/projects/bioqc_dev/ilitests/BQ-861/cPin/IX5776/A77357/A77357.CBTEAANXX_2.bam
1	249250621	1570203	7343
2	243199373	1245651	7872
3	198022430	952374	3035
4	191154276	759524	10950
5	180915260	838452	2633
6	171115067	837922	2242
7	159138663	825103	3925
8	146364022	719650	2514
9	141213431	710007	4441
10	135534747	832524	8857
11	135006516	788880	4441
12	133851895	750451	2291
13	115169878	403146	1052
14	107349540	515681	1639
15	102531392	580429	2220
16	90354753	652479	3459
17	81195210	737849	5020
18	78077248	380018	2704
19	59128983	589009	3740
20	63025520	483982	1629
21	48129895	228486	1305
22	51304566	371196	1975
X	155270560	353504	2262
Y	59373566	124104	5880
MT	16569	138	2
GL000207.1	4262	14	0
GL000226.1	15008	27039	830
GL000229.1	19913	409	22
GL000231.1	27386	521	28
GL000210.1	27682	143	2
GL000239.1	33824	492	24
GL000235.1	34474	584	21
GL000201.1	36148	157	5
GL000247.1	36422	373	11
GL000245.1	36651	433	6
GL000197.1	37175	138	4
GL000203.1	37498	191	9
GL000246.1	38154	107	4
GL000249.1	38502	191	3
GL000196.1	38914	132	2
GL000248.1	39786	165	1
GL000244.1	39929	260	6
GL000238.1	39939	150	2
GL000202.1	40103	294	2
GL000234.1	40531	963	21
GL000232.1	40652	1234	27
GL000206.1	41001	192	8
GL000240.1	41933	415	8
GL000236.1	41934	180	11
GL000241.1	42152	913	16
GL000243.1	43341	718	40
GL000242.1	43523	205	6
GL000230.1	43691	433	10
GL000237.1	45867	908	33
GL000233.1	45941	436	9
GL000204.1	81310	732	4
GL000198.1	90085	1851	41
GL000208.1	92689	1480	94
GL000191.1	106433	641	11
GL000227.1	128374	390	11
GL000228.1	129120	3895	1160
GL000214.1	137718	9427	184
GL000221.1	155397	1759	37
GL000209.1	159169	599	12
GL000218.1	161147	1817	33
GL000220.1	161802	71437	1008
GL000213.1	164239	330	11
GL000211.1	166566	954	17
GL000199.1	169874	17023	2650
GL000217.1	172149	934	34
GL000216.1	172294	10365	1630
GL000215.1	172545	355	11
GL000205.1	174588	4279	36
GL000219.1	179198	2008	57
GL000224.1	179693	5600	153
GL000223.1	180455	589	20
GL000195.1	182896	4374	41
GL000212.1	186858	2641	134
GL000222.1	186861	983	145
GL000200.1	187035	407	14
GL000193.1	189789	3371	60
GL000194.1	191469	3193	44
GL000225.1	211173	21533	3744
GL000192.1	547496	3324	49
*	0	0	707776