Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	MFHAS1	Gene	0	25.08	96.71	80.64	22.26	2.56	94.43	6.22	14.71	34.76	62.77	42.95	30.05	29.02	734.81	40.70	136.63	237.51	157.19	232.47	156.87	107.69	55.30	153.84	120.23	226.30	436.91	49.93	887.85	65.04
2	276282	Transcript	0	28.69	161.87	99.49	23.86	1.99	96.12	6.30	14.99	71.31	75.84	50.78	42.27	42.91	810.31	45.71	108.19	348.93	167.73	304.30	190.01	128.88	54.01	165.55	143.77	275.08	810.64	70.74	1469.40	94.97
3	ER1a	ExonRegion	0	21.95	59.10	82.35	11.87	1.75	65.20	4.60	15.58	17.34	43.51	23.62	26.94	22.95	573.48	19.22	95.24	212.16	145.41	116.95	86.08	73.51	50.40	134.13	48.10	119.60	405.30	20.98	682.11	41.53
4	E1_Da	NovelBoundary	1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	3.20	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.95	4.62	0.00	0.00	1.80	0.00	2.17	3.05	0.00	0.00	0.00	15.41	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	22.12	208.15	131.85	32.35	0.00	71.98	7.78	14.53	59.44	103.54	50.20	58.34	50.25	714.37	40.86	70.38	496.19	190.21	371.80	105.85	140.71	40.26	186.11	85.30	198.90	797.22	64.26	1268.64	99.01
6	I1	Intron	0	0.16	0.43	0.11	0.10	0.01	0.20	0.06	0.04	0.65	0.29	0.08	0.11	0.15	1.27	1.07	0.26	2.42	0.34	1.59	0.50	0.95	0.16	0.26	0.51	0.65	2.06	0.10	6.19	0.39
7	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.46	0.00	0.13	0.16	0.14	0.21	0.37	2.73	0.00	0.28	2.90	0.44	0.36	1.26	0.98	0.00	0.21	0.25	0.00	1.08	0.00	6.88	0.23
8	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.29	0.39	0.26	0.22	0.00	0.55	0.15	0.00	0.72	0.42	0.20	0.07	0.20	1.32	1.92	0.30	4.21	0.56	2.44	0.22	1.29	0.00	0.28	0.57	0.55	2.47	0.06	6.27	0.49
9	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	3.09	0.83	0.18	0.38	0.00	0.49	3.79	0.55	2.07	0.00	1.48	0.00	1.67	0.56	0.28	0.58	1.46	2.67	0.00	2.71	0.00
10	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	4.27	0.00
11	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.34	0.54	0.04	0.00	0.00	0.29	0.00	0.05	0.51	0.31	0.00	0.26	0.28	0.98	1.88	0.82	5.72	0.67	0.85	0.37	1.10	0.19	0.34	0.30	0.38	4.40	0.00	7.41	0.62
12	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.52	0.34	0.44	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00	1.73	0.24	2.75	0.00	1.18	0.00	0.00	0.27	0.53	0.73	0.00	2.81	0.00
13	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.10	0.85	0.08	0.00	0.00	0.36	0.16	0.03	1.60	0.29	0.07	0.05	0.28	0.99	1.40	0.44	3.65	0.87	2.03	0.21	1.07	0.08	0.20	0.37	0.62	1.61	0.00	5.11	0.26
14	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	1.76	1.01	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	2.77	4.16	0.00	3.36	1.47	3.37	2.09	0.77	0.18	0.00	0.44	0.73	3.14	0.00	2.93	0.00
15	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.55	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.79	0.05	0.00	0.16	0.00	1.81	5.01	0.00	3.81	0.84	3.35	0.50	1.46	0.23	0.23	0.78	0.91	1.81	0.00	9.17	0.00
16	I1_SR7	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	1.51	0.00	0.00	3.73	0.00	6.07	1.77	0.00	0.00	0.79	1.47	1.61	0.00	0.71	0.64	0.00	2.84	0.00
