Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	LRRC69	Gene	0	5.15	8.18	0.86	1.69	3.65	6.39	3.18	1.89	2.76	3.64	2.30	2.26	1.63	3.40	5.80	5.04	7.70	2.77	4.15	1.38	3.20	0.92	0.57	7.46	2.81	0.50	1.73	17.59	0.61
2	343709	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	5.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	448384	Transcript	0	5.80	4.84	0.26	1.89	5.35	7.91	2.99	1.27	2.52	2.58	3.28	0.98	2.13	2.76	7.77	4.90	5.85	1.01	3.46	1.31	2.60	0.69	0.56	0.89	3.04	0.43	2.22	2.23	0.54
4	ER1a	ExonRegion	0	16.28	16.60	4.28	6.05	6.46	16.04	9.05	3.68	5.74	8.80	6.38	9.22	4.12	8.74	8.23	9.82	22.49	9.64	8.17	1.87	10.34	2.93	1.63	3.24	5.45	1.06	0.49	3.46	1.41
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.32	8.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.79	1.39	2.62	0.00	0.95	0.00	0.00	2.36	9.25	0.00	0.00	9.83	2.14	4.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	16.34	0.00	1.45	9.49	20.04	17.99	5.66	4.23	1.22	0.00	16.51	1.14	4.94	4.76	9.97	10.40	13.08	0.00	0.00	0.00	4.09	1.99	0.00	0.00	3.64	0.00	0.00	4.13	2.58
7	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	6.19	0.00	0.00	3.47	1.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00
9	E1a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	5.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.48	0.00	0.00	0.00	4.03
11	ER2a	ExonRegion	0	10.94	3.78	0.44	0.92	12.04	14.70	2.60	3.80	4.01	5.30	3.82	1.93	2.54	3.51	13.98	13.95	8.10	2.32	9.80	7.75	3.74	4.17	0.73	2.59	7.88	1.26	10.17	1.23	1.25
12	E2_Da	NovelBoundary	0	6.02	0.00	0.00	0.00	18.72	26.09	2.92	2.54	2.92	1.68	0.00	0.00	4.90	4.83	8.37	11.47	11.48	4.62	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	3.30	2.10	0.00	0.00	1.49
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	8.55	3.59	0.00	0.00	0.00	1.96	5.84	0.00	0.00	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	1.98	0.00
14	I2	Intron	0	3.82	4.90	0.47	0.40	4.90	6.13	1.91	0.92	3.84	2.81	1.79	1.30	0.60	2.08	4.84	8.05	8.52	1.97	2.31	2.24	3.54	0.45	0.30	0.90	2.67	0.66	0.87	1.23	0.99
15	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	2.42	5.11	0.07	0.32	4.32	7.09	1.53	0.49	3.07	2.00	1.05	0.74	0.55	1.33	3.21	8.44	6.54	1.49	2.61	2.39	3.83	0.24	0.16	1.06	1.33	0.28	0.90	0.51	0.63
16	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.67	2.92	1.37	0.00	7.13	4.28	2.32	2.37	4.95	3.03	1.77	1.25	0.26	3.32	6.23	5.77	8.24	2.10	2.01	1.61	2.58	0.25	0.21	0.50	4.92	0.96	0.00	1.33	0.66
17	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	5.26	7.40	0.67	1.45	3.68	4.99	2.92	0.37	5.44	6.12	5.19	3.92	1.38	3.31	9.81	10.25	17.99	3.88	1.48	2.62	3.89	1.75	1.09	0.87	4.85	1.83	2.22	4.27	3.18
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	5.19	27.15	1.10	0.00	13.41	0.00	0.00	0.00	10.66	5.47	1.52	3.04	1.75	6.00	8.37	16.29	18.05	4.62	0.00	0.00	8.06	2.09	0.00	0.00	7.05	6.87	0.00	14.51	5.05
19	ER3a	ExonRegion	0	6.05	3.19	0.00	4.71	3.41	13.50	5.49	0.00	2.72	2.55	1.87	0.86	0.84	3.62	34.22	5.37	4.60	2.69	5.21	1.93	6.45	0.05	0.82	1.86	9.32	2.20	1.51	6.63	0.06
20	E3_Da	NovelBoundary	0	8.97	8.14	1.15	0.00	13.26	17.15	2.35	4.48	6.21	5.39	0.00	0.00	1.46	6.12	25.71	12.39	26.22	0.00	0.00	6.53	4.05	0.00	0.00	0.00	5.19	0.00	0.00	3.50	7.03
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	4.72	4.07	0.00	0.00	0.00	8.82	0.00	0.00	3.44	3.52	0.00	1.57	0.00	1.37	8.37	0.00	5.13	0.00	8.09	0.00	4.01	0.00	2.36	2.57	0.00	0.00	5.07	3.59	0.00
