Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-509J21.4	Gene	0	2.49	6.11	1.94	3.74	0.85	3.35	2.11	0.43	7.57	10.39	2.49	1.79	0.98	5.06	4.74	5.92	4.41	1.79	1.85	1.71	25.73	3.66	1.57	2.75	2.74	2.10	0.85	2.18	0.23
2	423112	Transcript	0	0.44	3.03	1.24	1.47	0.18	0.51	1.52	0.48	1.18	2.58	1.32	0.64	0.37	1.33	0.00	2.92	2.41	2.28	0.00	0.49	6.48	0.86	0.95	1.37	0.71	1.37	0.17	0.68	0.00
3	457566	Transcript	0	3.08	3.97	1.03	5.49	0.19	3.77	1.47	0.00	10.97	16.25	3.78	2.04	1.01	6.31	13.92	7.69	3.13	0.92	7.38	0.54	35.23	6.54	0.50	1.42	2.73	0.58	0.75	1.40	0.16
4	IG30	Intergenic	0	12.42	0.00	3.75	19.74	2.83	4.78	3.36	6.94	0.49	3.45	0.86	2.68	0.94	2.62	2.20	6.50	6.16	16.44	1.39	2.40	6.81	1.30	1.18	1.56	0.93	3.42	0.40	7.79	0.87
5	IG30_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.12	0.00	0.00	0.00	3.20	0.75	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	1.76	2.40	1.19
6	IG30_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	13.44	0.00	4.06	21.38	2.80	5.12	3.64	7.51	0.53	3.69	0.93	2.90	1.02	2.84	2.38	7.04	6.68	17.74	1.50	2.59	7.38	1.41	1.26	1.69	1.01	3.70	0.29	8.25	0.85
7	ER1a	ExonRegion	0	1.95	0.00	0.12	6.65	0.00	0.00	0.00	3.41	1.18	0.53	0.00	1.12	0.00	0.21	0.00	0.23	1.49	10.72	0.00	0.00	3.29	1.31	0.00	0.00	0.88	1.14	0.00	1.72	0.00
8	E1_Da	NovelBoundary	0	21.59	0.00	9.17	8.84	6.19	1.57	5.61	8.71	0.00	1.92	1.42	15.87	1.43	8.69	7.77	14.00	51.82	47.13	7.87	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	3.64	3.99	0.00	25.43	3.37
9	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	0.00	2.05	1.90	0.00	0.00	3.37	4.38	0.00	0.00	0.00
10	I1	Intron	0	11.69	4.51	2.27	19.37	7.71	7.89	4.87	6.16	12.37	5.80	2.07	7.58	0.89	6.61	14.12	17.57	19.59	22.88	10.18	7.71	17.10	0.43	0.78	4.98	4.11	1.45	1.68	5.05	3.39
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	38.75	6.40	10.84	46.12	11.24	14.65	9.75	30.96	11.64	11.05	4.75	16.50	2.10	15.08	14.80	24.53	51.81	56.30	17.25	17.02	27.53	1.52	2.38	3.13	9.73	6.79	2.75	19.06	5.15
12	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	3.57	0.00	3.06	20.83	15.10	3.25	4.52	8.98	5.11	6.34	4.58	8.43	0.24	8.30	11.71	19.71	9.32	17.20	8.78	2.98	12.10	0.00	0.00	1.37	1.26	0.00	1.39	2.52	2.77
13	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	20.58	11.93	2.45	38.33	17.27	20.12	10.06	5.92	24.46	13.99	4.41	21.01	2.13	15.49	25.65	42.46	46.98	54.80	31.47	22.80	49.29	0.26	1.26	8.71	5.12	1.29	2.31	7.89	4.91
14	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	36.15	6.41	7.96	39.03	21.51	19.38	11.00	17.47	34.64	20.58	8.00	19.39	2.67	18.17	47.07	39.69	48.24	61.96	17.86	15.56	40.61	0.09	0.26	15.58	16.77	3.51	4.68	17.29	9.01
15	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	26.90	18.65	2.98	72.21	31.40	28.29	18.91	8.56	59.27	17.21	5.23	20.74	2.34	19.90	58.58	73.05	55.12	65.26	35.99	23.19	50.14	1.51	2.79	24.98	14.48	2.62	8.60	8.67	16.80
16	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	29.29	8.47	0.00	34.25	24.73	15.17	8.73	14.15	48.13	11.70	4.68	16.75	2.39	12.52	91.38	52.21	24.55	57.55	16.44	8.43	31.36	2.50	0.03	18.08	5.12	1.38	0.00	6.83	9.49
17	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	17.34	0.00	0.00	1.99	0.00	4.75	2.02	0.17	35.34	5.78	2.70	7.42	0.00	3.79	32.08	15.41	10.56	11.16	9.05	6.13	17.89	1.80	0.00	7.82	2.34	0.00	0.00	3.26	2.20
18	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	11.67	7.26	1.16	21.14	10.17	4.61	5.61	1.92	18.46	3.30	0.85	8.05	0.56	8.27	28.35	21.12	17.19	23.75	6.10	5.31	7.55	0.34	0.63	13.14	5.48	0.82	1.58	5.72	4.79
