACAAACTCCAGACACACCATCTTTAAGAACTGTAACATTCACTGCAAGGGTCCGTGGCTTCACTCTTGAAGTCAGTGAGACCAAGAACCCACCAATTCTGGACATA[chr4:103456373[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_327_1;SVINSLEN=123;SVINSSEQ=TCCGAACATCAGAAGGAACAAACTCCAGACACACCATCTTTAAGAACTGTAACATTCACTGCAAGGGTCCGTGGCTTCACTCTTGAAGTCAGTGAGACCAAGAACCCACCAATTCTGGACATA TR:VR 67:3 51:1 chr4 103456373 r_327_1 A ]chr3:51857063]TATGTCCAGAATTGGTGGGTTCTTGGTCTCACTGACTTCAAGAGTGAAGCCACGGACCCTTGCAGTGAATGTTACAGTTCTTAAAGATGGTGTGTCTGGAGTTTGTTCCTTCTGATGTTCGGAA . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_327_0;SVINSLEN=123;SVINSSEQ=TATGTCCAGAATTGGTGGGTTCTTGGTCTCACTGACTTCAAGAGTGAAGCCACGGACCCTTGCAGTGAATGTTACAGTTCTTAAAGATGGTGTGTCTGGAGTTTGTTCCTTCTGATGTTCGGA TR:VR 67:3 51:1 chr9 30674470 r_396_0 T T]chrX:95602138] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_396_1 TR:VR 67:7 28:0 chrX 95602138 r_396_1 A A]chr9:30674470] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_396_0 TR:VR 67:7 28:0 chrUn_KI270438v1 10919 d_1217 A . PASS END=11371;SVTYPE=DEL;SVLEN=-452;SVINSLEN=112;SVINSSEQ=GCGCTTTGTGGACTATGGGGGAAATGGATATATCTTCACATTAAAACTATGCAGAAGCATTCAGAGAAACTTCTTTGGAATGTGTGCATACAACTCACCAGAGTTGAACCTA TR:VR 21:3 27:0 chr10 102436227 r_83 T . PASS END=110770159;SVTYPE=DEL;SVLEN=-8333932;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=C TR:VR 82:21 30:0 chr10 125357429 r_134_0 G G]chr13:69997164] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_134_1 TR:VR 200:4 40:0 chr13 69997164 r_134_1 T T]chr10:125357429] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_134_0 TR:VR 200:4 40:0 chr10 42167869 r_36_0 A ATAGAACGGAATCATTGAATGGACTCGAATGGAATCATCATCAAATGGAATCGAGTGGAATCATCGAATGGACTCGA]chr14_KI270725v1_random:99254] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_36_1;SVINSLEN=76;SVINSSEQ=TAGAACGGAATCATTGAATGGACTCGAATGGAATCATCATCAAATGGAATCGAGTGGAATCATCGAATGGACTCGA TR:VR 86:4 48:1 chr14_KI270725v1_random 99254 r_36_1 C CTCGAGTCCATTCGATGATTCCACTCGATTCCATTTGATGATGATTCCATTCGAGTCCATTCAATGATTCCGTTCTA]chr10:42167869] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_36_0;SVINSLEN=76;SVINSSEQ=TCGAGTCCATTCGATGATTCCACTCGATTCCATTTGATGATGATTCCATTCGAGTCCATTCAATGATTCCGTTCTA TR:VR 86:4 48:1 chr13 36990309 r_219_0 A [chr13:85948074[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_219_1 TR:VR 91:13 44:0 chr13 85948074 r_219_1 G [chr13:36990309[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_219_0 TR:VR 91:13 44:0 chr15 20293174 r_253_0 T ]chr8:69929094]A . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_253_1 TR:VR 115:3 66:0 chr8 69929094 r_253_1 A A[chr15:20293174[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_253_0 TR:VR 115:3 66:0 chr2 94225074 r_278 C . PASS END=94272263;SVTYPE=DEL;SVLEN=-47189 TR:VR 139:12 77:0 chr21 43808466 d_801 A . PASS END=43808846;SVTYPE=DEL;SVLEN=-380 TR:VR 42:4 19:0 chr5 235628 i_862 G . Too_small_size END=235628;SVTYPE=INS;SVINSLEN=42;SVINSSEQ=GATCTTTATAATTCCTATTTCTAATGATCTTGTACATCGAAG TR:VR 66:4 18:0 chr10 103732626 r_84 C . PASS END=103826706;SVTYPE=DEL;SVLEN=-94080 TR:VR 99:38 45:0 chr10 125365701 r_135_0 C C[chr13:65252429[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_135_1 TR:VR 188:8 35:0 chr13 65252429 r_135_1 A ]chr10:125365701]A . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_135_0 TR:VR 188:8 35:0 chr10 94946899 r_78_0 C [chr16:51034696[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_78_1 TR:VR 55:10 41:0 chr16 51034696 r_78_1 A [chr10:94946899[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_78_0 TR:VR 55:10 41:0 chr12 4770487 d_215 C . Too_small_size END=4770524;SVTYPE=DEL;SVLEN=-37 TR:VR 27:9 17:0 chr13 36990303 d_242 T . PASS END=36990489;SVTYPE=DEL;SVLEN=-186 TR:VR 56:10 22:0 chr19 38546690 r_273 A . PASS END=38547350;SVTYPE=DUP;SVLEN=660;SVINSLEN=46;SVINSSEQ=GAGAAAGAAAATGATAAAACAAATGTGATGCAGGGTGCGTCACGTG TR:VR 47:3 15:0 chr2 94252729 r_279_0 A [chr2:94274217[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_279_1 TR:VR 95:9 70:0 chr2 94274217 r_279_1 A [chr2:94252729[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_279_0 TR:VR 95:9 70:0 chr20 36396588 i_656 A . PASS END=36396589;SVTYPE=INS;SVINSLEN=968;SVINSSEQ=CACATACACATACACCACACATACCACATACACACACACACACACACACATACCACATACACACACCACACATACCACATACACACACCACACACATACCACATACACACACACCACACACATACCACACACACACACACACCACACACATACCACATACACACACACACCACATACACACACAGGCGCAGGCGCACACACACACACCACAGACATACATACAAACACCACACACACACACACCACACATACAGGCACACGTGCACACACGCACTACACATACACACACACCAGACACACATGCATACACAGACACATACACACACACACAGGTGTGCGCACACACAGGCGCGCGCACACACACCACAGACACACACCACACACACATACACGCACATACACGCACACCACACACCACATGCACACACACACACCACATACACACACCACACACACACCACACACACATACACGCACACCACACACCACATGCACACACACACACCACACATACACACACACACCACATACACACCCCACACATGCACACACACACGCACACACACCACACACACCACATGCACACACACATACACCACACACGCACACACACATGCACACACACACATGAACACACAGGCGCGCACACACACACACACACACACTGGCATGTGCACACACACACCACAGACACATATCACATACACACACCACACACACATACACACACACACACACATACGCGGACACCACACACACCACATACACACACCCAGGCACGCACACACATACCACAGACACACACACACACCACACACACACCACACACATACACGCACACCACACACACACTGCATACACACACACATCACATACACATACACCACACACACACACACCTCATATACACATACCACACGCACATACACACACACACATACACACATACCACATACACACACCACATA TR:VR 43:5 26:0 chr3 71037598 r_328 T . PASS END=71092844;SVTYPE=DEL;SVLEN=-55246 TR:VR 61:17 27:0 chr5 239882 d_970 G . Too_small_size END=239928;SVTYPE=DEL;SVLEN=-46 TR:VR 64:4 17:0 chr8 54305666 i_1130 C . PASS END=54305666;SVTYPE=INS;SVINSLEN=888;SVINSSEQ=TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTGTTCTTAGATGGGATTTATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTGTATTTTGAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATACTCTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCACTGCACCCACTAATGTGTCATCTAGCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCGAGCCCCCACCACAGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTCCTGGGTCCATGTGATCTCATTGTTCAATTCCCACCATGAAGAAATGCTCATCATCACTGGCCATCAGAGAAATGCAAATCAAAACCACTATGAGATATCATCTCACACCAGTTAGAATGGCAATCATTAAAAAGTCAGGAAACAACAGGTGCTGGAGAGGATGCGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGTTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTGACCCAGCCATCCCATTACTGGGTATATACCCAAATGAGTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATATCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAACCATCATTCTCAGTAAAATATATCAAGAACAAGAAACCAAACCTGACATACATGTTT TR:VR 33:16 22:0 chr10 107613914 r_85_0 T TAATGCC]chr10:107616162] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_85_1;SVINSLEN=6;SVINSSEQ=AATGCC TR:VR 35:4 13:0 chr10 107616162 r_85_1 G GGGCATT]chr10:107613914] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_85_0;SVINSLEN=6;SVINSSEQ=GGCATT TR:VR 35:4 13:0 chr10 125420022 r_136_0 A ]chr13:62210351]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_136_1 TR:VR 171:10 40:0 chr13 62210351 r_136_1 A A[chr10:125420022[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_136_0 TR:VR 171:10 40:0 chr10 50397816 r_37_0 C C]chr10:104703204] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_37_1 TR:VR 81:15 39:0 chr10 104703204 r_37_1 G G]chr10:50397816] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_37_0 TR:VR 81:15 39:0 chr13 36990496 r_220 C . PASS END=94688004;SVTYPE=DEL;SVLEN=-57697508 TR:VR 95:13 48:0 chr2 94252931 r_280_0 C C]chr2:94253969] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_280_1 TR:VR 67:4 48:0 chr2 94253969 r_280_1 A A]chr2:94252931] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_280_0 TR:VR 67:4 48:0 chr3 101859435 r_331 T . PASS END=102156627;SVTYPE=DUP;SVLEN=297192 TR:VR 78:8 32:0 chr4 2886408 r_333 T . PASS END=3167714;SVTYPE=DUP;SVLEN=281306 TR:VR 55:7 31:0 chr8 1015139 d_1130 C . PASS END=1016204;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1065 TR:VR 25:3 12:0 chr10 110494224 r_86_0 C [chr13:96041027[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_86_1 TR:VR 49:12 40:0 chr13 96041027 r_86_1 G [chr10:110494224[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_86_0 TR:VR 49:12 40:0 chr10 125596567 r_137_0 A A]chr10:133364545] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_137_1 TR:VR 188:5 34:0 chr10 133364545 r_137_1 G G]chr10:125596567] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_137_0 TR:VR 188:5 34:0 chr10 50449534 r_38 T . PASS END=79523072;SVTYPE=DUP;SVLEN=29073538 TR:VR 101:59 45:0 chr10 96980023 r_79 A . PASS END=103696213;SVTYPE=DEL;SVLEN=-6716190 TR:VR 106:23 38:0 chr12 48568308 r_176_0 C C]chr13:95958002] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_176_1 TR:VR 100:4 46:0 chr13 95958002 r_176_1 A A]chr12:48568308] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_176_0 TR:VR 100:4 46:0 chr13 36994812 r_221 C . PASS END=37118548;SVTYPE=DUP;SVLEN=123736 TR:VR 123:9 40:0 chr17_GL000205v2_random 25237 d_524 A . Too_small_size END=25217;SVTYPE=INS;SVINSLEN=27;SVINSSEQ=CATTCGATCCTCTTAGCAGTGATCTGG TR:VR 98:9 57:1 chr2 90390251 r_277 G . Too_low_VAF END=94224981;SVTYPE=DEL;SVLEN=-3834730;SVINSLEN=161;SVINSSEQ=GAAAAATCATCGAATGGAATCGAATGGAATCATCATCAAAAGGAATTGAATGGAATCATCATAGAATGGAATCGAAAAGAATCATCATCAAATGGAATCGAACGGAATCATCATCGAATGGAATCCAAAAGAATCATCATCGAGTGGAACCGAATGGAATC TR:VR 476:7 338:0 chr3 101864600 d_899 T . PASS END=101866849;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2249;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=A TR:VR 48:7 14:0 chr10 110695738 r_87_0 A ]chr16:35189655]AAATGATCTCAGGTTCT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_87_1;SVINSLEN=16;SVINSSEQ=AAATGATCTCAGGTTC TR:VR 46:8 27:0 chr16 35189655 r_87_1 T TGAACCTGAGATCATTT[chr10:110695738[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_87_0;SVINSLEN=16;SVINSSEQ=GAACCTGAGATCATTT TR:VR 46:8 27:0 chr10 125755452 r_138_0 C C]chr8:97394527] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_138_1 TR:VR 190:18 29:0 chr8 97394527 r_138_1 A A]chr10:125755452] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_138_0 TR:VR 190:18 29:0 chr10 50830372 r_39 T . PASS END=52277689;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1447317 TR:VR 144:44 27:0 chr12 48577310 r_177_0 A A]chr12:49790642] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_177_1 TR:VR 95:7 48:0 chr12 49790642 r_177_1 T T]chr12:48577310] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_177_0 TR:VR 95:7 48:0 chr18 68210385 i_481 T . PASS END=68210385;SVTYPE=INS;SVINSLEN=863;SVINSSEQ=ATATATTTATATATATATTTATATATTTATATATATTTATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATATATTTATATATATTTATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATTTATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATGTATATATTTATGTATATATTTATATATATCTTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATGTATATATTTATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATGTATATATTTATATATATATTTATATATATCTTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTTTATATATATTTATATATATATATATATATATATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATGTGTATTTACATGTGTTTATATATATTTATATATATATTTGTATATATATGTATATATATATTTATATATATATTTATATATATTTATATATATATTTATATATATATTTATATATATATACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA TR:VR 23:3 23:0 chr2 163022487 r_283_0 G ]chr22:24713892]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_283_1 TR:VR 59:12 33:0 chr22 24713892 r_283_1 T T[chr2:163022487[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_283_0 TR:VR 59:12 33:0 chr10 111029154 r_88_0 C C]chr10:111037495] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_88_1 TR:VR 37:21 23:0 chr10 111037495 r_88_1 A A]chr10:111029154] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_88_0 TR:VR 37:21 23:0 chr10 126077240 r_139_0 A A]chr10:128556414] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_139_1 TR:VR 169:42 32:0 chr10 128556414 r_139_1 C C]chr10:126077240] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_139_0 TR:VR 169:42 32:0 chr10 51558517 r_40 C . PASS END=53332538;SVTYPE=DUP;SVLEN=1774021 TR:VR 120:43 39:0 chr8 143321422 i_1176 T . Too_low_VAF END=143321422;SVTYPE=INS;SVINSLEN=278;SVINSSEQ=CTTTCTGTCTGTCTCTTTCTCTCTGTCTGTCTGTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTTGTCTGCCTGCGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCCCCCTGCCTACTATGCGCGCGTGCCTGCTCCATCCCTGCGTGTCTGTCTGTCTGTCACGTCTCTCTGTCTGACGCCTCTCTGCTCTCTGTCTGTCTCTCTGTACGCACGCATCACTGCGTACGCATGCGCACCCTGCATGCCTGTCCCTGCCTGCATGCGTACACCTGCATGCATCCCGCGTAACGTGCG TR:VR 78:3 18:0 chr10 111032411 r_89_0 C [chr10:111055621[AGGTCATTCCTTTCCCTGATGTTT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_89_1;SVINSLEN=23;SVINSSEQ=AGGTCATTCCTTTCCCTGATGTT TR:VR 50:21 36:0 chr10 111055621 r_89_1 T [chr10:111032411[AACATCAGGGAAAGGAATGACCTT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_89_0;SVINSLEN=23;SVINSSEQ=AACATCAGGGAAAGGAATGACCT TR:VR 50:21 36:0 chr10 126122432 r_140_0 A [chr8:97252940[TTTCATAAAGAACATCTCAGAGAAGGAGACACAAGCCACCCCACT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_140_1;SVINSLEN=44;SVINSSEQ=TTTCATAAAGAACATCTCAGAGAAGGAGACACAAGCCACCCCAC TR:VR 142:13 43:0 chr8 97252940 r_140_1 T [chr10:126122432[GTGGGGTGGCTTGTGTCTCCTTCTCTGAGATGTTCTTTATGAAAT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_140_0;SVINSLEN=44;SVINSSEQ=GTGGGGTGGCTTGTGTCTCCTTCTCTGAGATGTTCTTTATGAAA TR:VR 142:13 43:0 chr10 51936788 r_41 A . PASS END=78380060;SVTYPE=DUP;SVLEN=26443272 TR:VR 207:43 40:0 chr10 97274790 r_80_0 A AGTG]chr10:99693922] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_80_1;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=GTG TR:VR 83:23 21:0 chr10 99693922 r_80_1 A ACAC]chr10:97274790] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_80_0;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=CAC TR:VR 83:23 21:0 chr20 12390258 r_310_0 C C[chr8:142373433[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_310_1 TR:VR 102:5 29:0 chr8 142373433 r_310_1 T ]chr20:12390258]T . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_310_0 TR:VR 102:5 29:0 chr6 139140047 r_357 T . PASS END=139150390;SVTYPE=DEL;SVLEN=-10343 TR:VR 50:13 21:0 chr1 239732304 d_122 G . PASS END=239732425;SVTYPE=DEL;SVLEN=-121;SVINSLEN=42;SVINSSEQ=ATAAGTATACCTAATATCTCACTTAGATAAGATACCTAATAT TR:VR 48:3 15:0 chr10 126172652 r_141_0 T [chr8:122343053[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_141_1 TR:VR 212:59 47:0 chr8 122343053 r_141_1 A [chr10:126172652[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_141_0 TR:VR 212:59 47:0 chr10 51941725 r_42_0 T T[chr6:80695810[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_42_1 TR:VR 158:9 40:0 chr6 80695810 r_42_1 A ]chr10:51941725]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_42_0 TR:VR 158:9 40:0 chr10 99676725 r_81 T . PASS END=110816492;SVTYPE=DUP;SVLEN=11139767;SVINSLEN=10;SVINSSEQ=TGCTCCCCTC TR:VR 74:14 20:0 chr20 12856475 r_311_0 C ]chr8:143639500]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_311_1 TR:VR 112:12 39:0 chr8 143639500 r_311_1 A A[chr20:12856475[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_311_0 TR:VR 112:12 39:0 chr8 104548378 r_384_0 A ATATAATAATTATTAATATATAATATAATTATAATTATATATTATATACAAAATATAATATAACAGAATTA]chr8:106104246] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_384_1;SVINSLEN=70;SVINSSEQ=TATAATAATTATTAATATATAATATAATTATAATTATATATTATATACAAAATATAATATAACAGAATTA TR:VR 184:16 37:0 chr8 106104246 r_384_1 A ATAATTCTGTTATATTATATTTTGTATATAATATATAATTATAATTATATTATATATTAATAATTATTATA]chr8:104548378] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_384_0;SVINSLEN=70;SVINSSEQ=TAATTCTGTTATATTATATTTTGTATATAATATATAATTATAATTATATTATATATTAATAATTATTATA TR:VR 184:16 37:0 chr8 66834409 r_371 G . PASS END=66996453;SVTYPE=DUP;SVLEN=162044 TR:VR 120:9 35:0 chr10 126172785 r_142_0 C C]chr8:122094763] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_142_1 TR:VR 221:20 44:0 chr8 122094763 r_142_1 A A]chr10:126172785] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_142_0 TR:VR 221:20 44:0 chr10 51970138 r_43_0 G G]chr10:52090562] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_43_1 TR:VR 198:41 36:0 chr10 52090562 r_43_1 A A]chr10:51970138] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_43_0 TR:VR 198:41 36:0 chr11 93202186 d_204 A . PASS END=93205575;SVTYPE=DEL;SVLEN=-3389;SVINSLEN=14;SVINSSEQ=AAAAAATCAGGAAA TR:VR 48:6 24:0 chr12 50083321 r_179_0 C C]chr13:81374050] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_179_1 TR:VR 107:18 38:0 chr13 81374050 r_179_1 G G]chr12:50083321] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_179_0 TR:VR 107:18 38:0 chr10 126189429 r_143_0 C C]chr10:126296359] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_143_1 TR:VR 180:54 41:0 chr10 126296359 r_143_1 T T]chr10:126189429] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_143_0 TR:VR 180:54 41:0 chr10 52070681 r_44_0 C [chr10:78388227[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_44_1 TR:VR 189:36 31:0 chr10 78388227 r_44_1 A [chr10:52070681[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_44_0 TR:VR 189:36 31:0 chr12 52561593 r_180_0 G GGC]chr16:51040864] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_180_1;SVINSLEN=2;SVINSSEQ=GC TR:VR 99:8 32:0 chr16 51040864 r_180_1 G GGC]chr12:52561593] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_180_0;SVINSLEN=2;SVINSSEQ=GC TR:VR 99:8 32:0 chr13 58158264 d_245 A . PASS END=58158507;SVTYPE=DEL;SVLEN=-243 TR:VR 54:18 11:0 chr16 56741035 r_261_0 G GGGA[chr21:25791292[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_261_1;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=GGA TR:VR 66:3 39:1 chr21 25791292 r_261_1 G ]chr16:56741035]TCCG . