Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	C6orf163	Gene	0	2.12	2.67	3.04	3.40	1.54	3.53	3.03	1.96	5.53	3.42	3.06	4.48	0.49	0.50	0.62	3.71	4.60	0.56	1.26	3.52	9.24	0.50	0.86	2.21	1.13	0.75	1.52	2.51	3.22
2	369574	Transcript	0	0.57	0.94	0.28	0.83	0.57	1.56	0.77	0.11	2.06	1.56	1.58	1.17	0.16	0.13	0.00	1.45	2.12	0.24	0.00	1.67	3.99	0.10	0.36	1.13	0.00	0.00	0.11	0.57	1.76
3	388923	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	0.00	0.00	0.00	9.68	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	2.02	0.00	0.00	0.00
4	IG45	Intergenic	0	2.29	3.11	0.67	4.14	1.74	4.15	4.39	1.39	4.71	3.08	3.65	5.45	0.20	1.40	0.61	4.36	6.57	0.78	2.27	8.28	12.29	0.32	0.64	1.72	0.51	0.28	0.90	2.75	0.92
5	IG45_SR1	SilentIntergenicRegion	0	1.89	2.68	0.30	5.06	0.00	2.67	3.91	0.97	2.77	2.29	1.89	4.46	0.46	0.64	0.81	3.82	4.21	1.76	2.26	2.78	6.29	0.64	0.96	1.52	0.76	0.83	0.65	2.88	0.47
6	IG45_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.11	5.25	0.59	2.34	2.91	4.31	5.97	1.69	6.20	2.80	4.62	5.94	0.00	1.96	0.47	4.84	7.48	0.39	2.29	11.18	15.88	0.18	0.23	1.10	0.42	0.00	0.94	2.37	0.38
7	IG45_SR2	SilentIntergenicRegion	0	2.88	0.48	1.09	5.96	1.53	5.18	2.60	1.32	4.25	4.14	3.75	5.63	0.28	1.26	0.66	4.19	7.26	0.55	2.29	8.76	12.28	0.26	0.98	2.77	0.43	0.23	1.05	3.21	2.04
8	ER1a	ExonRegion	0	2.16	3.75	0.57	3.34	2.27	6.22	3.07	0.43	5.15	3.55	5.58	4.35	0.63	0.53	0.00	5.80	6.08	0.96	0.00	6.70	15.95	0.42	0.42	4.51	0.00	0.00	0.43	2.28	5.55
9	E1_Ab	KnownBoundary	0	2.77	0.00	3.11	0.00	0.00	3.72	10.64	0.00	7.40	6.59	2.59	2.47	0.00	0.00	0.00	10.71	9.41	0.00	0.00	0.00	5.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13
10	ER1b	ExonRegion	0	2.03	2.23	3.27	5.47	1.69	7.48	3.85	0.64	4.49	3.30	5.32	2.71	0.41	0.49	0.00	2.55	5.44	1.47	1.11	4.19	16.29	0.63	0.00	0.00	0.99	0.00	0.64	3.09	7.26
11	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	8.73	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	2.24	1.40	4.07	6.39	9.37	0.00	0.95	0.00	3.82	8.64	4.62	8.09	0.00	9.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.46	8.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00
13	I1	Intron	0	1.80	1.75	0.80	1.03	0.94	1.45	1.59	0.84	5.51	2.46	2.28	4.92	0.56	0.41	0.57	1.39	4.62	0.65	0.38	2.03	7.83	0.39	0.74	1.70	0.38	0.08	0.31	2.23	1.44
14	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	2.31	0.83	0.00	1.17	3.62	4.98	4.64	0.00	0.56	0.00	0.00	3.74	0.81	1.34	1.15	8.34	0.00	0.00	2.70	0.00	0.00	0.00	2.73	1.67
15	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	2.54	2.15	0.00	0.00	0.00	1.00	1.82	1.09	3.67	4.26	1.51	2.76	0.45	0.22	1.00	1.53	4.26	0.33	0.32	2.61	7.90	0.71	0.36	2.23	0.28	0.00	1.26	1.08	1.74
16	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.00	1.60	0.00	0.00	0.57	1.88	2.81	0.65	10.17	2.73	1.56	7.44	0.53	0.43	1.63	2.68	6.50	1.19	0.75	3.15	10.36	0.21	0.64	1.39	0.50	0.00	0.00	1.59	2.31
17	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.78	5.13	0.00	2.59	0.00	1.50	2.06	0.67	2.52	1.57	0.86	7.41	0.00	0.00	0.00	0.00	4.78	0.00	0.00	1.48	6.35	0.10	1.31	1.56	0.52	0.00	0.00	2.91	1.28
18	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.16	1.32	1.87	2.01	1.64	1.39	0.92	0.93	5.38	1.29	2.93	4.62	0.80	0.56	0.00	1.11	4.02	0.65	0.18	1.38	6.76	0.39	1.01	1.45	0.40	0.18	0.00	3.01	0.85
19	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	5.73	0.00	0.00	12.70	0.00	0.00	4.23	1.56	2.85	7.29	0.00	0.00	0.00	0.00	5.18	0.00	0.00	3.23	3.81	0.00	0.00	0.00	1.82	1.72	0.00	1.80	0.00
20	ER2a	ExonRegion	0	4.51	0.00	3.41	6.93	0.00	5.82	4.56	0.00	9.01	6.61	4.10	3.31	0.00	1.14	0.00	0.00	4.66	0.00	0.00	4.47	9.23	0.00	0.80	5.77	0.56	0.26	7.87	6.64	1.54
21	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.93	3.12	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.64
