Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	ZNF696	Gene	0	6.93	9.26	14.83	3.51	14.67	14.87	3.53	3.93	16.65	22.69	5.87	13.10	12.90	13.60	8.45	12.56	16.98	24.30	12.10	7.98	15.23	6.65	11.75	16.34	7.00	10.88	9.73	13.06	13.71
2	330143	Transcript	0	5.88	6.73	14.50	3.41	17.64	15.63	5.27	4.14	8.01	28.97	4.80	10.45	12.35	17.91	3.81	11.16	14.29	28.24	7.71	7.90	14.21	4.78	12.62	14.88	7.47	10.67	17.16	14.54	12.61
3	IG29_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	4.72	0.00	0.67	8.41	3.24	3.64	2.02	6.08	2.75	0.00	0.00	1.42	1.75	0.41	9.52	0.00	3.01	4.09	0.00	8.15	3.57	0.27	0.36	1.72	1.57	0.86	0.00	2.85	0.94
4	IG29_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	7.14	3.65	1.12	14.63	4.98	8.25	2.02	14.11	4.87	0.00	0.00	1.24	2.60	2.12	11.20	1.97	8.35	7.58	0.00	14.37	7.45	1.80	1.81	4.30	1.91	1.57	0.00	3.26	1.34
5	IG29_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	22.73	5.43	4.11	24.57	54.85	7.18	14.24	19.51	8.21	4.23	1.23	3.69	4.58	8.95	8.49	15.19	12.86	11.67	17.61	20.20	6.38	6.47	4.31	10.98	6.79	4.40	7.72	12.88	6.50
6	IG29_SR3	SilentIntergenicRegion	0	4.74	1.76	8.13	0.85	3.94	5.79	5.37	1.52	6.83	8.82	2.38	2.97	3.81	5.32	7.38	3.35	5.06	4.30	3.41	1.12	4.03	5.69	2.36	6.33	2.33	2.92	3.05	0.10	6.60
7	IG29_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	17.62	5.13	6.43	5.77	2.62	9.24	7.87	2.96	5.10	13.72	3.27	1.13	5.64	8.71	5.45	4.51	5.51	7.35	0.71	4.39	5.14	7.88	6.27	6.94	5.73	3.61	4.31	0.34	9.10
8	IG29_SR4	SilentIntergenicRegion	0	9.08	0.00	7.31	0.69	6.20	4.88	4.83	0.42	1.71	3.99	2.16	1.23	3.27	3.90	9.46	0.86	1.54	1.85	0.77	4.59	1.18	5.46	0.26	2.74	2.95	2.00	1.78	0.09	2.29
9	IG29_AR9	ActiveIntergenicRegion	0	6.05	0.00	3.54	0.00	4.05	2.36	4.12	0.29	0.73	2.16	0.79	0.50	1.20	1.91	4.34	0.79	1.83	1.86	0.50	1.73	1.38	1.56	2.24	1.13	0.95	0.56	0.63	0.23	1.95
10	ER1a	ExonRegion	0	4.80	1.30	6.11	1.93	9.52	12.49	3.15	1.88	4.08	24.19	2.30	7.43	7.53	10.86	4.70	7.55	14.79	20.56	3.45	3.89	7.22	4.50	8.29	8.26	2.34	14.65	6.50	9.13	16.28
11	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	1.84	1.21	2.33	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	2.99	0.00	0.00	0.00	2.16	1.91
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.84	9.70	23.72	0.00	7.37	14.12	12.70	9.31	6.43	36.79	7.56	10.27	21.53	22.95	0.00	10.10	17.42	28.51	0.00	13.98	13.28	4.38	11.67	19.32	9.09	8.02	35.38	21.30	10.56
13	I1	Intron	0	1.50	0.50	0.39	0.00	0.38	2.57	0.47	0.43	0.66	0.90	0.09	0.43	0.20	1.41	1.08	1.24	1.74	2.15	0.75	0.86	0.78	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.51	0.10
