Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-446G24.3	Gene	0	5.47	2.20	4.83	1.45	0.66	5.45	3.65	4.69	4.14	2.33	4.79	2.15	3.31	1.95	5.37	2.00	1.70	3.54	2.15	3.60	2.68	11.26	2.18	4.77	6.62	3.70	2.71	0.77	4.85
2	436876	Transcript	0	2.28	0.01	2.91	0.72	0.00	2.35	2.76	4.79	1.94	1.09	2.51	1.14	0.93	0.85	2.18	0.94	0.72	1.98	1.13	1.64	1.63	4.13	1.28	1.48	3.96	1.23	1.18	0.08	3.53
3	449620	Transcript	0	6.82	3.18	3.65	0.98	0.58	6.86	3.97	4.09	1.96	1.27	4.07	2.59	3.99	1.22	6.28	0.63	1.75	4.54	1.69	3.79	1.77	15.19	2.64	6.27	6.30	2.34	4.53	1.03	3.28
4	ER1a	ExonRegion	0	3.49	0.00	5.57	4.30	0.00	3.94	6.31	2.51	3.20	0.61	4.96	2.81	2.14	0.95	4.41	1.49	0.66	2.89	1.92	3.08	5.13	5.51	1.48	0.82	4.25	4.24	4.40	0.49	3.21
5	E1_Da	NovelBoundary	0	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	5.45	0.00	2.54	0.00	0.00	5.82	4.16	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	3.67	3.56	0.00	2.07	1.88
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.95	0.00	1.47	0.00	0.00	1.92	2.86	6.52	0.00	2.00	3.10	2.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.42	2.22	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00	1.82
7	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.35	4.67	11.72	20.01	2.48	6.97	4.60	4.67	1.71	7.20	6.64	14.39	7.23	4.82	0.00	5.49	3.03	3.42	3.24	2.10	9.77	6.15	9.18	2.18	3.26	2.39	3.25	6.20	6.62
8	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.19	0.29	0.00	0.00	0.26	0.18	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	3.28	0.57	2.85	0.36	0.00	0.28	0.31	0.00	0.32	0.53
9	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	5.36	0.00	5.16	0.00	0.00	5.36	6.45	7.87	2.08	1.05	5.86	0.59	2.18	1.22	6.44	1.64	3.68	2.80	4.87	6.75	4.67	11.72	2.58	2.26	12.51	1.69	0.00	0.00	2.95
11	E2_Ab	KnownBoundary	0	6.02	0.00	8.47	0.00	0.00	12.74	11.10	0.00	5.33	0.00	5.63	0.00	4.81	3.37	18.34	3.82	6.28	9.25	16.18	18.52	12.19	18.86	2.07	0.00	15.04	2.02	0.00	0.00	4.79
12	ER2b	ExonRegion	0	4.99	1.88	6.32	0.00	0.00	11.52	5.29	6.24	9.73	3.49	8.37	0.15	4.93	2.40	8.74	5.25	4.23	5.19	3.59	8.40	3.37	21.72	1.68	5.22	10.37	5.65	2.12	1.01	6.19
13	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	1.31	5.35	0.00	0.00	6.85	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	2.41	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	3.14
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	2.30	4.07	1.00	0.00	0.00	3.91	2.29	2.39	0.00	0.00	3.23	1.23	0.00	0.00	8.17	0.00	0.00	5.39	0.00	0.00	3.21	11.86	0.00	0.00	1.93	2.15	7.50	0.00	3.10
15	ER2c	ExonRegion	0	1.90	0.06	2.74	0.00	0.00	1.14	0.97	2.03	1.09	2.87	1.15	0.60	1.29	2.95	2.22	2.48	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	3.11	1.40	2.72	3.42	1.47	0.74	0.00	5.66
16	E2_Db	NovelBoundary	0	2.77	0.00	1.00	0.00	0.00	1.84	2.69	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	1.73	0.00	9.80	5.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	1.94	0.00	7.56
18	ER3a	ExonRegion	0	5.87	5.32	6.17	0.00	3.28	6.15	3.18	9.84	6.33	4.29	8.33	2.07	2.22	3.04	3.83	3.33	2.14	7.18	2.14	5.10	4.09	14.09	2.55	5.94	6.15	2.11	5.98	0.60	8.02
19	E3_Da	KnownBoundary	0	7.85	0.00	10.49	0.00	0.00	7.25	2.92	9.11	5.97	3.56	8.95	1.51	6.62	4.50	0.00	0.00	3.65	4.62	0.00	14.97	3.21	22.41	5.02	9.93	6.82	2.19	12.67	2.29	7.82
20	E3a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3b	ExonRegion	0	12.90	2.03	7.63	2.93	0.00	11.77	8.91	5.05	2.25	1.81	4.28	4.05	7.11	2.42	4.58	1.89	4.17	4.42	1.65	9.40	0.47	23.37	5.98	14.28	11.15	1.80	4.13	2.52	3.81
22	E3_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E3b_E4a	KnownJunction	0	10.85	4.27	7.35	9.71	0.00	3.84	0.00	2.34	2.98	3.79	3.23	5.27	4.59	1.37	7.57	7.04	3.92	0.00	0.00	3.31	0.00	9.14	2.46	4.90	10.00	0.00	0.00	6.29	6.87
24	ER3c	ExonRegion	0	16.54	3.52	6.33	7.31	0.00	6.48	5.18	1.84	2.89	4.33	2.38	4.86	6.50	1.81	4.80	5.06	4.01	0.00	4.53	2.81	0.10	16.10	4.26	9.22	12.97	4.49	0.00	4.89	6.33
25	ER4a	ExonRegion	0	8.16	6.16	5.41	1.40	0.00	3.82	0.00	4.77	5.99	3.50	2.43	3.46	2.37	2.61	8.75	1.07	1.17	2.21	0.12	0.35	1.74	13.29	2.18	8.99	6.77	8.70	1.28	1.09	8.05
26	E4_Da	KnownBoundary	0	4.60	0.00	6.65	0.00	0.00	3.76	0.00	9.11	10.02	7.79	3.23	2.95	1.62	2.48	27.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	25.72	0.00	14.18	1.93	13.60	0.00	0.00	11.42
27	ER4b	ExonRegion	0	5.25	3.45	2.32	0.00	1.74	4.90	0.72	4.84	3.64	2.01	4.71	2.49	4.86	1.23	6.07	0.00	1.06	3.80	3.42	1.97	1.65	10.34	1.93	4.54	5.83	3.08	1.96	0.58	2.93
28	IG22	Intergenic	0	2.14	1.07	1.11	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	1.44	1.19	0.41	1.08	0.91	0.00	0.00	0.00	0.64	1.06	0.00	0.48	3.61	0.00	0.00	0.95	4.19	0.00	0.54	0.89
29	IG22_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.17	1.09	1.13	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	1.46	1.21	0.42	1.09	0.92	0.00	0.00	0.00	0.65	1.08	0.00	0.48	3.65	0.00	0.00	0.97	4.25	0.00	0.55	0.91