17	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.46	0.00	0.00	6.82	0.00	6.92	0.42	0.00	2.81	0.00	0.27	0.00	0.00	2.11	3.01	0.00	5.49	0.00
18	I1_SR8	SilentIntronRegion	0	0.06	0.45	0.12	0.10	0.00	0.12	0.06	0.00	0.89	0.36	0.05	0.18	0.02	1.79	0.86	0.35	2.39	0.65	1.92	1.68	1.77	0.43	1.44	0.69	0.90	6.01	0.23	6.18	1.86
19	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.35	1.57	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	1.24	0.23	0.19	0.30	0.67	2.00	0.75	0.81	4.76	0.94	7.67	0.77	0.65	0.59	0.36	0.00	0.66	3.27	0.59	4.82	0.00
20	I1_SR10	SilentIntronRegion	0	0.25	0.79	0.06	0.00	0.19	0.08	0.00	0.14	1.00	0.29	0.23	0.11	0.02	0.55	0.83	0.05	2.53	0.22	1.05	0.42	1.01	0.07	0.30	0.66	0.27	2.47	0.32	3.28	0.26
21	I1_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	1.24	0.08	0.88	0.00	0.58	0.84	2.30	0.00	2.07	0.79	0.30	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.53	0.66	0.00	2.23	0.25
22	I1_SR11	SilentIntronRegion	0	0.32	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.55	1.31	0.22	0.00	0.00	0.81	1.30	1.39	0.75	5.25	1.32	4.81	7.35	2.52	0.54	1.36	2.57	0.65	17.90	0.00	12.48	0.00
23	I1_AR12	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	2.50	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	1.43	0.00	13.10	0.00	3.80	0.00
24	I1_AR13	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.55	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.27	0.18	0.00	0.20	0.00	1.53	1.40	0.00	2.56	0.00	3.38	1.33	1.08	0.00	0.29	1.53	1.13	2.28	0.00	5.98	0.32
25	I1_SR14	SilentIntronRegion	0	0.13	0.39	0.20	0.43	0.00	0.00	0.00	0.22	0.07	0.17	0.07	0.00	0.00	2.47	0.00	0.15	0.27	0.00	2.11	0.40	0.43	0.00	0.11	0.26	0.77	1.04	0.00	7.74	0.32
26	I1_AR15	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.38	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.09	0.22	0.15	2.59	0.00	0.29	1.22	0.00	2.26	0.00	0.26	0.00	0.00	1.77	1.19	2.96	0.00	9.61	0.55
27	I1_SR15	SilentIntronRegion	0	0.20	0.30	0.00	0.00	0.00	0.78	0.38	0.00	0.32	0.41	0.15	0.00	0.25	2.96	0.44	0.00	0.86	0.91	3.32	0.00	0.46	0.00	0.00	1.02	1.21	1.34	0.00	9.54	0.57
28	I1_AR19	ActiveIntronRegion	1	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	9.57	0.00	0.00	3.17	0.27	1.07	1.57	0.48	0.00	0.00	1.14	0.41	2.36	0.00	14.70	0.00
29	I1_SR16	SilentIntronRegion	1	0.43	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.18	0.00	12.72	1.70	0.63	1.52	0.29	6.30	3.30	0.78	0.00	0.04	3.39	8.00	2.10	1.89	121.86	0.24
30	I1_AR20	ActiveIntronRegion	0	6.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.40	0.00	0.00	0.00	42.26	2.64	2.14	0.78	0.00	32.85	14.47	1.27	2.03	0.57	17.37	25.91	3.83	1.43	331.81	0.63
31	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.56	4.25	0.00	6.16	0.00
32	ER2a	ExonRegion	1	44.79	198.96	140.97	29.83	3.92	140.08	9.49	28.59	179.57	101.61	64.66	67.10	61.04	1212.36	63.46	116.95	599.57	232.17	362.10	267.55	166.42	88.42	248.53	183.42	423.56	1845.23	89.73	3311.16	156.27
33	E2_Da	NovelBoundary	1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	3.91	0.00	0.00	0.00	15.47	0.00	0.00	13.53	13.87	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	7.08	12.75	0.00	19.50	3.43
