Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-315C6.1	Gene	0	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.45	0.33	0.89	0.00	0.47	0.77	0.00	0.21	0.44	1.49	0.40	0.48	0.31	2.59	0.89	0.92	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.22
2	445340	Transcript	0	0.00	0.41	0.91	0.00	0.00	0.35	0.26	0.70	0.00	0.36	0.56	0.00	0.16	0.34	1.17	0.31	0.38	0.18	1.92	0.70	0.72	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.17
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	1.05	0.77	2.10	0.00	1.06	1.36	0.00	0.49	1.03	3.51	0.94	1.14	0.02	4.86	2.10	2.17	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.51
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.22	0.00	4.28	1.77	9.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	16.18	3.97	1.56	1.99	0.00	2.99	6.86	1.59	0.00	8.13	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	0.82	3.93	0.38	0.82	0.75	3.25	1.15	0.98	3.04	3.47	1.77	0.99	0.77	1.80	3.65	2.53	2.28	2.02	10.85	3.14	4.85	0.28	0.21	0.99	1.09	0.36	0.21	1.00	0.94
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.95	3.50	0.33	0.71	0.48	2.88	1.20	1.09	2.97	3.80	2.00	1.10	0.61	2.10	3.99	2.32	2.44	1.73	10.08	2.98	4.25	0.27	0.27	0.87	1.14	0.47	0.09	1.29	1.09
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.36	5.42	0.56	1.21	1.64	4.52	1.02	0.62	3.29	2.37	1.00	0.62	1.30	0.76	2.48	3.26	1.73	3.04	13.52	3.71	6.91	0.30	0.00	1.38	0.92	0.00	0.62	0.00	0.45
9	Ix	Intron	0	1.24	2.28	0.35	0.76	0.00	1.74	1.38	0.29	1.21	1.75	1.38	0.98	0.00	0.79	3.24	3.12	1.18	1.96	10.45	3.41	4.29	0.00	0.10	1.47	0.45	0.00	0.87	0.26	0.63
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.18	2.64	0.41	0.88	0.00	1.81	1.35	0.34	1.21	1.73	1.55	1.13	0.00	0.85	3.71	3.39	1.37	2.27	10.99	3.64	4.53	0.00	0.11	1.57	0.52	0.00	0.89	0.30	0.73
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	1.12	2.89	1.19	0.00	0.00	0.00	2.06	0.27	0.00	0.00	11.43	8.43	2.85	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	2.89	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.53	8.43	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.55	0.00	1.09	0.70	0.29	0.00	0.00	0.16	0.00	0.77	0.00	0.00	4.80	1.11	1.99	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	2.95	0.00	0.00	9.05	0.00	5.71	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	2.70	0.00	1.43	2.27	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	2.14	0.00	0.00	7.17	0.00	3.07	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	1412.23	1496.33	1121.49	1692.32	1230.26	1422.98	831.67	1236.88	2525.55	1611.32	771.73	1057.36	1036.15	1307.26	2536.94	1336.43	2032.79	267.26	290.43	1177.88	1743.44	810.06	878.81	1239.62	1175.65	1992.46	809.22	1784.50	1331.07
17	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00