22	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	0.00	0.00	0.00	9.68	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.70	2.02	0.00	0.00	0.00
23	E2a_E4a	NovelJunction	0	3.01	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	5.03	2.09	0.00	0.00	3.23	3.37	0.00	0.91	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	4.05	3.37	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	1.80	0.00
24	E2_Db	NovelBoundary	0	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.69	0.00	2.50	0.00	6.11	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	3.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.67	0.00
25	E2b_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER2b	ExonRegion	0	0.13	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	1.44	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	1.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51
27	I2	Intron	0	0.77	0.48	0.94	1.15	0.39	0.88	0.73	0.96	2.49	1.96	0.71	1.31	0.26	0.22	0.22	1.33	3.04	0.62	0.64	1.03	5.87	0.14	0.00	0.34	0.00	0.13	0.59	2.87	0.56
28	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.77	0.48	0.94	1.15	0.39	0.88	0.73	0.96	2.49	1.96	0.71	1.31	0.26	0.22	0.22	1.33	3.05	0.62	0.64	1.03	5.88	0.14	0.00	0.34	0.00	0.13	0.59	2.87	0.56
29	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	6.43	0.00	5.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.79	0.00	0.00	0.00	10.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	1.95
30	ER3a	ExonRegion	0	0.00	6.08	0.79	1.49	1.94	0.97	0.71	0.00	2.22	1.36	1.45	2.59	0.00	0.07	2.59	1.17	4.10	0.91	3.02	0.96	9.28	0.00	0.84	1.02	0.86	0.51	1.93	2.26	0.94
31	E3_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	9.65	5.43	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	3.75	7.18	0.00	0.00	0.00	10.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
32	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.78	5.75	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	I3	Intron	0	1.18	1.21	0.39	1.80	0.54	1.06	0.79	0.95	2.11	1.27	0.50	2.33	0.17	0.23	0.52	0.96	2.17	0.48	0.30	1.43	5.02	0.06	0.14	0.57	0.11	0.30	0.40	2.48	0.50
34	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	1.20	1.27	0.39	1.65	0.48	1.03	0.80	1.00	1.95	1.26	0.51	2.29	0.18	0.24	0.55	0.93	2.16	0.51	0.32	1.46	5.06	0.03	0.15	0.57	0.12	0.31	0.42	2.38	0.47
35	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.70	0.00	0.55	4.69	1.56	1.62	0.66	0.00	5.17	1.42	0.39	3.14	0.00	0.00	0.00	1.51	2.57	0.00	0.00	0.90	4.34	0.59	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	4.44	1.09
36	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.95	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	1.83	0.00	0.00	6.20	0.00	0.00	0.00	3.29	4.52	0.00	0.00	0.00	9.71	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	4.97	3.68	0.00
37	ER4a	ExonRegion	0	2.15	2.14	3.93	2.81	1.30	3.32	4.05	5.71	5.93	3.95	3.40	7.32	0.81	1.07	2.54	5.60	5.53	0.00	1.61	6.92	7.51	0.45	1.87	2.70	1.99	1.97	2.65	6.50	3.70
38	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	5.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	4.75	10.74	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	5.15	0.00	2.88	10.57	0.00	2.04	0.00	2.75	4.12	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	1.71	0.00
40	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.63	0.00
41	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	1.61	3.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER5a	ExonRegion	0	2.21	2.44	4.25	2.95	1.56	1.54	2.70	2.40	6.09	3.12	1.41	4.75	0.54	0.25	0.00	3.81	3.57	0.40	1.65	1.06	5.33	0.74	0.91	1.33	1.54	0.97	0.57	0.19	1.72
43	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	1.26	0.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00