Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	NLGN3	Gene	0	3.45	3.08	3.33	1.10	1.75	3.00	1.18	1.62	4.55	4.52	1.95	3.13	1.20	6.46	9.73	6.01	10.33	6.56	2.94	1.56	3.63	2.23	4.18	4.56	2.59	3.77	1.94	11.72	2.52
2	395855	Transcript	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	0.00	1.48	2.33	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00
3	374051	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	0.00	1.07	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	1.49	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	358741	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	1.95	0.00	2.15	0.00	0.00	2.62	0.00	2.06	1.39	0.00	4.98	4.19	0.70	1.56	1.61	0.88	0.00	2.36	2.57	1.14	0.00	0.58	0.02	3.42	4.10	0.00
5	476589	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.31	0.00	1.26	0.10	0.00	0.05	0.22	0.00	0.54	0.00	0.12	0.18	0.25	0.00	0.00	0.13	0.08	0.08	0.00	0.06	0.43	0.00	2.45	0.98
6	IG31	Intergenic	0	1.53	1.89	2.97	0.82	0.84	2.91	0.81	0.42	7.43	2.73	2.32	5.35	1.91	5.73	7.50	6.62	4.74	2.66	4.21	1.60	3.10	2.06	3.26	6.84	3.36	9.41	9.86	20.54	2.47
7	IG31_SR1	SilentIntergenicRegion	0	2.18	2.80	5.71	2.01	1.71	5.73	1.41	0.90	11.05	4.76	4.59	9.61	4.39	11.52	13.96	13.23	8.48	4.89	8.52	2.58	4.86	3.92	5.46	13.99	6.69	17.86	20.64	39.08	4.01
8	IG31_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.62	2.11	3.20	0.00	0.79	2.15	0.33	0.30	11.86	2.53	2.15	7.69	0.67	4.49	9.49	6.09	4.85	2.50	2.08	2.67	3.35	1.17	5.85	6.38	3.08	12.01	8.13	21.57	4.73
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	2.11	1.08	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	3.05	0.00	5.84	0.00	0.00	0.00
13	ER2a	ExonRegion	0	1.16	1.25	1.04	0.00	0.38	0.75	0.31	0.25	0.90	2.58	0.92	0.86	0.30	2.97	1.69	5.84	3.78	4.22	0.75	1.28	1.47	0.69	3.18	0.96	1.00	1.94	0.34	4.47	0.75
14	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	1.61	0.00	0.00	2.13	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	4.54	9.97	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	5.13	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.40	0.00
16	E2a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	2.14	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	2.98	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E5a	KnownJunction	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	3.20	0.00	0.00	0.00	1.48	2.33	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.30	0.00	2.19	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	2.59	2.04	0.00	0.00	0.00	0.82	9.97	3.67	3.76	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	0.00	0.00	2.29	2.94
19	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	5.85	0.00	3.05	0.00	0.00	2.23	0.00	6.19	1.65	0.00	5.99	2.61	2.11	1.17	4.82	2.64	0.00	1.95	3.09	0.99	0.00	0.21	0.05	10.26	4.40	0.00