19	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER2a	ExonRegion	0	0.02	0.97	2.31	8.07	1.85	3.64	2.63	1.39	4.99	6.52	1.35	2.85	2.08	1.94	0.00	5.62	2.60	0.55	0.00	4.91	9.97	0.83	0.68	0.40	2.88	3.69	0.69	4.23	0.00
21	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	9.70	1.15	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	2.89	1.96	1.42	1.87	1.40	3.08	0.00	2.91	2.32	4.62	0.00	0.00	3.61	2.09	0.00	2.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E2a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER3a	ExonRegion	0	0.00	3.73	1.09	0.00	0.00	1.45	4.82	0.00	2.71	1.25	0.00	0.57	0.17	1.23	0.00	3.78	1.79	0.25	0.00	0.00	6.76	0.00	0.95	2.84	0.00	0.83	0.96	0.86	0.00
24	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER4a	ExonRegion	0	0.17	1.97	1.48	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	3.87	2.74	0.00	0.00	1.98	0.00	5.77	2.10	1.42	0.00	0.00	10.93	0.00	2.89	0.99	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00
26	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	3.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.36	0.00	0.00
27	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	8.92	4.11	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	5.99	5.41	0.00	0.00	2.02	0.00	7.19	7.32	4.62	0.00	0.00	17.93	2.48	4.14	3.05	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00
28	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER5a	ExonRegion	0	2.24	5.00	2.10	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	3.67	2.30	0.00	0.00	1.85	0.00	3.74	2.68	0.59	0.00	0.00	10.29	0.00	0.86	3.51	0.00	0.51	0.08	0.00	0.00
30	E5a_E7b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	0.26	0.00	0.36	0.00	0.00	1.33	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	3.51	0.00	0.00	0.00	0.41	0.91	0.00	0.00	0.00
32	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00	3.79	0.28	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00
33	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	1.63	0.00
34	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	0.14	0.00	0.17	1.45	0.00	0.42	0.00	0.00	2.61	0.78	0.04	0.17	0.00	0.00	0.16	0.17	0.35	0.00	0.11	0.00	1.76	0.30	0.00	0.15	0.05	0.37	0.00	0.10	0.00
35	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	I5_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.73	5.58	1.65	5.51	0.00	3.60	1.54	0.47	6.17	17.75	1.80	2.73	1.16	6.56	2.42	8.13	7.40	3.09	3.27	2.26	39.94	2.89	0.00	0.67	4.27	1.47	1.88	1.25	1.08
37	E6_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	6.56	2.92	0.00	8.56	26.48	0.00	1.23	0.00	5.10	0.00	0.00	8.35	4.62	0.00	0.00	53.23	2.48	0.00	2.21	7.20	3.86	0.00	0.00	0.00
38	ER6a	ExonRegion	0	3.94	7.67	2.09	3.85	0.77	3.24	1.36	0.00	9.89	15.86	2.93	1.75	1.11	7.63	8.88	7.02	5.46	1.22	4.27	2.18	44.69	4.30	2.00	3.73	3.29	1.74	1.16	1.68	0.63
39	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	1.60	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	3.82	0.83	0.00	8.09	0.00	3.17	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
40	E6a_E7a	KnownJunction	0	3.01	0.00	0.92	10.78	0.00	4.83	2.52	0.00	15.77	22.17	0.00	3.22	1.62	8.02	25.91	11.25	4.10	0.00	16.18	0.00	47.61	7.88	0.00	0.00	3.33	0.00	0.00	2.29	0.00
41	E6a_E7b	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	I6	Intron	0	0.13	1.61	0.30	0.22	0.00	0.96	0.55	0.00	5.61	2.67	1.05	1.03	0.82	0.63	2.57	1.98	2.22	0.88	0.77	0.62	7.05	0.49	0.11	0.78	1.00	0.19	0.17	0.20	0.43
