Order SeqName SeqType IsAE ABC_RG012 ABC_RG016 ABC_RG015 ABC_RG046 ABC_RG047 ABC_RG048 ABC_RG049 ABC_RG058 ABC_RG059 ABC_RG061 ABC_RG073 ABC_RG074 ABC_RG086 GCB_RG003 GCB_RG005 GCB_RG006 GCB_RG007 GCB_RG010 GCB_RG014 GCB_RG045 GCB_RG050 GCB_RG055 GCB_RG062 GCB_RG063 GCB_RG064 GCB_RG071 GCB_RG072 GCB_RG069 GCB_RG085 1 RP3-388E23.1 Gene 0 0.57 1.42 0.74 1.27 2.16 1.58 2.67 0.00 2.53 1.02 0.32 1.53 0.11 2.04 1.46 3.73 1.72 0.51 0.56 0.00 2.52 0.00 0.00 0.95 0.51 0.00 0.00 0.72 0.59 2 444302 Transcript 0 0.42 1.16 0.44 0.82 1.96 1.17 2.40 0.00 2.25 0.50 0.30 1.11 0.11 1.26 1.36 3.23 1.63 0.37 0.53 0.00 1.91 0.00 0.00 0.88 0.40 0.00 0.00 0.42 0.28 3 ER1a ExonRegion 0 1.78 4.01 1.39 2.91 4.05 2.85 11.67 0.00 10.47 0.00 1.48 1.79 0.54 4.31 6.60 14.34 2.39 0.80 2.65 0.00 7.10 0.00 0.00 3.48 1.72 0.00 0.00 0.68 0.56 4 E1_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.47 8.63 0.00 6.60 7.95 0.00 12.36 0.00 3.13 4.70 1.85 6.16 7.57 21.80 5.60 0.00 0.00 0.00 5.82 0.00 0.00 5.86 3.56 0.00 0.00 0.00 1.75 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 Ix Intron 1 1.97 3.70 0.90 6.04 1.50 4.53 8.34 1.41 4.55 1.55 1.64 3.26 0.20 2.80 4.09 7.71 8.46 3.27 2.69 0.42 7.21 0.14 0.42 5.77 2.74 0.24 0.56 2.00 0.26 7 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 1.98 3.71 0.90 6.06 1.50 4.54 8.36 1.41 4.57 1.55 1.65 3.27 0.20 2.81 4.10 7.74 8.49 3.28 2.70 0.42 7.22 0.14 0.42 5.78 2.74 0.24 0.57 2.00 0.26 8 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.45 1.01 0.18 1.50 0.00 0.75 0.21 0.19 1.76 1.21 1.12 1.66 0.00 0.93 1.06 0.35 3.39 1.01 1.51 0.58 1.60 0.00 0.38 1.47 0.60 0.33 0.00 0.70 0.00 9 E2_Aa NovelBoundary 0 0.00 0.00 1.40 0.00 0.00 1.96 0.00 1.99 1.40 2.04 0.00 0.00 0.00 4.21 15.95 7.65 0.90 13.87 8.09 8.27 0.00 0.00 1.87 2.45 5.00 1.89 0.00 3.41 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 1.26 0.00 0.06 5.75 2.16 0.03 0.00 0.44 1.13 0.00 2.90 0.00 0.00 0.22 1.03 4.00 0.76 0.00 0.00 1.12 0.00 0.00 0.93 0.05 0.00 0.00 0.64 0.00 11 E2_Da NovelBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.50 0.00 0.00 0.00 0.00 2.47 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.31 0.00 0.00 7.44 3.93 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.41 1.23 0.00 2.05 0.00 0.36 0.08 0.00 0.88 1.10 0.23 1.67 0.25 0.63 0.00 0.24 2.29 1.50 1.97 0.53 0.41 0.00 0.00 0.41 0.55 0.00 0.00 0.62 0.26 14 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.37 2.02 0.00 1.12 0.00 0.00 2.47 0.00 1.81 0.00 0.00 3.01 0.00 4.53 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 0.00 1.69 0.36 0.00 0.26 0.00 1.70 0.00 0.00 2.75 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 Ix_AR7 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 17 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.12 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 0.00 1.74 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 18 Ix_AR8 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 1.44 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.46 0.00 13.58 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.43 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3_Aa NovelBoundary 0 0.00 4.75 0.00 0.00 0.00 1.80 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.13 0.00 3.21 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.48 0.00 0.00 2.02 3.70 20 Ix_SR4 SilentIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.89 0.00 11.31 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.77 0.00 0.00 0.00 0.00 21 ER3a ExonRegion 0 0.34 0.51 0.79 1.13 0.00 0.87 0.32 0.00 0.35 1.36 0.00 0.87 0.00 1.99 0.00 0.78 0.54 0.30 0.00 0.00 1.35 0.00 0.00 0.00 0.22 0.00 0.00 0.77 0.84