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_261_0;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=TCC TR:VR 66:3 39:1 chr2 180603395 d_691 C . PASS END=180603456;SVTYPE=DEL;SVLEN=-61 TR:VR 38:6 14:0 chr2 35845436 i_562 T . PASS END=35845436;SVTYPE=INS;SVINSLEN=158;SVINSSEQ=AAAAATGCTTACTATGCTAGATGACACATTAGTGGGTGCAGTGCACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA TR:VR 28:15 14:0 chr20 17155886 r_312 T . PASS END=17157278;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1392;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=T TR:VR 53:24 10:0 chr22 19205944 r_322_0 G [chr22:22891200[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_322_1 TR:VR 37:9 26:0 chr22 22891200 r_322_1 T [chr22:19205944[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_322_0 TR:VR 37:9 26:0 chr3 80208403 r_329 T . PASS END=80229030;SVTYPE=DEL;SVLEN=-20627 TR:VR 77:7 33:0 chr5 50250232 i_951 C . PASS END=50250232;SVTYPE=INS;SVINSLEN=1311;SVINSSEQ=TCCATCAAAAGAAAGGTTCAATTCTGTGAGGTGATGCACACATCCCAAAGAAATTTCTCAGAATCCTTCAGTCTAGTTTTTATGTGAAGATATTTCCTTTTTCACTGTAATCCTCAAAGTGCTCCAAATATCCATCGGCAGAGTCTACAAAAAGTGGAAGTCAGTGTGGCGATTCCTCAGGATCTAGAACTAGAAATACCATGAGATCTAGAACTAGAAATACCATTTTACCCAGCCATCCCATAACTGGATGTATATCCAAAGGCTTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACTTATGTTTATTGCGGCACTATTTACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCAACAACAATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCAGATATACATCATGGAATACTATGCAGCCTTAAAAAATGATGTGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAACTGGAAACCATCATTCTCAGCAAACTATCACAAGCACAAAAAACCAAACACCGCATGTTCTCACTCAAGGTCGGAATTGAACAATGAGAACACATGGACACAGGATGGGGAACATCACACTCCAAGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGTGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGCTAAATCACGAGTTAATGGGTGCAGCACTCCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTGCACATTGTGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATTTAAAAAAAAAGACTGTTTCCAAACTGCTTAATCAATAGAAGGTTTCAACTCAGTGAGATGAACGCACACATCACAAAGGAATTTCTCAGAAAGATTCTGTCTAGTTAGTTTTTATGTCAAGATATTTCCTATTTCACCATAGGCCTCAATCCACTCAGAAATATCTCTTTGCAGATTCTACCAAAGGGCTGTTTCCAAACTGCTCAATCAAAAGAAAGTTTCAACTCTGTGAGATAAAAGCATACAACCTAAAGAAATTTCCAGAGGGCTTCTGTCTAGTTTTTGTGAGAAGATATTTCCTATTTCACCACAGGCCATCAAGGGCTCAGAAATATCCCTTTGCAGATTGTAGAAAAAGGACTCTTTCCAAACTGCTCAATCAAAAGAAATGTTCAACACTGTGAGATGAATGGAACATAACAAAGAAGTTTCTCAGAATGTTTCTGACTAGTTTTTATGTGAAGATATTTCTTTTTCAAGACAGGCCTCAAATGGTTCAGAAACATCCCTTTGCAGATTGTACAAAAAGACTGTTTCCAAATTGCTCAAT TR:VR 28:5 12:0 chr8 143321455 i_1180 A . PASS END=143321455;SVTYPE=INS;SVINSLEN=680;SVINSSEQ=CCTCTCTCCCTCACCCCCTGTCTCTGCACTCTACTGTCTAAGCCTATGCATCTACCTACCGCCACCTCCATACACATACATGCACATCCATCCTAGTCTGCCTACATCCACCTGGATCCATCCCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCCCTCTGTCACTCCATCCTACCTACTGTATGTCATCTACCTACGTATGTATGTATGTATGCATCCATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTACTGTCTGTCTACCTACCTGGATGTCTCTCTCTGTCTCCCTCCATCGACCTGGACCTCTCTCTCTCTACTCTGTCTGTCCTGCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTTCCATGTGACCTGCCTCTGCCTGCCTCGCATCCTACCTACATCCCACCCACCCACCTGGACCCATCCCACCTACCACCACCCTGCAGCCAAACATCCACATACATCCTGTCTGTCTGTCTCCCTGCTCTGCCTCCATCCACCTACATATGTCTCACACCCAGTGCACAATCCATCTACCTACCATCCCACACACACCTGGACCATCCACTGCACATGCATCCCTGCACCTCGCTAGTCTCACCTGCCTATCTACACACAGACCATCTACACACACAGACCATCCCTGCATGCATCTCTCGCCATCC TR:VR 78:5 18:0 chr1 2429963 r_0 T . PASS END=3827504;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1397541 TR:VR 43:13 36:0 chr10 113849116 r_90_0 T [chr10:114837096[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_90_1 TR:VR 56:36 36:0 chr10 114837096 r_90_1 G [chr10:113849116[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_90_0 TR:VR 56:36 36:0 chr10 126190810 r_144_0 C ]chr12:66626043]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_144_1 TR:VR 181:14 40:0 chr12 66626043 r_144_1 A A[chr10:126190810[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_144_0 TR:VR 181:14 40:0 chr10 52659619 r_45 T . PASS END=78809067;SVTYPE=DEL;SVLEN=-26149448 TR:VR 209:24 33:0 chr13 59240313 i_261 A . PASS END=59240313;SVTYPE=INS;SVINSLEN=5695;SVINSSEQ=TTACTTTGCCCTGGAAGGGGTTGGGGATTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTATTTATTCATTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCTCAATCTCTGCTCACCGCAACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTTGGGAGTAGCTGGGATTACAGGCAAGCGCAACCACGCCCAGCAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCTGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAATTCCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCGTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCCAGCCGGGGTGGGGGATTCTTAAGATGAGAAACATAAAGTGATAACACAACACAAATGAAATATCCCGCCACACATGTGCTATTCTCTGCTGAATGTTTCCACTTCTAAGACCTAAGGATTCATTAAAAATCCGTATAACCTAAAAGAACTCCTCATACTATACCAATGCCACTTACCAAGGCAATGCCAATTTGTTCTCATCTCATGATGGACACTATTCTACACCCAGTTGCCTAAGGCAGACTCATTTGTTATTTTGATTCTTCTTCTAACTAATCCCCACATCCAAGCAACAGTCATATCCTCTTTCTTCTGCCTCCTTTATAAACTATCTTAATTCCAGCAATTGCCACTATCATAATCATAGGGAATAATCATGCTTGATTTTTTCCTACATTGTGTGAACCAATCAACAGGTGAACTCATCGATAACATCATTCAGTCTGTTGCAACGTCCTCATGTTAATCTCTATGCCTTAAATGTTACCTCTGCAATCCATTCTCCATCTTTTGTTCCTTTAAAAGTCTCAAATCTTGTCAGAGCATTACTTTGTTTAGAAACCCACAGTGGCTTTCATAATTTTTAGGGTGATGTCTGAACTCTTTATGATGTCATTCAAGGCCTTTCAACATCTGGTTTGGGGTTACTTTTATAGTGTTCTATCTCACCACTATTTTTCTCCCTCCCTTACTTATGTATTTCATAACTCATGTCTCAGACTTACTGAACTATTTTTGTTATAAATATTTTCCTGAATTTCTGTTGATTCTAAGCCTTAGAAAACTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGAGAGTTTCCCACTACCCCTACTTACCTCTCTACATAATTTCATCTCCTTACCTTATTAACTGCATAACATCCTTCAAAAATCAATGAAAGCATCATTTCTTTTGGAAGTTTTCCCTGAATTTCTAACACTCTGGGTTAGAAGAACCTCTTATGTGCTCATATAGCCCTGTGGCTTCTCATTACTGCATCACACTATGTTATAATTATCTGTTCACTTGTCTGTCTTCCTAGTTACATTAAAAACCCTTGAAGAAAAGCAATGATGTCTTATTAATCATCGCATCCCTAGTACCTTATAGAGTTTTGTCATTTAGCAAATGCTAAGTGTTGAACAAATGAACGAATACCCAAAAGGCATAAGTGAGTGTTACACAGGTAATTTAGGAACTGCCTGTTAAACTTACTTTATTACCAAAATCTTATCATCTCTTCATAAGAATCTTAATATCACTTTATTCTCATCAAAAATAGTTGAAATAAATGATTTTTTTTCCTAAGAATTAAAAAAAGGAAAGGAGATAAAGCAATCTAGTATGAAGTGTTTGCCATCCTTGATTTTTCTTCTTCTGGTTTAAGACCCAAACTAACTTTATGAGGCTAAAAATAAAAAGTCTTGTAGAATGACTTTTAAGTATTCAGCAATGATCAGTTCTGCACTAAATGCACAAAAAGAGCTCAGTATCCATTTTGTGAATATCTAATATATTTAAATTAAATTGGCAACTCATTATAGTGACTAAGACATAGAATTACTTTGTCATAAATTATAGGTAATCTGTAGTTTCACATTAACTCTATTACCAGTAATAGAGTTTTAATGTGGTACTTACACTTTGATAAAAGAGAAATCATCTTGTCACTAGAAATATGTAAGACGTGAATAGAGAAAAAATGGGAAAGTTGGGGGGAAAATAATGCAAGATGTGGGTAAGAATGAGGAATTATAGGAAAAATTAGAATGACTAGGGAAAATAGCAACAAGGAAAGAAAGAGAAAAAATAAGGATGGACAGAAAAAAGTAACAGTATGGGCTGAGGAGATCGTAGGAAAGGGAAAACCAGTAAGAAAAGATGAAATAGAAAAATACAGAATCAAAAAAAGAGCAGAATAATATGAAATATATATGGATCACTGCTACATTGAGAAAATGAACTAGTGCCAATAGAAATGCATATATTATATGCCTAAGTTTAAACAGGAAGTTTTCATATGAGTAGTAAACAGAAATAAACATAGATAATATTACATTTTTAAACAATTTGATAATGATTACCTAAGAAGCTTATTTTATAGCTTGAAATTACTCTACAAATCAGAATTATATTGGTTGTGCAATGGGGGAAATTTATTTTCTTTTCTCAAGGATGTGTGCAGGCAGAACACCACTAGGTAAAGCTGTCAGGTTTATGTTTCTCAAAGTGAATTCCATGTACCTTCTATAAGTTGTGCTGGGTTCTGCAGTAGAAATATATATCCAGAGAAGGGAATATGTGCAACATACTCATTATTTTAAACATTAACAAAAAGACGCGCTGTGGTCCCATTTTACAGAGGTATACTTTTTTTTTACTTCAAGAAGACAGTATTTTATTTTCCCAGTAGATTTTCTTTAAACCCACTTTATGTGTCTGCTGTAGTACCTTTGCAATTCACTATTTGATATCTAGTTAGAGGAATTAAGAAAAAAGCTTCCATAGTGAATTTGAAAAACGGGACGTTTTGGAGGATCATTTTGAGAAGAATAAAGAAAAGGGATTTTCTGACTCATCCCTGTTTTTCTCATGTGATTAATTTTTATTCTGTAGTACAGAAAAATGTAAAATGAGAGTTTTAGCTTAGAGCACACATAATTAATCACAATATTGTGAGAAGAAAACTTCTGTATAAATAACAGTGGAACTTAGTGAATAGTCCAATGTCTTAGTCCTTTTAGTGTTGCTGTAACAGAATACCCAAGACTGGGTAGTTTATTTTAAAAAGAGTTTTATTTGTCTCACAATTCAGTCTGCTAGAAAGTTCAAGATTGGACATCGGCATCTGATGAGGGCCTCAGGCTGCTTCAACTCACTGTGAAAAGTGGAAAGGAAACCAGCCCTTGCAAAGAGATCATGTGATGACAGAGGAAGTAAGAGGGAGAGAAGGGGAGCTGGCAAGCTGTTCTTAAAAACCAGCTATCCTGGGAACTAATAGAGCTACAGCTTACTCACCTGTGAGTGAACATTAATCTATTCACTGAGGGCATTAATCTATTCAAAGGATCTATTTCCATAACCCAAACACCCCGCACTAGGCTCCATTTCCCAACATTGCCAAATTGGGAATCAAATTTCAATATTAGGTTTAGAGAGGACAAAAATCCAAACAATAGCATCCAGTATACCACAAATTCAGAAAAAAATCGTGATAAATTGGATTTCTATAAATATGGGTGATGGCTCAAGACCTTATGAGCATAATTGTGATAGAAGATGGTCATAGTCTATAACTTCAAATTTTCTCTATTAGCTCCATTTACATTTTTAAAAATCATATGCATAAGAAGGGGACCAATTTGAATTAGATGAGTAAAATAACATTTGGAAAACTGGCCCTATTCTAAGATGAATAACTGTCAATATGTCTATGCATTATTCATTGGTAATTAATTTTTTACTGTAAATGTTTGTGTAAGAAAATTACATACATATATATATATATGTATATATATAAAATTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCCCTCCATCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTGTGACCTCTGCCTCCCTGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTTGCTAGACTACAGGTGTGCACGACTACGCCCAGCTAATTTTTTGTATTTTCAGTAGAGACAGGGTTTCACCATATTGGCCAGGATGGTCTCGATCTCTTGACCTTGTGATCCACCCACCTTGGCCTCAAAGTGCTGGTATTACAGGCGTGAGCTACTGTGCCCAGCCAATACATATATATTATATATGCATTATATATGTACTATATAATATATATTACATATTATATATTATACATGTATTATATAATATATAATATAATATATTATATATAATATGATATAATATATATTATATATTATATGTAACATTTATTATATATTATATATAATATGTGCTATAGATAATATATATTTTATATAATACATTATATATTATATAATATGTATGATCTATATATTATATATTATATAATACGTGTTACATATAAATATATAATACATATATATCGAGTTCATGTCTCTTGTTTTCATGAGGAGACACACTTGATATGTGTCTTGTGGGTGGAAGTAGATCAGGTGGAGTTTTTGGAGGGATACATGTAAGATTATATATAGATATTTGCCCACTGTTCTCTGATGTTTCTTCCATGTTCTTTTCATTCACTAAAATTTAGGCTTTTGAAAAGGAAAACTGCTTGCAATAAACATTATACTGTAAACAATGGTCTCCCCATGTTTAGCTCCTTAAAATAGCCTATCCTTTTCCATTCTAAGGGAAGAACTAGGCTAAAGAGTATGGCAATATATTAAAAATTATCCTATCCTCTTGAGGAAGGATGAACATTAATACATCAGCAGACGATTCATTTGGGAAAGTTTTGTGGCCATAAATATTCAGCTAAAGATTAATTCTCTGACTTCATTCACCTATTTGTCATAGCTTCCTTAATTAAGGTCCTTAATTGAGAAAAAAATATATCGTGATATTGAGCAGATTCGTTTTCTAAAGATTTTTCTTCAACCTAACCAACTCTAACTTTTAAAATATCATGCCATTAAAAGCTTTCCACAGAAAATTAGAAAAGTAATCTTTCATCATACTTACAGTTTCTTGGAAATAATTTCATATTTGCATTCATAGTCATCTTAAACTTTTCCAGTCCTTTACTCATTTCTATTTTGTCAATCACCATTATCCTTACTAACAGACTGTCATAAGTTACATACAAATTCACCTAATTCACTATATTGAGAGTACTGTGAATATTAGAAACATTTCTTATTCATTTTTCATTTATTAATCTTTTTACACACATGCTTTTTATACATTATATTTACAAAAAATGCTTGCTGACTTAATGTACTTAAATATAATGTGAACATAAGATACATTCACTAGGTAAAAATGGTTAATTCTAGTCTAAAATAAAATTATTAAATTATATTCTAAAGACACTAATTTTTAAAATAAAATGCAATTTATTTTTTCAACCATAAACTTTGTTTAAGACATAGGGAAATTTCTATTTCTAAGTCAATGGAAAAAGGAGAACTATTTAAAAATATTACTTTTTAAGTAATAGGTTTCCATAAGATTCTGAAATGGATCAATAGATGGCAGTGATACTGGAAAGTGAACAATGATTTCTGTGATTAATATATACATGCACAGCTTTACATCTTTACTATCTCCTTTACCAAAATTGCACTTTGTATTATTGGCAAACTGATAAGAGTGC TR:VR 53:8 14:0 chr2 181236780 r_285_0 A [chr2:202708156[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_285_1 TR:VR 96:25 28:0 chr2 202708156 r_285_1 T [chr2:181236780[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_285_0 TR:VR 96:25 28:0 chr8 106014922 r_385 A . PASS END=110498813;SVTYPE=DUP;SVLEN=4483891 TR:VR 164:18 35:0 chrY 11325188 d_1325 T . Too_low_VAF END=11325608;SVTYPE=DEL;SVLEN=-420;SVINSLEN=8;SVINSSEQ=TACATCAC TR:VR 597:3 318:0 chr10 113930187 r_91_0 T T[chr12:49023914[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_91_1 TR:VR 68:13 32:0 chr12 49023914 r_91_1 T ]chr10:113930187]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_91_0 TR:VR 68:13 32:0 chr10 126190956 r_145_0 G G[chr12:66591144[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_145_1 TR:VR 196:17 34:0 chr12 66591144 r_145_1 G ]chr10:126190956]G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_145_0 TR:VR 196:17 34:0 chr10 52659745 r_46_0 T [chr10:52660726[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_46_1 TR:VR 121:21 13:0 chr10 52660726 r_46_1 T [chr10:52659745[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_46_0 TR:VR 121:21 13:0 chr11 103527634 r_171_0 C CAAATAGACTTGCAAATGAGCAAGAAGCAGAGATAAAA[chr8:75040837[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_171_1;SVINSLEN=37;SVINSSEQ=AAATAGACTTGCAAATGAGCAAGAAGCAGAGATAAAA TR:VR 78:22 18:0 chr8 75040837 r_171_1 T ]chr11:103527634]TTTTATCTCTGCTTCTTGCTCATTTGCAAGTCTATTTT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_171_0;SVINSLEN=37;SVINSSEQ=TTTTATCTCTGCTTCTTGCTCATTTGCAAGTCTATTT TR:VR 78:22 18:0 chr11 93786616 i_208 C . PASS END=93786616;SVTYPE=INS;SVINSLEN=644;SVINSSEQ=GGCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAATACCTGATGTCAGGTGATCCACCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCAATAGTGTACCCTTTCAAAGGTTTTTCTATGCACTTACATACATCTATTTCCAATCCTATTACTTGCCTTTCCCCCGCCCCCACTTAATATTTCCTAGAGACACTTCCATGTTAGTACTTATGAGTCTACTTAATTCTTCTAACACTGTATGATATTCTGGAACATGGATGTACGGTATGTTTAACCACTTGTATTTAACGGACATGTAGATTGCTTCCAACAAGTAAACTGCTTCCAACAATGCTAGCAGTGGTAAACATCTTGAATATATACCCTGTATATGTGCAACTTTTTCTGCAGGTTAAATTTTTAGTCGTGGTAATAGTGAATCAAAGGAGATATACATTTAAAAGTTTCGGCTGGGTGCAGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGGTGGATCACCTGACATCAGGTATTTAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTATCTCTACTAAAAATACAAAG TR:VR 59:19 16:0 chr12 57633661 d_224 T . PASS END=57633994;SVTYPE=DEL;SVLEN=-333 TR:VR 46:6 21:0 chr2 182627044 r_286 T . PASS END=206988820;SVTYPE=DEL;SVLEN=-24361776;SVINSLEN=98;SVINSSEQ=ATATACCTTTAGACTGTAGATCCAATAAGAAAAAAATGTTTCCTAATATGCAATTGCCTTTGAGAAAAAAAAAACCAAAGGACAAATGTCTTTATATA TR:VR 84:13 33:0 chr20 17159587 r_313 G . PASS END=18003195;SVTYPE=DEL;SVLEN=-843608 TR:VR 70:22 33:0 chrX 53749602 i_1336 T . Too_small_size END=53749602;SVTYPE=INS;SVINSLEN=39;SVINSSEQ=TATATATATTTATATATATTTATTTATATATTTATATAT TR:VR 37:3 10:0 chr10 113930324 r_92 T . PASS END=117135609;SVTYPE=DUP;SVLEN=3205285 TR:VR 62:9 32:0 chr10 126191676 r_146_0 C ]chr8:119183294]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_146_1 TR:VR 218:71 36:0 chr8 119183294 r_146_1 A A[chr10:126191676[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_146_0 TR:VR 218:71 36:0 chr10 52679055 r_47_0 G G]chr10:78794529] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_47_1 TR:VR 194:26 42:0 chr10 78794529 r_47_1 A A]chr10:52679055] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_47_0 TR:VR 194:26 42:0 chr11 93786712 i_209 C . PASS END=93786712;SVTYPE=INS;SVINSLEN=646;SVINSSEQ=CTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACTGCGCCCGGCCCCAATGAGTGTACCCTTTCAAAGGTTTTTCTATGCACTTACATACATCTATTTCCAATTTTCTATTACTTGCCTTTCCCCCGCCCCCACTTAATATTTCCTAGAGACACTTCCATGTTAGTACTTATGAGTCTACTTAATTCTTCTAACACTGTATGATATTCTGGAACATGGATGTACGGTATGTTTAACCACTTGTATTTAACGGACATGTAGATTGCTTCCAACAAGTAAACTGCTTCCAACAATGCTAGCAGTGGTAAACATCTTGAATATATACCCTGTATATGTGCAACTTTTTCTGCAGGTTAAATTTTTAGTCGTGGTAATAGTGAATCAAAGGAGATATACATTTAAAAGTTTCGGCTGGGTGCAGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGGTGGATCACCTGACATCAGGTATTTAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACTCTATCTCTACTAAAAATACAAAGGCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATAGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTAAATACCTGATGTCAGGTGATCCAC TR:VR 59:22 16:0 chr12 59405868 r_181_0 A ]chr13:62220339]T . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_181_1 TR:VR 82:4 37:0 chr13 62220339 r_181_1 T T[chr12:59405868[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_181_0 TR:VR 82:4 37:0 chr19 51161887 d_598 T . PASS END=51161953;SVTYPE=DEL;SVLEN=-66 TR:VR 32:13 18:0 chr2 185802095 r_287_0 G [chr2:197016236[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_287_1 TR:VR 63:6 32:0 chr2 197016236 r_287_1 A [chr2:185802095[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_287_0 TR:VR 63:6 32:0 chr5 32855851 i_926 A . PASS END=32855851;SVTYPE=INS;SVINSLEN=439;SVINSSEQ=CTCTATACCCATTAAACAAAACCTTCGCTTTACACGCCCCTGCCCCCGCAATCTGTCCGTGGTAACCACAACCATTCTGTTTTCTGTTTCTATAACATATAATATAATATATTATATAACATATAATATAATAGGAATTATATAACATATAATATATTATATAACATATATTCAATTATATTATATATTATATAATATCCATATATTATATAGCATATAATATAATATATTATATGTTATATAATATAATATATTATATATTATATAATATATTATATGTTATATAATATATTATATGTTATATAATATATTATATTATATAATATATTATATATATATAATATATTATATATTATATAATAATATTATATTATATGTTATATAATATAATATATTATATGTTATATAATATATTATATAACATATAATATAATATATT TR:VR 74:6 18:0 chr8 76922340 r_372_0 T T]chr8:76929906] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_372_1 TR:VR 89:19 19:0 chr8 76929906 r_372_1 G G]chr8:76922340] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_372_0 TR:VR 89:19 19:0 chrY 11328238 d_1327 C . Too_low_VAF END=11328583;SVTYPE=DEL;SVLEN=-345 TR:VR 522:9 273:1 chr10 113930953 r_93_0 C C[chr12:49668990[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_93_1 TR:VR 97:9 21:0 chr12 49668990 r_93_1 G ]chr10:113930953]G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_93_0 TR:VR 97:9 21:0 chr10 126195544 r_147_0 A A]chr8:118133987] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_147_1 TR:VR 282:67 35:0 chr8 118133987 r_147_1 C C]chr10:126195544] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_147_0 TR:VR 282:67 35:0 chr13 59240388 r_222_0 T [chr13:68204606[A . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_222_1 TR:VR 87:3 36:0 chr13 68204606 r_222_1 A [chr13:59240388[A . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_222_0 TR:VR 87:3 36:0 chr15 73866617 r_256 A . PASS END=86540221;SVTYPE=DEL;SVLEN=-12673604 TR:VR 52:6 49:0 chr16 76760395 i_373 A . PASS END=76760395;SVTYPE=INS;SVINSLEN=490;SVINSSEQ=ATGAGTTGATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACATTGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCACTGCACCCATTAATGTGTCATCTAGCATTAGGTATATCTCCCAATGCTATCCCTCCCCCCTCCCCCGACCCCACCACAGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTCCTGGGTCCATGTGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTTCTTGCGATAGTTTACTGAGAATGAATTACTGAAAGAGAGGCATTAAAGTATTCAACTATTTGTTGGATTTGTCTATTTTCTGTAGTTCTGTAAGTTTCTCCTTCATATCTTTTGATGCTCTGTTGCTAGGTATGCAATCATGTCTTCTTGAAAAATCAACTCATCCATCATGGA TR:VR 28:6 12:0 chr22 21891669 r_323 G . PASS END=23262068;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1370399 TR:VR 27:5 26:0 chr3 118169342 d_901 T . Too_small_size END=118169384;SVTYPE=DEL;SVLEN=-42 TR:VR 28:16 11:0 chr5 1273190 i_882 A . PASS END=1273190;SVTYPE=INS;SVINSLEN=291;SVINSSEQ=CACATCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACCCACATCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACCACACATCCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACCACACATCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACCACATCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACCACACATCAGACCCCCGGGACCGACCGCCATCCACAGTCACCACACATCCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACCACACATCAGACCCCACGACCGCCATCCACAGTCACC TR:VR 85:5 21:0 chr6 149983643 i_1017 T . PASS END=149983643;SVTYPE=INS;SVINSLEN=483;SVINSSEQ=CTCTTTTTTTTTTTGGAGGGAAGGGCTGGGTGTTTTTTTTTTTTGAGTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTTTTGAGCTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTGAGCTTGGAAGGGGCTGGGTGTCATTTTCTTTTTTTTTTTTTGGAGCTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGAGCTGGAAGGGCTGGGTTCATTTTCTTTTTCTTTTTTTTTGAGCTGGAAGGGCTGGGTGTCATTTTCTTTTCTCTTTTTTGAGTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTTTTTTTTGAGTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTTGAGTGGAAGGGCTATGTCTTTTTTTTTGAGTGGAAGGGCTTTTTTTTTTTTTGAGTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTTTTTTTTGAGTGAAGGGCTGGGTGTCTTTTCTTTTTTTTTTTGAGCTGGAAGGGCTGGGTGTCTTTTTCT TR:VR 46:7 19:0 chr8 76922347 r_373_0 C [chr8:76929943[TATAGTT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_373_1;SVINSLEN=6;SVINSSEQ=TATAGT TR:VR 89:16 19:0 chr8 76929943 r_373_1 T [chr8:76922347[ACTATAT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_373_0;SVINSLEN=6;SVINSSEQ=ACTATA TR:VR 89:16 19:0 chrY 11330273 d_1328 T . Too_low_VAF END=11330346;SVTYPE=INS;SVINSLEN=75;SVINSSEQ=GTCATAATGTCCCCTGTTAGGCACAGAGTATAAGAAGAGTTACATCACCTGGGTGATCAAGTGCAGGATCTGTCA TR:VR 433:10 228:0 chr1 245975085 d_125 C . PASS END=245975777;SVTYPE=DEL;SVLEN=-692;SVINSLEN=212;SVINSSEQ=AGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCGGCCCAGGGAAAGCCATCGTCTCCG TR:VR 30:3 15:0 chr10 113931436 r_94_0 T ]chr12:49706996]C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_94_1 TR:VR 93:13 26:0 chr12 49706996 r_94_1 C C[chr10:113931436[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_94_0 TR:VR 93:13 26:0 chr10 126195609 r_148_0 C ]chr12:66591185]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_148_1 TR:VR 257:80 36:0 chr12 66591185 r_148_1 A A[chr10:126195609[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_148_0 TR:VR 257:80 36:0 chr11 93787147 i_211 C . PASS END=93787147;SVTYPE=INS;SVINSLEN=74;SVINSSEQ=TCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGGTGGATCACCTGACATCAGGTATTTAAGACCAGT TR:VR 57:16 16:0 chr12 59870011 r_182_0 A AGGT]chr13:63722085] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_182_1;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=GGT TR:VR 81:4 33:0 chr13 63722085 r_182_1 C CACC]chr12:59870011] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_182_0;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=ACC TR:VR 81:4 33:0 chr13 59240362 i_263 T . PASS END=59240380;SVTYPE=INS;SVINSLEN=3273;SVINSSEQ=TCATGAGGAGACACACTTGATATGTGTCTTGTGGGTGGAAGTAGATCAGGTGGAGTTTTTGGAGGGATACATGTAAGATTATATATAGATATTTGCCCACTGTTCTCTGATGTTTCTTCCATGTTCTTTTCATTCACTAAAATTTAGGCTTTTGAAAAGGAAAACTGCTTGCAATAAACATTATACTGTAAACAATGGTCTCCCCATGTTTAGCTCCTTAAAATAGCCTATCCTTTTCCATTCTAAAGGAAAGAACTAGGCTAAAGAGTATGGCAATATATTAAAAATTATCCTATCCTCTTGAGGAAGGATGAACATTAATACATCAGCAGACGATTCATTTGGGAAAGTTTTGTGGCCATAAATATTCAGCTAAAGATTAATTCTCTGACCATTCACCTATTTGTCATAGCTTCCTTAATTAAGGTCCTTAATTGAGAAAAAAATATATCGTGATATTGAGCAGATTCGTTTTCTAAAGATTTTCTTCAACCTAACCAACTCTAACTTTTTTAAAATATCATGCCATTAAAAGCTTTCCACAGAAAATTAGAAAAGTAATCTTTCATCATACTTACAGTTTCTTGGAAATAATTTCATATTTGCATTCATAGTCATCTTAAACTTTTCCAGTCCTTTACTCATTTCTATTTTGTCAATCACCATTATCCTTACTAACAGACTGTCATAAGTTACATACAAATTCACCTAATTCACTATATTGAGAGTACTGTGAATATTAGAAACATTTCTTATTCATTTTTCATTTATTAATCTTTTTACACACATGCTTTTTATACATTATATTTACAAAAAATGCTTGCTGACTTAATGTACTTAAATATAATGTGAACATAAGATACATTCACTAGGTAAAAATGGTTAATTCTAGTCTAAATAAAATTATTAAATTATATTCTAAAGACACTAATTTTTAAAATAAAATGCAATTTATTTTTTCAACCATAAACTTTGTTTAAGACATAGGGAAATTTCTATTTCTAAGTCAATGGAAAAAGGAGAACTATTTAAAAATATTACTTTTTAAGTAATAGGTTTCCATAAGATTCTGAAATGGATCAATAGATGGCAGTGATACTGGAAAGTGAACAATGATTTCTGTGATTAATATATACATGCACAGCTTTACATCTTTACTATCTCCTTTACCAAAATTGCACTTTGTATTATTGGCAAACTGATAAGAGTGCATATTATTTAAGGCCTTCCAAGAAGCAGACACCAATATGGAATTAAACATTCAAGCAATGTATTAGTCCATTTTCACACTGCTATGAAGAAATACCTGAGACCAGGTAATTTATAAAGGAAAAGAGGTTTAATGGACTCACAGTTCCACATGTCTGGGGAGTCCTAACAATCATGGGAGAAGGTGAAGGAGAAGCAAAGGCACATCTTACATGGTGCAAGCAAGGAAGCCTGTGGAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTCGTGAGACTTATTGCTATCATAAGAACAGCACAGGAAAAACCCACTCCATGATTTAATTACCTCCTACTGGGTCCCTACCACAACACATGGGGATTATGGGAGTTACAATTCAGGATGAGACTTGGGTGGGGACACAACTAAACCATATCAAGCAATTTATTAAGAAAAATATCTGTAGGAAAATGGGAGGGAACCCAAGGAGACTAAAAGAGGTGTCAGACCAGAATGAAGGCCTTACCCTTATGAAGAAAGAGGAAATAAATGTTGAATGAAAGAGTCAGACTGAAGTGCAATCACACAGAATTTTGATAAAGTCAATTGGGGATCTTTGAACCAAAACTGTCCATTAGAGGAGTCTAACTCCCTCAGAATCAAGCCTGCCTTGGTATCCCAGCTAAGCTTAGTCATTGGTTGGGAGCCCATGGGAAGCACGGCCTCAAAGCATACTAGGTTATAGACTTCAGAAAGCAGTAGCAGAGACATTTGTTTGGTCAATTATGATCCCCAAAGTTGAAGATCTGAGACCAACAATTTGTCGGCTCTCACCAAAGGAATTAAGACAATGGCTGCAATTAATTGACAATGTTTTTCAAATCTAACATGTGGTATTGAAGAGGAATAACAACAATGATTGATTGATAAATAGACAGACATTAGAATAGTGGTGTGGTCTGAGTGGAAGAAAGCATTGTCTAGATTGGTGATTTCTGGATGGACCCTGGAATTTAGTTCTTGGATTCAAATCTTAACTCCAAACTTTCTAGCTGTAAGCAAATTAATCAAGCTTACTTTTTCTCAACTGCTTCATCTGTAAAACGAGGTTAACTGTTGTACCTTTCTTACAGAAAGCACTATTATTCTCTTAGATTGTTAACATCAGAGGGCACTTTAAAGGTAATATCATTCAACAACATAGATTCCTATGGCTTAAACTCATTCTACTATGAACACTCCAAAAGTTGAGTGTTTTAATTTATTTGTGAGTTAGGAAATGAGGAATGGACAAGGAAATCAGCTCTGCTTTAATGAGAAAGGCAAAAAAATCCAAAGATGAAGTCATCAAAAGCTTTGCTTCAAAATACATTTAGGTGATATTTAGTAGAGGCCAGGGGTGAGGAGCCTGGGAAGATGTTGATCAAATAACATAAAATTTTAGTTAGATTGGAAGAATAAGTTCAAGAGATCTGTTGTATATCATGGTGACTATGGTTAATAACAATATATTGTCTACTTAAATACAATAATAACAATCTATTGTCTTAAAAACAATATATTATCTGCTTAAAAATTGCTAAAAGAGTAGATAAAAGTGCTCTCTTGACAAAAAAAAAATTCTCCACAAAGCAACAATTTAAAATCCATATAGCTATTCTAAAAATTTATATTGATATTATGTTAAAAACTCATCATAACTATGGGAGCACAATTCGCTTGACAACTATTGTATCTTAGTTATGCATTTTCATTTTTTAGTGTCTAAATCAAAATGCTGTGTATATTCCCAATCTACACTGTAGAATTTCAGTTTATTAGGTCATGCATTTGCTCAGCAAACAAAGATACTCATGCTTAAGATGTCTTTACACAAGTTAATTTTTGGATTTTAGAACAGTATTATTTTAATCTGCTTGCCTTGCCCCCAGAAAAGCATTGGTCTTCCTATAGGAAATTTATAAATTGAAATATACAATGAATTTAATTTGTGCTTTTATTCATTTTCAAATTTATATTGACGAGTGGCCTTGAATTTTTGGTCACTGCTAGCTATTTTTTGGTTTTACCATGAATAAGGT TR:VR 52:10 14:0 chr2 190607019 r_288 C . PASS END=204943406;SVTYPE=DUP;SVLEN=14336387 TR:VR 85:12 31:0 chr20 62875403 i_665 C . PASS END=62875404;SVTYPE=INS;SVINSLEN=841;SVINSSEQ=CCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCGCACCCCCACCCCCACCCGCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCACCCCCACCCGCACCCCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCGCACCCGCACCCCCACCCTCACCCTCACCCGCACCCGCACCCCCACCCCACCCCCACCCGCACCCACACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCACCCCCACCCCCACCCACACCCGCACCCGCACCCCCACCCTCACCCTCACCCGCACCCGCACCCCCACCCCCACCCGCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCCCCCCACCCTCACCCGCACCTGCACCCCCACCACCCTCACCCACACCCGCACCCCCACCCCCACCCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCGCACCCCCACCCCCCACACCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCCACCCCACCCTCACCCGCACCCCCACCCTCACCCCCACCCCCTCACCCCCACCCTCACCCGCCCCCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCACCCCCACCCTCACCCACACCCTCACTCCCACACACTCACCCCCACCCCCACCCTCACACCCGCACCCGCACCCCCACCCCTCCCCCCACCCCCACCCCCACACACCCTCCCCCTCACCCTCACCCGCACCCGCACCCCC TR:VR 40:3 26:0 chr22 23486672 i_726 T . PASS END=23486673;SVTYPE=INS;SVINSLEN=763;SVINSSEQ=CTACTACAAATTTATTAAAGTAAATACACATTTCACAAAAAAAGAAGAGAGGAAGGGAAAAACATGTTAAAAACAAAGATAGGTACATTTTATGGTGAAAAAGCCTCCATATATATCATATATCTTAATTGTATCATATATAATATATATCCCGCTATTACATATGAAATATATTTATATAGTATATTATATACTATATATATAATATAATGACATATATGTAATATGTATTATATAATATTATCATATATATTATATATTATATATACATATATAATATATATAACATTTTATATACATGCAAATTATATATTTCATATAATATATATTCTATGTCATATATATTATATATAATATATATGTAAATGACATAGAATATATATTATATATATATAATATATTAGGACGTATTATATATGATATATATTATATATTACGTATGTCATTTATTATATATATAATTAATTTTTTTTTAGACAGAGTTTTGTTCTGTTTCACAGGCTGGAGTGCAATGGCGCCATGTTGGCTCACTGCAAACTTTACCTCACGGGTTCAAGTGATTGTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTAGCTGGGACTACACCACACTGGGACTGCACCAGCTGCCACCACGCCTGGATAATTTTTTGTAGTTTTAGTAGAGACAGGGCTTCACTGTATTGGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTCACCTTGTGATCCTCTTGCTTTGGCCTCCGAAATTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCAAGATCC TR:VR 25:3 17:0 chr3 11826770 d_875 T . Too_small_size END=11826812;SVTYPE=DEL;SVLEN=-42 TR:VR 50:16 17:0 chr6 150015739 r_358 A . PASS END=150043015;SVTYPE=DUP;SVLEN=27276 TR:VR 71:16 20:0 chr8 116562783 d_1163 A . PASS END=116564531;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1748 TR:VR 76:6 17:0 chrX 1369509 d_1269 T . PASS END=1375494;SVTYPE=DEL;SVLEN=-5985;SVINSLEN=159;SVINSSEQ=GGGAGAATCAATGTGTTTTGTTTCTAAGCCGCCCAGCCTCTGGTATTCTGTGACAGCAGCCTGAGATGGACTAAGCCATCTCATAAGAAGAGACGAGGACACAGACACACACAGAGGGACGACCCTGTGAGGGCACAGGGAGAAGACGGCGTCTCCAAG TR:VR 40:5 12:0 chrX 58504120 d_1288 G . PASS END=58504228;SVTYPE=DEL;SVLEN=-108;SVINSLEN=106;SVINSSEQ=CAGTTTGGAAACAGTCTTTTTGTAGTACCTGCAAATGATATTTGGAGTGCTTTGAAGACTATGGTGAAAAAGGAAATATCTTCACATGAAAACTAGACAGAATCAT TR:VR 31:4 7:0 chr10 113951982 r_95_0 G G[chr13:91055835[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_95_1 TR:VR 58:14 29:0 chr13 91055835 r_95_1 T ]chr10:113951982]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_95_0 TR:VR 58:14 29:0 chr11 94425510 i_212 G . PASS END=94425537;SVTYPE=INS;SVINSLEN=184;SVINSSEQ=GATGCTGAGATGCAAAAATCTATACACAAGATCAATGAAACCAAGTATTGGTTCTTCAAAAGAATAAATAAGACAGACCACCCTAGCTATATTAACAAAGAAAAAAAGGAGATCCAAATAAGTCCAATGAGAAATGACAATGATGATATTATAACTAATCCTACAGAAATCAAAAACTGCATGT TR:VR 47:4 20:0 chr19 1049696 i_494 C . PASS END=1049696;SVTYPE=INS;SVINSLEN=930;SVINSSEQ=CCACCACTCCCCTCCCGTGAACCCCCCACCACTCCCTCCCTGTGAGCCCCCGGACCACTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCACCGCTCCCCCTCCCTGTGAGTCCCCCACCACTCCCTCCCTGTGAGCCGCCCCACCACTCCCTCCCCCGTGAACCCCCACCACTCCCTCCCGTGAACCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCCACCGCTCCCTCCCTGTGAGTCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCCACCACTCCCCTCCCCGTGAACCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCGGACCACTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCACCACTCCCTCCCTGTGAGCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCGACCGCTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCACCACTCCCTCCCTGTGAACCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGGCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCACCACTCCCCTCCCCGTGAGCCCCCCCGACCGCTCCCCCTCCCCGTGAGGCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCACCGCTCCCTCCCCGACCCAGGCCCCCCGACCGCTCCCTCCCGTGAGGCCCCCCACCACCCTCCCCGTGAGGCCCCCCACCACTCCCTCCCTGTGAACCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAGCCCCCCACCACTCCCTCCCCGTGAACCCCCCACCACTCCCCTCCCTGTGAGCCCCCACCACTCCTCCCTCCCGTGACCCCCCGACCGCTCCCTCCCCGTGAGGCTCC TR:VR 38:9 14:0 chr2 191784573 r_289_0 G G]chr2:195357473] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_289_1 TR:VR 93:19 34:0 chr2 195357473 r_289_1 G G]chr2:191784573] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_289_0 TR:VR 93:19 34:0 chr22 24480265 r_324_0 T [chr22:24575785[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_324_1 TR:VR 43:10 32:0 chr22 24575785 r_324_1 G [chr22:24480265[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_324_0 TR:VR 43:10 32:0 chr6 61322604 i_993 T . Too_small_size END=61322604;SVTYPE=INS;SVINSLEN=36;SVINSSEQ=CTTTGTGTGCATTCAACTAACAGAGTTAAAGATTCC TR:VR 36:5 19:0 chr8 119086844 r_386_0 A [chr8:122366057[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_386_1 TR:VR 214:78 34:0 chr8 122366057 r_386_1 A [chr8:119086844[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_386_0 TR:VR 214:78 34:0 chr10 114412767 r_96_0 T T]chr12:54095377] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_96_1 TR:VR 71:21 30:0 chr12 54095377 r_96_1 A A]chr10:114412767] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_96_0 TR:VR 71:21 30:0 chr10 126423975 r_149_0 C C[chr2:191856347[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_149_1 TR:VR 104:14 35:0 chr2 191856347 r_149_1 G ]chr10:126423975]G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_149_0 TR:VR 104:14 35:0 chr10 