Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	NFIL3	Gene	0	9.65	9.25	2.56	12.10	10.11	7.05	3.35	7.95	2.46	4.52	9.21	3.73	6.70	7.54	3.21	2.63	2.05	19.59	6.47	10.13	5.78	5.07	3.74	6.78	6.30	2.19	3.75	1.47	3.69
2	297689	Transcript	0	32.38	33.25	8.30	18.98	24.91	16.61	4.98	17.17	4.51	27.04	19.36	6.84	16.53	22.29	8.37	7.34	1.85	69.35	40.46	29.11	14.28	14.34	15.12	18.60	17.43	2.19	6.86	0.00	6.64
3	375724	Transcript	0	0.97	0.34	0.17	1.85	4.31	0.17	0.01	1.26	2.10	0.16	1.63	0.83	0.48	0.96	1.88	0.22	0.84	4.36	1.19	1.03	1.10	0.02	0.02	0.96	0.22	0.01	0.17	0.00	0.46
4	ER1a	ExonRegion	0	4.61	4.70	1.20	3.67	8.27	2.45	1.54	5.89	0.80	3.23	2.85	1.00	1.81	3.63	0.60	0.44	0.11	16.11	6.19	7.94	2.08	1.84	1.48	4.61	2.38	0.51	0.80	0.00	1.11
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2b	KnownJunction	0	32.38	33.25	8.30	18.98	24.91	16.61	4.98	17.17	4.51	27.04	19.36	6.84	16.53	22.29	8.37	7.34	1.85	69.35	40.46	29.11	14.28	14.34	15.12	18.60	17.43	2.19	6.86	0.00	6.64
7	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	1.76	0.00	0.00	0.00	0.26	0.36	0.00	0.00	0.17	0.59	1.66	0.25	0.00	0.56	0.00	0.00	0.31	2.15	0.00	0.00	1.60	0.00	0.44	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00
8	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	3.13	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	0.77	0.20	0.52	0.08	4.22	0.52	0.04	0.09	1.26	0.47	0.13	1.26	0.45	0.15	0.03	0.04	0.02	4.91	0.17	0.28	0.08	0.07	0.07	0.72	0.66	0.03	0.04	0.00	0.03
12	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER2b	ExonRegion	0	11.14	10.70	2.93	14.31	10.91	8.26	3.91	8.99	2.77	5.08	10.88	4.30	7.91	8.75	3.83	3.15	2.48	21.48	7.13	11.38	6.79	5.96	4.38	7.64	7.34	2.61	4.48	1.79	4.36
14	ER2c	ExonRegion	0	2.14	0.82	0.00	5.48	8.72	0.00	0.00	3.68	5.06	0.00	4.76	1.24	0.97	2.72	5.60	0.63	2.50	8.19	3.39	2.81	3.21	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.46	0.00	1.34