43	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	0.24	0.36	0.56	0.00	0.00	0.15	0.45	0.00	1.68	2.56	1.06	0.82	0.93	0.30	3.17	1.10	0.33	0.85	0.35	0.00	4.90	0.40	0.40	0.95	0.64	0.35	0.61	0.18	0.52
44	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.47	1.01	0.00	2.12	1.42	0.00	7.40	2.03	1.17	0.17	0.73	0.63	1.94	4.49	1.68	1.89	1.80	1.55	9.62	0.51	0.00	0.30	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00
45	I6_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	0.00	1.89	1.61	5.35	0.81	0.00	0.00	0.16	0.00	0.81	1.42	0.00	1.43	6.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19
46	I6_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	5.55	2.73	0.35	1.70	0.29	0.00	4.29	1.13	2.32	0.87	0.48	1.14	6.32	0.55	0.00	1.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.67
47	I6_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	4.62	0.24	0.00	0.00	0.78	0.29	0.00	9.68	3.15	0.66	1.39	1.66	1.92	1.96	1.63	5.79	0.00	0.91	0.00	8.47	0.77	0.00	1.21	2.23	0.44	0.00	0.32	0.48
48	I6_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	5.95	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	2.32	6.68	2.38	2.47	0.00	0.23	0.35	5.38	2.88	0.00	0.00	0.00	6.69	0.00	0.00	0.00	3.75	0.10	0.00	3.06	0.00
49	I6_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.71	6.57	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	4.49	10.11	2.38	2.47	0.00	0.00	0.00	5.06	1.34	0.00	0.00	0.00	7.13	0.00	0.00	0.00	5.72	0.00	0.00	3.26	0.00
50	I6_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.49	2.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	6.25	3.35	1.02	1.49	0.00	0.00	0.00	1.54	0.04	0.00	0.00	0.00	5.33	0.00	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.87	0.00
51	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	E7_Ab	NovelBoundary	0	0.00	3.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	0.00	1.27	1.06	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER7a	ExonRegion	0	5.36	8.21	1.12	7.31	0.00	5.50	2.02	0.00	14.32	23.10	5.95	2.47	1.30	8.39	16.80	10.76	2.25	0.00	9.05	0.00	42.79	13.97	0.00	1.08	4.29	0.00	1.83	1.63	0.00
54	ER7b	ExonRegion	0	4.58	13.90	2.92	3.78	1.69	8.24	3.25	0.00	15.79	16.59	4.44	3.26	1.35	9.19	7.77	8.56	8.55	2.30	1.45	0.96	31.85	10.80	2.51	4.39	6.05	3.73	1.20	4.18	0.00
55	ER7c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	3.88	3.87	6.22	0.73	0.00	1.20	4.07	1.73	0.73	2.48	0.00	0.00	5.84	0.00	0.00	0.88	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00
56	IG31	Intergenic	0	0.36	1.28	0.36	1.21	0.12	0.80	0.39	0.04	1.38	1.46	0.66	0.34	0.25	0.78	1.35	2.29	2.02	0.23	0.54	0.33	4.76	0.52	0.13	0.88	0.52	0.19	0.00	0.55	0.03
57	IG31_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.69	1.36	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.48	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00
58	IG31_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	1.07	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	3.64	2.37	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00
59	IG31_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.46	0.12	0.00	0.00	0.51	0.30	0.00	1.21	0.97	0.34	0.41	0.00	0.34	0.75	0.82	1.87	0.00	1.19	0.62	2.85	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00
60	IG31_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	1.09	2.35	0.98	3.14	0.36	1.71	0.88	0.13	2.17	2.53	1.56	0.50	0.76	1.88	2.28	3.80	2.39	0.70	0.23	0.20	8.22	1.58	0.40	1.88	1.36	0.46	0.00	0.36	0.10