22	I3	Intron	0	3.36	2.90	0.42	1.58	4.14	4.04	1.52	0.81	3.89	3.58	1.79	1.82	0.97	2.46	5.86	6.58	7.73	1.70	1.45	1.58	2.64	0.42	0.34	1.28	3.48	1.36	0.72	1.76	1.67
23	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.98	4.86	0.78	3.33	11.91	7.99	3.04	1.28	8.33	9.39	3.04	2.79	2.70	4.15	9.93	11.37	15.43	1.60	1.11	1.28	6.46	1.88	1.47	3.75	8.14	3.83	1.70	2.46	2.87
24	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	4.73	2.64	0.47	1.81	3.85	4.77	2.22	1.28	4.93	3.46	2.40	2.41	1.16	3.25	7.89	9.02	9.60	2.30	1.71	2.71	3.24	0.34	0.23	1.56	4.60	1.49	0.98	2.26	2.57
25	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.06	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER4a	ExonRegion	0	2.61	17.48	0.44	1.87	4.02	7.01	3.79	3.32	5.53	6.83	2.13	1.60	1.35	5.70	3.40	8.94	8.98	2.67	8.04	0.72	3.06	0.00	1.11	0.99	2.02	0.41	3.25	2.49	1.03
27	E4_Da	NovelBoundary	0	5.72	9.11	0.95	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	3.82	12.52	0.00	0.00	3.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.58	0.00
28	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	5.75	3.34	2.46	0.00	3.05	3.79	1.20	0.00	6.27	2.66	0.00	0.00	4.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E4a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00
30	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.21	3.53	0.24	3.08	1.30	2.89	1.05	0.89	3.89	3.14	1.64	3.00	0.07	3.17	3.45	4.68	7.57	3.96	0.77	1.00	1.31	0.00	0.00	0.26	2.31	1.08	3.03	1.79	0.88
31	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	2.21	6.47	0.00	0.00	0.00	2.19	0.56	0.75	2.04	1.94	0.00	2.40	0.87	3.08	1.87	4.72	7.22	5.26	5.17	7.81	1.09	0.00	0.00	0.00	2.31	2.10	0.00	1.20	0.00
32	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.60	4.56	1.25	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	2.68	0.00	0.00	1.87	0.00	3.39	0.00	3.29	1.33	10.02	8.09	3.14	1.56	0.00	1.82	0.00	1.59	0.00	0.00	3.68	0.00
33	ER5a	ExonRegion	0	2.98	11.41	0.00	0.00	2.91	3.82	1.09	0.10	2.76	1.26	0.96	1.75	3.27	3.20	0.00	5.48	4.12	1.36	0.00	1.41	2.04	0.00	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E5_Da	NovelBoundary	0	2.95	17.74	1.40	0.00	0.00	8.29	2.92	2.14	0.00	5.51	0.00	2.80	0.00	6.49	16.34	3.75	11.01	13.87	0.00	8.10	10.91	0.00	2.31	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00	5.35
35	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER6a	ExonRegion	0	1.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	1.28	0.00	0.35	0.65	0.07	0.02	0.03	0.50	0.00	0.00	1.72	0.51	0.04	0.00	0.45	0.00	0.00	4.70	0.56	0.00	0.00	0.32	0.00
37	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.08	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00
38	E6a_E8a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER7a	ExonRegion	0	1.21	0.69	0.00	0.00	1.83	0.00	1.11	1.10	0.24	0.63	1.65	0.00	1.64	0.51	0.00	0.00	4.46	0.26	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	18.09	0.75	0.00	0.00	42.12	0.57
40	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.93	0.00	0.00	0.00	1.55	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	19.92	1.89	0.00	0.00	89.19	0.00
41	ER8a	ExonRegion	0	0.34	5.50	0.00	0.00	0.53	0.44	0.57	0.85	0.65	0.80	0.38	0.29	0.00	0.73	2.21	0.00	1.54	0.62	0.51	0.00	0.23	0.00	0.00	14.19	0.31	0.00	0.29	41.54	0.00