Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	COL10A1	Gene	0	7.19	0.73	0.25	0.10	9.73	0.59	0.08	0.02	0.80	0.58	0.14	0.34	0.03	7.49	2.45	3.82	1.32	4.14	4.82	0.48	6.62	0.00	17.26	12.30	172.78	0.44	24.58	1.46	32.24
2	418500	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	6.54	0.79	3.91	0.57	1.52	6.07	0.00	1.63	0.00	5.53	5.06	124.89	1.21	20.76	0.62	34.49
3	243222	Transcript	0	0.38	0.00	0.52	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	0.97	0.86	0.36	0.79	0.00	2.58	0.00	0.66	0.16	4.30	0.00	2.72	0.00	0.27
4	452729	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
5	327673	Transcript	0	1.13	0.42	0.22	0.00	0.00	0.71	0.26	0.00	1.17	0.19	0.63	0.83	0.00	0.02	0.01	0.66	0.00	0.01	0.44	1.07	3.58	0.00	0.25	0.57	0.77	0.00	0.01	0.00	0.02
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	5.92	1.59	1.85	1.14	3.03	4.05	0.00	3.26	0.00	8.56	4.86	124.42	0.23	32.08	1.24	61.09
7	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.92	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
8	E1a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.16	0.00	5.97	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	2.51	5.26	125.36	2.19	9.44	0.00	7.89
9	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.03	1.46	0.00	0.00	0.00	0.67	0.02	0.45	1.56	0.18	0.29	1.79	0.00	0.00	7.75	1.12	3.45	0.23	0.54	0.34	1.80	0.00	0.22	3.14	0.79	0.00	0.00	0.79	0.98
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.38	1.07	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.00	1.15	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.40	0.30	0.28	0.00	2.21	0.00	0.32	0.19	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00
11	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.76	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.56	0.00	0.20	0.00	0.00	0.54	0.25	0.00	0.00	0.44	0.29	0.30	0.00	0.11	0.00	0.22	0.18	0.69	0.80	2.02	3.31	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.00	0.60	0.00
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2_Ab	NovelBoundary	0	3.01	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.20	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	4.20	0.87	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	5.25	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00
18	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	2.77	0.00	0.00	0.00	3.82	0.00	0.00	0.00	3.80	10.87	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	1.13	0.42	0.22	0.00	0.00	0.71	0.26	0.00	1.17	0.19	0.63	0.83	0.00	0.02	0.01	0.66	0.00	0.01	0.44	1.07	3.58	0.00	0.25	0.57	0.77	0.00	0.01	0.00	0.02
22	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.49	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER3b	ExonRegion	0	3.22	0.00	0.00	2.18	19.18	0.00	0.00	0.00	1.17	0.69	0.32	0.29	0.00	9.32	2.13	5.72	1.71	7.99	2.53	0.00	5.45	0.00	32.83	10.19	236.38	0.28	61.37	3.90	72.81
24	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	41.12	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	1.54	0.00	5.58	8.37	6.27	1.10	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	10.05	8.49	165.33	0.00	42.14	1.66	25.06
26	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.20	0.92	0.00	0.68	0.46	0.13	0.19	0.35	0.00	0.00	0.23	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.52	2.86	0.00	0.34	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.72	0.00	1.52	9.30	0.00	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	6.01	0.00	0.00	0.00
28	ER4a	ExonRegion	0	4.39	0.00	0.17	0.00	5.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.00	0.45	0.00	6.78	0.92	3.28	0.67	5.02	2.11	0.00	2.81	0.00	15.50	7.04	128.15	1.08	13.78	1.62	15.00
29	E4_Da	KnownBoundary	0	10.50	0.00	0.00	0.00	21.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	3.83	4.62	8.09	0.00	4.09	0.00	20.29	6.10	134.80	3.86	43.54	4.31	10.37
30	ER4b	ExonRegion	0	9.92	1.08	0.28	0.00	12.61	0.78	0.08	0.04	0.98	0.57	0.10	0.28	0.05	9.33	3.40	4.64	1.67	4.70	6.58	0.46	8.45	0.00	21.01	16.74	220.48	0.44	29.41	1.62	38.97
31	E4_Db	KnownBoundary	0	2.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	1.24	4.62	0.00	0.00	3.37	0.00	2.51	2.75	6.78	0.00	0.00	0.00	3.04
32	ER4c	ExonRegion	0	0.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.79	0.00	0.86	1.71	0.72	1.58	0.00	3.93	0.00	1.32	0.31	8.49	0.00	5.44	0.00	0.53