Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-545I5.1	Gene	0	5.91	2.50	6.48	19.76	3.37	6.87	8.16	0.79	1.88	6.59	5.13	3.51	0.90	5.38	14.08	10.51	4.24	2.88	5.50	23.51	5.65	4.04	3.58	2.97	7.76	4.33	3.63	15.59	2.77
2	452617	Transcript	0	5.79	2.82	5.49	9.26	2.80	6.55	4.73	0.63	1.01	6.54	3.96	2.53	0.79	4.41	10.71	10.78	2.74	2.74	4.78	18.03	4.20	4.11	2.16	2.75	5.75	3.40	2.29	13.16	1.21
3	IG41_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	1.77	0.66	2.76	28.13	6.82	3.41	5.83	0.76	0.70	0.30	1.23	1.28	0.54	1.68	3.04	8.50	4.01	1.59	1.98	11.40	3.24	2.23	4.85	0.89	4.97	4.22	1.13	17.16	3.59
4	ER1a	ExonRegion	0	5.72	0.72	3.64	44.03	4.17	5.10	8.62	0.49	1.06	3.25	0.64	2.58	1.31	4.67	7.13	10.75	3.53	2.44	1.71	23.59	6.89	4.52	3.94	4.12	6.51	4.34	0.98	18.12	0.00
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	3.44	1.33	0.00	0.00	7.19	1.52	0.00	0.00	0.00	3.49	0.00	0.00	1.98	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	1	14.45	3.78	13.13	0.00	6.04	11.59	0.00	0.00	0.00	7.51	0.00	1.48	1.34	9.17	0.00	26.93	2.75	4.62	0.00	26.96	3.93	10.79	0.00	4.96	7.24	2.06	0.00	21.84	0.00
7	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.97	0.00	0.18	8.32	1.43	0.88	1.81	1.59	0.00	0.92	0.00	1.16	0.16	0.88	0.00	1.55	2.38	2.56	0.00	0.91	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00
8	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	2.22	1.49	0.55	4.53	1.05	3.34	1.21	1.63	1.40	0.48	0.40	0.74	0.39	1.18	3.50	2.66	2.66	1.43	2.13	3.15	1.77	0.26	0.09	1.08	0.61	0.31	0.44	2.35	0.26
9	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.76	1.09	0.44	5.17	0.00	2.50	0.55	1.51	2.45	0.89	1.63	0.66	0.12	0.75	4.10	3.22	4.22	1.46	1.75	0.84	2.78	0.00	0.33	0.87	0.92	0.12	0.84	1.02	0.00
10	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	3.62	0.00	0.00	0.00	1.94	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	9.53	10.54	10.53	11.43	7.26	7.39	7.48	3.91	3.55	24.32	10.12	10.60	2.91	4.89	29.99	11.60	3.23	9.64	15.27	11.36	4.65	3.76	7.53	4.37	12.80	9.74	2.17	23.74	2.42
12	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	2.66	0.00	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	6.25	0.00
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	2.92	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.53	1.62
15	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.48	0.39	0.27	0.46	0.32	1.33	0.85	0.12	0.34	0.70	0.08	0.26	0.00	0.67	1.99	4.27	2.17	0.56	1.14	3.84	1.20	0.00	0.12	0.28	1.62	0.46	0.00	1.58	0.15
16	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	0.32	1.26	0.25	1.35	0.05	0.62	0.35	0.21	1.39	0.22	0.22	0.73	0.00	0.65	4.13	5.03	2.14	0.22	0.56	3.65	1.34	0.00	0.20	0.57	4.20	1.01	0.00	1.72	0.23
17	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.70	0.20	1.09	1.56	0.39	1.04	0.51	0.15	2.68	0.94	0.39	0.56	0.00	0.69	7.46	4.03	2.74	0.84	1.16	3.56	1.86	0.20	0.00	0.70	4.46	1.36	0.20	0.88	0.14
