Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	LZTS1	Gene	0	2.20	9.46	6.83	0.77	1.74	3.29	0.68	1.61	4.50	7.30	2.13	5.15	2.81	10.44	2.03	4.94	3.95	6.08	1.94	5.15	8.39	2.13	13.43	5.52	15.55	4.90	7.79	301.37	24.45
2	381569	Transcript	0	0.33	0.00	2.25	0.00	0.37	0.10	0.00	0.28	0.09	1.24	1.01	2.10	1.42	5.65	2.26	1.41	0.19	1.05	1.63	0.56	3.77	0.55	4.43	2.14	5.12	0.96	1.96	15.23	3.57
3	360248	Transcript	0	0.00	3.39	2.87	0.00	0.00	2.95	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	2.35	0.00	2.57	7.77	0.00	4.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	4.39	0.00	0.00	43.00	5.15
4	265801	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	334294	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.98	0.00	1.47	0.00	1.11	0.31	0.00	0.84	0.26	0.44	0.31	1.06	1.33	2.18	1.18	1.69	0.00	0.88	0.73	0.50	1.20	1.64	3.20	1.12	2.83	1.43	2.43	1.52	3.95
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	1.33	4.01	1.62	8.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.14	0.00	2.27	2.87	7.05	0.00	1.99	1.80	2.01
8	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.99	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.44	10.71	0.64
9	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	8.81	0.00
10	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.39	0.00
11	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.92	0.00
12	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	0.00	0.05	0.02	0.07	0.05	0.03	0.00	0.02	0.08	0.05	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.40	0.06	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	28.53	0.10
13	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	77.77	0.00
14	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	103.66	0.00
15	E2_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	1.36	0.00	0.00	2.10	7.97	3.82	0.99	9.25	8.09	0.00	0.00	0.00	9.80	2.21	7.65	2.19	0.00	97.19	6.47
16	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	1.39	1.24	1.30	6.12	5.60	2.53	0.58	2.27	4.15	1.17	3.98	0.00	7.84	2.42	5.48	1.44	1.45	42.38	4.75
17	ER2b	ExonRegion	0	0.00	2.99	1.52	0.00	0.00	1.36	0.80	0.85	0.00	4.70	0.77	1.96	0.53	3.71	0.66	4.04	1.71	1.28	1.67	0.00	2.70	0.34	6.65	2.69	6.26	4.08	4.88	90.64	13.20
18	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	8.53	1.54	0.00	0.00	5.45	2.23	0.00	0.00	1.52	2.37	1.45	4.68	8.69	0.00	7.11	1.22	0.00	0.00	0.00	5.54	2.38	9.65	2.93	7.35	0.00	0.00	93.19	13.77
19	ER2c	ExonRegion	0	0.26	3.47	5.55	0.00	1.60	2.93	0.75	1.13	1.10	6.12	1.91	2.98	1.33	8.15	0.00	3.81	1.51	3.25	6.53	1.55	9.20	1.27	10.19	3.10	6.91	3.40	2.05	101.64	10.76
20	E2_Da	KnownBoundary	0	2.83	8.34	6.60	0.00	0.00	6.91	0.00	4.28	0.00	6.71	0.00	2.74	0.00	8.97	0.00	0.00	3.96	0.00	0.00	0.00	5.54	4.33	12.61	0.00	7.50	6.48	4.77	121.54	11.69
21	E2a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00
22	ER2d	ExonRegion	0	3.71	6.52	6.51	0.00	1.32	2.10	1.09	1.82	0.30	7.83	2.60	3.15	0.35	12.27	0.00	6.84	2.80	5.31	5.20	7.46	12.20	1.80	11.52	3.71	11.59	0.94	4.57	121.70	16.26
23	E2_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	53.96	0.00
24	E2b_E3a	KnownJunction	0	7.79	4.85	0.00	0.00	0.00	4.91	0.00	2.54	0.00	3.04	3.23	0.00	0.00	9.06	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	10.25	7.78	4.86	2.51	8.43	5.23	0.00	9.99	74.86	9.18
25	E2b_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	I2	Intron	0	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.12	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.51	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.00	0.00	95.56	0.00
27	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.12	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.51	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.18	0.00	0.00	95.72	0.00
