Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-234P15.1	Gene	0	2.95	2.95	2.11	3.29	2.24	4.88	6.93	5.49	3.60	5.79	9.56	2.54	0.89	2.02	2.42	3.70	2.57	1.99	2.20	10.98	6.70	5.37	7.05	3.94	3.93	2.34	5.46	8.41	1.15
2	438676	Transcript	0	3.08	1.10	0.97	0.99	0.67	2.59	2.49	1.65	1.41	4.39	9.46	1.45	0.48	1.61	3.65	1.61	1.38	0.72	1.45	7.04	3.41	2.23	4.28	4.19	1.65	1.01	2.68	3.17	0.48
3	ER1a	ExonRegion	0	3.63	3.88	2.88	4.94	3.37	5.21	9.34	8.24	4.55	4.26	7.60	2.02	0.78	1.83	1.74	4.27	2.80	2.66	2.20	13.10	6.42	7.77	6.23	3.31	4.68	2.71	5.64	10.94	1.38
4	E1_Da	NovelBoundary	1	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	5.79	2.89	0.00	1.13	0.00	3.14	0.00	4.62	0.00	7.86	0.00	0.00	2.07	0.00	0.00	4.25	0.00	19.55	1.62
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	0.00	0.00
7	I1	Intron	0	0.73	2.33	0.47	2.14	0.33	3.10	2.04	0.38	2.49	1.86	2.18	1.94	0.31	1.31	2.82	1.50	2.54	2.22	2.34	5.43	4.46	0.40	3.72	2.31	1.54	0.35	2.12	1.75	1.14
8	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.48	1.58	0.43	2.38	0.59	2.81	1.64	0.25	1.62	1.56	0.95	1.11	0.00	0.86	2.79	1.24	2.31	2.57	1.20	7.12	3.24	0.08	0.08	1.10	0.58	0.28	0.77	1.94	0.32
9	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.80	3.46	0.27	1.33	0.00	1.80	0.93	0.68	0.93	0.80	0.95	1.98	0.78	0.84	3.66	2.30	4.01	1.96	0.95	5.02	1.95	0.67	0.52	3.37	1.39	0.29	0.79	2.59	0.49
10	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.44	1.50	1.65	5.83	0.00	2.03	6.29	2.25	3.12	2.35	2.66	2.37	1.40	0.49	2.12	1.68	0.81	1.57	2.94	3.75	5.07	2.45	1.20	1.77	2.81	0.00	4.30	2.84	1.54
11	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.72	0.57	0.00	0.00	2.23	1.80	0.00	2.07	1.04	0.82	0.37	0.00	0.81	0.00	2.22	0.02	0.00	2.10	0.00	3.38	0.00	0.00	0.96	0.00	0.00	0.00	0.61	0.89
12	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.12	3.89	0.34	1.17	0.00	4.51	2.31	0.12	4.81	2.80	5.27	3.74	0.59	2.68	2.95	1.69	3.12	1.87	5.17	2.70	7.91	0.53	13.66	4.78	3.50	0.62	5.15	0.86	3.08
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	9.70	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	3.53	7.51	2.85	5.45	1.34	4.61	0.00	3.29	4.14	0.00	32.37	0.00	3.65	0.00	14.43	2.63	10.87	0.00	0.00	2.11	11.72
14	ER2a	ExonRegion	0	0.76	1.61	0.83	0.00	0.00	6.09	3.12	0.02	2.50	12.02	17.29	5.24	1.62	2.98	3.40	3.67	3.04	0.96	1.60	9.31	10.61	0.65	12.36	6.39	3.57	2.36	7.16	4.92	1.00
15	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.17	2.77	0.00	0.00	13.16	11.10	0.00	11.66	7.27	1.52	1.81	1.56	2.48	8.37	3.82	5.06	0.00	0.00	0.00	11.91	0.00	7.04	8.97	3.86	0.00	2.53	0.00	3.86
16	E2a_E3a	KnownJunction	0	5.25	0.00	1.10	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	3.71	17.34	0.00	0.00	2.08	8.57	0.00	0.97	0.00	0.00	4.13	0.00	2.19	2.17	8.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	I2	Intron	0	1.27	4.07	0.76	0.77	0.66	3.10	1.52	0.10	3.06	3.80	3.80	2.25	1.01	2.14	1.31	3.28	2.41	2.24	2.40	2.06	6.44	0.10	20.40	2.95	2.77	1.14	4.87	1.36	1.72
18	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.49	0.74	0.00	0.00	0.00	2.69	3.25	0.00	1.81	2.99	1.64	2.20	0.97	1.71	1.59	1.71	2.23	2.66	0.37	2.22	4.27	0.00	12.07	1.98	1.32	0.72	1.27	0.19	0.69
19	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.70	4.65	1.06	0.65	0.00	2.86	1.82	0.33	2.94	4.30	7.09	2.28	0.82	2.57	1.33	2.69	2.16	2.32	2.31	1.96	7.08	0.16	24.65	1.17	4.65	2.13	6.45	1.62	1.51
20	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.38	6.95	0.89	1.27	0.87	3.32	0.54	0.00	5.14	4.30	2.11	3.14	1.66	2.37	1.79	4.56	3.31	2.29	5.10	2.44	8.26	0.16	23.35	6.08	2.47	0.84	6.62	1.59	3.38
21	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.58	0.00	1.49	0.00	0.00	0.43	0.90	0.00	0.47	0.00	0.37	0.00	4.24	0.00	1.62	0.00	0.00	2.74	0.00	1.47	0.47	1.08	0.00	0.69	0.00	0.00
22	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.58	2.81	1.24	1.11	2.71	4.06	0.37	0.00	1.34	3.47	4.62	0.69	0.24	1.71	0.00	4.22	1.66	1.42	0.59	1.53	5.36	0.00	21.67	1.99	2.11	0.58	4.41	2.41	0.62
23	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3_Aa	NovelBoundary	0	5.84	13.67	34.96	0.00	0.00	11.32	2.92	7.27	39.04	19.57	4.46	1.33	11.94	2.57	43.85	0.00	17.96	0.00	0.00	3.47	9.59	2.38	2.36	11.72	3.64	5.92	8.90	8.81	9.11
25	ER3a	ExonRegion	0	3.42	0.00	0.02	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	1.94	5.09	0.00	0.00	1.18	4.53	0.11	0.06	0.00	3.47	1.20	0.00	0.54	0.65	2.65	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00