18	I2_SR5	SilentIntronRegion	0	0.16	0.00	0.37	0.00	0.00	0.81	0.59	0.03	1.53	0.11	0.70	0.27	0.00	0.63	3.08	5.86	2.09	0.71	0.47	2.05	2.21	0.00	0.13	1.11	2.77	0.35	1.35	1.68	0.69
19	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.11	4.27	3.86	0.27	1.20	0.00	3.85	0.00	0.53	0.86	0.38	0.45	5.84	5.12	1.48	0.00	0.00	8.06	1.00	0.00	0.00	0.43	1.13	0.00	0.00	2.59	1.05
20	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.46	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	7.51	0.00	0.70	1.41	0.00	0.00	5.16	7.07	2.42	0.00	0.00	7.32	2.22	0.00	0.00	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.94
21	I2_SR6	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00	2.72	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	29.62	2.66	3.69	0.00	0.00	6.73	0.98	0.00	0.00	1.70	2.60	0.00	0.00	2.75	0.81
22	I2_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.57	0.15	1.04	4.77	0.65	1.06	0.00	0.00	2.75	1.73	0.16	1.16	0.00	0.87	18.83	6.51	2.55	0.77	1.70	8.70	1.51	0.00	0.00	0.19	2.76	0.21	0.00	3.06	0.48
23	I2_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	4.03	0.00	0.00	1.44	0.00	1.24	0.00	0.00	5.60	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	4.28	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	I2_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.15	5.30	0.13	0.00	0.35	1.40	0.29	0.13	1.24	0.98	0.48	1.17	0.36	0.68	4.12	3.30	2.08	0.83	4.82	2.20	6.47	0.25	1.00	2.92	0.65	0.34	2.10	1.07	1.00
25	I2_SR9	SilentIntronRegion	0	0.28	2.75	0.05	0.93	0.47	1.51	0.20	0.24	1.07	1.78	1.92	0.69	0.42	0.77	1.54	2.29	0.76	0.88	1.88	1.04	4.99	0.06	0.84	1.69	0.83	1.07	1.78	1.19	1.32
26	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.64	3.66	0.50	0.00	2.62	2.67	0.31	0.77	3.31	2.14	1.16	1.55	0.54	1.12	5.31	4.42	2.94	0.46	2.09	1.36	3.65	0.43	1.29	2.37	1.79	1.12	1.96	1.94	3.00
27	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	1.19	0.67	0.00	1.20	0.00	0.06	2.74	1.91	0.69	0.11	0.98	2.97	2.19	0.00	0.28	0.00	0.44	0.48	1.41	0.00	0.00
28	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.69	5.05	0.32	1.71	0.84	0.00	1.14	0.60	0.23	0.67	0.00	0.49	3.82	0.47	0.62	0.00	2.65	1.14	2.37	0.75	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00
30	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	1.49	5.71	0.00	1.36	0.00	0.86	0.00	0.00	4.34	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00
31	ER3a	ExonRegion	0	2.39	4.69	0.72	0.00	0.00	4.54	5.38	0.00	0.00	4.58	2.74	0.90	0.00	2.03	4.72	3.72	1.17	1.64	3.04	20.04	2.95	3.53	1.32	1.14	2.27	2.99	7.69	4.82	0.10
32	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	3.08	0.00	3.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	3.39	1.52	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	8.44	2.75	0.00	0.00	3.48	6.77	0.00	0.00	2.95	8.37	10.56	2.32	0.00	8.09	14.80	3.37	0.00	0.00	2.69	3.11	2.15	0.00	10.20	0.00
34	ER4a	ExonRegion	0	5.63	0.00	8.86	9.34	2.12	8.79	8.90	0.00	2.43	2.66	7.45	2.14	0.00	7.15	16.02	11.89	6.15	0.84	5.33	29.45	5.86	3.91	2.35	2.00	8.35	2.52	5.17	13.41	5.95