52909409 r_48_0 T T]chr10:52910842] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_48_1 TR:VR 69:14 16:0 chr10 52910842 r_48_1 T T]chr10:52909409] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_48_0 TR:VR 69:14 16:0 chr12 60156806 r_183_0 T [chr13:68761675[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_183_1 TR:VR 81:7 34:0 chr13 68761675 r_183_1 T [chr12:60156806[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_183_0 TR:VR 81:7 34:0 chr13 62194282 r_223_0 T [chr13:62827135[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_223_1 TR:VR 73:9 31:0 chr13 62827135 r_223_1 C [chr13:62194282[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_223_0 TR:VR 73:9 31:0 chr14_GL000225v1_random 44269 r_241 C . Too_low_VAF END=53356;SVTYPE=DUP;SVLEN=9087;SVINSLEN=2;SVINSSEQ=AG TR:VR 758:3 579:1 chr2 192559534 r_290 C . PASS END=193803670;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1244136;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=G TR:VR 87:11 34:0 chr7 21819964 i_1053 T . PASS END=21819964;SVTYPE=INS;SVINSLEN=695;SVINSSEQ=AAGAATGTAACACGCCTATGTCCTGAATGGTAATGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGTTTTTATGGTTTTAGGTTTAACGTTTAAATCTTTAATCCATCTTGAATTGATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAAGGGATCCAGTTTCAGCTTTCTACATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGCACCATTTATTAAATAGGGAATCCTTTCCCCATTGCTTGTTTTTCTCAGGTTTGTCAAAGATCAGATAGTTGTAGATATGCGGCATTATTTCTGAGGGCTCTGTTCTGTTCCATTGATCTATATCTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTGGTTACTGTAGCCTTGAGTTCATATCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAACCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACCCAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTGGTGGGGTCGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACACATTAGTGGGTGCAGTGCACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA TR:VR 38:32 16:0 chr8 120374039 r_387_0 C [chr8:120704398[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_387_1 TR:VR 222:20 33:0 chr8 120704398 r_387_1 G [chr8:120374039[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_387_0 TR:VR 222:20 33:0 chrX 62953557 r_408_0 A A]chrX:62956330] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_408_1 TR:VR 29:3 13:0 chrX 62956330 r_408_1 G G]chrX:62953557] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_408_0 TR:VR 29:3 13:0 chr1 13979478 r_11 A . PASS END=15849166;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1869688 TR:VR 56:8 33:0 chr1 246613713 r_25_0 C C]chr16:6215487] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_25_1 TR:VR 64:3 47:1 chr16 6215487 r_25_1 A A]chr1:246613713] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_25_0 TR:VR 64:3 47:1 chr10 11463581 r_28_0 A A]chr10:58407794] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_28_1 TR:VR 106:3 32:0 chr10 58407794 r_28_1 T T]chr10:11463581] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_28_0 TR:VR 106:3 32:0 chr12 60166487 r_184_0 C C[chr13:62210682[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_184_1 TR:VR 86:6 34:0 chr13 62210682 r_184_1 A ]chr12:60166487]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_184_0 TR:VR 86:6 34:0 chr13 63542420 r_224_0 C [chr13:63543853[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_224_1 TR:VR 63:12 20:0 chr13 63543853 r_224_1 G [chr13:63542420[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_224_0 TR:VR 63:12 20:0 chr2 60400947 r_276 C . PASS END=61551673;SVTYPE=DUP;SVLEN=1150726 TR:VR 95:27 32:0 chr3 90463696 d_888 T . PASS END=90463801;SVTYPE=DEL;SVLEN=-105;SVINSLEN=103;SVINSSEQ=GAGAATGCTTCTGTCTAGTTATTTGAAGATATTCCCGTTTCCAACGAAGGCCTCAAAGCAGTCCAAATATCCACTTGCAGATTCCACAAAAAGAGTGTTTCAA TR:VR 51:5 25:0 chr6 64826218 d_1068 T . PASS END=64826281;SVTYPE=DEL;SVLEN=-63 TR:VR 45:14 12:0 chr8 81901350 i_1139 T . PASS END=81901350;SVTYPE=INS;SVINSLEN=324;SVINSSEQ=TTTTGGACAGGTAAAATGGGGGACTTGTAAGGAGAGTTTATGGGATTTAAAAGGCTATGCTGTAACAGGCAAGTGATAACAGGCTTTAATCCTTTTAAAGCGTGCTGTGGGATGGGATATTGGCGTTGAGTGGGGTAAGGGTGATTAGGTTTTAGTGGGATAGTAATGGGCATGTGATCGGTTGCCAGGGAGGGAGTAGAGATGTCCCATACCTGTGGATTAAGGCGGGTAGATACAAGGGGAGGATGCAAAGGAGACTTTGAACTGGGGGAATGGGTGACAATGAGGTGTGGCTATAGCCCAGGAATAGTCAGGGAAGCAGAT TR:VR 64:45 20:0 chr10 114914162 r_97_0 G GT]chr12:52938369] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_97_1;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=T TR:VR 99:8 48:0 chr12 52938369 r_97_1 G GA]chr10:114914162] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_97_0;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=A TR:VR 99:8 48:0 chr10 53044920 r_49 G . PASS END=78815824;SVTYPE=DUP;SVLEN=25770904 TR:VR 117:18 34:0 chr12 61366106 r_185_0 A ]chr13:69998310]C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_185_1 TR:VR 85:7 36:0 chr13 69998310 r_185_1 C C[chr12:61366106[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_185_0 TR:VR 85:7 36:0 chr13 63958176 r_225_0 C C[chr16:35185208[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_225_1 TR:VR 65:7 18:0 chr16 35185208 r_225_1 A ]chr13:63958176]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_225_0 TR:VR 65:7 18:0 chr15 86407308 i_341 C . PASS END=86407308;SVTYPE=INS;SVINSLEN=403;SVINSSEQ=AGAAATTAAACTCAGTTTAATAATAACATTTTTTGCCAGTAATTGGGTATATTTTGGGAAATAGTAGAATAAAGATTTGTAGACTCTCTTACATCTCCTAAAAGAAAATTCACTAAGCATGTATGTGGAAAACATCTTAAAATAAAGATAGATAAGAACGTTTTTGTGAATTAAAAAAGTAATGTGAACTTGAATTTTTTATACACACAGTATATACTCTATTATATGTATACACAGAATACAACTCTATCAGTATTGAACTTAGTTTGTCATTCCATAAAATGGCCATAGATGGCCAGATCAAGTAATCCTACTCATTTTACCCTGTATTACTGAAAATAAAAATGGGGGGGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA TR:VR 22:7 17:0 chr17_KI270729v1_random 11081 i_451 C . Too_low_VAF END=11082;SVTYPE=INS;SVINSLEN=151;SVINSSEQ=ATTCCATTCCATTCCGTGTCTATTTCCAGTTGATTCCATTCCATTCCATTCCAATTCATTCGATTCCGTTCCATTCCATTGGGATTCCATTCCATTCCATTCAGATTCCATTCCATTCCATTCCATTTCATTCCTGACCATTCCATTCCAC TR:VR 143:4 42:1 chr5 3601008 d_1000 C . PASS END=3601060;SVTYPE=DEL;SVLEN=-52 TR:VR 54:18 18:0 chr8 81956746 d_1153 T . PASS END=81956805;SVTYPE=DEL;SVLEN=-59 TR:VR 63:7 17:0 chr10 53298628 r_50 G . Too_low_VAF END=63237261;SVTYPE=DEL;SVLEN=-9938633 TR:VR 91:3 28:0 chr12 64167980 r_186 A . PASS END=66599729;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2431749 TR:VR 99:32 31:0 chr2 196522601 r_291 T . PASS END=197004444;SVTYPE=DEL;SVLEN=-481843 TR:VR 54:7 25:0 chr6 156998281 r_359 C . PASS END=157196684;SVTYPE=DEL;SVLEN=-198403 TR:VR 79:7 33:0 chr10 53298644 r_51 T . PASS END=77779195;SVTYPE=DUP;SVLEN=24480551 TR:VR 102:16 32:0 chr12 64788307 r_187_0 C ]chr8:122064651]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_187_1 TR:VR 141:52 29:0 chr8 122064651 r_187_1 T T[chr12:64788307[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_187_0 TR:VR 141:52 29:0 chr2 196992888 r_292 T . PASS END=197016367;SVTYPE=DUP;SVLEN=23479 TR:VR 58:5 29:0 chr6 72152743 i_997 A . PASS END=72152743;SVTYPE=INS;SVINSLEN=144;SVINSSEQ=TATATATATGTATATATATGGAATATATGTATATATATGTATATATATGGAATATATGTATATATATGTATATATATGGAATATATGTATATATGTATATATATGGAATATATGTGTATATATGTATATATATGGAATATATGT TR:VR 57:8 18:0 chr8 120633211 r_388 G . PASS END=120707128;SVTYPE=DUP;SVLEN=73917 TR:VR 248:20 25:0 chr10 53325582 r_52 T . PASS END=82976269;SVTYPE=DUP;SVLEN=29650687 TR:VR 202:44 23:0 chr12 64854091 r_188_0 T [chr8:126142302[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_188_1 TR:VR 228:15 36:0 chr8 126142302 r_188_1 T [chr12:64854091[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_188_0 TR:VR 228:15 36:0 chr17 55282951 i_415 T . PASS END=55282951;SVTYPE=INS;SVINSLEN=58;SVINSSEQ=TACTTCCTTAAAAAATGGTCTTCATGCCGAATGGAAACCACCAGATTCTCTCTGGTGT TR:VR 26:4 22:0 chr5 1333469 i_890 G . Too_low_VAF END=1333469;SVTYPE=INS;SVINSLEN=1284;SVINSSEQ=GGACTATTGTATACACACCAGATGATGAGGATAAGGGGGACTACTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGAGACTACTGTATACACACGGGATGAGGATGAGGGACTATTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGACTACTGTATGTACACCGGCTGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGCTGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTAGATACACGGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACGGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTACACACACGGGATGAGGATGAGGGACTATTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGAGACTACTGTATACACACGGGATGAGGATGAGGGACTATTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGACTACTGTATACACACACAGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACATTGGATGAGGATAAGGGGGGACTATTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGAGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGAGACTACTGTATACACACGGGATGAGGATGAGGGACTATTGTATACACACCAGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGGGACTACTGTATACACACCGGATGAGGATAAGGGGAGACTACTGTATACACACGGGATGAGGATGAG TR:VR 79:3 14:0 chr8 88237358 d_1155 A . PASS END=88237522;SVTYPE=DEL;SVLEN=-164 TR:VR 68:9 22:0 chrX 75655094 d_1290 C . PASS END=75655453;SVTYPE=DEL;SVLEN=-359 TR:VR 48:13 16:0 chr10 115131279 r_98_0 T T[chr13:76969462[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_98_1 TR:VR 46:4 33:0 chr13 76969462 r_98_1 T ]chr10:115131279]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_98_0 TR:VR 46:4 33:0 chr11 16629898 i_187 A . PASS END=16629908;SVTYPE=INS;SVINSLEN=115;SVINSSEQ=AGTCTCTGAGTATTGTTTTTATTTCTGTATTTCTATCAATTTCTATCTGTATTTCTATCCGTTTTCTCTGGATTTTCTAGTTTGTGGGCATAGAGGTGTTCGTAAAGTCTTTGAG TR:VR 34:4 20:0 chr12 65954969 d_227 T . Too_small_size END=65955008;SVTYPE=DEL;SVLEN=-39 TR:VR 113:84 14:0 chr13 70506161 r_227_0 G G]chr13:70510852] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_227_1 TR:VR 26:3 22:0 chr13 70510852 r_227_1 T T]chr13:70506161] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_227_0 TR:VR 26:3 22:0 chr17 56792454 i_416 T . PASS END=56792454;SVTYPE=INS;SVINSLEN=230;SVINSSEQ=GGTGATGGTGGCAGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATAAGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGGTGATGGTGGTAGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGATGGTGGTGGTGGTGATGGATGGTGGT TR:VR 31:3 18:0 chr3 134936173 r_332 G . PASS END=135150717;SVTYPE=DEL;SVLEN=-214544 TR:VR 51:18 40:0 chr5 37788434 i_928 T . Too_small_size END=37788434;SVTYPE=INS;SVINSLEN=40;SVINSSEQ=AATGTGTGAATTACCTCCCTGTATTTCCCCTCCACAACCA TR:VR 96:8 14:0 chr8 91203860 d_1156 C . PASS END=91209296;SVTYPE=DEL;SVLEN=-5436 TR:VR 81:20 20:0 chr10 115143677 r_99_0 T [chr10:115144160[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_99_1 TR:VR 61:33 17:0 chr10 115144160 r_99_1 T [chr10:115143677[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_99_0 TR:VR 61:33 17:0 chr10 54187251 r_53 A . PASS END=62815052;SVTYPE=DUP;SVLEN=8627801 TR:VR 125:42 27:0 chr11 16631063 i_188 G . PASS END=16631076;SVTYPE=INS;SVINSLEN=339;SVINSSEQ=ATGTGTTTAGATCACTCATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGCTTGGCTCACTGCAAGCTCTACCTCCCAGGTTCTGGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCCCGCCAGCATGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTTGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCAAGGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGACTGGCCAGATCA TR:VR 34:4 21:0 chr12 66253162 r_189_0 T ]chr13:30266905]G . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_189_1 TR:VR 121:4 28:0 chr13 30266905 r_189_1 G G[chr12:66253162[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_189_0 TR:VR 121:4 28:0 chr13 79187408 d_247 C . PASS END=79187483;SVTYPE=DEL;SVLEN=-75 TR:VR 39:19 15:0 chr17 58267995 r_264_0 G ]chr8:96290673]G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_264_1 TR:VR 111:25 32:0 chr8 96290673 r_264_1 G G[chr17:58267995[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_264_0 TR:VR 111:25 32:0 chr19 55944780 d_600 T . PASS END=55945721;SVTYPE=DEL;SVLEN=-941 TR:VR 26:14 12:0 chrUn_GL000216v2 162442 i_1234 T . PASS END=162464;SVTYPE=INS;SVINSLEN=606;SVINSSEQ=AGACTAAAGTTACAGCACCTATGGAGATCAGTGCAGAGATATGTCACAATGTCCCCTGTAGGCAAAGCCTAGGCAAGAGATGCATCACATGAGTGATCATTGAAGAGATATGTCACAATGTCCCCTGTAGGCAAAGCCTAGGCAAGAGTTGCATCACCTGGGTGATCAGTGCAGATATATGTCCAATGTTCCCTGTAGGCAAAGCCTAGGCAAGAGTTACATCACCTTTGTCATCAGTTCAGGGATATGTGGAAACGCCCCTGTAGGCAGAGCTTGGACAATGGTTACACCACCTAGTTTATCAGTGCAGAGATATTTCACAATAACCTCTGTAGGCAGTTCCTAGTCAAGAGTTGAATCACCTGGGTGATCAGTGCAGATCTCTACATTTCACAATGCCCCGTTGGACAGAGGGTAGACAAGAGTGACATCACCTAGGTGATCAGTGCAGAGATTTGTCAAAATTCCCTGTAGGCAGTGATTATAAAAGTGTTACATCACCTAAGTGATCAGTGCAGAGATATGTCACAAAGCTCCTTTAGGCCGAACTTAGATGTGTTACATCCTGGGTGATCAGTGCAAAGGTATGTCACAAAGCCCCCGGTA TR:VR 78:6 37:0 chr10 115144188 r_100_0 C CTGTCGCAATTTCAAAACTTTTAAAGATGTAAGTACAAATA[chr13:91898062[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_100_1;SVINSLEN=40;SVINSSEQ=TGTCGCAATTTCAAAACTTTTAAAGATGTAAGTACAAATA TR:VR 96:33 30:0 chr13 91898062 r_100_1 T ]chr10:115144188]TATTTGTACTTACATCTTTAAAAGTTTTGAAATTGCGACAT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_100_0;SVINSLEN=40;SVINSSEQ=TATTTGTACTTACATCTTTAAAAGTTTTGAAATTGCGACA TR:VR 96:33 30:0 chr10 133658691 r_156_0 G G]chr13:38333533] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_156_1 TR:VR 106:27 26:0 chr13 38333533 r_156_1 A A]chr10:133658691] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_156_0 TR:VR 106:27 26:0 chr10 54189101 r_54 A . PASS END=78163070;SVTYPE=DEL;SVLEN=-23973969;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=G TR:VR 132:43 37:0 chr11 17272424 r_160_0 G [chr11:17273748[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_160_1 TR:VR 25:12 21:0 chr11 17273748 r_160_1 G [chr11:17272424[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_160_0 TR:VR 25:12 21:0 chr19 564419 d_568 C . PASS END=564580;SVTYPE=DEL;SVLEN=-161 TR:VR 34:7 16:0 chr20 28728979 r_315_0 C [chrUn_KI270442v1:41049[CTCCATTCCATTTGACTCCACTCCTCTCCACTCCACTCCATTCTATCCCATTCCTTTCAAATCCACTCCATTCCGTTGCACTCCTCTCCACTCCACTTCACTCCAATTGTCACCACTCCACTCCACTCCTTTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCTACTCCATTCCATTCCCTTCCATTCTGTTCCATTCCATTTCATTCCACTGCACTCCAAAT . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_315_1;SVINSLEN=217;SVINSSEQ=CTCCATTCCATTTGACTCCACTCCTCTCCACTCCACTCCATTCTATCCCATTCCTTTCAAATCCACTCCATTCCGTTGCACTCCTCTCCACTCCACTTCACTCCAATTGTCACCACTCCACTCCACTCCTTTCCATTCCATTCCATTCCATTCCATTCTACTCCATTCCATTCCCTTCCATTCTGTTCCATTCCATTTCATTCCACTGCACTCCAAA TR:VR 142:3 92:1 chrUn_KI270442v1 41049 r_315_1 T [chr20:28728979[TTTGGAGTGCAGTGGAATGAAATGGAATGGAACAGAATGGAAGGGAATGGAATGGAGTAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAAAGGAGTGGAGTGGAGTGGTGACAATTGGAGTGAAGTGGAGTGGAGAGGAGTGCAACGGAATGGAGTGGATTTGAAAGGAATGGGATAGAATGGAGTGGAGTGGAGAGGAGTGGAGTCAAATGGAATGGAGT . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_315_0;SVINSLEN=217;SVINSSEQ=TTTGGAGTGCAGTGGAATGAAATGGAATGGAACAGAATGGAAGGGAATGGAATGGAGTAGAATGGAATGGAATGGAATGGAATGGAAAGGAGTGGAGTGGAGTGGTGACAATTGGAGTGAAGTGGAGTGGAGAGGAGTGCAACGGAATGGAGTGGATTTGAAAGGAATGGGATAGAATGGAGTGGAGTGGAGAGGAGTGGAGTCAAATGGAATGGAG TR:VR 142:3 92:1 chr8 122360899 r_389_0 G G]chr8:122365314] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_389_1 TR:VR 150:62 26:0 chr8 122365314 r_389_1 A A]chr8:122360899] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_389_0 TR:VR 150:62 26:0 chr8 91568822 i_1141 T . Too_small_size END=91568822;SVTYPE=INS;SVINSLEN=42;SVINSSEQ=TACCTGTCTTACTATCTGCATGATTTTAAAAAATAATAATCT TR:VR 85:24 18:0 chrX 80397401 i_1339 C . PASS END=80397402;SVTYPE=INS;SVINSLEN=227;SVINSSEQ=CGGGCGGGGCGGCTGGCCGGGTGGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCCGGAAGGGGCGGCTGGCCAGGCGGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCCGGATGGGGCAGCTGGCCGGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCTGGGCGGAGGCGCCCCTCACCTCCCGGACAGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCCA TR:VR 47:3 17:0 chr10 115179349 r_101 C . PASS END=133618080;SVTYPE=DEL;SVLEN=-18438731 TR:VR 104:23 30:0 chr12 66599397 r_190_0 G G]chr12:66625915] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_190_1 TR:VR 146:18 41:0 chr12 66625915 r_190_1 G G]chr12:66599397] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_190_0 TR:VR 146:18 41:0 chr13 83175912 r_228 A . PASS END=94711864;SVTYPE=DEL;SVLEN=-11535952 TR:VR 61:4 27:0 chr17 67838359 i_417 A . PASS END=67838359;SVTYPE=INS;SVINSLEN=318;SVINSSEQ=ATTTTGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGTGGATTGCCTGAGCTCGAGAGTTGGAGACCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTAGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTAAACTCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGATATCATGCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTTCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTTTACA TR:VR 72:4 13:0 chr19 5747606 d_575 T . Too_small_size END=5747641;SVTYPE=DEL;SVLEN=-35 TR:VR 33:13 17:0 chr2 205373662 r_293 T . PASS END=205943846;SVTYPE=DEL;SVLEN=-570184 TR:VR 58:17 26:0 chr20 64011890 d_771 G . Too_small_size END=64011876;SVTYPE=INS;SVINSLEN=45;SVINSSEQ=ATACACCTACGAGAGGAGGACAGGAAGTCTCACGGCTTCTTTCTT TR:VR 41:9 16:0 chr8 9278191 r_367_0 C [chr8:9283675[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_367_1 TR:VR 74:45 26:0 chr8 9283675 r_367_1 C [chr8:9278191[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_367_0 TR:VR 74:45 26:0 chr10 115275430 r_102 T . PASS END=118040674;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2765244 TR:VR 38:6 40:0 chr12 66625674 r_191_0 C [chr8:122071151[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_191_1 TR:VR 117:9 39:0 chr8 122071151 r_191_1 A [chr12:66625674[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_191_0 TR:VR 117:9 39:0 chr13 83542640 r_229 G . PASS END=85043819;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1501179 TR:VR 67:7 26:0 chr16 89430439 d_470 A . Too_small_size END=89430404;SVTYPE=INS;SVINSLEN=7;SVINSSEQ=ACTCTTG TR:VR 21:3 15:0 chr17 67839534 i_418 T . PASS END=67839534;SVTYPE=INS;SVINSLEN=310;SVINSSEQ=GTTTGACTTTATTTATTTAGTTTTGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTTGCCCAGGGTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCAGCTCACCACAACCTCCGCTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGTCTCAGCCTCCTGAGTGGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACTACGCCTGGCTAATTTTTGGTATTTTCAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGACCTCAGGTAATCCGCCGGCCTCGGCCTCCCATGGTGCCGGGATTACAGGTGTGAGCCATCGCGCCCGGCCCG TR:VR 71:4 13:0 chr2 205867661 r_294 T . PASS END=212677466;SVTYPE=DUP;SVLEN=6809805 TR:VR 120:37 20:0 chr8 9282935 r_368 C . PASS END=9869953;SVTYPE=DEL;SVLEN=-587018 TR:VR 88:42 34:0 chr10 115414719 r_103_0 A [chr10:115422535[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_103_1 TR:VR 44:11 38:0 chr10 115422535 r_103_1 A [chr10:115414719[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_103_0 TR:VR 44:11 38:0 chr12 103571914 r_199 G . PASS END=105096233;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1524319 TR:VR 63:24 26:0 chr12 66625973 r_192_0 A [chr8:122360947[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_192_1 TR:VR 191:63 47:0 chr8 122360947 r_192_1 A [chr12:66625973[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_192_0 TR:VR 191:63 47:0 chr13 85945051 r_230_0 G [chr13:85945298[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_230_1 TR:VR 40:9 22:0 chr13 85945298 r_230_1 T [chr13:85945051[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_230_0 TR:VR 40:9 22:0 chr17 67839952 i_419 G . PASS END=67839952;SVTYPE=INS;SVINSLEN=328;SVINSSEQ=GGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCATGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGTGTAGCTGGGACTACAGGCGTCTACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATATTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCGAGGATGGTCTCGATATCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGACGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTCAAGTTTTTTTTT TR:VR 70:4 14:0 chr19 20642018 i_512 A . PASS END=20642018;SVTYPE=INS;SVINSLEN=323;SVINSSEQ=TTCATGGCCAGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATACCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAGAAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTGGGTGCCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCATGAACCCGGGAGGTGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATACACAT TR:VR 32:3 13:0 chr2 205943480 r_295_0 A A]chr2:235031916] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_295_1 TR:VR 64:29 34:0 chr2 235031916 r_295_1 G G]chr2:205943480] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_295_0 TR:VR 64:29 34:0 chr8 94927058 r_375_0 G G]chr8:96294219] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_375_1 TR:VR 120:15 23:0 chr8 96294219 r_375_1 C C]chr8:94927058] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_375_0 TR:VR 120:15 23:0 chr1 2652106 r_1_0 C [chr1:4050970[AAAATCTGACAGCATGGAACAAGACTACTGCCCCCAGGTGAGCATTTGACAGCCTGGGAAAGCACCCTCTACCCACACGTGAGCATCTGACAGCATGGAGCAGCACCCACAGCCCAAGGTGAGCATCTGATGGTT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_1_1;SVINSLEN=134;SVINSSEQ=AAAATCTGACAGCATGGAACAAGACTACTGCCCCCAGGTGAGCATTTGACAGCCTGGGAAAGCACCCTCTACCCACACGTGAGCATCTGACAGCATGGAGCAGCACCCACAGCCCAAGGTGAGCATCTGATGGT TR:VR 124:8 88:0 chr1 4050970 r_1_1 T [chr1:2652106[ACCATCAGATGCTCACCTTGGGCTGTGGGTGCTGCTCCATGCTGTCAGATGCTCACGTGTGGGTAGAGGGTGCTTTCCCAGGCTGTCAAATGCTCACCTGGGGGCAGTAGTCTTGTTCCATGCTGTCAGATTTTT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_1_0;SVINSLEN=134;SVINSSEQ=ACCATCAGATGCTCACCTTGGGCTGTGGGTGCTGCTCCATGCTGTCAGATGCTCACGTGTGGGTAGAGGGTGCTTTCCCAGGCTGTCAAATGCTCACCTGGGGGCAGTAGTCTTGTTCCATGCTGTCAGATTTT TR:VR 124:8 88:0 chr10 115415040 r_104_0 T T[chr13:83103842[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_104_1 TR:VR 56:13 49:0 chr13 83103842 r_104_1 C ]chr10:115415040]C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_104_0 TR:VR 56:13 49:0 chr12 66627833 r_193_0 G G[chr8:118015338[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_193_1 TR:VR 158:66 33:0 chr8 118015338 r_193_1 A ]chr12:66627833]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_193_0 TR:VR 158:66 33:0 chr13 87078208 r_231_0 G GCACAA]chr13:88051960] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_231_1;SVINSLEN=5;SVINSSEQ=CACAA TR:VR 64:20 23:0 chr13 88051960 r_231_1 T TTTGTG]chr13:87078208] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_231_0;SVINSLEN=5;SVINSSEQ=TTGTG TR:VR 64:20 23:0 chr5 651354 i_874 C . PASS END=651354;SVTYPE=INS;SVINSLEN=709;SVINSSEQ=TGGGTGGTGAGGTGTGACTGTGAGGCGTGGACTGAGGTGTGACTGTGAGGCGTGGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGGACTGTGAGGTGTGGACTGTGAGGGGTGACTGTGAGGCGTGGACTGTGAGGGGTGACTGTAGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACCACGAGGCATGGACTGTGAGATGGGATCTGTGAGGTATGTGACCATGGGGTGTGGGCTGTGAGGTATCAACCCTGAGTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGGGCTGTGAGGTGTGAATGTGAGGCGTGACTGTGAGGCGTGACTGTGGAGGCGTGGACTGTGAGGTGTGGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGGACTGTGAGGTGACTGTGAGGTGTGGACTGTGATGTGTGACTGTGAGGTGTGGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGCGTGGACTGTGAGGCATGACTGAGGCGTGACTGTGAGGCGTGACTGTGAGGCGTGGACTGTGAGGCGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGTGTGCCTGTGAGGCATGGACTGTGAGGCGTGGACTGTGAGGGGTGACTGTGAGGTGTGACTGTGAGGCGTGGACTGT TR:VR 58:7 15:0 chr6 90296862 d_1070 T . PASS END=90296913;SVTYPE=DEL;SVLEN=-51 TR:VR 34:16 21:0 chr8 94927391 r_376_0 T [chr8:110325555[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_376_1 TR:VR 124:14 24:0 chr8 110325555 r_376_1 A [chr8:94927391[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_376_0 TR:VR 124:14 24:0 chrX 156030364 i_1359 A . Too_low_VAF END=156030364;SVTYPE=INS;SVINSLEN=615;SVINSSEQ=GGGGTTAGGGGTTTAGGGTTTAGGGCCTAGGCCAGGGCTAGGCCAGGAGGCCAGGGCCAGGCGGCCAGGCTAGGCCAGGGCCAGGCAGGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGGCCAGGGCCAGGGCCAGGGGCCAGGCCAGCCAGGGCCAGCCAGGGCCAGGCCAGGGCCTCCAGGGCCAGGGCCAGGCAGGCCAGGCCAGGGCCAGGGCCAGGGCCAGGGCCGCGGGGCCAGGCCAGGGCCAGGGCCAGGGGCCAGGCCAGGCCAGGGCCAGGGGCCAGGGCCAGGCCAGGCCAGGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAAGGCCAGGCCAGGCCCTCCGGGGCCAGGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGGCCAGGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGCCAGGGCCAGGCCAGGGCCAGTTAGGGTTAGGGGTTAGGTTAGGGTTAGGGTTGAGGTTGGGGTAAGGGTTAGGGTTAGGGTTCGGGGTTGAGGTTAGGAGTTAGAGTTAAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTAGGGATTAAGGTTGTGAGAGTTGGGGTTGGGGTTGG TR:VR 237:9 192:1 chr10 115717430 r_105_0 C [chr10:116385931[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_105_1 TR:VR 82:10 32:0 chr10 116385931 r_105_1 T [chr10:115717430[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_105_0 TR:VR 82:10 32:0 chr10 13897935 r_29_0 T TAGCCGTGAAGT]chr8:127052817] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_29_1;SVINSLEN=11;SVINSSEQ=AGCCGTGAAGT TR:VR 162:22 34:0 chr8 127052817 r_29_1 C CACTTCACGGCT]chr10:13897935] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_29_0;SVINSLEN=11;SVINSSEQ=ACTTCACGGCT TR:VR 162:22 34:0 chr10 62813627 r_55_0 C [chr10:78162835[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_55_1 TR:VR 118:43 41:0 chr10 78162835 r_55_1 A [chr10:62813627[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_55_0 TR:VR 118:43 41:0 chr20 64132149 i_671 A . PASS END=64132149;SVTYPE=INS;SVINSLEN=274;SVINSSEQ=TAGAGACCCCCTCACTGTCAACTCTCATGTCCTATAGAGACCCCCTCACTGTCCACCCTCATGGCCTATAGAGACCCCCTCACTGTCCACCCTCAGTGTCCTATAGAGACCCCCTCACTGTCCACCCTCATGGCCTGTAGAGACCCCCTCACTGTCCACCCTCATGTCCTGTAGAGACCCCCTCACTGTCCACCCTCATGGCCTGTAGAGACCCCCTCACTGTCCACTCTCATGTCCTATAGAGACCCCCTCACTGTCCACCCTCATGGCCTGT TR:VR 41:3 16:0 chr10 116385928 r_106_0 T T[chr13:36975836[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_106_1 TR:VR 76:4 32:0 chr13 36975836 r_106_1 C ]chr10:116385928]C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_106_0 TR:VR 76:4 32:0 chr10 24008354 r_30 G . PASS END=26814488;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2806134 TR:VR 62:21 24:0 chr13 88048260 r_232 T . PASS END=93746126;SVTYPE=DUP;SVLEN=5697866 TR:VR 78:20 34:0 chr16 1191811 i_355 G . PASS END=1191814;SVTYPE=INS;SVINSLEN=51;SVINSSEQ=TCTCTGACCCAGCAGGCTGGCCTGGCTGTGTGGCCTCAGGCACACTGGGCT TR:VR 27:4 10:0 chr20 28761952 d_733 C . PASS END=28762067;SVTYPE=INS;SVINSLEN=143;SVINSSEQ=TAATTGGAGATTCTACAGAAAGAGTGTTTCAAAACTGCTCAATCAAAAGGAAGCTTCAACTCTGTGAGATGAAGGCACACAGCACAAAGAAGTTTCTCAGAATGCTGTTGTCTAGTTTTTATGTGCAGATATTGCCTTTTCCA TR:VR 45:6 18:0 chr5 44438767 r_347 T . PASS END=44863576;SVTYPE=DUP;SVLEN=424809 TR:VR 205:35 33:0 chr6 165991002 r_360 T . PASS END=168054220;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2063218 TR:VR 36:8 41:0 chr8 95852919 r_377 C . PASS END=95956713;SVTYPE=DUP;SVLEN=103794 TR:VR 152:15 28:0 chr1 2656015 r_2 C . Too_low_VAF END=3781751;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1125736 TR:VR 163:4 110:0 chr10 117364435 r_107_0 T T]chr13:92244055] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_107_1 TR:VR 73:7 38:0 chr13 92244055 r_107_1 A A]chr10:117364435] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_107_0 TR:VR 73:7 38:0 chr10 63237238 r_56_0 A A]chr10:71498865] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_56_1 TR:VR 79:14 34:0 chr10 71498865 r_56_1 A A]chr10:63237238] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_56_0 TR:VR 79:14 34:0 chr12 105381597 r_200_0 T T]chr12:106861748] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_200_1 TR:VR 62:10 24:0 chr12 106861748 r_200_1 A A]chr12:105381597] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_200_0 TR:VR 62:10 24:0 chr13 99972637 r_233 G . PASS END=100150769;SVTYPE=DUP;SVLEN=178132 TR:VR 34:3 36:0 chr16_KI270728v1_random 603361 i_382 C . PASS END=603361;SVTYPE=INS;SVINSLEN=316;SVINSSEQ=CCAAATATACATTCACAGAAATGGACAAAAACAGTGTTTACAAGTTTTTGCATGTAAAGAGAGGTGTAACTGTGTGAGCGGAATGTATACATAACAAAGCAGTTTCTCAGAAAGCTTCTTTCTAGTATTTATCTGAAGATATTTCTTTTTTCACCATAGTCCTCAATGCACTCCTAAAAGTCCCTTTGCAGATTCTAAAATATACTGTTTCAAAACTGCTCACTGAAAAGAAAGGTTTAACTCTGAGGGATGAATGCACATATCACAAAGTGGTTTCTAGATAGTTTCCTTCTAGTTTTTATCCTGGGATATTTGC TR:VR 23:5 6:0 chr6 167098750 r_361_0 T T]chr6:167099101] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_361_1 TR:VR 18:15 17:0 chr6 167099101 r_361_1 T T]chr6:167098750] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_361_0 TR:VR 18:15 17:0 chr7 551749 i_1037 A . PASS END=551749;SVTYPE=INS;SVINSLEN=190;SVINSSEQ=CCCCCACCTCCCACCCAGGTCCTTCTCCAGAGCTACTGCCACCACCACGTCACCACCCAAACCCCCACCTCCCACCCAGGTCCTTCTCCAGAGCTACTGCCATCACCACGTCACCACCCAAACCCCCACCTCCCGCCCGGGTCCTTCCCGCAGAGGCACCCACTGCCACCACCACGTCACCACGCAAACC TR:VR 30:3 18:0 chr8 127267045 d_1172 T . PASS END=127267106;SVTYPE=DEL;SVLEN=-61 TR:VR 119:11 23:0 chr8 144125814 d_1183 C . Too_small_size END=144125845;SVTYPE=DEL;SVLEN=-31;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=A TR:VR 73:5 15:0 chr8 95867879 r_378_0 T TATAAATAAGTAAATAAATAAATGGGGGAGAATAGATAAA]chr8:97387164] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_378_1;SVINSLEN=39;SVINSSEQ=ATAAATAAGTAAATAAATAAATGGGGGAGAATAGATAAA TR:VR 170:18 37:0 chr8 97387164 r_378_1 A ATTTATCTATTCTCCCCCATTTATTTATTTACTTATTTAT]chr8:95867879] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_378_0;SVINSLEN=39;SVINSSEQ=TTTATCTATTCTCCCCCATTTATTTATTTACTTATTTAT TR:VR 170:18 37:0 chr10 120839327 r_108_0 T T[chr12:52531975[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_108_1 TR:VR 87:13 29:0 chr12 52531975 r_108_1 A ]chr10:120839327]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_108_0 TR:VR 87:13 29:0 chr10 2664734 r_26 C . PASS END=2735725;SVTYPE=DEL;SVLEN=-70991 TR:VR 44:5 38:0 chr12 106860297 r_201_0 G [chr12:109752007[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_201_1 TR:VR 51:9 32:0 chr12 109752007 r_201_1 C [chr12:106860297[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_201_0 TR:VR 51:9 32:0 chr12 72822611 d_231 T . PASS END=72822771;SVTYPE=DEL;SVLEN=-160 TR:VR 34:7 15:0 chr16_KI270728v1_random 607638 i_383 A . PASS END=607638;SVTYPE=INS;SVINSLEN=152;SVINSSEQ=AGAAAGGTAAAGTCTGTAAGATGAATGCACGCGTCACAAAGCAGTTTATCAGAAAGCTTCTTTCTAGTTTTTATGTGAAGATGATTTCTTGTTTCCACCATAGGCCTCAAAGCGCTCCCAAATATCCCTTTGCAGATAACTGCTGATTGAAA TR:VR 21:4 8:0 chr6 167098762 r_362 C . PASS END=170479394;SVTYPE=DUP;SVLEN=3380632 TR:VR 39:14 37:0 chr8 95867928 r_379 T . PASS END=96523830;SVTYPE=DUP;SVLEN=655902 TR:VR 175:15 31:0 chr10 121135377 r_109 C . PASS END=122878339;SVTYPE=DUP;SVLEN=1742962 TR:VR 99:81 37:0 chr10 68803375 d_161 C . Too_small_size END=68803417;SVTYPE=DEL;SVLEN=-42 TR:VR 34:5 21:0 chr12 75534056 d_232 C . Too_small_size END=75534095;SVTYPE=DEL;SVLEN=-39 TR:VR 32:9 15:0 chr17 75233832 r_265 T . PASS END=75267593;SVTYPE=DEL;SVLEN=-33761;SVINSLEN=11;SVINSSEQ=CAGGAGTTCAC TR:VR 84:9 28:0 chr2 210087143 r_296 C . PASS END=234639822;SVTYPE=DEL;SVLEN=-24552679 TR:VR 82:40 37:0 chr3 164118746 d_913 T . PASS END=164118803;SVTYPE=DEL;SVLEN=-57 TR:VR 34:8 14:0 chr8 96062937 r_380_0 C C]chr8:106145742] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_380_1 TR:VR 151:27 35:0 chr8 106145742 r_380_1 C C]chr8:96062937] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_380_0 TR:VR 151:27 35:0 chr10 121370604 r_110_0 G G]chr10:126140428] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_110_1 TR:VR 178:5 33:0 chr10 126140428 r_110_1 C C]chr10:121370604] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_110_0 TR:VR 178:5 33:0 chr11 25101793 r_161_0 T [chr2:193213246[C . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_161_1 TR:VR 93:3 40:0 chr2 193213246 r_161_1 C [chr11:25101793[C . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_161_0 TR:VR 93:3 40:0 chr12 121643673 r_203 C . PASS END=121730728;SVTYPE=DUP;SVLEN=87055 TR:VR 55:8 33:0 chr12 76825942 r_194 G . PASS END=87917098;SVTYPE=DUP;SVLEN=11091156 TR:VR 52:15 23:0 chr17 75321379 i_423 G . PASS END=75321379;SVTYPE=INS;SVINSLEN=108;SVINSSEQ=TTAGCCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCGACTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCACGAGCCACCGTGCCCAGCCGATTTATTTATTT TR:VR 84:35 13:0 chr19 21576087 r_269 A . Too_low_VAF END=22630314;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1054227;SVINSLEN=10;SVINSSEQ=GAATGCAGAA TR:VR 62:3 40:1 chr2 212677362 r_297 A . PASS END=232185756;SVTYPE=DUP;SVLEN=19508394 TR:VR 117:34 31:0 chr4 118048085 i_818 T . PASS END=118048085;SVTYPE=INS;SVINSLEN=427;SVINSSEQ=AAAAACAAAATTTCCCACATATACACCATGGAATACTATGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATATCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAAACCATCATTCTCAGTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGAGATCACATGGACCCAGGAAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTGGTGGGGTCGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACACATTAGTGGGTGCAGTGCACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA TR:VR 25:8 16:0 chr8 144557750 i_1200 T . PASS END=144557750;SVTYPE=INS;SVINSLEN=189;SVINSSEQ=TCAGAGGCAAAGGCTGAACCTTCATGGTATTCATAGAGGCAAAGCCTGAAACCTCATAGTATTCAGAGGCTAAAGGCTGAACCTTCATAGTATTCAGAGGCAAAGCCTGAACCTTCATAGTATTCAGAGGTTTAAAAGCCTGAACCTTCATAGTATTCAGAGGCAAAGCCTGAACCTTCATAGTATTCT TR:VR 52:5 19:0 chr10 121448090 r_111_0 A [chr10:124003968[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_111_1 TR:VR 212:86 26:0 chr10 124003968 r_111_1 C [chr10:121448090[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_111_0 TR:VR 212:86 26:0 chr12 77786938 r_195 T . PASS END=90508670;SVTYPE=DEL;SVLEN=-12721732 TR:VR 95:14 35:0 chr8 96270259 r_381_0 A [chr8:106107337[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_381_1 TR:VR 150:23 26:0 chr8 106107337 r_381_1 A [chr8:96270259[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_381_0 TR:VR 150:23 26:0 chrUn_KI270519v1 86922 i_1270 C . PASS END=86925;SVTYPE=INS;SVINSLEN=874;SVINSSEQ=TTCTTTGTAACATTTTCGTTCAACTCATTGTGGTGAAGATTTCTTTTAATTCAGCAGTTTTGAAACACACTTTTTGTAGAATCTGCAAGTGAATATTTGGAGTGCTTTGAGGCCTATTGTGGAAAAGGAAATATCTTCATATAAAAACTACACAGAAGCACTCTGAGAAACTTGTCTGTGATGAGTGCACTCAGCTCACAGAGTTGAAGGTATCTTTTGATTGAACAGTTTTGAAACTCTCTTATTTTTTTTTATTTTTTTCTCCAGTTTTTTGTTTTGTTTATTATACTTTAAGTTTTAGAGTACATGGACACAACATGTAGGTTAGTTACATATGTATACATGGGCCATGCTGGTGTGCTGCACCCATTAATTCATCATTTAGCATTAAGTATATCTCCTAATGCTATTCCTGCACCTTCTGCCCACAACACAACAGTCCCCAGAGTGTGATATTCCCCTTTGCTGTGTCCATGTTTTCTCGTTGTACAATTCCGACCTATGAGTGAAAAAAAAATGGGGTTTTTGTTTTTTGTCCTTGCGATAGTTTACTGAGAATGATGATTTCCAATTTCATCCATGTTCCTACAAAGGACATGAACTGATCAGTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATAGTGGTGTATGTGAAATATTTTCTTAATCCAGTCTACCACTGCTGGACATTTGATTGTTTCCAAGTCTTTGCTACTGTGAATAGTGCCAAATAAATATATGTCTGCATGTAGTCTTTGTAGCAGCATGATTTATAATTTTTGTAGAATCTGCAAGTGGATATTTGGAGCCCTTGAGGCCTACGGTGGAAAAGGAAACATCTTCACACAAAAACTATACAGAAGCATTCTGAGAAACTTCT TR:VR 59:7 35:1 chr10 27845235 d_141 A . PASS END=27847858;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2623 TR:VR 35:3 19:0 chr10 71498951 r_58_0 G [chr10:71503733[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_58_1 TR:VR 56:3 23:0 chr10 71503733 r_58_1 T [chr10:71498951[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_58_0 TR:VR 56:3 23:0 chr12 80924017 r_196_0 T [chr12:80925498[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_196_1 TR:VR 43:14 17:0 chr12 80925498 r_196_1 C [chr12:80924017[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_196_0 TR:VR 43:14 17:0 chr2 217635320 r_298_0 T T]chr2:223784716] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_298_1 TR:VR 143:19 45:0 chr2 223784716 r_298_1 T T]chr2:217635320] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_298_0 TR:VR 143:19 45:0 chr20 6784542 r_308_0 G [chr22:39776359[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_308_1 TR:VR 49:16 28:0 chr22 39776359 r_308_1 T [chr20:6784542[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_308_0 TR:VR 49:16 28:0 chr8 96293427 r_382_0 T [chr8:96294353[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_382_1 TR:VR 76:14 13:0 chr8 96294353 r_382_1 T [chr8:96293427[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_382_0 TR:VR 76:14 13:0 chr10 121623640 r_112_0 C [chr12:49992935[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_112_1 TR:VR 258:17 42:0 chr12 49992935 r_112_1 A [chr10:121623640[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_112_0 TR:VR 258:17 42:0 chr10 127740104 i_131 A . Too_low_VAF END=127740104;SVTYPE=INS;SVINSLEN=111;SVINSSEQ=TCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACATCTACACCCCACACC TR:VR 171:7 33:0 chr10 32046359 r_32_0 C ]chr3:146295728]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_32_1 TR:VR 108:31 37:0 chr3 146295728 r_32_1 T T[chr10:32046359[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_32_0 TR:VR 108:31 37:0 chr2 218218416 r_299 G . PASS END=223354606;SVTYPE=DUP;SVLEN=5136190 TR:VR 108:13 48:0 chr21 10085914 d_790 T . PASS END=10085987;SVTYPE=DEL;SVLEN=-73;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=A TR:VR 57:6 40:0 chrX 1588399 d_1274 C . Too_low_VAF END=1588408;SVTYPE=INS;SVINSLEN=92;SVINSSEQ=CCCTTCCTCCTCCCTCCCCCCTCCCTCTCCCCCTCCCTCTTCCCCCTCCCTCTCCCCCCTTCCCCTCCCCTCCCTCTCTTCCCCTCCCCTCT TR:VR 280:8 128:1 chrY 56838859 i_1385 A . Too_low_VAF END=56838859;SVTYPE=INS;SVINSLEN=858;SVINSSEQ=TAGGAAGCTTTACGACTTATCCCTGCATTGATCACTAGGTGATGTAACACTTGTCTAGGCTCTCTCTACACGGGAGTTTTCACCTATCTCTACACTGACCACCTAAGTGATGTAACCCTTGTCTAGTTGGAGCCTACTGGAGATTTCTGACATACCTATGCAAAGATCACCGAGGTGATGTAAATCATTTCCAGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGGGATCTAGGCTCACTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCGTTTTAGCCGGGATGGTCTCGATCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCCCATTTCCAGGCTTTTTGTACAGGGTACATTGTGATATATCTCTGCACTGATCACCCAAATAATGCAAATCTTCTCTAAGTTCCGCAGGGGAGGGGGCATTGTGACATATTTCTGAACTGATCATCCAGGAGATGTAACTATTCTCCAGGCTTTGACTAAAGAGCGTCGCAAGGTTTTGGGAGAGCCTCAGCCGGAATTTCTCAGACAGACAAGGGCACGGAGAGGCCAGCGGTCTCCTTCCACATCAGCCGGGGTGCGCAATGAGTGCAGGTCTAGCCAGGAGGCCAGCAAAGAGAGCTAGACGTGTGCGTTCCACCGCCAGGCTCTCCATGGTGGCAGCTGTGAGGGGCTGC TR:VR 349:13 205:1 chr1 2677700 i_11 A . Too_low_VAF END=2677700;SVTYPE=INS;SVINSLEN=1421;SVINSSEQ=GCATCTGACAGCCTGGAACAGCACCCACACCCCCAGGTGAGCATCTGACCGCATCGCATGGCATCCTCACCCCCAGTTGCGCATCTGATGGTCTGGAGCAGCACCCACACCCACAGGTGAGCATCAGACAGCCTGGAACCGCAGCCACACCCCCAGGCGAGCATCTGACAGCCTGAGCAGCATCCACACCCCCAGGTGAGCATTTGACAGCCTGGAACAGCACTCACACCCCCAGGAGAGCATCCGGCAGCCTGGAGCGGAACCCACGGCCACAGGCGAGCATCTGAGAGCCTGGGTCGGCACCCACACCCCCAGGTGAGCATCTGATGGTTTGCGGCAACACCGACACCCACAGGTGAGCATCTGACAGCCTGGAACAGAACCCACACGCCCAGGTGAGCATCTGACAGCCTGGAACAACAGCCTGCAGGCCACCAGGTGCGCATGTGACAGCCTGGAACAGCACCAACACCCCCAGGCGAGCATCTGACGGCCTGGAACAGCACCCACACCCCCAGGTGAGCATCAGGACAGCCTGGAACAACACCCATACCCACAGGTGAGTGATCCTGACATTGTGGAGCAGCACCCCACACCCACAGGTGAGCATCTGCGACAGCCTGGAGCAGCACCCACACCCCCAGGTGAGCATCTGACAGCCTGGAACAGCACCCTGCACTCCCAGGTGAGCATCCGGACAGCCTGGAGCAGCACCCACCACTCCCAGGCCAGCATCCGATAACCTGGAGCAGCACCCACAACCCCAAGTGAGCATCTGATTGTCTGGAGCAGCACCCACACAACCACAGGTGAGCATCGTAGGGTCTGGAGCAGTGCCCACAGCCCCACGCGAGCATCTGACAGCTCGGAGCAGTGACCACACCTCCAGGTGAGCATCTGACAACAGGGAGCAGCACCTGCAGCCCATGGTGAGCATCTTTGACAACCTGGAGCAGCAGGCCACACACCCAGGTGAGCATCTGATGATCTGGAGCAGCACCCACAACCACAGGTGAGCATCGGAGAGTCAGGAGCAGTGCCCACACACCCAGGCGATCATCTGACAGCCTGGAGCAGTGCCCACACCCGCAGGTGAGCATCTGACAGCGTGGAGCAGCACCCACAGCCCAAGGTGAGCATCTGACAACCTGGAGCAGCACCCACGCCCCCAGGCGAGCATCTGAACACACGGAGCAGCACCCACACCCCCAGGCGAGCATCCGACAGCCTGCAGCAGCACCCACACACCCAGGTGAGCAAACTGACAGCCTGGAGCAGCTGTTCCCACATACCCAGGTGATCATCTTGATAGCCTGGAACAGCACGCTGCTCCCCCAGTTGAGCATCTGACAGCCTGGAACAGCACACACACCCCCAGGCGAGCATCTGACAACCTGGAACAGCACCTATACGCCCAGATG TR:VR 141:3 113:1 chr10 121647342 r_113_0 T T]chr10:122316358] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_113_1 TR:VR 201:76 34:0 chr10 122316358 r_113_1 T T]chr10:121647342] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_113_0 TR:VR 201:76 34:0 chr10 32046530 r_33_0 A A]chr10:83626869] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_33_1 TR:VR 125:31 32:0 chr10 83626869 r_33_1 C C]chr10:32046530] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_33_0 TR:VR 125:31 32:0 chr11 36210988 r_162_0 T ]chr9:109842888]C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_162_1 TR:VR 70:6 31:0 chr9 109842888 r_162_1 C C[chr11:36210988[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_162_0 TR:VR 70:6 31:0 chr17 11351264 r_262_0 A ACAAGAATTTCAAATTCTGTAACACAAGAATTTCAAATTC]chr17:11397622] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_262_1;SVINSLEN=39;SVINSSEQ=CAAGAATTTCAAATTCTGTAACACAAGAATTTCAAATTC TR:VR 50:5 31:0 chr17 11397622 r_262_1 A AGAATTTGAAATTCTTGTGTTACAGAATTTGAAATTCTTG]chr17:11351264] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_262_0;SVINSLEN=39;SVINSSEQ=GAATTTGAAATTCTTGTGTTACAGAATTTGAAATTCTTG TR:VR 50:5 31:0 chr7 105014214 r_365 G . PASS END=105066779;SVTYPE=DEL;SVLEN=-52565;SVINSLEN=4;SVINSSEQ=TTCC TR:VR 57:7 13:0 chr8 97393769 r_383_0 A [chr8:97394487[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_383_1 TR:VR 77:19 18:0 chr8 97394487 r_383_1 A [chr8:97393769[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_383_0 TR:VR 77:19 18:0 chr10 121647374 r_114_0 T [chr10:126077249[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_114_1 TR:VR 307:16 27:0 chr10 126077249 r_114_1 A [chr10:121647374[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_114_0 TR:VR 307:16 27:0 chr10 128609106 r_150_0 A [chr10:129911289[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_150_1 TR:VR 83:7 34:0 chr10 129911289 r_150_1 G [chr10:128609106[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_150_0 TR:VR 83:7 34:0 chr17 11370813 r_263_0 G [chr17:11397607[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_263_1 TR:VR 54:5 31:0 chr17 11397607 r_263_1 A [chr17:11370813[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_263_0 TR:VR 54:5 31:0 chr19 24124404 i_515 T . PASS END=24124404;SVTYPE=INS;SVINSLEN=59;SVINSSEQ=AAAAATATTCTAAGGAATAATTCTAAGGAAATAAATAGAATAAAGAATTTTAAGGAAGT TR:VR 34:3 18:0 chr2 90399578 d_665 T . Too_low_VAF END=90399691;SVTYPE=INS;SVINSLEN=224;SVINSSEQ=AATCATTGAATGGAATCAAATGGAATCATCAATGAATGTAATCGAATGGAGTTATCGATTGGAGTCTGTTGGAATCGTCATCGAATGGAACCGAATGCAGTCATCATTGAATGGAATCGGATGGAATTATCGAATGGACTAGAATGGAGTCATCATTGAATGGAATCGAATGGAATCATCAAATAGACTCAAAAGCAATCAACGAATGGACTCAAATGGAGTCA TR:VR 485:3 243:1 chr21 10750498 d_791 C . PASS END=10750507;SVTYPE=INS;SVINSLEN=142;SVINSSEQ=CCAGAGACGAACATTTCCGTTGATGGACCAGTTTTGAAACATTCTTTCTGTAGAATCTGCAAGTGGACATTTCAAGTGCCTTGAGGCCTGTGGTGGAAAAGGAAATATCTTCACATAAAAACTAGACAGAAGAATTCTGAGA TR:VR 169:11 124:0 chr5 166022 d_967 T . Too_low_VAF END=166191;SVTYPE=DEL;SVLEN=-169;SVINSLEN=29;SVINSSEQ=AATGCTCTGACGGGGCGGAGCTCACACTA TR:VR 61:3 20:0 chr10 121648206 r_115_0 A A]chr10:129782170] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_115_1 TR:VR 157:17 30:0 chr10 129782170 r_115_1 T T]chr10:121648206] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_115_0 TR:VR 157:17 30:0 chr12 83393746 d_233 A . PASS END=83393824;SVTYPE=DEL;SVLEN=-78;SVINSLEN=20;SVINSSEQ=TATCTCTATATAAAGCATAT TR:VR 46:4 6:0 chr19 245992 r_268_0 C CCTAACCCTAAACGCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCAACCCCAACCCCAACCCCAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAAG]chr21:46699347] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_268_1;SVINSLEN=151;SVINSSEQ=CTAACCCTAAACGCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAACCCCAACCCCAACCCCAACCCCAACCCTAACCCTAACCCTAACCCTAAG TR:VR 141:3 114:0 chr21 46699347 r_268_1 C CCTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGCGTTTAGGGTTAG]chr19:245992] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_268_0;SVINSLEN=151;SVINSSEQ=CTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTGGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGCGTTTAGGGTTAG TR:VR 141:3 114:0 chr2 220329387 i_631 C . Too_low_VAF END=220329387;SVTYPE=INS;SVINSLEN=191;SVINSSEQ=TATTACTTGTCTTGGATGCCTGTGCTTGTGAAGTATTGCTCAAGAAATTTTTGCCCAGACCAGTGTCCTGAAGAGTTTCTTTTAGGAGTTTTCTCTTAGAAGGTCCACGGTTTTGAGGTGTAAATTTAAGTCTTTAATCCATTTTGATTTGATTTTTGTGTATGACAAGGGATAGGGGTCTAGTTTGATTC TR:VR 75:3 11:0 chr22 49029646 r_325_0 A [chr4:185239775[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_325_1 TR:VR 53:5 36:1 chr4 185239775 r_325_1 T [chr22:49029646[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_325_0 TR:VR 53:5 36:1 chr8 97525354 d_1159 T . PASS END=97526500;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1146 TR:VR 87:18 20:0 chr1 146690049 d_107 A . PASS END=146690265;SVTYPE=DEL;SVLEN=-216 TR:VR 32:7 23:0 chr10 122795902 r_116_0 C [chr10:122850348[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_116_1 TR:VR 74:58 34:0 chr10 122850348 r_116_1 C [chr10:122795902[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_116_0 TR:VR 74:58 34:0 chr12 131435616 i_252 C . PASS END=131435616;SVTYPE=INS;SVINSLEN=234;SVINSSEQ=GGGATTGAACGTTAGACCCAGGTGGCATCGCCTGCAGAATGCCTTGCTGGGATTGGCTGGGATTGAACGTTAGACTCAGGTGGCATTGCCTGCAGAATGCCTTGCGGGGATTGGCTGGGATTGAACGTTAGACTCAGGTGGCATCACCTGCAGAATGCCTTGCGGGGATTGGCCGGGATTGAACGTTAGACTCAGGTGGCATCGCCTGCAGAATGCCTTGCTGGGATTGGCTGG TR:VR 19:3 12:0 chr12 86175775 r_197_0 C C[chr2:176813937[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_197_1 TR:VR 70:12 49:0 chr2 176813937 r_197_1 A ]chr12:86175775]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_197_0 TR:VR 70:12 49:0 chr2 220333511 i_632 C . PASS END=220333529;SVTYPE=INS;SVINSLEN=70;SVINSSEQ=CCTATGTCTTTCTCTACCTCCTGTTTGCCTCCCTGTTTACCTTCCTCCCTCTTACTCCATCCATGCCTCT TR:VR 60:4 11:0 chr5 1663688 d_998 T . Too_low_VAF END=1663986;SVTYPE=DEL;SVLEN=-298;SVINSLEN=31;SVINSSEQ=GGACGGAGGGGTCCTTCTGGTGAGGGCGGCG TR:VR 88:3 17:0 chrUn_KI270538v1 75010 i_1274 A . Too_low_VAF END=75010;SVTYPE=INS;SVINSLEN=341;SVINSSEQ=AGAAAGGTTCGAGTCCGTGAGTTGAACGCACACAACAGAAAGCAGTTTCTGAGGATGCTTCTGTCTGGTTTGTATGTGAAGTCATTTCCTTTTCCATCTAAATCGCCTCAAATCGCTAAAAGATCCACTCGCAGATACTACAAAAAGACTCTCAAAACTGCTCTCTCAAAAGGAAGGTTCAACTGTGTGAGTTGAATGCACACATCACATAGCAGTTTCTGAGAACGCTTCTGTCTAGTTTGCATGTGAAGAGATTCCATTTACAACGAATTCCTCAAAGAGCTCCAATTATCCACAAGCAGAGTCTACAAAAGCAGTGTTTTGAAACTGCTCTATCAATA TR:VR 213:3 75:0 chr10 122809235 r_117 G . PASS END=122941228;SVTYPE=DEL;SVLEN=-131993 TR:VR 106:60 35:0 chr10 130154474 r_152_0 C C[chr8:55796361[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_152_1 TR:VR 93:7 38:0 chr8 55796361 r_152_1 T ]chr10:130154474]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_152_0 TR:VR 93:7 38:0 chr10 76262123 d_162 C . PASS END=76264101;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1978 TR:VR 60:6 20:0 chr12 88700216 r_198_0 C ]chr3:32945865]TGCTCAGCTGATTAAATTTTTTAAATGGTCAGCCAGGCGCAGTGGCTTACACCTGTACTCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTGG . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_198_1;SVINSLEN=181;SVINSSEQ=TGCTCAGCTGATTAAATTTTTTAAATGGTCAGCCAGGCGCAGTGGCTTACACCTGTACTCCCAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCGGGCAGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAGGCATGGTGGTG TR:VR 71:3 42:0 chr3 32945865 r_198_1 G GCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGTACAGGTGTAAGCCACTGCGCCTGGCTGACCATTTAAAAAATTTAATCAGCTGAGCA[chr12:88700216[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_198_0;SVINSLEN=181;SVINSSEQ=CACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTCCCGACCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCCGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGTACAGGTGTAAGCCACTGCGCCTGGCTGACCATTTAAAAAATTTAATCAGCTGAGCA TR:VR 71:3 42:0 chr2 89791256 d_629 T . PASS END=89791365;SVTYPE=INS;SVINSLEN=297;SVINSSEQ=TTGTCAATTCGATGATTCCATTTGGTTCCATTTGATGATGATACCATTGGATTCCATTCGTTGATGATTCCGTTCGATTCCATTCGATGATGATCCCATTCTATTCCATTCGATGATGATTCTATTCGATGATGCTTCCATTACATTTCATTCGGTGATGATTTTATTCGAGTCCATTTGTTGATTCCTTCGATTCCATTCGATGATGATTCCAATTGAATCCATTCTATTATTCCATTCAAGTCCATACGATGAATCCATTAGATCCCAATCGATGATTCCATTAGATTCCATTCA TR:VR 69:20 34:1 chr10 122887159 r_118_0 G [chr10:126734805[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_118_1 TR:VR 86:27 29:0 chr10 126734805 r_118_1 C [chr10:122887159[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_118_0 TR:VR 86:27 29:0 chr10 130378886 r_153_0 A ]chr12:52484463]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_153_1 TR:VR 107:8 38:0 chr12 52484463 r_153_1 A A[chr10:130378886[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_153_0 TR:VR 107:8 38:0 chr11 384880 i_175 G . PASS END=384894;SVTYPE=INS;SVINSLEN=258;SVINSSEQ=GGCAAGACCCACTCCCAGGCCTGGAACCCCCACAGCCGGGCAAGACCCACTCCAGGCCTGGAACCCCCACAGCCGGGCAAGACCCACTCCCAGGCCTGGAACCCCCACAGCCGGGCAAGACCCACTCCCAGGCCTGGAACCTCCCCACAGCCGGGCAAGACCCACTCCCAGGCCTGGAACCCCCACAGCCGGGCAAGACCCACTCCCAGGCCTGGAACCCCCACAGCCGGGCAAGAAGACCCACTCCCAGGCCTGGAA TR:VR 19:8 16:0 chr2 220746667 r_300 C . PASS END=220749211;SVTYPE=DEL;SVLEN=-2544 TR:VR 62:4 24:0 chr2 91506143 d_667 G . Too_low_VAF END=91506203;SVTYPE=DEL;SVLEN=-60 TR:VR 135:6 89:1 chr10 39381252 d_143 T . PASS END=39381363;SVTYPE=INS;SVINSLEN=111;SVINSSEQ=GCAGATTCTAGAAAAAGACCGTTTCCAAACTGCTCAATGAAAAGAAAGGTTCAATTCTGTGAGCTGAATGCACACATCACAAAGGAGTTTCTCAGAAAGCTTGTGTCTAGT TR:VR 50:5 15:0 chr10 76570706 r_59 A . PASS END=90401468;SVTYPE=DUP;SVLEN=13830762 TR:VR 96:22 31:0 chr12 132728320 r_204_0 C ]chr6:75917322]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_204_1 TR:VR 64:16 42:0 chr6 75917322 r_204_1 T T[chr12:132728320[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_204_0 TR:VR 64:16 42:0 chr16 33336915 d_439 C . Too_low_VAF END=33336942;SVTYPE=INS;SVINSLEN=124;SVINSSEQ=CTTTGCTGGCTGGGTGGCATGGCTGGCCTGGCTGGCTGGCAGGCATGGCTGGCTGGCTGGCTTGGCTGGGTGGCTTGGCTGGCTGGCCGGCTGGCTGTGGCTTGGCTGGCTGGCTGGCTGGCTT TR:VR 119:3 75:0 chr17 81426451 i_428 T . PASS END=81426451;SVTYPE=INS;SVINSLEN=61;SVINSSEQ=AGTGGTGGGTGATGTGGTTGGTGGTGATAGTCGTGGGTGATGTGGTTGGGGGTGATAGTGG TR:VR 52:4 17:0 chr19 27362177 i_516 T . Too_low_VAF END=27362177;SVTYPE=INS;SVINSLEN=104;SVINSSEQ=GTTTCCAAAGTGCTCAATCTAAAGCAAAGGTTCAACTCTGTGAGATGAATGCACACATCACAAAGAAGTTTCTCAGAATGCTTCTGTCTAGTTTTTATATGAAG TR:VR 203:5 46:1 chr22 10719191 d_806 T . Too_low_VAF END=10719458;SVTYPE=DEL;SVLEN=-267;SVINSLEN=232;SVINSSEQ=CCTTTCGAGTCCATTCAGTTCCATTCCATAACATTTGAGTCCATTCCATTCCATTACATTCCATTGCATTAAATTCGAGTCCATTCCATTCCATTTCATTCGAGTCCCTTTCATTCCGTTCCATTCAATTCGAGTCCATTCCTTACCATTACATTCCGTTCGATTTGAGTCCATTCCATTCCATTCCATTCGAATCCATTCCACTCTATTCCATTCGAGTCAAATCCATTCC TR:VR 116:3 74:0 chr6 170479083 r_363_0 T [chr6:170479419[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_363_1 TR:VR 35:14 21:0 chr6 170479419 r_363_1 C [chr6:170479083[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_363_0 TR:VR 35:14 21:0 chrX 16968984 i_1323 G . PASS END=16968984;SVTYPE=INS;SVINSLEN=424;SVINSSEQ=CTGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCAGGCAGAGGCGCCCCTCACCTCCTGGATGGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCCACCTCCCTCCCAGACGGGGCGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGCGGCCGGCCGGGCAGAGGGGCTCCTCACTTCCCAGTAGGGGCGGCCGGGCAGAGGCGCCCCTCACCTCCCGGATGGGGTGGCTGGCCGGGCGGGGGGCTGACCCCCCACCTCCCTCCCGGACGGGGTGGCTGCTGGGCGGAGACGTTCCTCACTTCCCAGACGGGATGGCTGCCGGGCGGAGGGGCTCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGCCGGGCGGAGGGGCCCCTCACTTCTCAGACGGGGCGGCTGCTGGCC TR:VR 48:3 12:0 chr1 3768514 r_3 T . PASS END=5360772;SVTYPE=DUP;SVLEN=1592258 TR:VR 45:12 42:0 chr10 76586984 r_60_0 C C]chr8:127499941] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_60_1 TR:VR 179:13 32:0 chr8 127499941 r_60_1 T T]chr10:76586984] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_60_0 TR:VR 179:13 32:0 chr12 163337 i_222 C . PASS END=163337;SVTYPE=INS;SVINSLEN=248;SVINSSEQ=CTCCCTCCACAGAACCGGAGCCCTCCCTCCCCTCTCCCTCCACAGAACCGGACCCCCTCCCCTCTCCTCCCTCCACAGAACCGGACCCCTCCCCTCCCCTCCCTCCACAGAACCGGACCCCCCTCCCCCTCCCTCCCTCCACAGAACCGGACCCCTCCCCTCCTCCTCCACAGAACCGGACCCCTCCCCCCTCCCTCCACAGAACCCCCTCCCCTCCCTCCACAGAACCGGACCCCCTCCCTCTCCCC TR:VR 32:7 13:0 chr1 3781676 r_4_0 G G]chr19:48931689] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_4_1 TR:VR 61:10 30:0 chr19 48931689 r_4_1 C C]chr1:3781676] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_4_0 TR:VR 61:10 30:0 chr10 123352442 r_119 C . PASS END=124799497;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1447055 TR:VR 220:12 23:0 chr10 77076336 r_61 A . PASS END=105031714;SVTYPE=DEL;SVLEN=-27955378 TR:VR 109:19 37:0 chr11 41143001 r_163 T . PASS END=41720979;SVTYPE=DUP;SVLEN=577978 TR:VR 123:12 31:0 chr4 180805111 r_341 T . PASS END=180904870;SVTYPE=DEL;SVLEN=-99759;SVINSLEN=3;SVINSSEQ=TAA TR:VR 22:16 30:0 chrX 95601208 d_1293 G . PASS END=95601740;SVTYPE=DEL;SVLEN=-532 TR:VR 47:7 19:0 chr1 3799114 r_5_0 C C[chr19:49262129[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_5_1 TR:VR 48:6 33:0 chr19 49262129 r_5_1 T ]chr1:3799114]T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_5_0 TR:VR 48:6 33:0 chr10 123467839 r_120 A . PASS END=124427443;SVTYPE=DEL;SVLEN=-959604 TR:VR 174:18 27:0 chr10 77625620 r_62 G . PASS END=96961858;SVTYPE=DUP;SVLEN=19336238 TR:VR 108:23 26:0 chr11 43786178 r_164 G . PASS END=44472278;SVTYPE=DEL;SVLEN=-686100 TR:VR 95:6 32:0 chr12 26225084 r_172 T . PASS END=27894191;SVTYPE=DUP;SVLEN=1669107 TR:VR 73:14 33:0 chr2 223351178 r_301_0 T [chr2:227628760[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_301_1 TR:VR 99:9 36:0 chr2 227628760 r_301_1 G [chr2:223351178[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_301_0 TR:VR 99:9 36:0 chr5 84855 i_856 C . PASS END=84855;SVTYPE=INS;SVINSLEN=759;SVINSSEQ=GGGTGGTCAGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCAGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCCTCGATGAGAGGCCGGGCGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCAGGGTGGTCGGGGAAGGCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGAAGCCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCAGGGTGGTCGGGGAAGGCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCAGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCCCTCGATGGGAGGCAGGGTGGTCGGGGGAAGGCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCAGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGGCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGTCGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGAGAGGCCGGGGTGGTCGGGGAAGGCTCGATGGGAGGCCGGGTGGTCGGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCAGGGGGTGGTCGGGGAAGCCTCGATGGGAGGCAG TR:VR 76:14 20:0 chrUn_KI270538v1 87694 i_1276 C . Too_low_VAF END=87694;SVTYPE=INS;SVINSLEN=179;SVINSSEQ=AGATACTACAAAAATACCGTTTCAACACTGCTCTCTCCAATGCTCTATGGAAGGTTCAACTCTGTGAGTTGAATGCACACATCACAAAGCAGTTCCTGAGAATGCTTCTGTCTAGTTTGTATGTGAAGATATTTCCTTTTCCATCATAGGCCTCTAATCGCTCCAAATATCCACTTGGA TR:VR 158:4 58:1 chr1 3799152 r_6_0 T [chr1:6816279[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_6_1 TR:VR 56:8 31:0 chr1 6816279 r_6_1 A [chr1:3799152[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_6_0 TR:VR 56:8 31:0 chr10 123962798 r_121_0 T T]chr12:57914441] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_121_1 TR:VR 111:12 40:0 chr12 57914441 r_121_1 T T]chr10:123962798] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_121_0 TR:VR 111:12 40:0 chr10 77633218 r_63_0 G [chr8:123935853[T . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_63_1 TR:VR 187:4 30:0 chr8 123935853 r_63_1 T [chr10:77633218[T . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_63_0 TR:VR 187:4 30:0 chr11 46613107 r_165 G . PASS END=134746406;SVTYPE=DEL;SVLEN=-88133299 TR:VR 80:6 36:0 chr2 223360183 r_302 A . PASS END=227363983;SVTYPE=DUP;SVLEN=4003800 TR:VR 112:17 33:0 chr7 137332155 i_1076 T . PASS END=137332155;SVTYPE=INS;SVINSLEN=433;SVINSSEQ=AAAAAGCAGGACACCGAGAATGATGGTTTCCAATTTCATCCATGTCCCTACAAAGGATATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTAATCCAGTCTATCATTGTTGGACATTTGGGTTGGTTCCAAGTCTGTGCTATTGTGAATAGTGCCGCAATAAACATACGAGGGGAATATCACACTCTGGGGACTGTGGTGGGGTCGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAGATGACACATTAGTGGGTGCAGTGCACCAGCATGGCACATGTATACATATGTAACTAACCTGCACAATGTGCACATGTACCCTAAAACTTAGAGTATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA TR:VR 35:4 17:0 chr1 3802717 r_7_0 G [chr1:5358962[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_7_1 TR:VR 58:12 40:0 chr1 5358962 r_7_1 T [chr1:3802717[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_7_0 TR:VR 58:12 40:0 chr10 124004279 r_122_0 A A]chr10:124135554] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_122_1 TR:VR 197:86 40:0 chr10 124135554 r_122_1 G G]chr10:124004279] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_122_0 TR:VR 197:86 40:0 chr1 3825111 r_8_0 A A]chr1:3956091] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_8_1 TR:VR 58:18 39:0 chr1 3956091 r_8_1 G G]chr1:3825111] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_8_0 TR:VR 58:18 39:0 chr10 124014785 r_123_0 C [chr10:124015697[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_123_1 TR:VR 104:33 17:0 chr10 124015697 r_123_1 C [chr10:124014785[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_123_0 TR:VR 104:33 17:0 chr10 131824354 i_137 C . PASS END=131824363;SVTYPE=INS;SVINSLEN=182;SVINSSEQ=ACCCCCACAGGAGACGCAGGCACCAGATAGGGAGTCCGCCTACACCCCCACAGGAGACGCAGGCACCCAGATGGGGAGTCACCTGCACCCCCCACAGGAGACGCAGGCCCCAGATAGGGAGTCACCTGCACCCCCACACAGGAGACGCAGGCCCCAGATAGAGAGTCCACCTGCACCCCCAC TR:VR 58:11 13:0 chr10 78439155 r_64 G . PASS END=83361046;SVTYPE=DEL;SVLEN=-4921891 TR:VR 211:39 41:0 chrUn_KI270742v1 40700 d_1253 C . Too_small_size;Too_low_VAF END=40743;SVTYPE=DEL;SVLEN=-43 TR:VR 142:4 81:0 chr10 78492759 r_65 G . PASS END=83044404;SVTYPE=DUP;SVLEN=4551645 TR:VR 194:44 34:0 chr2 116720758 i_616 T . PASS END=116720764;SVTYPE=INS;SVINSLEN=87;SVINSSEQ=CGCCCAAGACATGCAAGGACAAGCAAAACAAAATCTAACTGTCAGGACCCCATCATGAATTGGCTGTCCAACTGGCATTGGCGTTGG TR:VR 26:4 18:0 chr2 229372713 r_303_0 A A]chr2:229925058] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_303_1 TR:VR 75:34 28:0 chr2 229925058 r_303_1 C C]chr2:229372713] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_303_0 TR:VR 75:34 28:0 chr7 142526560 i_1078 C . PASS END=142526560;SVTYPE=INS;SVINSLEN=76;SVINSSEQ=TACAGAGCTAAGATGGACTTAGTGTGTTGGCAGTTTGCAAAATCTGGGCCATTTGGTCATTTTCTTCAGTGACTTT TR:VR 39:9 22:0 chr1 4058230 r_9 G . PASS END=5333584;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1275354 TR:VR 55:8 41:0 chr10 124137971 r_124_0 A [chr8:96503537[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_124_1 TR:VR 125:14 35:0 chr8 96503537 r_124_1 A [chr10:124137971[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_124_0 TR:VR 125:14 35:0 chr10 78777956 i_95 C . PASS END=78777990;SVTYPE=INS;SVINSLEN=5594;SVINSSEQ=CAGCAGGAAGGCTTGAAACTCCTCTCTTATTCTGGCACATCCTCTGCCGCATCCCTGAAACTTGGCCATCGGCACTGGTGCTGCCTTCCGGGGCTGTGCAGAGCCAGTCTGCCATTTGTCAGAGATTGGAGAGCAATGTTATGTCCCCAAGTCTTCTCTTTTGCAGGTCAAATGTCTCCAGTTCCTTTCATCCAAAATGTCCTGCTTTGCATGGCTCTGAATCCTCTAACTTTGCAGGGGAGAGTGAGAAGACAAAAGGCTAGGAGAGGAGCTAGGAGTATGGCTACCACCTTCCAGGAGAGCTGCCAGGGCCCAGATGGGGGCATAGCACCCAGGAGGAGAGGAGGAGGCAGGGCAACCACGGCAAACGGTGACTTGAACCCCCTTCCCAACCCCCCTCATCCTGGATGTTCGTGGAACCCTCCCTGTGTCCTTCAAAGAGAGATCAGAGATACAAAGCTGCACTTAAGCCACTCAGAGCCAAGCATGGGTGAACAGCACCTTGCCTAGCAGCCTACCTGGTAACACAGGGAAACTGCTGATGTTCCCTGAAATTGTAGGGTGGGGCTCTAGGGCTTGATAATACCACTTTCTGAGGTGTCACCTGCACCTGTCAAGGGCGACAGGTATTTTCTTTCTTGAAGAAGAGCTCTCATGCCATGATGATTCAGCTTTGCTGAGTAACTCTCAAATCTCTCAACGTGGCCAGTTCAGGTAGGGTAGCTAACGTGACCCTCTAGTGACACCACCCTCCCTGCGGTGGACATCAGGCGTCAGACTGTCAGAAGCACCTGATCCACAACGGTAAGCCTGCCCTCACAGAGCATTGAACTTGCCATCCTTGCAGATCTTCCTTACCTCCTGAACAATCAGAAAGGCAGAGGAAAGAAAAGGTAGAAGGAGAACTGGATTTGGAGTCTGGAGTAGAACTTACATCATCTTCCCTGTGATTTGGGGCAATTTGATTATCATCTCCAAAACTCCTTTGTTTGGGAAATGAGGTTAATGGTGTATGACTCACAAAGTCTCTGAAAGGACTAAATGACATGGTGTTTGGCAAAGTGCCAAGCATCAGTATATAGTAGGTGCTCAATAAATGTTAATGGAAAAGAGATCTGCTTTCAGATGTAGAGAAACAGGACATCTGGATATCAGACTGATATCCACTTGTGGATGATCTATTAGTAAGAGGATGGGTCTATGATCTGGGAGCAGAAGCAGAAGGTGTGTTATTTTGATTAAGAGTCTTCCATGCCTGCTCTGAAATCTCTGGCCTTGAGCTTGCTGTCTGGCTGCAAGCATCAACGTGCCTAGGACAGCTGCATTGAAGGTCAACACAAAGAAGAAAGAAGCATGATCTCACCATTAAGTACCCCATTCTGCCCACCCATGTCTTCCTCTTGACAGAACAGAGCCATTAGAGGACTACTAGGTTCAACTCTAAATTTGACCCTAAGGGAGGTAACAAATTAACCCACTATCCCCCATTAACTCTCCTGCATGGCTTCATTTATCAAGACAAGCTGCTGCTTTGGAGAGATGAGAACCAGAAACAGGACCCAGAGGGGGTTTCATGATCCTAGTTCTGAGCTCGCACCCTCGTTGTTCTGGAATATAGGAAGGAGGGAGGGGACTTTCAACTGCCTGTACTGTCTAGGTGCTTTGTGCCATCTCATTTAATGCCCGTAATCAGCCTGTGAATCAGATAGCACTATCTCCATTTGGCAATGAAGGAACTTCAAAGAAAAAGTAAGTTGCCTGAGGTCACTGTCAGATTGGGACAAAAACCCAAGTCTGGCTCCAAAGCCCGTGCTCCTAGCTCCTAACCCTCCTCTGGGGTTTGCTACCTGCAGACATTAAGTGAAGCACTATGCAGTCATTACTTCATTTAACCCTCACAACAACTTTATAAATAGATATCACTATCGCCGTTTTTCAGGAGATTGAATCTCCAATTTCTTAAAGGCCTTGTTCAAGGTCACACAGGAGATAGGTTGTGGAGCCAGGTTTTGAGCCCGTTTGTCCATCTTCAGAGCCTCAAGAAGCATTGTTACATTAAGCTTTTTTGCTTAAAATTAATTCATTTATCCATGAAACATTTCTATATGGGCAGGGCTCTGTGTTAGACACTTAGGGTTACAGAGATGGCTACTCCAAGGTCCCTGCCCTTAGAAGTCTCTTCCATCTTTCCATCCTCAGCTCGACCTCCTCTGGCCTCTGTTGGGAGAAGCCCTGGCCACATTGGCTCCCATCTTTTCTATAACTTCACATGGTGTCCAATGTCCAGAGCCCTGCAGGGGTGTCTGAAGAGACAGGAAGGACAACCTGTAGGAGCTGCCCATGGAGGGAACAGGAGTCCAGGACTTTCATTTCTGTCTCAGCAGGTCCCTCACTTGTTCCATGTGCTATCTGTCACCCCACTGGCAACTCCCATCTTTCTGTGAAATTAATATAACACAGGACAGGCTGGGTTGTGCCATGACAAGTGATCTCAAACTCGGTAACTGATTGCAACGAGGCATTTTTTTTCTCATGGTACATATGCAAAGGTGGTCAGCAAGAGAGCCCTGCTCCCCAGAGTCACCCAAGGATGTAGAATGAGGCCATCCCCATCTGGTACCTGTTTCCATGTACTGGCTCTTAGAGACACCTGCCCAGGGGGACACATGTCATCTCTGCTCACATGCCACTGGCCAAAGCAAGTCACCTGGCCTGAGTAAATTCAAAGTGGGCTGTAGGTGCCATCATCCTAGCCTGGCAGGAGAGGGGAATCCGAATATTCATAAACAGCCCCAGTGACCACCACAAAAGATGACCACAAAAAATATAATGAAACCCAAGCAAGTTTATTAAATTATTGCCGCGGAAGATTCTGAGCCTGAGAGCTCCTCTGCCTCTTCGTTCACAAAGGAGATAAGCAAGCTTTAGAGATGTGTTAAAAATGTATTAGCTCCTTAGTGAAACTTTCTATTTCATTCATCATATTTAGCAAATATTTATTGAGAGTCTTCCATGTGCCAGGCACTCCTAAGCATATCAGACAAACCAGTGAATAGAAGTCCCCACAGTGAGTGAATAAAACAGACAAAAATCCCTGCCCTATGGGAGCTTACATTTCAGAGGGGGAGACAAATATTGAACAGTAGATATGAAAAATAAATAAATTATACACTGGTAATATGTAGTTACAGACACACTGATAGAGAATGGAAAATGCGCTGACTTTCTCCTGTGGGAGTCGGCCTTGTTGGAGGCACCAGCCATTCCCTCGGGCTCCTCACGACTACGTCTCCTGCAGCGGGAGCCTCGCTGCTAACCCCTTGCTCTTTTGTCTCCTGCCCTTCTTCTAAATGAGAAGGTAGCTGAGGTCTCTCTGCGTTCAGCAGGAGCCACAAGGAAGGAGTCCTCTCGCTTTGCCCAGGTCACCTCCTTCTGTCCATCACTGCTGGCTTGTTTATTCCCTCACTGGCTCACATAGCTATCGCAGGGCCCAAGCACTCCTGCTGTTGGAGGACTTGCCCCTCATCATATTGGAATATGACATTGCACCTGCATCTCACTGTAAGTATACAATTTATAAATAACTATGTTAGACTTGACTTGTGGTGCCCTTTTGACATACTAATGACTAGGTAAAATTTACTGGGGATTTTGCGTGTGTGAGGCATGATCCTGGGTCCTTTATGTGTATACCTGATTTCCTTTAATCGTTGCAACAGCCCACACTGTTGGACTTGTCTGTATTTCCATCTCACAGGGGTGGCAGTCCAGGCTCACTTAAGCTCAGCCCTTGCCCAGGTCATACGATGTGGGAGCAGGAAGGAGAGGAGAGCAGGGCAGCCCCTGCCTATCACGGCCTCTGCTCTTTGTCTCATTACAAAACCACCTTCCTATTTGGGAGCCATTTAATTAAATATTTATTCATTTTTGAGTTTGTGGTATTCTTTTCTAATTTGGAGCATGTGTGTGTGTTTCCATGTCTCAAAGATGTGCATAGACTCTATGGTGCCAAATGTAGGAAACAGCCCTGCTTCCTCGCTAAACAGACATCTATCACATGGGAAACCAGTGCCCTCATCCAGAGCTGGTGGGAGAAGCGAAGAAGGTGCCACTTCAGGGAGGACAATTTGGGAGAATGGGTTTATGAATTAAAACACGTTTACTTTTGAACTCAATGGTTCCACCTCTAGAAGACAGGATTTCACAGGTGCTCAAAGATATGGATACCGGGATGTTCACTGTAACATTGTTTATATTATTAATAGCATTAAAAAGCTGAAAACTACCCCATACTCAATAGGAGGGGATTGTTTACATAAATCTTGTGCGTGTGTGCATGAAATGTTAGCCAAGCATTTCGGTGGGTGATTATGAACGGCATCTGGTGGGAAACAGTAGTTGCAGAGCATTTTGTGTTGTGTTCATCCATTTGTGTAAAAGCATCTATGCACATATATTACAAATAACTGCTTATATGGGTATAGAATACTTGAGAAGGATATATAAGAAACTGTGATGATGGCCATCTCTGAGAAGGAAGAGAGGGATTGGGGGGTTACTCACTCTTGTTTGTGTATCTTCACAAGTGCTTTGAGTATTTTTACACATGCATGTGTTATATTGACAGTTGGCAGTTGTTAGATACTCTCTGCACTACTGTATAAATAAATGGACTTAATCCACACGACTATGGTACAGGCTGCAGTACCATCCCCATCTTACAGATGATATAGCTGAGGCACAGAGAGGTTAAGTAGCTTGCTCAAGGCCACTTGGCTTGGAAGTGCTGGTAAGGGGGATTTTTGGCTGGGCAGTCTGGCCCCAGGACCTGAGCCCTCAACCTCCACGATGTTAAAGAGAAAAGGAGAGCAAGCAAGCCCCTTAGATGGGCCTGGTGCAGCTCCCCCTTCCTCCTCTCCCAGAGGGACCATCTTCTCTTCTAGCCAGAGTCTTTGCCAACCCTCTCTGCTAGTTTCTTTGCCTCTAGCTGAAAATGAGCCAAGTCCTCCTACAGCCTAGGAAGCTGTGTGAGGCAGAGACAGTGCTGTGCATTCACGAAGCTATTTCTTTGTCCAGAGCACTGGATTAGAGCACGTTTTCAGTGCTCACAGCCCTAGCAGTGGTCAGACGCCTAAAGCTTGCCATGGAAATTTAGCAGGAGTGAGATGCTACTTCCTGTCCAAGGCAATGATGAGCAGGTGGTCCTTCTCCATGTTTCCCCCTTTCTGTGGAGCTAGAGGTCAAGGTGTCTGAGATGCAGGACTGCCAGGTGGGAGTAGCCTGGGTCCCCAAGTCACCACTTGTGGAAGGACCATGCACAACCACTGCCAGGCCTTCCTCACACAATGACAGGAGCCAGGTGCAGCTCTGTTGGGTTACACCGCTGAGATTTGGGGGTTTCTCGATGGCATTGTCTACCCTCTCCTTAGGGCCCAGGCCTCATCCTTGTCTGTTATTTTTTAACTCACAAATTCTTAAAGAAGATACAGACCCCGGAGACATAGGCTTCAAAGGTGCTTGTCACTTGCTGTCGGGACTTGCCCTCACCTCTCCTGGGCTTGCTCAGCCACAGTGGCCTCTAATGGGCAGAGTCA