Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC007551.2	Gene	0	7.77	2.91	2.08	15.90	10.30	2.90	4.47	12.36	2.67	4.61	5.35	2.37	1.61	3.72	7.85	24.97	11.63	2.31	3.80	7.99	3.55	3.41	2.94	2.79	9.51	4.25	3.17	8.73	3.88
2	424194	Transcript	0	0.97	0.00	1.12	17.51	6.42	1.82	0.92	0.61	0.68	0.53	2.81	0.00	0.55	0.73	3.56	3.13	2.19	0.00	2.62	2.77	1.89	0.76	0.01	0.25	2.66	1.33	0.61	5.38	0.97
3	437235	Transcript	0	1.57	0.60	0.47	0.00	1.82	1.17	0.42	6.20	0.87	1.18	3.78	1.59	0.14	1.32	1.80	12.68	4.69	0.11	0.60	4.16	1.22	0.91	1.19	0.60	3.32	0.73	0.66	0.84	1.36
4	412856	Transcript	0	3.61	0.00	0.70	0.00	4.01	2.40	0.36	2.47	1.03	1.21	2.39	1.41	0.00	1.20	1.08	8.89	3.26	0.39	0.00	0.00	1.90	0.78	1.37	0.03	4.61	4.45	6.32	0.00	0.00
5	IG17	Intergenic	0	14.23	1.56	3.79	95.18	3.16	5.12	12.73	3.88	6.26	3.51	0.58	5.69	0.63	1.54	10.28	11.31	4.83	5.67	1.03	9.82	2.54	4.96	2.05	2.44	5.32	4.83	2.97	5.28	0.86
6	IG17_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	14.32	1.57	3.81	95.79	3.18	5.16	12.81	3.90	6.30	3.53	0.58	5.73	0.63	1.55	10.34	11.38	4.86	5.70	1.04	9.88	2.56	4.99	2.06	2.45	5.36	4.87	2.98	5.31	0.87
7	ER1a	ExonRegion	0	2.92	0.00	3.37	52.52	10.87	4.50	2.75	1.84	2.04	1.58	8.44	0.00	1.65	1.57	10.69	8.51	2.64	0.00	5.76	6.64	5.19	2.29	0.00	0.00	4.29	4.00	1.83	15.56	2.44
8	ER1b	ExonRegion	0	25.13	5.84	5.61	136.10	29.61	8.78	12.43	31.20	5.62	8.82	14.55	5.98	2.60	9.83	18.36	68.47	17.53	2.12	18.86	13.58	10.62	6.11	6.73	2.63	16.12	11.96	9.16	36.04	11.93
9	ER1c	ExonRegion	0	25.18	5.41	6.37	116.93	35.12	4.15	25.57	30.45	7.14	9.29	8.91	7.17	2.27	7.90	26.96	51.01	27.51	11.34	5.64	16.89	8.26	6.15	7.20	1.69	15.50	13.13	6.43	28.59	12.16
10	E1_Da	NovelBoundary	0	18.58	0.00	5.86	185.06	7.22	12.81	56.07	11.40	6.97	9.79	0.00	9.67	2.80	4.48	32.49	26.85	13.35	9.25	8.09	23.32	5.58	1.90	4.83	2.39	20.95	11.50	9.34	12.49	5.12
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.90	0.00	0.00	6.58	1.78	0.00	1.37	0.00	7.80	1.33	0.00	0.00	4.22	0.00	2.24	2.22	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	4.09
13	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	21.55	3.22	4.78	88.75	8.27	9.31	28.37	10.52	13.64	6.42	3.02	9.66	4.24	6.37	31.44	17.81	11.53	6.93	18.59	21.25	8.15	4.01	2.49	6.60	8.01	6.65	10.08	11.73	6.65
14	ER2a	ExonRegion	0	1.07	0.00	1.96	7.31	0.00	0.00	4.03	5.06	0.28	1.80	3.57	2.47	0.00	0.68	1.40	1.90	2.50	0.00	0.00	3.51	0.00	0.45	0.45	0.00	0.36	0.39	0.00	5.30	0.67
15	ER2b	ExonRegion	0	9.11	6.77	0.73	0.13	0.04	3.31	2.66	26.04	2.82	6.27	7.61	1.04	4.95	4.27	6.54	48.13	11.34	0.46	6.97	11.19	2.63	5.07	4.27	4.42	16.08	5.48	0.11	9.85	7.54
16	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	10.91	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E3a	KnownJunction	0	7.73	7.56	1.40	0.00	0.00	5.06	7.78	11.45	6.03	8.63	7.91	1.66	1.50	9.64	16.94	56.46	14.81	4.62	0.00	26.38	5.62	4.38	10.64	2.69	15.08	6.74	0.00	6.20	6.37
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3a	ExonRegion	0	6.16	3.67	2.52	0.00	14.22	3.82	1.56	12.46	3.44	6.53	7.94	2.94	1.70	5.07	4.29	25.27	18.02	2.69	3.27	14.94	3.54	5.34	5.19	4.48	9.04	5.15	5.70	12.47	7.04
20	E3_Da	NovelBoundary	0	5.60	0.00	0.00	9.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.07	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	0.00	0.00
21	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E5a	KnownJunction	0	11.09	0.00	3.04	0.00	7.37	3.64	0.00	13.44	1.25	4.63	8.92	1.87	0.00	5.85	0.00	21.27	13.53	0.00	8.09	7.28	1.80	11.62	2.17	2.27	12.46	2.19	4.37	6.38	4.95
