Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-70L8.1	Gene	0	1.32	1.98	0.21	0.88	1.80	0.85	0.25	0.00	0.28	5.16	2.20	1.22	0.48	1.78	3.98	1.14	1.66	0.95	1.97	1.02	1.93	0.22	0.45	0.00	0.53	0.58	0.00	1.61	0.17
2	427788	Transcript	0	0.81	0.95	0.17	0.38	1.48	0.36	0.11	0.00	0.12	2.91	1.24	0.71	0.20	0.82	1.93	0.69	0.76	0.47	1.14	0.85	1.01	0.09	0.28	0.00	0.35	0.25	0.00	0.74	0.14
3	ER1a	ExonRegion	0	1.10	0.00	0.86	0.00	7.30	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	1.28	0.00	0.00	0.00	4.26	1.47	0.00	0.93	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	0.69
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.18	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	2.41	0.00	1.22	0.00	9.64	0.00	0.00	8.09	0.00	3.57	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	8.54	1.98
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.27	0.00	0.46	0.00	0.49	1.03	0.75	0.00	0.38	1.99	0.30	0.31	0.24	0.60	1.15	0.00	1.06	0.24	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.91	0.20	0.17
7	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	3.45	0.00	0.00	0.00	1.12	4.33	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	3.31	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
8	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	4.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
9	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	4.33	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
10	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.62	0.00	0.56	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	1.49	1.66	0.84	1.77	0.00	0.25	1.33	1.07	0.85	0.00	1.84	0.00	1.64	0.00	0.18	0.31	0.08	0.91	1.05	0.47	0.48
11	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	6.02	11.05	0.00	0.00	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	9.51	0.00	0.00	0.00	2.08	0.00	7.19	8.49	0.00	0.00	0.00	5.98	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	2.07	2.91
13	ER2a	ExonRegion	0	1.13	3.39	0.00	1.88	0.13	1.81	0.53	0.00	0.59	5.59	2.19	0.98	1.02	3.33	7.28	1.11	3.08	1.52	1.68	0.00	3.00	0.47	0.48	0.00	0.33	1.24	0.00	3.00	0.00
14	E2_Da	NovelBoundary	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	2.98	13.30	1.61	0.00	0.00	4.76	0.00	3.52	4.52	0.00	0.00	0.00	0.00	3.94	0.00	0.00	4.51	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	Ix	Intron	0	1.11	1.18	0.94	0.00	2.96	2.02	0.52	0.00	0.80	6.43	2.57	1.87	0.00	1.78	1.55	0.91	3.10	1.43	1.66	0.97	1.48	0.16	0.23	0.28	0.31	1.02	0.40	0.85	0.87
17	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.21	1.15	0.93	0.00	3.04	2.14	0.50	0.00	0.87	6.68	2.59	1.96	0.00	1.95	1.69	0.99	3.25	1.38	1.66	0.96	1.62	0.17	0.26	0.30	0.34	1.05	0.43	0.90	0.95
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.26	1.67	0.00	3.19	1.20	1.20	0.00	0.00	5.75	3.76	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	3.07	2.55	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.36	0.00
19	Ix	Intron	0	2.02	0.16	0.91	0.00	1.21	1.43	1.10	0.09	1.19	6.66	1.65	1.89	0.00	1.10	0.23	1.35	2.22	1.34	0.48	0.27	2.27	0.00	1.08	0.21	0.50	0.93	0.00	2.34	1.09
20	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	1.79	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	2.20	0.00	0.00	0.00
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.05	0.16	0.93	0.00	1.23	1.45	1.12	0.09	1.21	6.74	1.66	1.92	0.00	1.11	0.23	1.37	2.25	1.36	0.48	0.28	2.27	0.00	1.09	0.22	0.50	0.93	0.00	2.38	1.11
22	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.60	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.19	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.98	0.00	0.00
23	ER3a	ExonRegion	0	1.81	1.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.47	4.01	2.60	0.00	0.76	0.00	1.07	0.72	0.81	4.04	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.69	0.00