Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP3-485C17.1	Gene	0	6.99	2.75	2.57	8.43	5.72	2.99	10.96	3.34	2.58	3.01	2.26	2.35	0.00	0.16	46.81	0.67	0.14	5.99	23.73	6.10	7.88	19.11	3.44	5.46	2.59	3.84	1.83	4.73	38.83
2	445310	Transcript	0	4.33	2.24	1.30	3.94	2.88	1.84	11.73	2.46	1.49	2.44	1.34	1.31	0.00	0.11	56.67	0.39	0.05	6.00	23.19	4.09	6.08	15.40	3.34	4.88	2.30	2.25	0.90	2.53	31.32
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.59	0.00	0.63	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	0.00	0.95	1.18	0.75	0.00	0.00	0.05	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.07	0.00	20.71	0.00	0.00	0.00	0.00	9.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.77	0.00	0.00	0.00	8.09	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	7.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.98	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.84	0.00	2.54	0.00	1.01	0.01	0.00	1.42	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	6.67	0.00	0.00	0.70	2.44	0.00	0.00	0.03	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.55	0.49
8	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	12.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	1.76	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	Ix	Intron	0	0.38	1.79	0.14	0.71	0.96	0.49	0.82	0.29	4.15	1.25	0.48	2.11	0.01	0.35	7.85	0.39	0.64	1.16	7.81	0.63	1.90	0.87	0.39	1.12	0.79	1.20	0.40	2.26	1.99
11	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.81	1.69	0.61	0.00	0.00	1.93	1.48	1.11	8.38	5.88	0.53	5.45	0.00	1.18	10.57	2.01	0.00	2.81	8.45	0.39	3.26	1.80	0.45	2.67	0.78	1.94	4.19	3.01	1.76
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	1.12	0.00	4.98	1.31	4.03	2.24	4.64	7.78	1.09	8.12	0.00	1.46	5.84	1.76	0.00	2.85	11.22	2.81	4.28	5.72	1.81	7.58	1.43	1.84	6.77	3.26	0.00
13	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.20	1.65	0.24	2.28	1.83	1.57	1.03	0.44	10.01	2.88	1.61	4.12	0.10	0.73	12.56	1.18	0.51	2.25	6.50	1.86	3.67	2.02	0.83	2.32	1.06	1.21	0.73	2.45	2.00
14	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	3.92	2.96	0.28	0.00	2.48	0.88	0.67	0.92	14.63	4.54	0.59	6.00	0.43	1.65	40.19	1.65	1.34	4.13	4.75	0.61	3.23	1.66	1.94	2.19	2.80	5.74	0.00	6.97	2.28
15	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	1.10	6.44	1.43	0.00	7.50	0.23	1.38	2.51	14.82	3.94	1.22	16.29	0.00	1.23	60.20	2.54	7.13	3.07	19.07	3.76	3.41	2.46	3.71	9.17	13.65	8.31	1.25	27.80	15.04
16	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	1.29	10.32	2.31	3.27	4.51	0.52	0.00	1.06	13.98	6.30	0.04	12.09	0.00	2.65	34.06	0.54	11.09	2.66	17.36	3.31	5.17	4.77	6.15	4.71	12.68	27.66	1.06	29.99	14.37
17	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.99	10.61	1.12	4.54	5.81	1.20	2.79	1.71	19.97	2.19	1.18	9.74	0.00	2.06	42.58	0.69	4.32	4.67	34.39	2.64	2.41	2.99	2.27	3.04	2.66	8.42	0.71	13.83	7.47
18	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.43	0.32	0.50	2.58	3.41	0.40	3.21	1.29	5.34	2.57	2.03	3.35	0.00	0.52	19.25	0.67	0.60	3.89	32.87	0.20	1.28	1.49	0.18	1.94	2.00	0.87	1.10	3.35	5.85
19	Ix_SR6	SilentIntronRegion	0	0.33	0.50	0.17	3.09	1.00	0.92	3.09	0.38	6.43	2.17	0.60	2.15	0.00	0.51	15.06	0.84	0.53	2.33	24.11	0.00	2.27	0.62	0.56	2.43	0.37	0.81	0.00	2.18	1.66
20	Ix_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.95	0.00	2.02	1.40	0.05	0.00	0.00	1.85	2.56	0.21	1.68	0.00	0.39	5.00	0.36	0.24	0.83	7.20	1.19	3.41	0.26	0.00	2.37	0.82	0.00	0.00	0.88	0.81
21	ER3a	ExonRegion	0	15.00	6.79	4.97	8.84	10.63	6.03	24.84	7.20	3.09	4.36	3.65	3.93	0.00	0.77	80.60	2.11	0.00	16.40	54.72	8.67	14.77	62.06	5.92	10.52	4.48	8.28	3.11	6.03	46.44
22	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.79	2.96	0.00	3.01	0.00	0.00	8.37	0.00	0.00	9.25	0.00	0.00	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35
23	E3a_E4a	KnownJunction	1	4.90	4.17	0.00	0.00	0.00	1.88	41.71	4.58	1.28	7.03	1.33	0.00	0.00	0.00	232.61	0.00	0.00	18.49	72.83	8.27	14.76	29.61	10.98	13.94	6.71	1.76	0.00	2.07	93.23
24	Ix	Intron	0	0.42	0.63	0.00	0.35	1.19	0.27	0.00	0.00	1.15	0.91	0.12	1.17	0.00	0.22	1.97	0.12	0.29	0.75	6.22	0.40	2.64	0.18	0.18	0.42	0.07	0.00	0.27	0.16	0.62
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.00	0.00	2.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.42	1.62	2.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	8.33	0.00	0.00	0.00	4.11	5.00	0.00	1.19	0.00	0.85	0.00	0.00	0.00	3.46	3.22	0.00	3.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.59
27	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.62	0.00	0.00	1.58	0.26	0.00	0.00	0.87	0.83	0.00	1.06	0.00	0.00	2.11	0.00	0.00	0.62	7.16	0.53	2.04	0.69	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.14
28	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.64	1.06	0.00	0.00	0.76	0.82	0.00	0.00	0.67	0.43	0.00	0.72	0.00	0.13	3.06	0.00	0.41	0.58	9.58	0.00	1.48	0.00	0.07	0.75	0.43	0.00	0.00	0.49	0.00
29	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.59	0.00	0.00	0.72	0.00	0.58	6.22	0.00	0.25	0.00	6.66	0.00	2.69	0.00	0.00	2.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34
30	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.62	0.00	0.00	2.94	0.00	0.00	2.67	0.00	1.00	0.00	3.66	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.03
31	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.90	0.45	0.00	1.01	0.00	0.18	0.00	0.00	1.05	0.41	0.33	1.77	0.00	0.38	1.70	0.35	0.54	0.54	5.36	0.39	4.21	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.77	0.00	1.25
32	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	8.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
33	ER4a	ExonRegion	0	10.40	2.21	4.15	16.23	9.50	3.98	15.54	4.49	4.02	5.71	3.79	2.76	0.00	0.00	76.80	0.62	0.37	6.38	30.67	11.68	12.99	16.13	5.52	7.75	4.13	5.71	3.19	9.04	79.11