20	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.92	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	1.72	1.02	0.00	0.00	1.26	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	3.43
21	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	2.53	0.00	4.41	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	2.41	0.00	1.52	0.00	0.00	3.50	0.00
22	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	1.17	1.01	1.68	0.49	0.17	1.22	1.30	1.73	3.84	1.65	1.65	1.62	0.92	2.37	3.66	3.95	3.40	1.67	2.57	0.89	0.96	1.65	0.79	1.49	1.39	2.70	2.29	2.57	1.92
23	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	1.48	1.43	0.74	0.95	0.33	2.13	0.09	1.00	1.35	0.89	1.02	1.63	0.27	1.48	2.26	2.33	3.98	0.27	0.52	0.20	0.91	0.22	0.64	1.40	1.47	1.19	0.75	1.63	1.09
24	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.46	0.00	0.00	0.00	8.17	2.98	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
25	E4_Ab	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	4.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	3.82	2.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	1.52
26	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.31	0.00	1.26	0.10	0.00	0.05	0.22	0.00	0.54	0.00	0.12	0.18	0.25	0.00	0.00	0.13	0.08	0.08	0.00	0.06	0.43	0.00	2.45	0.98
27	ER4b	ExonRegion	0	0.00	5.46	0.00	0.12	4.05	4.19	1.67	1.50	2.97	2.91	1.92	1.45	0.00	6.52	1.14	1.76	3.85	10.18	1.23	1.71	1.91	1.01	1.90	2.84	0.99	1.33	0.00	6.02	3.87
28	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	4.38	2.53	2.02	0.00
29	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	4.96	5.07	0.00	0.00	0.00	5.07	0.00	0.00	0.90	0.00	16.18	0.00	3.41	0.00	1.82	3.05	0.00	0.00	0.00	3.59	3.27
30	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	2.04	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	3.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.84	0.00
31	ER5a	ExonRegion	0	1.46	1.66	2.64	0.00	3.39	2.47	0.71	1.25	3.25	0.82	3.45	3.31	0.00	7.67	8.29	3.76	7.45	1.49	4.95	0.41	3.48	2.67	2.53	2.64	2.37	1.91	6.85	6.88	2.76
32	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	2.63	0.00	2.83	4.95	0.00	0.00	1.40	2.59	0.00	0.00	3.11	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	3.77	0.00
33	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	9.31	2.22	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	3.38	0.00	3.70	1.36	0.00	1.13	0.00	3.37	5.49	4.62	0.00	2.98	10.59	4.38	0.00	5.38	5.49	3.35	16.45	5.89	1.68
34	I5	Intron	0	2.05	4.70	1.43	1.41	0.72	1.73	1.61	1.99	7.91	4.05	2.25	2.50	1.69	2.80	15.55	6.11	9.55	2.06	2.33	0.14	1.60	0.99	0.69	2.90	3.08	4.96	1.46	8.44	2.03
35	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	0.96	3.94	0.62	0.73	0.25	1.28	0.76	1.06	5.79	2.46	1.69	1.47	1.09	1.45	8.95	2.96	6.77	1.44	2.13	0.14	0.94	0.62	0.25	2.06	1.89	3.75	1.19	6.15	1.40
36	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.35	13.14	7.02	0.00	0.00	3.38	13.25	6.58	17.59	4.91	4.01	4.42	8.05	3.60	62.09	19.81	20.58	2.73	3.62	2.73	5.34	5.41	3.87	2.58	13.84	10.19	0.00	26.97	3.41
