Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	UBE2R2	Gene	0	223.78	279.82	214.48	125.38	190.33	265.09	113.37	177.06	224.48	342.12	424.20	294.16	317.53	397.87	295.61	334.50	228.18	291.15	336.02	216.01	479.07	314.69	343.61	421.42	377.64	661.65	445.56	612.12	324.69
2	263228	Transcript	0	624.15	544.80	480.30	297.79	375.88	636.25	311.10	440.36	403.65	796.64	1034.01	719.08	780.67	920.86	538.71	733.74	592.08	696.91	722.16	531.17	1221.25	850.06	850.52	875.35	921.08	1726.93	889.67	1677.76	873.20
3	IG25	Intergenic	0	2.35	0.58	0.21	0.85	0.81	0.59	0.56	1.05	0.23	1.89	0.66	1.08	0.80	2.08	9.61	3.93	1.33	4.39	1.72	2.53	2.03	3.42	1.44	2.36	3.39	9.49	1.19	2.85	0.99
4	IG25_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.39	0.32	0.19	0.24	0.12	0.16	0.28	0.32	0.11	1.29	0.49	0.85	0.13	0.69	8.07	2.85	1.07	0.60	0.69	0.62	1.01	0.45	0.33	0.87	2.39	7.88	1.10	1.56	0.56
5	IG25_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	50.71	7.15	0.68	16.09	17.93	11.22	7.40	19.15	3.20	16.79	4.86	6.78	17.20	36.59	47.63	30.67	7.61	97.91	27.37	49.66	27.06	76.85	28.78	39.04	28.28	49.37	3.36	34.58	11.76
6	ER1a	ExonRegion	0	287.25	113.07	173.84	115.21	161.40	224.07	112.01	193.83	109.40	229.15	195.04	181.04	215.62	320.90	193.08	285.31	175.75	324.59	182.63	221.65	394.62	394.54	323.44	222.31	235.96	756.63	194.22	641.16	241.97
7	E1_Da	NovelBoundary	0	5.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	3.38	2.73	28.30	0.00	1.31	0.00	16.18	0.00	9.55	1.90	0.00	2.99	3.49	11.80	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	783.39	387.32	236.52	321.60	480.87	716.51	408.57	598.78	425.42	988.65	1085.60	713.54	939.60	953.13	565.27	826.87	561.70	748.11	412.27	673.01	1317.06	1096.42	1138.55	797.58	806.39	2677.67	1012.84	2800.35	1220.97
9	E1a_E3a	NovelJunction	0	27.96	4.36	15.35	0.00	26.38	7.60	8.58	14.18	5.45	7.59	26.76	18.89	7.58	20.27	0.00	6.73	4.77	20.04	8.09	18.19	10.19	6.22	11.08	22.79	12.62	9.78	6.56	23.00	18.19
10	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	1.21	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
11	I1	Intron	0	2.00	3.72	0.57	1.05	0.94	2.30	1.57	1.08	6.45	3.92	2.52	1.45	1.56	1.58	17.66	1.68	6.78	2.34	4.55	1.37	6.92	0.81	1.07	3.66	2.44	4.96	1.49	4.10	1.96
12	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.91	1.94	2.68	8.65	3.24	4.00	4.11	1.24	9.93	5.53	6.33	4.54	6.39	7.36	49.35	2.59	21.15	2.75	6.13	0.17	6.72	2.50	3.39	4.42	6.65	27.07	2.10	18.69	5.39
13	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	1.50	1.23	1.18	0.00	0.74	0.78	1.15	0.71	7.27	3.54	1.79	0.41	1.71	2.15	13.58	0.94	5.35	1.59	5.61	0.00	4.76	1.21	1.72	2.01	1.33	2.28	2.79	4.00	0.65
14	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.70	4.83	0.55	1.58	0.54	2.92	2.00	0.10	9.01	2.75	3.93	1.43	1.39	2.28	15.89	2.19	6.35	2.72	6.33	1.45	11.78	0.20	0.78	3.35	3.11	3.64	1.82	3.90	1.25
15	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	2.88	6.33	0.00	1.09	1.21	3.24	1.15	1.61	9.43	2.63	4.43	2.03	1.87	2.18	12.20	1.50	6.17	2.48	2.77	0.76	8.65	1.00	1.30	6.02	1.93	2.89	2.59	2.00	2.02
16	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.20	5.32	0.57	1.97	1.07	5.73	2.75	0.99	8.93	6.84	6.32	2.97	2.08	2.38	28.57	3.29	11.46	5.52	4.88	2.81	15.19	0.60	1.62	6.50	5.64	2.42	3.01	3.92	2.44
17	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	3.19	4.05	1.36	0.00	0.00	1.73	4.91	6.17	13.03	6.57	1.77	3.11	1.69	0.56	37.00	2.59	7.34	4.00	3.44	3.82	8.59	0.67	0.67	7.51	4.81	6.77	4.77	7.32	2.28
18	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.75	3.51	0.67	0.72	1.23	2.21	1.01	1.30	7.35	4.64	1.79	0.53	1.47	1.43	16.18	1.21	5.25	2.07	4.82	1.58	6.45	1.09	0.64	3.24	1.65	4.34	1.10	3.77	1.58
19	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	1.09	3.93	0.24	0.20	0.83	1.36	1.19	0.88	4.10	3.05	1.14	0.97	0.99	0.59	13.88	0.87	3.95	1.32	4.86	1.20	4.06	0.51	0.82	2.85	1.49	3.01	0.52	2.76	1.28