28	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	92.38	0.00
29	ER3a	ExonRegion	0	1.26	7.17	5.24	0.00	1.24	1.97	0.13	0.41	0.36	3.42	1.09	3.85	0.90	8.44	0.59	4.74	3.48	5.18	0.41	3.81	4.14	1.23	11.96	2.23	6.82	2.78	4.31	211.34	12.21
30	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	39.18	0.00
31	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	8.15	0.00	0.00	5.29	0.00	0.00	0.00	3.71	2.82	4.70	0.00	14.53	0.00	3.52	2.27	4.62	0.00	4.13	3.29	0.00	22.70	2.81	6.52	7.34	7.31	194.33	13.50
32	I3	Intron	0	0.30	0.09	0.28	0.00	0.00	0.19	0.00	0.15	0.06	0.20	0.00	0.15	0.00	0.15	0.13	0.21	0.00	0.22	0.09	0.15	0.12	0.15	0.15	0.24	0.24	0.09	0.31	22.41	0.13
33	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.69	0.51	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	67.48	0.54
34	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.22	0.00	0.28	0.00	0.00	0.23	0.00	0.19	0.08	0.25	0.00	0.19	0.00	0.14	0.16	0.25	0.00	0.13	0.11	0.19	0.15	0.18	0.18	0.29	0.29	0.11	0.37	12.86	0.04
35	ER4a	ExonRegion	0	0.32	4.78	7.26	0.00	0.00	2.44	0.28	0.78	0.49	2.80	0.92	5.69	0.73	10.89	0.49	4.38	4.65	3.98	0.00	3.19	3.78	0.78	11.42	3.54	7.25	3.11	4.58	226.41	11.51
36	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	4.85	6.33	0.00	0.00	7.79	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	2.41	0.00	5.05	7.97	0.00	6.28	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	5.02	3.05	5.04	0.00	1.99	155.51	7.73
37	E4a_E4c	KnownJunction	0	0.00	3.39	2.87	0.00	0.00	2.95	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	2.35	0.00	2.57	7.77	0.00	4.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.92	0.00	4.39	0.00	0.00	43.00	5.15
38	ER4b	ExonRegion	0	0.06	7.86	8.70	0.00	1.21	2.96	0.00	0.61	1.40	0.57	0.00	2.74	0.83	8.82	1.70	4.37	6.86	3.56	0.00	2.21	2.77	2.02	4.99	5.54	5.76	0.95	8.27	182.47	8.01
39	E4_Ab	KnownBoundary	0	0.00	4.85	5.48	0.00	5.60	0.00	0.00	2.04	1.67	1.68	0.00	5.60	1.62	7.78	0.00	3.82	2.61	0.00	0.00	4.13	5.66	1.99	5.86	8.13	7.08	2.10	8.80	235.58	6.90
40	ER4c	ExonRegion	0	3.71	3.82	8.55	0.00	4.98	1.26	1.47	1.84	1.12	4.92	0.00	6.18	1.05	7.38	0.00	2.26	3.63	2.66	2.32	1.98	5.32	0.44	13.15	5.64	9.04	1.53	4.70	240.58	5.59
41	E4_Ac	KnownBoundary	0	5.43	0.00	4.41	0.00	0.00	1.96	2.92	0.00	0.00	5.95	0.00	4.91	0.00	8.31	0.00	0.00	2.45	0.00	8.09	0.00	5.29	0.00	11.33	0.00	4.85	0.00	2.19	228.84	4.79
42	ER4d	ExonRegion	0	2.86	13.69	7.17	0.00	0.69	6.15	1.34	0.92	1.12	5.61	0.33	6.36	0.69	8.09	0.00	14.55	2.25	5.76	2.14	1.09	7.21	0.00	13.96	1.25	4.45	3.14	3.66	264.47	7.90
43	E4_Db	KnownBoundary	0	2.54	14.54	5.93	0.00	0.00	9.09	0.00	2.29	1.74	5.95	0.00	5.36	1.59	9.15	0.00	25.32	2.75	13.87	0.00	3.72	11.51	0.00	15.07	2.93	10.27	8.50	2.29	316.27	6.01
44	ER4e	ExonRegion	0	4.26	5.92	7.89	0.00	0.35	4.21	0.00	2.01	1.37	3.71	0.98	7.33	2.03	8.73	1.36	7.34	4.43	7.86	1.88	2.99	9.17	0.89	15.50	5.55	12.10	3.90	4.29	297.35	14.09
45	E4_Dc	KnownBoundary	0	0.00	19.29	4.46	0.00	6.34	1.61	0.00	0.00	1.89	7.67	0.00	8.10	1.46	5.58	0.00	10.56	2.25	9.25	0.00	6.29	5.58	2.33	13.69	5.80	6.71	3.82	6.51	273.09	10.17
46	ER4f	ExonRegion	0	2.67	11.95	7.66	1.23	2.22	3.98	0.90	2.06	6.90	9.50	2.75	5.87	3.92	11.76	2.86	5.06	4.46	7.14	2.20	6.37	10.30	2.72	15.08	7.09	20.56	6.25	10.04	377.14	32.36
47	IG39	Intergenic	0	0.08	0.10	0.03	0.15	0.00	0.14	0.04	0.12	0.17	0.06	0.03	0.05	0.00	0.07	0.25	0.07	0.29	0.12	0.02	2.66	0.05	0.04	0.13	0.34	0.11	0.02	0.07	56.72	0.45
48	IG39_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.08	0.10	0.03	0.15	0.00	0.14	0.04	0.12	0.17	0.06	0.03	0.05	0.00	0.07	0.25	0.07	0.29	0.12	0.02	2.66	0.05	0.04	0.13	0.34	0.11	0.02	0.07	56.72	0.45