37	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	4.87	5.79	5.23	5.87	1.03	2.68	6.04	5.32	22.07	9.04	5.65	7.50	5.51	6.86	43.29	15.29	26.45	4.67	3.06	0.10	4.43	2.80	2.21	8.85	8.50	7.56	5.36	18.88	5.38
38	I5_SR2	SilentIntronRegion	0	3.80	6.61	2.25	1.80	1.77	2.52	2.15	2.93	9.12	5.76	2.72	2.98	1.81	4.40	22.80	6.80	12.08	1.92	3.37	0.00	2.46	1.07	1.55	3.28	3.64	8.45	1.11	9.64	2.95
39	I5_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.06	3.27	1.31	1.92	0.00	2.44	1.26	1.20	5.46	6.44	3.37	2.49	1.86	3.78	10.67	10.44	2.85	3.71	1.72	0.00	2.19	0.36	0.00	2.04	3.14	1.84	0.00	9.93	0.00
40	I5_SR3	SilentIntronRegion	0	2.33	4.46	0.99	0.71	1.45	1.63	1.00	2.73	6.16	4.72	1.18	3.18	1.22	3.67	14.77	12.72	8.13	3.15	0.95	0.27	0.85	1.43	0.36	2.34	3.54	3.74	1.09	8.72	1.65
41	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	6.91	7.75	1.20	3.46	0.00	2.04	17.34	0.00	12.22	0.00	0.00	0.00	1.85	2.38	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	6.34	0.00
42	ER6a	ExonRegion	0	4.70	3.69	4.79	1.02	1.47	3.92	0.55	3.53	7.43	3.25	2.11	3.83	0.36	7.27	10.84	11.37	12.12	1.97	5.26	0.21	4.19	4.25	1.98	5.60	2.51	3.18	1.60	10.67	3.34
43	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	6.41	0.00	0.00	4.60	3.75	1.36	4.76	0.00	1.13	32.69	11.09	8.49	0.00	8.09	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.22	0.00
44	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.31	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	6.00	4.07	1.61	1.23	0.00	4.90	0.00	0.00	6.28	0.00	0.00	0.00	1.97	2.48	0.00	2.93	1.82	0.00	5.07	6.65	0.00
45	I6	Intron	0	3.53	3.39	1.34	2.51	1.10	2.47	1.36	2.16	6.33	6.99	3.36	2.72	1.05	3.67	10.40	10.88	11.70	2.11	3.03	0.46	2.71	0.81	0.41	1.88	2.89	3.33	0.46	8.75	1.89
46	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.39	5.97	1.90	3.75	1.02	2.80	1.19	1.23	6.49	8.10	4.77	4.33	1.03	4.60	13.89	14.96	15.11	1.56	3.00	0.00	3.43	0.38	0.57	1.35	3.70	3.20	1.11	10.20	3.71
47	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	4.92	3.07	1.27	1.74	0.72	3.02	1.51	2.57	7.31	7.57	4.17	2.98	0.93	3.82	12.29	14.71	12.68	2.52	2.85	0.63	3.20	0.77	0.22	1.70	3.29	4.24	0.24	8.20	1.76
48	I6_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.48	0.00	2.10	5.71	2.34	3.48	2.96	0.89	3.93	6.77	6.36	1.47	0.00	2.01	2.89	2.25	1.28	1.79	8.06	2.11	0.00	0.00	0.00	3.43	1.50	0.00	0.00	5.45	1.85
49	I6_SR2	SilentIntronRegion	0	2.03	2.55	0.96	3.38	2.01	1.28	1.10	2.12	6.04	5.27	0.92	1.45	0.99	2.36	3.63	2.45	8.81	1.85	3.06	0.32	1.68	1.49	0.85	2.06	1.77	1.93	0.43	8.11	0.47
50	I6_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.43	1.46	0.93	0.00	0.64	1.87	1.21	3.47	3.81	6.39	1.10	0.91	2.19	4.43	11.54	6.70	9.73	2.38	2.19	0.72	2.23	0.94	0.00	3.28	2.43	4.31	0.00	10.60	0.94