34	E2a_E3a	KnownJunction	1	24.01	169.28	70.41	0.00	0.00	46.16	0.00	4.68	37.61	27.12	30.27	24.85	40.06	488.62	17.34	26.09	170.96	92.98	186.13	181.77	83.19	27.23	68.01	122.98	180.56	610.84	66.25	926.08	66.98
35	I2	Intron	1	1.54	1.75	0.56	0.53	0.00	1.92	0.09	0.26	0.78	1.24	0.38	0.24	0.20	10.11	2.13	2.25	7.14	3.93	9.52	3.77	2.27	0.24	0.96	1.80	3.71	3.82	1.07	21.94	0.51
36	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.31	1.13	0.35	0.64	0.00	1.56	0.18	0.33	0.49	0.93	0.43	0.28	0.10	9.77	2.02	2.74	5.92	3.13	8.27	3.73	2.03	0.22	0.73	1.09	2.93	2.40	0.22	17.00	0.34
37	I2_AR1	ActiveIntronRegion	1	2.93	1.26	1.75	0.82	0.00	1.93	0.00	0.00	0.87	0.36	0.27	0.28	0.00	11.77	1.42	2.88	9.68	5.15	6.60	1.74	1.08	0.00	0.41	0.43	3.61	4.35	1.80	22.67	0.46
38	I2_AR2	ActiveIntronRegion	1	0.00	0.00	3.99	0.00	0.00	3.08	0.00	0.00	3.02	1.84	0.00	0.00	0.00	16.11	6.37	2.97	13.33	4.89	21.38	5.33	5.46	0.00	0.94	0.74	8.43	4.99	3.16	30.80	0.79
39	I2_SR2	SilentIntronRegion	1	2.10	3.84	0.61	0.35	0.00	2.95	0.00	0.14	1.67	1.29	0.47	0.06	0.27	8.71	1.97	1.28	11.11	3.94	12.77	2.93	3.49	0.00	0.79	1.81	3.93	2.40	1.82	24.00	0.74
40	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.86	15.48	4.61	3.62	0.00	8.20	0.00	1.26	3.09	7.30	4.37	0.85	1.36	96.46	8.07	10.65	26.37	36.41	80.77	43.05	20.06	3.31	19.86	30.41	43.83	80.79	15.58	301.09	4.06
41	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	1.26	0.35	0.31	0.60	0.00	0.51	0.00	0.00	0.21	0.67	0.11	0.12	0.00	4.27	1.45	0.92	3.45	2.85	2.38	2.57	1.06	0.00	0.17	0.44	0.94	1.49	2.12	5.98	0.11
42	I2_AR4	ActiveIntronRegion	1	1.23	2.00	0.74	0.00	0.00	3.37	0.00	0.25	0.31	2.28	0.00	0.34	1.43	7.47	1.27	1.37	5.91	3.46	6.88	2.96	0.20	0.00	0.75	2.36	3.35	1.30	0.00	27.33	1.28
43	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	1.83	2.92	0.19	0.00	0.00	0.86	0.00	0.27	0.48	1.07	0.00	0.36	0.19	4.44	2.82	0.72	4.00	2.01	6.30	3.00	0.75	0.53	0.79	0.65	1.98	0.69	0.00	5.35	0.70
44	I2_AR5	ActiveIntronRegion	1	0.91	0.00	0.14	0.00	0.00	1.98	0.00	0.31	1.25	2.39	0.00	0.21	0.00	7.16	2.97	1.69	7.49	3.94	9.49	1.62	2.23	0.61	0.46	3.11	3.96	5.22	1.55	14.88	0.28
45	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.66	0.00	3.60	8.73	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	10.94	0.00	8.00	4.09
46	ER3a	ExonRegion	0	30.60	173.89	71.85	45.25	4.30	157.17	9.64	11.59	62.61	103.40	85.13	34.12	40.23	1062.72	87.68	232.28	265.76	177.87	484.50	308.79	180.59	63.74	190.96	279.02	452.77	394.62	112.49	1159.01	111.08
47	IG46_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	42.06	235.46	82.16	66.29	7.47	142.45	17.25	27.80	139.16	106.30	93.30	34.39	80.85	1041.20	185.72	234.30	310.62	161.64	591.96	285.04	149.63	78.11	205.88	429.01	547.72	485.23	139.05	1541.67	179.24
48	IG46_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.72	28.00	0.00	1.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.22	0.00
49	IG46_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	9.02	0.00	0.73	0.00	1.29	0.20	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.64	0.00