14	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.52	0.65	0.51	0.00	0.50	2.51	0.41	0.56	0.74	1.17	0.12	0.56	0.26	1.84	0.47	1.62	2.27	2.41	0.97	1.12	1.01	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.33	0.14
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	2.75	4.58	1.55	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.21	2.75	4.62	0.00	3.31	0.00	2.33	0.00	5.44	0.00	0.00	0.00	2.29	1.52
16	ER2a	ExonRegion	0	4.29	8.21	14.65	11.67	22.63	16.45	7.01	5.43	8.68	33.58	3.86	10.43	13.23	24.53	5.48	19.55	14.41	40.10	14.16	13.43	15.39	6.18	15.54	21.49	7.53	10.90	24.80	15.28	9.41
17	E2_Da	NovelBoundary	0	2.24	4.46	4.46	0.00	0.00	0.00	0.00	4.33	0.00	5.43	0.00	6.30	1.43	5.49	16.74	2.98	9.39	4.62	8.09	0.00	5.86	2.38	0.00	6.10	1.48	0.00	4.62	5.80	1.58
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	7.31	4.46	12.41	0.00	33.75	20.03	0.00	0.00	2.92	28.00	4.05	10.45	6.11	17.61	0.00	5.74	7.61	27.74	8.09	0.00	19.21	1.99	15.61	8.37	10.99	9.23	9.44	13.61	13.21
19	I2	Intron	0	4.46	0.66	4.26	0.63	4.58	2.42	1.18	1.89	0.90	6.77	0.49	2.46	1.22	1.72	2.97	2.00	5.47	2.64	1.97	1.29	2.26	0.63	0.58	1.83	0.80	1.70	3.65	2.15	2.24
20	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.63	1.66	5.64	0.61	7.54	3.66	2.43	3.47	0.86	9.68	0.52	3.90	1.36	2.33	3.93	3.54	8.94	2.20	2.46	1.80	3.68	1.39	0.77	3.20	0.65	2.83	6.12	2.65	3.69
21	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	2.93	0.18	4.08	0.40	2.73	1.84	0.67	1.23	0.97	5.55	0.26	1.73	1.28	1.49	2.53	1.50	3.77	3.17	1.96	1.14	1.43	0.30	0.40	1.28	0.85	1.14	2.25	2.19	1.67
22	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	2.38	0.00	1.48	1.59	4.33	1.52	0.00	0.41	0.75	4.16	1.32	1.64	0.58	1.10	2.24	0.00	3.31	1.71	0.71	0.61	1.90	0.00	0.80	0.48	0.95	1.05	2.84	0.72	0.74
23	E3_Aa	NovelBoundary	0	6.02	4.85	3.46	0.00	12.08	1.80	0.00	0.00	2.41	6.47	0.00	1.51	5.35	0.00	0.00	3.37	12.27	4.62	0.00	3.80	3.61	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	4.40	0.00
24	ER3a	ExonRegion	0	7.18	10.00	15.62	3.47	14.96	15.05	3.49	4.08	17.96	22.31	6.23	13.67	13.37	13.61	8.86	12.86	17.23	24.29	12.83	8.22	15.94	6.85	11.97	16.95	7.41	10.54	9.68	13.36	13.58
25	IG30_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.38	0.00	0.60	0.00	0.00	1.26	0.00	0.22	0.50	0.86	0.00	0.18	0.35	0.89	0.75	0.29	0.98	0.62	0.38	0.43	1.02	0.36	0.00	0.83	0.81	0.00	0.00	0.39	2.19
26	IG30_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	2.78	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	2.05	0.00	1.02	3.48	1.66	0.00	0.00	0.00	2.91	1.25	1.03	0.00	6.90	0.67	0.00	0.00	1.38	1.87
27	IG30_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.67	0.00	1.05	2.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.36	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.00