Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	FAM167A	Gene	0	10.64	4.36	69.79	119.25	1.67	3.52	11.98	39.13	45.14	27.45	123.17	82.10	9.26	435.62	0.79	207.86	98.07	4.56	146.74	19.61	36.82	33.61	63.27	77.16	268.59	231.11	82.59	127.89	41.68
2	284486	Transcript	0	6.96	2.35	45.61	77.50	1.27	1.59	6.28	22.15	25.74	16.82	79.20	49.01	5.87	284.52	0.45	148.80	57.13	4.61	85.64	16.27	23.58	23.18	46.14	43.57	167.12	134.44	43.42	78.64	24.97
3	398342	Transcript	0	0.00	0.00	0.84	2.39	0.00	0.00	2.19	0.21	0.26	0.50	0.00	0.14	0.00	1.19	0.00	2.61	0.17	0.00	5.96	0.00	0.16	0.00	5.36	3.38	0.00	0.36	0.00	0.56	0.00
4	IG22_SR5	SilentIntergenicRegion	0	1.51	3.09	2.05	7.74	0.00	2.63	1.25	1.62	0.00	0.00	0.70	0.47	2.52	6.83	8.90	8.11	3.18	11.64	3.59	36.87	1.93	0.00	8.67	0.00	5.13	25.01	3.18	7.67	0.91
5	IG22_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	4.12	5.83	5.96	37.61	0.00	3.35	3.29	8.23	1.33	0.85	2.88	0.82	7.36	15.50	13.94	19.40	16.25	35.68	18.32	48.89	3.10	0.53	53.38	1.27	6.84	31.78	26.12	32.88	3.83
6	IG22_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	0.32	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.87	0.53	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01	0.00	0.38	0.31
7	IG22_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	1.83	0.24	0.00	1.37	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	3.37	1.02	0.49	0.00
8	IG22_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.33	0.03	0.96	2.01	0.00	0.08	0.06	0.28	0.27	0.16	0.75	0.46	0.02	2.78	0.26	6.47	1.65	0.22	1.07	1.08	0.36	0.58	0.71	0.96	2.62	8.21	1.44	1.37	0.23
9	ER1a	ExonRegion	1	5.54	1.16	26.50	73.44	1.75	0.00	0.04	6.25	2.90	5.30	20.82	11.76	1.42	127.14	0.00	108.07	19.68	3.90	19.51	11.30	9.01	9.46	22.17	6.57	37.91	56.52	7.49	35.32	8.29
10	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E3a	KnownJunction	0	2.36	0.00	23.15	10.78	0.00	0.00	2.46	7.56	4.75	8.63	44.73	21.39	3.60	159.77	0.00	77.19	20.82	4.62	40.46	14.14	13.04	18.04	38.02	13.28	94.49	53.64	2.39	35.59	6.70
12	E1a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.53	0.00	7.65	4.79	0.00	8.09	0.00	0.00	2.24	2.17	0.00	3.64	0.00	2.53	0.00	0.00
13	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	3.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.75	0.00	0.18	0.71	0.00	0.00	0.00
14	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	8.13	0.02	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.86	0.00	1.80	2.06	0.00	0.00	0.00
15	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.09	0.00	2.45	0.58	0.00	0.00	0.51	0.00	1.64	0.36	0.30	0.00	0.00	3.08	0.00	3.54	0.30	0.00	1.07	0.00	0.96	0.45	1.25	0.54	1.02	5.98	0.01	2.21	0.57
16	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	6.43	0.00	6.73	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	2.25	0.00	0.00	1.24	0.00	5.44	0.00	3.37	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	1.80	1.81	0.00	0.00	6.55	1.83	4.89	1.34
17	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.42	0.13	7.13	3.34	0.10	0.10	0.30	0.97	1.29	1.36	0.30	1.28	0.14	4.95	0.11	11.27	3.93	0.02	3.57	0.96	4.77	0.18	0.88	2.30	1.97	10.40	1.45	5.71	0.76
18	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.78	0.50	2.29	1.81	0.00	0.21	0.19	0.29	2.05	0.90	0.42	2.96	0.63	2.80	0.00	10.83	1.30	0.25	5.77	3.00	3.66	0.00	0.77	6.25	1.67	8.82	1.69	5.97	0.42
19	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	8.31	0.09	9.59	12.28	0.00	0.36	0.31	2.08	2.59	0.62	2.77	2.65	0.44	11.39	0.27	18.16	6.84	0.45	8.74	7.51	3.18	1.63	0.67	19.96	9.39	20.00	5.01	16.71	2.60
20	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	1.98	0.00	3.02	0.00	0.00	0.42	0.10	1.65	2.77	1.87	0.00	4.17	0.00	6.58	0.00	6.37	2.22	0.00	1.66	0.00	0.64	0.00	0.00	2.57	3.31	2.62	0.58	5.26	0.65
21	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.51	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	1.72	1.73	0.28	4.50	0.00	4.91	0.00	5.18	2.41	0.00	1.86	0.00	0.85	0.00	0.00	1.52	2.50	2.52	0.43	2.71	0.79
22	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.16	0.00	3.16	0.90	0.29	0.00	0.00	0.00	1.03	4.68	0.00	1.27	0.00
