Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-292B18.2	Gene	0	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.12	0.00	0.64	0.17	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.38	0.00	0.17	0.00	0.22	0.26	0.00	0.00	0.55	0.49	0.08
2	415477	Transcript	0	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.00	0.22	0.06	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.13	0.00	0.06	0.00	0.07	0.09	0.00	0.00	0.19	0.17	0.03
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.32	4.97	2.24	0.00	2.62	1.02	0.90	0.27	4.26	1.66	1.65	1.11	1.35	1.31	7.45	2.63	0.74	1.99	7.62	0.41	2.77	3.75	2.78	1.97	3.83	0.78	3.42	2.52	2.23
14	Ix	Intron	0	2.13	1.01	0.44	0.75	0.51	0.29	0.74	0.96	2.08	1.13	1.30	1.28	0.54	0.83	2.11	2.33	0.47	1.21	6.34	0.72	3.13	0.75	0.57	2.13	1.34	0.25	0.29	2.38	0.91
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.55	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.40	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	3.45	1.90	0.00	1.37	0.52	0.87	0.00	2.90	0.67
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.15	0.92	0.45	0.78	0.53	0.30	0.77	1.00	2.03	1.18	1.36	1.34	0.54	0.86	2.19	2.43	0.49	1.20	6.59	0.75	3.12	0.71	0.59	2.16	1.38	0.22	0.30	2.37	0.92
17	Ix	Intron	0	0.84	1.73	0.65	0.79	1.13	1.42	0.25	0.43	1.37	0.65	0.45	1.49	0.60	1.02	0.58	1.37	0.62	0.83	2.84	0.26	3.91	0.40	0.68	0.92	0.96	0.50	0.09	2.17	1.55
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.84	1.74	0.65	0.79	1.13	1.43	0.25	0.43	1.38	0.65	0.45	1.49	0.60	1.02	0.58	1.38	0.62	0.83	2.85	0.26	3.92	0.40	0.68	0.92	0.96	0.50	0.09	2.17	1.55
19	Ix	Intron	0	1.06	3.74	0.87	2.20	2.07	1.40	0.62	1.91	2.86	0.89	1.29	2.18	1.36	1.69	0.56	1.94	0.85	0.79	3.69	0.20	6.29	0.72	0.60	1.42	2.90	0.85	1.04	3.65	0.95
20	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	3.52	1.35	0.00	1.24	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.04	1.08	0.00	2.72	0.76	0.00	0.00	2.17	0.00
21	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.05	3.77	0.70	2.34	1.86	1.30	0.34	1.79	2.99	0.75	1.36	2.07	1.06	1.70	0.53	1.90	0.93	0.79	3.63	0.22	5.89	0.73	0.33	1.41	2.71	0.82	1.00	3.52	0.85
22	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.64	4.96	2.74	1.83	4.98	2.80	2.95	3.83	2.56	2.44	1.21	3.72	4.73	2.20	1.18	3.11	0.37	1.15	5.86	0.00	11.47	0.92	3.40	1.91	5.83	1.55	1.87	6.23	2.22
23	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.56	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00
25	ER5a	ExonRegion	0	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.37	0.00	1.96	0.53	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	1.16	0.00	0.52	0.00	0.66	0.79	0.00	0.00	1.68	1.50	0.25