Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC004080.6	Gene	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
2	449765	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	442079	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	412337	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E2_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E2_Ac	KnownBoundary	0	2.18	8.24	4.91	0.00	0.00	1.88	2.80	0.00	0.00	8.27	0.00	2.44	1.59	13.47	0.00	26.32	13.15	0.00	0.00	2.98	4.89	0.00	13.00	8.97	6.74	26.65	0.00	14.51	3.30
10	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix	Intron	0	1.78	0.59	2.00	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.34	0.00	2.38	2.12	24.45	7.42	0.00	1.76	0.62	1.71	0.17	0.33	0.20	0.79	3.47	0.34	5.85	0.74
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.80	0.60	2.03	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	1.75	0.00	0.35	0.00	2.41	2.15	24.81	7.53	0.00	1.79	0.63	1.73	0.17	0.34	0.20	0.80	3.52	0.34	5.94	0.75
15	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E3a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E3b_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E3b_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix	Intron	0	0.91	0.53	1.57	1.01	0.00	0.45	0.05	0.43	0.13	1.86	0.14	0.32	0.03	1.59	1.21	12.23	4.03	0.23	1.43	0.56	0.64	0.08	0.38	1.21	0.91	2.66	0.90	2.07	0.25
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.36	0.00	0.83	2.78	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.33	2.18	1.18	13.59	4.62	0.49	0.75	0.70	0.73	0.00	0.00	0.24	1.14	2.40	0.47	2.83	0.00
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.90	0.68	1.98	1.35	0.00	0.31	0.08	0.45	0.05	1.91	0.00	0.12	0.00	1.68	1.05	10.27	3.67	0.32	1.49	0.23	0.32	0.15	0.23	1.59	0.95	3.12	1.47	2.82	0.45
27	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.94	0.61	1.11	0.00	0.00	1.03	0.00	0.63	0.27	2.68	0.19	1.02	0.00	1.64	0.93	13.94	3.46	0.00	2.13	0.79	0.91	0.00	0.59	0.24	0.83	2.53	0.00	0.80	0.01
28	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.49	0.00	1.14	0.00	0.00	0.04	0.00	0.23	0.38	0.72	0.91	0.00	0.00	0.51	2.78	17.60	6.85	0.00	0.00	1.71	1.62	0.00	1.05	2.36	0.65	0.72	0.42	0.37	0.00
29	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	E4_Da	KnownBoundary	0	5.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.96	1.55	11.18	0.00	5.87	0.00	7.67	7.77	24.79	1.40	0.00	0.00	13.15	3.85	0.00	2.07	17.59	1.93	5.54	2.53	2.25	3.07
31	ER4b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E4_Db	NovelBoundary	0	2.54	4.17	1.17	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	6.97	18.61	0.00	0.00	1.62	0.91	0.00	10.71	1.17	0.00	0.00	8.27	1.48	0.00	0.00	8.31	5.23	1.76	0.00	2.16	1.45
33	Ix	Intron	0	6.31	3.56	2.16	0.00	0.90	0.25	0.37	5.08	0.41	3.19	0.22	0.46	1.79	5.75	8.82	18.55	3.30	0.35	9.41	2.90	3.41	0.66	0.00	5.15	1.32	4.34	0.67	3.60	0.99
34	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	7.02	3.97	2.69	0.00	1.12	0.28	0.35	4.90	0.29	2.97	0.27	0.35	2.22	6.47	10.22	19.84	3.72	0.28	8.81	3.11	3.44	0.83	0.00	6.34	1.33	5.08	0.84	2.36	0.96
35	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.60	1.98	0.00	0.00	0.00	0.16	0.49	6.04	0.95	4.25	0.00	0.93	0.05	2.96	3.28	13.80	1.66	0.67	12.30	2.12	3.42	0.00	0.00	0.37	1.29	1.42	0.00	8.92	1.14
36	Ix	Intron	0	1.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00
37	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00
38	Ix	Intron	0	3.03	2.55	1.11	0.72	0.32	0.25	0.00	1.16	0.19	2.04	0.44	0.47	0.24	3.22	4.63	8.48	3.82	0.23	6.05	1.20	1.21	0.09	0.33	1.75	0.52	1.54	0.61	1.54	0.42
39	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.44	2.13	1.91	2.55	0.00	0.15	0.00	2.73	0.25	1.24	0.53	0.82	0.28	2.12	8.76	11.04	5.20	0.21	7.16	1.17	1.82	0.40	0.60	2.79	0.94	2.08	0.26	1.95	1.48
40	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	4.65	2.99	1.20	2.26	0.55	0.47	0.00	2.20	0.64	4.32	1.62	0.25	0.16	3.84	9.97	9.16	4.78	0.00	8.15	1.21	1.95	0.00	0.41	4.63	1.14	2.49	0.98	0.55	0.45
41	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.03	4.95	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	2.56	0.00	2.01	0.00	3.28	1.47	7.62	4.27	0.00	3.22	0.76	1.30	0.00	0.00	1.12	0.65	1.01	0.59	0.73	0.05
42	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	2.27	2.46	1.13	0.00	0.31	0.31	0.00	0.77	0.11	1.81	0.23	0.16	0.29	3.80	3.10	8.79	3.48	0.33	6.44	1.39	0.99	0.06	0.29	1.04	0.24	1.42	0.65	1.95	0.18
43	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00