20	I1	Intron	0	0.72	2.54	0.30	0.38	0.17	1.23	0.59	0.64	4.03	2.91	0.95	1.76	1.39	0.66	9.15	0.89	3.60	0.74	2.41	0.79	7.14	0.70	0.49	1.76	1.26	2.36	1.05	2.91	1.45
21	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.86	1.91	0.16	0.70	0.36	1.17	0.44	0.81	2.88	2.69	0.60	1.27	1.36	0.45	9.36	1.02	3.16	0.57	2.36	0.81	5.77	0.80	0.78	1.27	1.36	2.63	0.81	1.79	1.15
22	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.39	1.67	0.09	0.79	0.00	0.49	0.44	0.20	3.55	3.75	1.81	4.30	1.73	1.81	6.85	1.09	5.93	0.85	2.05	0.61	10.91	0.79	0.47	1.23	1.62	3.75	2.22	6.88	1.87
23	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.54	2.82	0.37	0.24	0.12	1.31	0.65	0.61	4.45	2.92	1.00	1.73	1.37	0.64	9.25	0.83	3.58	0.80	2.46	0.80	7.32	0.66	0.39	1.97	1.19	2.16	1.05	2.99	1.52
24	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	3.23	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	0.00	4.58	0.00
25	ER2a	ExonRegion	0	816.32	608.77	364.66	301.16	359.47	961.09	404.03	596.30	524.43	1070.15	1216.26	820.51	944.85	1166.28	673.04	1001.35	693.85	1018.89	815.95	674.14	1769.93	1155.93	1180.00	919.16	1218.76	2466.97	889.09	2154.97	1152.55
26	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	9.57	3.82	1.01	0.00	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E2a_E3a	KnownJunction	0	754.95	578.12	528.20	301.75	379.19	523.07	250.77	560.86	424.90	689.54	1066.24	714.44	855.43	1146.56	704.20	733.70	560.98	826.45	849.26	697.40	1089.88	1258.56	817.84	1113.17	1128.15	1725.96	812.21	1421.59	926.09
28	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	5.08	0.00	0.00	0.00	4.28	0.00	0.90	0.61	2.86	0.00	0.00	1.63	6.71
29	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.36	5.18	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	2.88	0.44	0.00	0.00	2.44	0.00	1.81	0.00	2.95	0.00	0.00	1.05	1.86
30	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	1.84	4.49	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	2.00	2.73	4.53	0.00	1.43	0.00	1.81	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	2.68
31	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.88	4.93	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	1.84	3.42	0.54	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	1.00	4.21	4.53	0.00	1.43	0.00	0.23	0.00	1.43	0.00	0.00	0.48	1.34
32	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	3.79	0.34	2.57	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	2.52	1.09	3.53	0.00	1.40	0.00	0.90	0.00	0.77	0.00	0.00	1.40	1.74
33	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	1.63	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	1.45	1.25	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.77	0.00	1.52	0.90	0.00	0.00	2.19
34	I2_AR7	ActiveIntronRegion	0	1.06	2.78	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.23	0.90	0.89	1.17	0.46	0.80	0.50	3.63	0.00	1.66	1.19	1.18	0.34	3.51	0.22	0.00	1.06	1.06	0.77	0.00	0.80	0.00
35	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.31	0.93	0.00	0.00	1.41	0.40	0.00	0.00	0.97	1.04	0.69	0.18	0.19	0.52	1.99	1.07	0.00	0.00	2.76	0.00	1.64	0.00	0.00	0.93	0.00	0.44	1.06	0.23	0.77
36	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35	1.60	0.00	0.00	0.00	0.95	9.37	3.82	1.22	0.00	0.00	0.00	3.65	0.00	0.00	5.86	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER3a	ExonRegion	0	634.16	542.81	684.84	249.23	353.03	569.16	316.04	417.72	367.53	689.53	977.55	720.90	676.81	959.71	485.08	706.41	617.23	637.98	704.78	499.35	1113.05	817.87	777.50	994.64	955.58	1331.22	903.97	1348.08	733.89
38	E3_Da	NovelBoundary	0	8.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	7.19	2.00	0.00	3.25	0.00	0.00	0.00	0.00	5.36	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	2.21	3.03	0.00	0.00	6.87	0.00
