Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-225E12.1	Gene	0	0.23	1.72	0.18	0.77	0.52	0.73	0.43	0.79	0.66	0.77	0.38	0.20	0.35	0.10	0.00	0.27	0.48	0.21	0.00	1.10	0.92	0.77	0.39	1.38	1.53	0.17	0.00	1.22	0.14
2	415194	Transcript	0	0.13	1.00	0.10	2.13	0.23	0.45	0.19	0.37	0.48	0.57	0.26	0.12	0.29	0.06	0.00	0.12	0.35	0.12	0.00	0.69	0.52	0.39	0.22	1.49	1.23	0.52	0.00	0.71	0.06
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.64	0.93	1.28	0.26	0.33	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.64	0.99	0.84	0.00	0.64	0.99	0.16	0.00	0.00	0.31
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00
5	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	5.82	0.00	5.19	0.00	0.99	0.00	0.00	0.41	1.04	3.01	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.31	0.00	1.03	1.28	1.96	0.78	0.00	0.00	7.29	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	3.11	4.52	0.92	1.04	1.13	6.05	0.70	0.27	0.83	3.14	2.86	2.04	0.06	2.98	0.29	4.28	3.50	4.32	4.07	1.68	4.46	0.26	0.52	2.81	1.24	1.00	0.58	3.54	0.56
8	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	5.08	2.18	1.19	0.00	0.00	1.41	0.40	0.00	1.63	3.23	1.46	0.25	0.00	4.14	1.12	3.04	4.01	5.87	2.61	1.12	3.66	0.00	0.74	2.70	0.69	2.28	0.00	2.87	1.00
9	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.13	3.58	0.52	0.00	2.03	3.89	0.70	0.00	0.22	1.10	3.45	1.96	0.27	2.54	1.02	3.33	2.36	3.68	2.65	1.90	3.29	0.25	0.75	3.54	1.15	1.84	0.51	1.73	0.68
10	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.59	0.04	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	4.51	4.22	3.60	0.00	3.29	0.00	3.22	4.56	1.31	4.02	0.94	2.59	0.00	1.83	1.22	0.86	1.73	0.00	2.13	1.26
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.32	5.97	1.85	1.77	1.81	6.65	0.37	0.45	1.31	3.09	4.23	2.79	0.00	3.31	0.00	4.23	5.31	4.41	3.61	1.18	4.77	0.52	0.31	1.65	1.00	0.97	0.00	5.59	0.44
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.70	5.05	0.66	1.43	0.65	7.97	1.00	0.37	0.82	3.97	1.94	1.81	0.00	2.79	0.00	5.08	2.85	4.64	5.22	2.02	5.21	0.19	0.36	3.27	1.52	0.33	1.10	3.57	0.42
13	Ix	Intron	0	1.48	2.78	0.79	0.78	0.80	3.07	0.07	0.13	1.44	2.31	1.88	1.30	0.11	1.95	0.75	1.25	2.82	1.76	1.62	0.81	4.22	0.59	0.39	1.52	0.80	1.23	0.60	1.98	0.10
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.48	2.79	0.79	0.78	0.80	3.07	0.07	0.13	1.44	2.31	1.88	1.30	0.11	1.96	0.75	1.25	2.82	1.76	1.63	0.81	4.22	0.59	0.39	1.52	0.81	1.23	0.60	1.98	0.10
15	ER2a	ExonRegion	0	0.66	4.98	0.52	1.91	0.00	0.85	0.00	0.57	0.86	0.89	0.37	0.54	0.40	0.28	0.00	0.00	0.92	0.60	0.00	1.70	0.93	1.11	1.12	1.89	0.49	0.27	0.00	3.53	0.00
16	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	9.50	1.37	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.14	0.00	1.35	0.00	0.00	1.98	0.00	0.00	0.00	3.93	0.00	0.00	0.00	1.78	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	8.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	Ix	Intron	0	0.49	2.63	0.30	2.93	0.00	3.31	0.73	0.59	0.69	2.29	2.70	1.93	0.91	1.72	1.84	1.82	1.08	1.52	2.03	1.47	5.51	1.31	0.90	0.68	1.36	0.86	0.83	3.48	0.91
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.49	2.64	0.30	2.94	0.00	3.31	0.73	0.59	0.69	2.30	2.71	1.93	0.91	1.73	1.84	1.82	1.09	1.52	2.03	1.47	5.52	1.31	0.90	0.69	1.37	0.86	0.83	3.49	0.91
20	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	3.57	1.24	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	1.96	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	5.78	0.00	0.00	0.00	3.60	0.00	0.00	8.22	1.62
22	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.56	0.00	0.76	0.00	0.00	1.26	1.60	0.66	0.05	1.07	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	1.10	0.70	0.00	0.00	2.24	4.66	0.00	0.00	0.00	0.00