23	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.91	0.00	0.00	0.68	0.00	0.66	0.58	0.80	0.42	0.00	3.65	0.00	0.00	0.90	0.00	3.54	0.00	0.49	0.61	0.62	0.73	0.48	6.37	0.00	2.58	0.00
24	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	13.43	0.00	0.00	0.00	0.00	2.64	1.12	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	12.84	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	3.93	0.00
25	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	20.71	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	2.91	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.53	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00
26	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.15	4.79	0.00	0.00	1.68	0.42	0.51	0.99	0.01	0.28	0.00	2.39	0.00	1.40	0.35	0.00	3.84	0.00	0.33	0.00	1.40	0.71	0.01	0.73	0.00	1.12	0.00
27	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	9.31	6.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	1.23	1.75	0.00	7.33	7.57	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29
29	ER3a	ExonRegion	0	7.16	1.69	43.32	78.78	1.28	1.05	5.25	15.95	7.20	11.24	48.09	33.05	4.71	245.54	0.00	131.99	51.58	3.46	68.11	13.15	21.66	20.24	42.71	24.44	103.53	136.87	22.82	71.49	14.48
30	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	20.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.46	0.00
31	E3a_E4a	KnownJunction	0	10.32	0.00	78.33	102.02	6.04	1.96	5.26	39.22	15.62	25.61	101.04	69.31	2.74	321.32	0.00	182.30	100.66	9.25	97.11	14.56	21.30	31.02	56.24	28.41	121.35	192.64	58.00	90.81	31.07
32	I3	Intron	0	0.02	0.07	0.06	0.40	0.11	0.05	0.00	0.00	0.06	0.05	0.03	0.00	0.00	0.46	0.00	0.53	0.15	0.04	3.34	0.00	0.05	0.02	0.10	0.05	0.09	0.19	0.08	13.68	0.00
33	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.11	0.09	0.34	0.17	0.05	0.00	0.00	0.09	0.02	0.04	0.00	0.00	0.50	0.00	0.67	0.17	0.07	3.42	0.00	0.05	0.00	0.15	0.07	0.05	0.16	0.00	15.48	0.00
34	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.52	0.00	0.37	0.23	0.00	5.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	19.55	0.00
35	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.32	0.08	0.00	2.76	0.00	0.08	0.09	0.00	0.00	0.23	0.17	0.39	10.39	0.00
36	Ix	Intron	1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	94.44	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	154.60	0.00
37	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	95.54	0.00	1.41	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	156.56	0.00
38	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.13	0.24	0.00	0.00	0.09	0.44	0.00	0.45	0.07	0.00	13.70	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.14	0.56	0.00	25.33	0.09
39	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.13	0.24	0.00	0.00	0.09	0.44	0.00	0.45	0.07	0.00	13.70	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.14	0.56	0.00	25.34	0.09
40	Ix	Intron	0	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.10	0.00	0.00	1.09	0.00	0.79	0.13	0.00	1.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	16.09	0.00
41	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.10	0.00	0.00	1.09	0.00	0.80	0.13	0.00	1.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	16.21	0.00
42	Ix	Intron	0	0.05	0.00	0.10	0.33	0.00	0.02	0.02	0.06	0.12	0.17	0.15	0.11	0.00	1.45	0.00	0.92	0.53	0.00	4.13	0.00	0.15	0.00	0.19	0.27	0.74	0.67	0.17	17.81	0.14
43	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.05	0.00	0.10	0.33	0.00	0.02	0.02	0.06	0.12	0.17	0.15	0.11	0.00	1.45	0.00	0.92	0.53	0.00	4.13	0.00	0.15	0.00	0.19	0.27	0.74	0.67	0.17	17.82	0.14
44	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.73	0.00
45	ER4a	ExonRegion	0	10.35	3.71	66.24	102.09	1.21	3.57	8.92	33.98	17.80	24.87	83.66	58.21	6.37	360.58	0.00	180.63	74.20	4.65	119.00	21.23	26.42	33.19	59.05	48.13	211.44	216.60	48.73	112.41	23.32
46	E4_Da	KnownBoundary	0	13.45	0.00	72.68	77.00	0.00	9.13	8.18	59.72	24.48	23.01	62.70	51.93	5.06	384.22	0.00	193.47	61.00	0.00	218.50	47.72	35.38	32.28	64.27	52.88	243.53	136.04	62.22	116.78	21.03
47	ER4b	ExonRegion	0	12.98	5.88	87.20	148.27	2.05	4.77	16.33	52.64	69.57	36.54	172.04	113.88	12.60	566.64	1.34	261.13	130.89	5.31	196.94	23.37	48.69	42.06	78.24	110.84	368.96	293.14	120.38	165.03	59.91