Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	PIWIL2	Gene	0	1.45	0.85	1.04	0.33	0.71	1.55	0.57	0.74	1.48	1.31	0.20	0.72	0.33	1.27	0.66	1.52	1.46	2.07	1.26	0.82	1.81	0.79	1.99	1.75	1.91	1.74	0.96	1.18	0.74
2	356766	Transcript	0	0.10	0.20	0.85	0.00	0.28	0.52	0.00	0.19	0.45	0.13	0.01	0.91	0.00	0.24	0.11	0.41	0.17	3.10	0.35	0.20	0.38	0.27	0.25	0.46	1.08	0.14	0.48	0.02	0.05
3	454009	Transcript	0	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.15
4	IG9_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	12.98	26.50	20.70	13.32	39.50	20.53	5.38	11.33	16.01	22.09	26.34	21.62	10.37	24.30	7.52	21.28	36.39	23.67	22.44	8.20	31.16	7.92	20.43	21.35	21.35	20.89	26.47	19.27	14.20
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.30
8	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER3a	ExonRegion	0	0.04	0.67	1.08	0.00	0.00	0.29	0.36	0.00	0.00	0.30	0.00	0.47	0.00	0.19	0.00	0.89	0.07	1.38	0.00	0.69	0.12	0.00	0.27	0.45	0.50	2.63	0.00	0.00	0.28
10	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.51	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	3.39	2.05	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.16	0.18	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	1.54	0.53	0.00	1.28	1.33	0.00	0.97	1.10	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	2.46	2.87	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.40	0.00	0.00	1.49	1.48	0.00	0.00	0.39	0.00	0.68	0.00	0.99	0.00	1.57	1.28	1.35	0.00	1.01	1.15	1.32	1.74	3.90	1.02	4.04	0.00	0.00	0.73
14	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	4.62	0.00	0.00	1.64	0.00	2.41	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	1.83	0.50	0.00	0.00	1.00	0.00	0.54	0.00	1.55	0.00	0.61	0.30	3.14	0.00	0.00	0.63	0.89	1.80	1.68	1.44	0.00	0.00	0.00	0.88
16	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	3.22	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	1.30	0.00	1.13	0.00	0.00	0.95	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	6.25	0.00	3.45	0.00	0.00	0.00	1.55
17	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.22	0.79	0.00	2.44	0.00	1.34	0.00	0.96	1.27	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.62	1.40	0.00	0.00	0.19
18	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.31	0.00	0.00	0.00
19	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.53	0.00	3.10	0.00	1.22	0.00	0.00	0.28	1.27	0.00	1.29	0.00	0.53	0.00	1.72	0.75	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.93	1.83	0.72	0.00	0.00	0.86
20	E8_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.43	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER9a	ExonRegion	0	0.00	2.13	1.36	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	1.14	1.74	0.00	0.97	0.00	1.73	0.00	1.58	1.75	2.73	0.00	0.00	0.13	0.00	1.48	1.76	0.93	2.56	0.00	0.00	0.00
23	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
24	ER10a	ExonRegion	0	1.35	0.57	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.59	3.20	0.00	3.12	2.02	1.79	2.01	0.00	0.70	1.14	1.32	1.35	2.10	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	4.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	1.43	4.05	0.00	0.00	2.18	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER11a	ExonRegion	0	0.00	1.04	0.52	3.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	0.82	0.16	1.81	0.00	0.98	2.21	5.53	0.00	0.00	2.44	1.00	2.44	0.00	0.99	1.41	0.00	0.00	0.00
27	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	3.90	0.00	2.83	2.43	4.62	0.00	0.00	1.60	2.09	1.97	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E12_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER12a	ExonRegion	0	0.00	1.06	0.59	0.00	0.00	0.43	0.00	0.37	1.02	0.44	0.00	1.33	0.00	2.34	0.00	0.75	1.81	3.55	2.42	0.74	2.67	0.86	1.40	0.00	2.95	0.42	0.00	0.00	0.77
30	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	2.19	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	2.59	4.62	8.09	0.00	2.05	0.00	0.00	3.05	3.64	0.00	0.00	0.00	6.97
31	ER13a	ExonRegion	0	0.13	1.51	1.11	0.00	0.00	2.09	0.00	0.28	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	1.49	2.13	0.51	0.37	0.46	1.91	1.08	3.21	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	3.85