23	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.87	1.14	0.00	2.11	1.66	0.49	0.00	0.02	0.75	1.82	0.00	0.00	0.57	0.47
24	ER5a	ExonRegion	0	10.40	5.19	4.11	0.00	19.61	5.57	3.25	24.32	1.96	6.70	9.62	4.73	2.75	7.96	10.97	25.79	14.65	1.78	7.77	8.67	3.38	10.15	2.95	8.99	20.15	2.98	0.50	8.60	3.00
25	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E5a_E6a	KnownJunction	0	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	3.68	0.00	2.49	0.00	1.68	2.85	2.89	0.00	0.84	0.00	0.00	5.15	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	2.27	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E5a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	5.08	0.00	0.00	1.17	1.45	0.00	1.06	0.00	11.93	2.52	0.00	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E6_Aa	NovelBoundary	0	5.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	3.52	0.00	0.00	1.24	0.93	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	3.86	0.00	0.00	1.84	0.00
29	ER6a	ExonRegion	0	5.88	0.00	0.54	0.00	4.81	2.01	1.09	2.53	1.59	0.34	1.61	1.35	0.00	0.80	3.23	12.50	3.68	1.16	0.00	0.00	4.16	0.25	1.85	0.10	3.06	2.44	3.75	0.00	0.00
30	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.64	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	2.75	0.00	28.38	2.43	0.00	0.00	3.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	3.04
31	E6a_E7a	KnownJunction	0	2.48	0.00	1.54	0.00	7.22	1.50	0.00	2.39	1.49	1.60	2.72	0.00	0.00	1.95	0.00	14.15	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	7.24	10.90	15.21	0.00	0.00
32	I6	Intron	0	1.22	0.31	0.00	0.00	0.93	0.78	0.00	0.35	0.11	0.55	0.00	0.47	0.00	0.81	0.88	6.53	2.55	0.00	0.30	0.52	0.14	0.00	0.34	0.00	0.41	0.00	0.00	0.15	0.00
33	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	1.23	0.31	0.00	0.00	0.93	0.79	0.00	0.35	0.11	0.55	0.00	0.47	0.00	0.82	0.88	6.56	2.56	0.00	0.30	0.53	0.14	0.00	0.34	0.00	0.41	0.00	0.00	0.16	0.00
34	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.19	3.44	0.00	0.00	3.97	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER7a	ExonRegion	0	1.07	0.00	0.85	0.00	2.19	1.70	3.83	2.32	1.48	6.03	2.26	0.47	1.84	2.67	11.43	22.83	6.51	4.64	0.00	4.95	1.20	1.44	0.65	0.00	6.98	3.87	12.56	5.87	0.00
36	E7_Da	KnownBoundary	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	10.18	0.00	3.08	10.15	1.39	0.00	3.41	2.88	16.34	13.85	10.15	4.62	0.00	11.41	1.60	0.00	2.41	0.00	10.00	0.00	15.51	7.91	0.00
37	ER7b	ExonRegion	0	4.70	1.80	1.41	0.00	5.47	1.54	1.26	3.61	2.62	3.54	3.58	1.54	0.42	1.53	5.39	18.31	10.22	0.34	1.79	4.71	3.67	0.51	1.34	1.81	6.62	2.20	1.98	2.53	0.00
38	IG16_SR4	SilentIntergenicRegion	0	3.36	2.52	0.90	0.00	7.18	2.62	0.94	4.49	1.82	3.57	3.26	2.06	1.12	2.17	4.16	17.32	9.67	1.44	2.24	1.35	2.19	4.03	1.03	2.44	6.92	1.42	6.12	3.48	0.96
39	IG16_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	2.61	1.01	0.95	0.00	5.95	4.91	2.95	6.28	2.28	2.34	4.45	1.25	0.53	2.32	4.12	25.17	8.73	1.25	2.08	2.27	3.01	1.32	1.47	2.80	6.96	3.32	4.61	4.10	3.42
40	IG16_SR3	SilentIntergenicRegion	0	1.38	0.00	0.00	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	9.20	2.17	2.58	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.92	0.00	0.00
41	IG16_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	1.66	2.06	0.00	0.00	0.00	1.60	1.19	0.00	0.43	0.00	17.74	2.53	4.90	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.09	3.26	0.00