Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP3-325F22.1	Gene	0	0.87	2.60	0.68	0.00	0.99	0.69	0.00	0.19	2.10	1.17	0.84	0.56	0.59	0.14	0.55	0.50	0.45	0.39	0.97	0.00	2.45	0.55	0.55	0.43	0.14	0.16	0.37	0.82	0.00
2	432477	Transcript	0	0.75	1.63	0.50	0.00	0.69	0.62	0.00	0.18	1.52	0.64	0.46	0.31	0.33	0.13	0.33	0.39	0.32	0.23	0.48	0.00	1.59	0.53	0.46	0.33	0.14	0.15	0.36	0.36	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	3.12	3.13	1.62	0.00	2.37	2.67	0.00	0.89	4.11	0.00	0.00	0.00	0.02	0.66	0.00	1.21	0.73	0.00	0.00	0.00	2.77	2.63	1.76	1.02	0.69	0.76	1.78	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	3.01	22.01	1.17	0.00	0.00	1.96	0.00	2.49	34.23	1.88	4.08	4.34	5.51	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	2.11	3.96
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.09	5.52	2.13	0.00	0.00	3.51	0.00	0.94	16.16	1.84	0.91	2.04	1.32	0.81	3.75	0.63	2.28	0.00	0.00	0.00	4.73	1.38	2.77	1.65	0.00	0.40	0.00	0.42	0.34
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.17	5.90	2.28	0.00	0.00	3.75	0.00	1.00	17.26	1.97	0.97	2.18	1.42	0.86	4.01	0.68	2.44	0.00	0.00	0.00	5.06	1.47	2.96	1.76	0.00	0.43	0.00	0.44	0.37
8	Ix	Intron	0	1.25	8.87	2.90	1.91	3.25	4.76	0.57	0.92	14.43	4.74	5.67	3.69	2.79	0.77	1.53	0.98	2.16	1.46	1.44	0.55	5.13	1.59	1.08	3.37	1.05	0.86	2.41	1.49	1.18
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.53	6.57	2.49	1.78	3.23	4.09	0.50	0.44	13.47	3.70	3.54	3.25	1.71	0.15	1.14	0.41	2.71	1.30	0.26	0.00	4.57	1.18	1.05	1.78	1.06	1.30	1.51	2.14	0.44
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.67	3.49	4.23	2.09	1.90	1.60	0.98	2.17	6.66	4.07	2.20	4.51	2.58	0.57	1.34	1.69	3.48	0.37	0.62	0.00	2.53	0.54	0.53	2.09	1.39	1.37	1.07	2.71	1.24
11	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.37	11.08	2.67	1.91	3.63	5.85	0.48	0.73	16.87	5.26	7.31	3.61	3.20	1.02	1.71	0.97	1.63	1.81	2.04	0.88	6.03	2.01	1.25	4.23	0.95	0.58	3.07	0.95	1.40
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.11	1.76	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	3.37	2.79	0.00	0.00	0.00	1.89	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52
13	ER2a	ExonRegion	0	0.64	2.86	0.50	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	2.98	2.57	1.76	1.28	1.33	0.00	1.63	0.74	0.87	1.14	0.95	0.00	4.20	0.00	0.54	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	1.14	2.42	0.00	0.00	3.44	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	Ix	Intron	0	1.48	0.74	0.38	0.00	0.00	0.32	0.46	0.00	2.70	0.66	2.19	1.28	0.44	0.00	0.00	0.57	0.34	0.89	0.73	0.00	1.97	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.49	0.75	0.39	0.00	0.00	0.32	0.47	0.00	2.73	0.67	2.21	1.29	0.45	0.00	0.00	0.58	0.35	0.89	0.74	0.00	1.98	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	2.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.42	0.33	0.00	1.00	0.38	0.08	0.75	0.00	0.00	2.44	0.86	0.00	0.00	0.00	0.00	4.12	0.24	0.00	1.91	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00
20	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	1.92	0.00	0.00	0.12	0.00	0.14	0.00	0.00	0.43	0.00	0.64	0.00	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.60	2.02	0.00	2.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.78	1.03	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.15	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00
28	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	3.00	0.32	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.19	0.00
29	Ix_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.47	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	1.06	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.61	0.00
30	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.99	0.00	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.55	0.00
31	ER3a	ExonRegion	0	0.00	2.16	0.37	0.00	1.09	0.00	0.00	0.00	0.50	0.65	0.53	0.28	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	1.43	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	0.00