32	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	5.18	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	3.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	4.75
33	ER14a	ExonRegion	0	1.10	0.00	3.55	0.00	0.00	0.86	0.00	1.04	1.40	1.60	0.00	0.48	0.00	3.31	0.00	1.01	0.56	0.00	2.31	1.12	3.85	0.56	2.35	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	1.13
34	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	1.55	8.15	0.00	1.42	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	6.14	2.48	4.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72
35	ER15a	ExonRegion	0	0.78	1.14	1.47	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.19	1.26	0.00	0.81	0.00	1.81	0.00	0.00	0.77	0.00	0.83	0.00	0.92	0.29	1.77	0.00	0.59	0.51	0.78	0.00	3.44
36	E15a_E16a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	1.44	4.08	9.14	0.00	0.00
37	E16_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER16a	ExonRegion	0	0.00	0.29	2.89	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	1.05	0.00	1.03	0.00	1.99	0.00	1.91	1.49	0.86	0.00	1.23	1.56	0.81	3.16	0.70	0.99	0.77	2.31	0.00	1.14
39	E16_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	E16a_E17a	KnownJunction	0	0.00	3.88	5.66	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.83	0.00	0.00	0.00	3.44	3.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER17a	ExonRegion	0	0.00	0.71	2.05	0.00	0.00	0.66	0.00	0.44	0.00	0.78	0.00	0.21	0.00	0.53	0.00	2.16	1.77	2.08	0.86	0.74	1.26	1.19	0.55	0.75	1.79	1.50	1.98	0.44	0.92
42	E17a_E18a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.32	0.00	0.00	1.96	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	2.79	0.00	0.00	0.00	1.68	2.48	0.00	0.00	1.82	5.02	0.00	0.00	0.00
43	ER18a	ExonRegion	0	1.43	0.00	1.24	0.00	0.00	0.30	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	2.61	0.71	1.93	0.00	0.00	0.52	0.49	1.77	1.05	2.62	0.96	0.00	0.00	0.03
44	E18a_E19a	KnownJunction	0	2.83	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00
45	ER19a	ExonRegion	0	1.01	0.00	1.22	0.00	0.00	2.40	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.57	0.00	2.29	0.63	0.84	0.00	0.00	0.00	0.79	2.69	1.88	2.48	1.54	0.00	0.63	0.78
46	E19a_E20a	KnownJunction	0	3.01	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.53	0.00	5.49	0.00	0.00	1.66	1.29
47	ER20a	ExonRegion	0	1.95	0.00	1.42	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	3.50	0.02	0.64	0.00	0.00	0.00	0.73	1.24	0.00	2.09	0.23	0.00	0.11	0.12
48	E20a_E21a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	4.20	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	3.82	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	2.24	2.51	0.00	1.93	1.89	0.00	0.00	0.00
49	ER21a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	0.45	1.29	1.54	1.28	0.00	0.00	0.26	1.89	0.00	1.17	1.32	0.00	0.00	0.65
50	E21a_E22a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	3.71	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	2.36	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00
51	ER22a	ExonRegion	0	0.03	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.90	0.58	0.00	0.25	0.00	1.66	0.00	0.00	1.78	1.06	0.75	0.55	0.34	0.00	2.63	0.00	1.62	0.00	1.47	0.00	0.27
52	E22a_E23a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER23a	ExonRegion	0	0.93	0.00	0.39	0.00	0.05	0.41	1.90	0.00	0.53	1.36	0.00	0.00	0.00	2.23	0.00	0.00	0.69	0.91	0.00	1.30	1.23	0.00	1.51	0.00	0.75	0.00	2.92	0.00	0.39
54	E23a_E24a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	5.81	0.00	1.68
55	ER24a	ExonRegion	0	9.07	3.52	2.12	1.52	3.78	4.95	3.55	4.03	7.09	6.61	1.43	2.33	2.40	3.03	4.40	4.57	5.50	5.38	5.28	3.31	8.01	2.42	7.05	7.77	6.82	8.54	2.41	8.63	2.24
56	E24_Da	KnownBoundary	0	2.24	19.29	5.26	0.00	5.31	4.80	5.44	0.00	3.75	3.32	0.00	2.53	1.40	5.36	0.00	3.67	2.86	0.00	0.00	6.70	8.62	2.19	3.69	12.68	6.36	10.43	5.67	7.28	3.73
57	ER24b	ExonRegion	0	0.29	0.60	0.57	0.00	0.83	1.56	0.00	0.57	1.34	0.40	0.04	0.43	0.01	0.71	0.32	1.23	0.51	1.70	1.04	0.61	1.13	0.80	0.74	1.38	1.14	0.43	1.44	0.06	0.15