TR:VR 116:25 17:0 chr2 229527710 r_304_0 A [chr2:229923913[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_304_1 TR:VR 73:34 39:0 chr2 229923913 r_304_1 C [chr2:229527710[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_304_0 TR:VR 73:34 39:0 chrY 56840886 i_1396 G . Too_low_VAF END=56840886;SVTYPE=INS;SVINSLEN=492;SVINSSEQ=TTGGTGGTGGGGGCCGGAGAGATGAAGAGGAAGGGGGCGAGGGGAAGGGGTGAGGGCGGCGCGTTTTGGGGGCTTGGCTCTCCGGACATCTCCAGGAATCCCGCGGGAACTGGAAGCCGCTTCTCTGGCTCCCACGCGTCTTCAGCAGGGAGAAACCAGCCTGGAGTGTGGAGGAGAGTGTGGAACAACCTCCATGGGAGTCTGGAGTGTTTCAGACCCTCTCTCCGTGAAGGAGGCAATGCCTGTGGGTGTCGGGCTGGTTGCCGGGACAGTTCTCAGCTCCACACGTGCAGGCGTGTGGCTCTCATTCGCTTCCACGTATAAGACCAGAGCGAAACCCCAGACAGAAGATGCCTCCCCCGGCGTGATGGCCTGACGATGGATTCCCCAGGTGCGGCAACATGGGGGAGTCTGCAGAGGCCGGTTTGGTAACTGGGTGAGACCGAAGTGACCACCATATCGGACTCCACTCTTCACCCAGCATATTTTAAG TR:VR 186:3 112:0 chr1 4058248 r_10 G . PASS END=5353343;SVTYPE=DUP;SVLEN=1295095 TR:VR 52:3 39:0 chr2 229541809 r_305 A . PASS END=229900840;SVTYPE=DEL;SVLEN=-359031 TR:VR 67:25 37:0 chr21 16290386 d_798 T . PASS END=16291541;SVTYPE=DEL;SVLEN=-1155 TR:VR 37:5 15:0 chr9 135625338 r_398 T . PASS END=135747714;SVTYPE=DEL;SVLEN=-122376 TR:VR 36:17 40:0 chr10 124437962 r_125_0 T T]chr10:124438273] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_125_1 TR:VR 118:23 19:0 chr10 124438273 r_125_1 A A]chr10:124437962] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_125_0 TR:VR 118:23 19:0 chr6 31429056 d_1060 A . Too_small_size;Too_low_VAF END=31429093;SVTYPE=DEL;SVLEN=-37 TR:VR 107:3 34:1 chr10 124437964 r_126_0 A [chr10:124438273[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_126_1 TR:VR 118:22 19:0 chr10 124438273 r_126_1 A [chr10:124437964[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_126_0 TR:VR 118:22 19:0 chr13 30206185 r_205 G . PASS END=30229124;SVTYPE=DEL;SVLEN=-22939 TR:VR 34:20 29:0 chr18 13505739 d_546 A . Too_small_size END=13505784;SVTYPE=DEL;SVLEN=-45 TR:VR 22:16 11:0 chr7 151603590 i_1080 C . PASS END=151603590;SVTYPE=INS;SVINSLEN=94;SVINSSEQ=ACACGGAGGCACCCGCTCCGTCCTCACCGCACACGGAGGGACACGCTCCGTCCCCCACCGCACACGGAGGGACACGCTCCGTCCTCACCGCATA TR:VR 42:9 11:0 chr7 76498915 i_1069 G . PASS END=76498915;SVTYPE=INS;SVINSLEN=1125;SVINSSEQ=AGGTGTGTGGAGGTGTGGGGTGTATGGAGGTGGGTGTGTGGGGTGTATGGAGGTGTGGAGGTGTGTGGAGGGGTGAGGTGTGTAGGGTGTGTAGAAGTGTGTGGGGTGTGTGAGGTGGGTGTGTGAGGTGTGGGGGTGTGAGGTGTGTGGAGGTGTGGGGTGTGTGGAGCTGTGTGGGGTGTATGGAGGTGTAGGGTGTGGAGGTGTGTGTATGTGGAGGTGTGGGGTGTGTGGAGGTGTGGGATGTGTGGGGTGTGTGGAGGTGTGGTGTGTGGAGCTGTGTGGGGTGTGTGGAGGTGTAGGGTGTGTGGAGGTGTGGGGGTGTGAAGGTGTGGGGTGTGTGGAGGTGTGGGGTGTGTGGGTGTGGAGATGTGTGAGGTGTGGAGGTGTGAGGTGTGTGGTGTGTGGAGGTGTGGAGTGTGGGGTCTGTGAAGGTGTGAGGGGTGTGTGGAGGTGTGGGAGTTGTGTGGGGGTGTGTGTGGGGTGTGTGTGTGGAGGTTGGTGTGTGGAGGTGTGTGGTATGTGGAGGTGTGGGGGATGTGTGGGGTGTGTAGAGGTGAGGGTGTGTGGTGGTGTGTGGAGGTGTGGGGTGTGTGGGGTGTGGAGATGTGTGGGGTGTGGAGGTGTGAGGTGTGTGGAGGCTGTGTAGAGGTGTGGGAGGTGTGGAAGTGAGGTGTGTGGGGTGTGGGTGTGGAGTTGGGTGTGTGGAGGTGGGGGGTGTGGGTGGATTGGGGTGTGTGGTGTGTGTACGGTGAGGTGTCGGGTGTGTTTAGGTGTGGGTGTGTGTGGGGGTGTGGGGTGTGTAGGTGTGTCTGTGTGTGTGGGGGTGTGGGTGTGTGGAGGTGTGGAGGGTGTGTGGAGGTGTGGTGGTATGTGGGGGTGTGTGGAGGTGTGGGGTGTGGGTGTTGTGTGGGGTGTGTGGGGTGTGTGGAGTGTGTGGAGGTGGGGGTGTGTGGTGGTGTGTGGAGTGTGTGGGGTGTGTGGGTGGAGTTGTGTGGTGGTGTGTGGGTTGTGTGGTGTGGGTGTGGGGGTGTGTGGGGAGTGTGGGTGTGTGGGGGTGGGTGTGTGGGTGTGATTGGTGGGGTGTGTGGAGGTGTGCAGTGTGTGTAGGTGTGTGGGTGTCTA TR:VR 29:4 12:0 chr8 140337918 r_393 C . PASS END=140441704;SVTYPE=DEL;SVLEN=-103786 TR:VR 118:10 31:0 chr1 205855797 i_49 A . PASS END=205855798;SVTYPE=INS;SVINSLEN=275;SVINSSEQ=GAAAACTTTGGCCAAGGCGGGCAGATCACCTCAGGTTGGGAGTTCGAGACTAGCCTAACATGGAGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGCATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTAAGGTGGAAGAATTGCTTGAACACGGGAGAAGGAGGTTGTGGTGAGCCAAGATCTTGCCATTGCACTCCAGCCTGGACAACAAGAGTGAAATTCCATCTCCAAAAAAAGTAAAAATTAAAAAAAAAAAGAGG TR:VR 41:3 18:0 chr1 4555336 i_14 C . PASS END=4555391;SVTYPE=INS;SVINSLEN=105;SVINSSEQ=AGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAATTGGAGACCAGCCTGGACAACAAAGTGAGACCTTTTCTGTACAAAAAATTGCTGGGCATG TR:VR 28:8 21:0 chr15 100554454 i_346 C . PASS END=100554454;SVTYPE=INS;SVINSLEN=58;SVINSSEQ=CGGACGCAGATGAGGGACGGGCGGATGACTTCCTTCGGGACGCAGATGAGGGACGGGC TR:VR 26:4 11:0 chr7 152872581 i_1081 A . PASS END=152872581;SVTYPE=INS;SVINSLEN=128;SVINSSEQ=GTGGCCGGCAGGAGGGCGGTCAGGTGGCTGGGTGCAGGAGGGGCGGTCTGGTGGCCACGCAGGAGGAGGGCGGTCAGGTGGCTATGCAGGAGGGGCAGTCCGGTGGCTGGGCAGGAGGGGTGGTCTGG TR:VR 43:4 22:0 chr9 137328783 i_1223 T . PASS END=137328783;SVTYPE=INS;SVINSLEN=706;SVINSSEQ=GCACAGGGTCACACGGGACTACACGGGACTACACGGGGCTACACGGGGCTACACGGGGCTACACGGGAACTACACGGGAGCTACACGGGACTACACGGGGCTGCAGACGGGACTACACGGGGCTACACGGGGCTGCGGGACACGGGAGCTACACGGGACCACACGGGGCTACACGGGGCTACACGGGAGCTACACGGGGCTACACGCGGGGCTGCCGGGGAGCTGCGGGAGCTACACGGGGCTACACGGGGCTGCACGGGAGCTGCACGGAGCCCTGCGGGGCACACGGGACTACACGGGACTACACGGGGCTGCACGGGGCTGCACGGGAGCTACGCGGGGTCGCGGGAGCTGCAGAGGGGGAGCTACTGCGGGGCTACACGGGACTGCACGCGGGGGACTGCACGCGGGGCTACACGGGGCTGCACGGGAGCTACACGGGAGCTACACGGGGCTACACGGGAGCTGCACGGGAGCTACACGGGGCTACACGGGACCTGCACGGGACTACACAGGGTCACACAGGACTACACGGGACTGCAGGGGACTTGCACGGGGTCACCCGCCGGGACTACACGGGGACTACACGGGACTACACGGGACTACACGGAGGTCACACAGGACTGCACGGGACTACACGGGACTACACGGGGTCACACGGGACTACACGGGACTACACGGGGCTACACGGGACTGCACGGAGTCA TR:VR 30:6 9:0 chr13 31962024 r_206 A . PASS END=58251579;SVTYPE=DUP;SVLEN=26289555;SVINSLEN=17;SVINSSEQ=TCCCATCCATGTATTTT TR:VR 102:29 36:0 chr6 32585449 i_977 A . PASS END=32585449;SVTYPE=INS;SVINSLEN=314;SVINSSEQ=CACAGGATTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAAACTCCGCCTCCTGGGTTCACCCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCACCCACGACCAAGCCCGGCTAATTTTTTTCTGTATTTTTAGAAGAGACGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCCACCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCTTGAGCCACCGCGCCCGGCC TR:VR 20:3 12:0 chrY 56842802 i_1398 G . Too_low_VAF END=56842802;SVTYPE=INS;SVINSLEN=809;SVINSSEQ=TATGGGCTTTGCCTACAGAAGGCTTTGTGAAATATCTCATCCAGCCTGTGGACTGCGGCAGGTGCAGCCAGGAGGCCTGCCCGGACAGCCAGCCAGCGGCTATTATGAAGGCCTGCAGGCAGGCAGGCTCCACCCCTTCATGAATGGCGGTGAGCCCTGGGACAGCACGCCCCACCCCGGAAGGGTCCCAGGGCGTCGAGGCCTGCGGCTGTGGGGTGGTTGTGTTGGGGGGGAGGGGGTGTGGTGATGGCGGTGGTGGGGCTGGAGATACGAAGATGAAGGGGGCGAGGGGGAAGTGGTGAGAGGGGGCGCGATGTCGGGGGCTGGCTCTGCCGACCTCTTCAGGAATCAGGCGGGAACTGGAAGCTGCTCTCTGGGCTCCCACGCGTCTTCAGCAGGGAGAAACCGGCCTGGGAGGGTGGAGGGGAGTGTGGGACTGAATCTCCGTGGGAGTCTGCTGTGTTCCAGGCCCTCTCTCCGTGAAGGTGGCAGTGCCTGTGGGTGTCGCCGTTGCCGGGACAGTGTCACAGGGGCAGGCGTGTGGCTCTCGTTCATTTCCACGTAGGAGACCAGAGCGAGACCCCAGAGAGAAGATGCCTCCCCAGCGTGATGGACTGATGATGGATTCCCGTGTGCGGCAACATGGGGAGTCTTCGGTGTGGCAGTTTTGGAAACTGGCAAGGAGAGCGAAGGCACAATGCCAGTCTTCCACCTTGCCTGCATGTTTCCGGGTGCCCGCAGAGCTCCGGGGAGCAAACAGTCAGCATGACACATCTCTGAACTGATCAACAAAGTGATGTTACTTTTCT TR:VR 186:3 112:0 chr13 32124744 r_207_0 T T]chr13:58076405] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_207_1 TR:VR 83:21 29:0 chr13 58076405 r_207_1 A A]chr13:32124744] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_207_0 TR:VR 83:21 29:0 chr15 100554719 i_348 G . PASS END=100554719;SVTYPE=INS;SVINSLEN=826;SVINSSEQ=ACGAGGCGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGCGGATGACTTCCTTCAGGACGCAGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGATTCCTTCAGGACGCAGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCGGGACGCCGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCCGGACGCAGATGAGGGATGGGCGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGCGGATGACTTCCTTCAGGACGCAGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCCGGACGCAGATGAGGGATGGGCGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGATTCCTTCAGGACGCAGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCGGGACGCCGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCCGGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGATTCCTTCAGGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGACTTCCTTCGGGACGCCGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCCGGACGCAGATGAGGGATGGGCGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGACTTCCTTCCAGACGCAGATGAGGGACGGGTGGATGATTCCTTCAGGACGCAGATGAGGAACGGGTGGATGACTTCCTTCGGGACGCCGATGAGGAA TR:VR 26:3 10:0 chr5 10517243 d_1003 A . Too_small_size END=10517285;SVTYPE=DEL;SVLEN=-42 TR:VR 82:20 16:0 chr8 140526721 r_394 A . PASS END=140903383;SVTYPE=DEL;SVLEN=-376662 TR:VR 112:13 35:0 chr10 132572095 r_155_0 T [chr10:132572573[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_155_1 TR:VR 54:8 17:0 chr10 132572573 r_155_1 G [chr10:132572095[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_155_0 TR:VR 54:8 17:0 chr10 82837600 r_68_0 A [chr10:82839194[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_68_1 TR:VR 118:81 12:0 chr10 82839194 r_68_1 T [chr10:82837600[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_68_0 TR:VR 118:81 12:0 chr13 32124916 r_208 G . PASS END=32390813;SVTYPE=DUP;SVLEN=265897 TR:VR 70:15 34:0 chr6 34845840 r_351_0 A ATATTA]chr6:34934820] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_351_1;SVINSLEN=5;SVINSSEQ=TATTA TR:VR 76:10 33:0 chr6 34934820 r_351_1 A ATAATA]chr6:34845840] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_351_0;SVINSLEN=5;SVINSSEQ=TAATA TR:VR 76:10 33:0 chr10 124535251 r_127_0 G [chr10:124536475[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_127_1 TR:VR 130:7 23:0 chr10 124536475 r_127_1 A [chr10:124535251[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_127_0 TR:VR 130:7 23:0 chr10 82959501 r_69_0 G G]chr10:83485018] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_69_1 TR:VR 319:37 33:0 chr10 83485018 r_69_1 A A]chr10:82959501] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_69_0 TR:VR 319:37 33:0 chr13 32150889 r_209 C . PASS END=58446918;SVTYPE=DEL;SVLEN=-26296029 TR:VR 64:18 36:0 chr6 34928704 r_352_0 A [chr6:34954839[TT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_352_1;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=T TR:VR 81:9 30:0 chr6 34954839 r_352_1 T [chr6:34928704[AT . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_352_0;SVINSLEN=1;SVINSSEQ=A TR:VR 81:9 30:0 chr10 83092542 r_70_0 A [chr10:83139474[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_70_1 TR:VR 189:24 31:0 chr10 83139474 r_70_1 A [chr10:83092542[A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_70_0 TR:VR 189:24 31:0 chr13 32350079 r_210_0 G [chr13:58153312[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_210_1 TR:VR 74:19 31:0 chr13 58153312 r_210_1 G [chr13:32350079[G . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_210_0 TR:VR 74:19 31:0 chr2 146263358 r_281_0 G G[chr4:15846102[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_281_1 TR:VR 60:3 39:1 chr4 15846102 r_281_1 C ]chr2:146263358]C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_281_0 TR:VR 60:3 39:1 chr10 124742831 r_128_0 G [chr10:124814353[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_128_1 TR:VR 262:14 32:0 chr10 124814353 r_128_1 T [chr10:124742831[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_128_0 TR:VR 262:14 32:0 chr10 83625982 r_71_0 G G[chr3:146295534[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_71_1 TR:VR 109:4 41:0 chr3 146295534 r_71_1 A ]chr10:83625982]A . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_71_0 TR:VR 109:4 41:0 chr13 32352814 r_211 T . PASS END=81290955;SVTYPE=DEL;SVLEN=-48938141 TR:VR 72:19 38:0 chr15 101949445 r_257_0 C C[chr3:10801[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_257_1 TR:VR 294:3 297:0 chr3 10801 r_257_1 A ]chr15:101949445]A . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_257_0 TR:VR 294:3 297:0 chr18 36235973 r_267 G . PASS END=36348795;SVTYPE=DEL;SVLEN=-112822 TR:VR 40:7 45:0 chr2 148884392 r_282 A . PASS END=148907756;SVTYPE=DEL;SVLEN=-23364 TR:VR 40:9 33:0 chr5 1082648 i_878 T . Too_low_VAF END=1082648;SVTYPE=INS;SVINSLEN=494;SVINSSEQ=CGGGTTCTGGGGAAGTCCGGGCTTCCCGTCTCAGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCGCGTCTCGGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCTCTCTAGGGTTCTGGAAAGCCTGGGCTTCCTCTCTAGGGTTCTGGAAAGGCCGGGCTTCCGCGTCTCGGGTTCTGGAAAGCCTGGGCTTCCTCCTCTCTAGGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCCGTCTCGGGTTCTGGAAAGTCCAGGCTTCCCGTCTCGGGCCCTGGGAAAGCCTGGGCTTCCCATCTTGGGTTCTGGAAAGCCTGGGCTTCCTCTCTCTAGGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCCCCGTCCTCGGGCCCTGGGGAAGTCCGGGCTTCCCGTCCCAGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCTGTCTCGGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCTCTCTAGGGTTCTGGAAAGCCTGGGCTTCCTCTCTAGGGTTCTGGAAAGTCCGGGCTTCCCGTGCC TR:VR 76:3 21:0 chr6 374080 r_349_0 T ]chrUn_KI270466v1:965]GTATATAATATACAGTTTGGGTACTTTGACATTTTATATATGCTGTATATAATATGTAGTTTGAGTACTTTGATACTTTATGTACAGTGA . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_349_1;SVINSLEN=89;SVINSSEQ=GTATATAATATACAGTTTGGGTACTTTGACATTTTATATATGCTGTATATAATATGTAGTTTGAGTACTTTGATACTTTATGTACAGTG TR:VR 534:8 278:0 chrUn_KI270466v1 965 r_349_1 A ACACTGTACATAAAGTATCAAAGTACTCAAACTACATATTATATACAGCATATATAAAATGTCAAAGTACCCAAACTGTATATTATATAC[chr6:374080[ . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_349_0;SVINSLEN=89;SVINSSEQ=CACTGTACATAAAGTATCAAAGTACTCAAACTACATATTATATACAGCATATATAAAATGTCAAAGTACCCAAACTGTATATTATATAC TR:VR 534:8 278:0 chr1 213672218 d_114 T . PASS END=213672607;SVTYPE=DEL;SVLEN=-389 TR:VR 24:3 21:0 chr1 90243721 r_13_0 A [chr1:90244672[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_13_1 TR:VR 22:7 25:0 chr1 90244672 r_13_1 C [chr1:90243721[C . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_13_0 TR:VR 22:7 25:0 chr10 124799572 d_170 A . PASS END=124799643;SVTYPE=DEL;SVLEN=-71 TR:VR 130:7 12:0 chr10 8380386 r_27_0 G ]chr8:127826316]A . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_27_1 TR:VR 147:40 40:0 chr8 127826316 r_27_1 A A[chr10:8380386[ . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_27_0 TR:VR 147:40 40:0 chr13 32353026 r_212 G . PASS END=58348319;SVTYPE=DUP;SVLEN=25995293 TR:VR 66:20 37:0 chr15 101949445 r_258_0 C C]chr20:64287063] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_258_1 TR:VR 226:5 199:0 chr20 64287063 r_258_1 T T]chr15:101949445] . Too_low_VAF SVTYPE=BND;MATEID=r_258_0 TR:VR 226:5 199:0 chr10 124805833 r_129_0 T T]chr10:124813156] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_129_1 TR:VR 180:13 16:0 chr10 124813156 r_129_1 G G]chr10:124805833] . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_129_0 TR:VR 180:13 16:0 chr13 32443725 r_213_0 A [chr13:58073271[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_213_1 TR:VR 67:17 28:0 chr13 58073271 r_213_1 T [chr13:32443725[T . PASS SVTYPE=BND;MATEID=r_213_0 TR:VR 67:17 28:0 chr18 38499979 d_551 T . PASS END=38500107;SVTYPE=DEL;SVLEN=-128 TR:VR 28:18 17:0 chrX 34292422 i_1327 A . PASS END=34292437;SVTYPE=INS;SVINSLEN=110;SVINSSEQ=TTTGATCCCATCCAATTCTGAATCCTTAGGTCCTTTTCCCATTCTCCCATCACAGACATTATAGCACCTTCCCATCTCTCCTTCATTTATGATGGTTTTTGTCTACTTTG TR:VR 49:6 12:0