Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-390F4.4	Gene	0	7.06	0.62	0.00	0.00	38.83	0.40	0.98	10.53	0.11	0.00	0.23	0.00	0.00	0.18	13.29	1.92	1.30	0.19	0.31	0.53	11.06	6.10	0.88	1.87	0.14	1.83	0.00	0.00	8.29
2	413145	Transcript	0	8.69	0.31	0.00	0.00	47.89	0.52	0.64	7.35	0.05	0.00	0.46	0.00	0.00	0.09	12.79	2.11	1.31	0.09	0.15	0.29	10.23	7.30	0.88	2.15	0.07	1.00	0.00	0.00	9.94
3	IG17_SR1	SilentIntergenicRegion	0	7.27	0.00	0.00	0.00	35.62	0.00	0.60	6.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.31	3.44	0.62	0.00	0.00	0.00	4.03	3.70	3.29	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	5.91
4	IG17_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	8.62	0.00	0.00	0.00	43.17	0.00	0.59	2.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	3.62	1.53	0.00	0.00	0.00	3.36	3.92	3.12	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	10.34
5	ER1a	ExonRegion	0	10.01	0.00	0.00	0.00	30.50	0.10	1.58	10.83	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	13.79	4.50	1.61	0.00	0.00	0.00	8.46	10.34	0.13	0.26	0.00	0.62	0.00	0.00	2.96
6	E1_Da	NovelBoundary	0	5.43	0.00	0.00	0.00	12.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.57	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	5.50	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	7.43	0.00	0.00	0.00	80.32	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	7.57	3.82	2.50	0.00	0.00	0.00	15.48	2.43	1.97	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	13.73
8	I1	Intron	0	0.78	0.09	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.20	0.11	0.12	0.00	0.02	0.00	0.02	1.71	0.72	1.55	0.00	0.00	0.00	4.02	0.63	0.00	0.20	0.12	0.59	0.00	0.00	0.99
9	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.78	0.09	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.20	0.11	0.12	0.00	0.02	0.00	0.02	1.72	0.72	1.55	0.00	0.00	0.00	4.03	0.63	0.00	0.20	0.12	0.59	0.00	0.00	0.99
10	I1	Intron	0	0.76	0.30	0.00	0.00	1.33	0.03	0.00	0.23	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	2.48	0.21	1.65	0.34	0.00	0.00	4.38	0.19	0.00	0.00	0.06	0.49	0.00	0.00	0.82
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.76	0.30	0.00	0.00	1.32	0.03	0.00	0.23	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	2.48	0.21	1.65	0.34	0.00	0.00	4.38	0.19	0.00	0.00	0.06	0.49	0.00	0.00	0.83
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.67	1.37	5.39	0.00	0.00	0.00	0.00	16.34	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	11.35	0.00	0.00	0.00	0.00	3.69	0.00	0.00	0.00
13	ER2a	ExonRegion	0	7.32	0.00	0.00	0.00	24.37	0.31	1.11	10.05	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.25	14.74	1.63	1.34	0.00	0.00	0.76	9.36	3.86	1.41	1.42	0.00	1.73	0.00	0.00	11.96
14	E2_Da	NovelBoundary	0	556.47	213.97	654.39	518.52	663.76	240.91	260.50	271.17	105.27	328.87	332.16	215.84	297.49	221.12	142.71	206.01	217.01	0.00	0.00	273.07	113.67	142.69	170.21	103.60	224.73	249.67	141.64	84.25	226.01
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	13.68	0.00	0.00	0.00	47.60	0.00	0.00	5.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	16.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.69	14.39	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	12.68
16	I2	Intron	0	0.72	0.00	0.00	0.00	3.28	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.39	2.50	0.00	0.00	0.00	0.00	4.31	1.21	0.61	0.00	0.96	0.00	0.00	0.00	0.67
17	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.72	0.00	0.00	0.00	3.30	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	4.34	1.22	0.61	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.68
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.06	2.07	0.00	0.00	0.00	3.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	5.02	1.56	0.00	0.00	56.64	0.66	0.49	10.77	0.27	0.00	0.29	0.00	0.00	0.22	11.71	0.60	1.08	0.47	0.77	0.67	14.16	5.46	0.87	3.26	0.35	2.66	0.00	0.00	8.36
20	IG18	Intergenic	0	0.90	0.00	0.06	0.00	1.87	0.11	0.23	0.35	0.00	0.17	0.14	0.05	0.00	0.09	1.97	0.35	1.60	0.29	0.00	0.00	4.47	0.55	0.07	0.08	0.27	0.30	0.00	0.00	0.67
21	IG18_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.90	0.00	0.06	0.00	1.87	0.11	0.23	0.35	0.00	0.17	0.14	0.05	0.00	0.09	1.97	0.35	1.60	0.30	0.00	0.00	4.48	0.55	0.07	0.08	0.27	0.30	0.00	0.00	0.67