39	E3a_E4a	KnownJunction	0	730.06	705.41	867.11	350.93	503.13	921.47	474.43	376.03	563.19	1132.86	1414.38	1119.23	1210.59	1166.46	550.12	1001.45	987.08	760.69	857.35	501.16	1733.53	820.81	1074.28	985.88	1163.23	2013.45	1349.68	2467.73	1420.44
40	E3a_E5a	NovelJunction	0	31.97	32.48	25.41	17.69	0.00	14.50	4.98	6.27	20.46	30.36	39.70	28.49	51.68	32.24	18.34	33.97	29.73	32.36	24.28	3.47	45.85	42.25	31.42	15.97	44.67	47.21	77.08	34.19	35.03
41	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.70	2.54	0.13	0.90	0.86	0.79	0.30	0.60	1.66	1.95	0.83	1.09	1.08	1.12	1.34	0.42	1.98	1.20	2.88	0.14	3.54	0.18	0.14	1.23	0.47	1.02	0.18	1.80	0.87
42	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.69	0.70	0.72	0.00	0.00	0.78	0.04	1.41	1.03	0.46	0.13	0.66	0.69	0.19	2.35	0.00	2.85	0.71	5.13	0.00	3.55	0.39	0.32	0.95	0.46	1.35	0.20	1.18	0.43
43	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.30	1.56	0.09	0.00	0.59	1.89	0.33	0.22	0.68	2.70	1.73	0.97	1.13	0.80	7.60	0.00	2.12	0.47	1.47	0.10	1.92	0.00	0.66	2.60	0.17	0.00	0.36	1.93	0.16
44	I3_SR4	SilentIntronRegion	0	0.55	5.81	0.43	0.00	0.00	0.35	0.00	0.95	2.17	1.86	0.61	0.96	0.83	0.47	2.38	0.00	0.38	0.00	6.58	1.42	2.94	0.00	0.47	2.77	0.37	1.21	0.00	0.84	0.69
45	Ix	Intron	0	0.91	2.05	0.36	0.00	2.08	0.58	0.43	0.00	3.56	0.31	0.25	2.62	1.65	1.54	7.61	1.96	4.76	0.82	0.68	0.00	1.82	0.77	1.15	2.29	1.52	1.34	0.00	4.50	2.56
46	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.91	2.05	0.36	0.00	2.08	0.58	0.43	0.00	3.56	0.31	0.25	2.62	1.65	1.54	7.61	1.96	4.76	0.82	0.68	0.00	1.82	0.77	1.15	2.29	1.52	1.34	0.00	4.50	2.56
47	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	3.41	2.36	0.57	0.00	1.66	1.09	0.46	0.21	4.33	1.15	0.14	0.70	1.03	0.36	10.98	0.48	0.85	1.79	3.27	0.31	5.99	1.84	1.64	1.71	0.97	1.61	0.42	3.52	2.05
48	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	2.46	0.00	3.47	6.11	0.00	4.61	0.00	3.43	24.12	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	5.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93
49	ER4a	ExonRegion	0	716.25	853.37	677.57	440.44	483.84	887.65	440.34	529.82	515.07	1080.95	1706.99	1098.21	1059.32	1194.47	775.91	927.33	807.89	966.79	1167.03	645.25	1733.98	987.74	1114.52	1184.52	1325.83	2288.20	1376.88	2316.85	1099.17
50	E4_Da	NovelBoundary	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	4.23	0.00	0.00	5.60	3.57	1.35	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	3.77	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00
51	E4a_E5a	KnownJunction	0	724.81	855.30	607.00	493.93	489.27	705.16	306.56	546.43	489.31	992.77	1282.37	855.35	851.23	1041.76	629.25	832.92	736.68	756.84	1213.65	690.21	1452.48	875.70	947.51	1277.60	1138.94	1761.50	1057.02	1468.99	794.01
52	I4	Intron	0	2.83	3.97	0.42	1.04	0.88	1.49	0.33	0.73	2.44	2.62	1.55	0.96	0.89	1.47	4.73	1.02	2.27	2.17	3.01	0.75	4.57	0.20	0.62	1.95	1.63	1.31	0.60	2.07	1.04
53	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	1.93	4.30	0.41	1.40	1.16	1.50	0.29	0.49	2.38	2.46	1.27	1.03	1.03	1.31	5.68	1.04	2.25	1.72	3.42	0.87	3.85	0.24	0.48	1.98	1.84	1.13	0.80	1.71	1.02
54	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.80	3.15	0.50	0.00	0.00	1.55	0.45	1.52	2.74	3.15	2.51	0.79	0.49	2.04	1.87	0.93	2.47	3.38	1.68	0.41	6.97	0.00	1.09	1.94	1.08	1.89	0.00	3.19	1.16
55	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	7.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.86	3.60	0.00	1.87	0.00	3.55	0.00	2.75	3.15	0.00	0.00	7.28	14.28	0.00	1.97	2.21	5.76	3.86	0.00	1.93	0.00
56	ER5a	ExonRegion	0	170.16	259.02	182.97	105.83	172.73	218.05	87.16	143.44	213.56	296.20	361.61	248.54	272.53	338.49	272.43	288.32	187.55	231.86	296.56	178.32	386.72	243.02	281.03	383.26	316.92	520.75	411.09	480.09	269.70