51	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.19	10.78	0.00	1.80	0.00	2.19	6.30	0.00	0.00	4.70	1.62	5.78	8.17	3.29	12.36	0.00	0.00	0.00	3.13	0.00	1.87	0.00	1.74	0.00	0.00	23.81	3.70
52	I6_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.08	0.00	2.21	0.00	1.24	5.60	1.60	3.32	2.15	3.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.35	2.68
53	ER7a	ExonRegion	0	5.33	3.80	6.38	1.21	3.11	3.82	3.24	3.47	9.05	7.15	3.66	5.00	2.24	10.91	16.98	11.80	20.98	8.19	2.84	1.39	4.38	3.60	5.80	4.81	3.19	8.59	1.36	23.15	4.04
54	E7_Da	KnownBoundary	0	7.79	17.26	20.23	0.00	7.37	6.41	2.57	4.68	5.63	6.79	6.23	9.40	3.03	11.72	24.32	2.75	50.47	4.62	0.00	4.13	3.65	4.42	7.24	0.00	9.13	0.00	10.78	30.01	15.42
55	ER7b	ExonRegion	0	6.78	8.40	5.77	0.00	3.24	5.18	1.13	3.00	3.24	6.55	2.74	3.25	2.27	8.86	9.51	3.30	13.47	13.07	0.00	4.12	4.81	4.61	10.72	5.55	7.58	1.57	8.52	25.55	4.84
56	E7_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	9.27	0.00	2.92	5.32	0.00	6.18	7.79	0.00	5.69	0.00	4.83	19.93	13.16	13.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.25	0.00	0.00	0.00	3.77	1.78
57	E7b_E8a	KnownJunction	0	2.30	0.00	5.13	0.00	0.00	3.88	0.00	0.00	1.55	6.99	0.00	2.41	1.27	7.16	0.00	3.75	12.63	9.25	0.00	4.05	7.18	0.00	11.92	5.74	7.31	1.59	0.00	14.47	1.29
58	I7	Intron	0	1.46	3.89	1.01	0.54	0.00	1.87	0.46	1.95	5.59	6.00	2.07	1.59	0.29	2.12	5.91	7.61	7.44	2.38	2.66	0.00	1.83	0.00	0.68	1.63	2.16	3.45	0.28	7.14	1.92
59	I7_SR1	SilentIntronRegion	0	1.46	3.90	1.01	0.54	0.00	1.88	0.46	1.95	5.61	6.01	2.07	1.59	0.30	2.13	5.93	7.63	7.46	2.38	2.66	0.00	1.84	0.00	0.69	1.63	2.17	3.46	0.28	7.16	1.93
60	E8_Aa	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65	2.92	9.21	2.56	3.67	1.58	1.54	0.00	3.23	0.00	13.16	14.72	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	8.31	0.00
61	ER8a	ExonRegion	0	4.32	3.34	4.28	1.05	0.48	3.08	1.06	1.54	3.72	5.49	2.01	3.11	1.24	7.44	9.95	4.60	11.86	8.72	3.60	2.48	4.72	3.18	4.41	6.97	3.73	4.11	2.16	13.18	2.53
62	E8_Da	KnownBoundary	0	2.42	7.95	3.01	0.00	0.00	1.96	2.63	0.00	1.25	3.40	2.78	1.87	1.53	8.75	9.57	9.41	12.43	4.62	0.00	0.00	7.46	0.00	2.02	5.14	3.49	1.93	0.00	6.25	0.00
63	ER8b	ExonRegion	0	3.35	3.90	2.07	2.02	3.02	3.98	0.71	1.13	5.10	4.47	0.90	3.81	1.62	4.78	11.94	3.87	7.21	6.82	3.78	1.53	3.88	0.91	4.51	5.28	2.44	2.28	2.17	8.74	2.68
64	ER8c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
65	IG32	Intergenic	0	2.89	3.34	1.57	2.53	0.57	2.09	1.79	2.16	4.92	4.94	2.14	3.10	1.61	2.53	8.04	7.41	6.91	2.21	3.45	0.72	1.88	1.51	0.79	1.99	2.62	3.23	1.95	6.75	1.55
66	IG32_SR1	SilentIntergenicRegion	0	1.81	2.57	0.55	0.78	0.13	1.62	0.87	1.41	3.01	3.93	1.98	3.14	0.72	1.83	2.43	5.78	5.67	1.58	1.62	0.45	1.15	1.00	1.08	0.53	1.29	2.04	1.35	4.57	0.71
67	IG32_SR2	SilentIntergenicRegion	0	3.44	3.52	2.12	3.50	0.81	2.20	2.34	2.66	6.00	5.59	2.23	3.05	2.06	2.89	11.19	8.26	7.65	2.41	4.43	0.89	2.30	1.79	0.69	2.73	3.21	3.82	2.28	7.88	1.96