Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-298J23.1	Gene	0	5.09	1.21	0.63	1.79	0.00	0.69	0.25	0.46	2.66	3.25	0.15	0.15	0.40	5.37	4.37	2.08	4.11	3.85	1.60	3.00	3.92	2.25	1.13	1.08	2.50	1.38	0.23	4.28	0.59
2	438967	Transcript	0	3.90	0.85	0.44	0.83	0.00	0.55	0.30	0.21	1.59	2.53	0.07	0.18	0.19	4.40	2.96	1.80	2.57	4.04	0.74	3.04	2.98	1.21	1.30	0.89	2.16	1.33	0.27	3.84	0.51
3	ER1a	ExonRegion	0	4.10	1.12	0.58	2.50	0.00	0.50	0.00	0.64	3.02	2.53	0.21	0.00	0.56	3.78	4.26	1.30	4.42	1.01	2.22	0.99	3.22	2.82	0.06	0.75	1.54	0.57	0.00	2.36	0.35
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	2.79	0.00	3.37	8.37	4.62	0.00	0.00	4.97	0.00	0.00	2.81	1.70	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.51	0.38	0.20	0.28	0.00	0.70	0.00	0.22	1.43	2.04	0.05	0.58	0.41	1.74	1.52	0.82	3.92	1.31	0.50	0.54	2.46	0.28	0.21	0.51	0.56	0.55	0.36	2.30	1.31
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.52	0.38	0.20	0.28	0.00	0.70	0.00	0.22	1.43	2.04	0.05	0.58	0.41	1.74	1.52	0.82	3.93	1.31	0.50	0.54	2.47	0.28	0.21	0.51	0.56	0.56	0.36	2.31	1.32
8	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.04	3.52	0.00	2.33	0.00	0.45	0.65	0.00	0.67	4.74	0.00	1.00	0.72	2.19	3.80	3.11	1.49	6.12	0.00	0.45	3.30	0.00	0.00	1.01	1.08	0.87	0.00	0.93	0.46
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.18	2.60	0.32	0.91	0.00	0.79	0.00	0.35	0.38	2.41	0.23	0.83	0.00	1.59	2.14	2.85	3.27	4.26	0.81	0.70	3.59	0.34	0.11	0.50	0.92	0.50	0.00	0.91	0.74
10	Ix	Intron	0	1.71	0.00	0.00	5.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	3.68	1.98	0.00	6.14	2.55	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.20	0.00
11	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.73	0.00	0.00	5.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.75	3.79	2.04	0.00	6.34	2.63	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.36	0.00
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	4.95	0.00	5.78	21.57	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00	1.76	10.91	0.00	0.00	16.60	25.31	0.00	6.93	4.62	16.18	0.00	1.85	2.48	2.46	5.38	0.00	4.03	1.84	12.18	3.93
13	ER2a	ExonRegion	0	7.60	1.43	0.74	0.00	0.00	1.16	0.89	0.00	1.74	5.07	0.00	0.55	0.00	9.43	4.63	4.09	3.29	11.11	0.00	8.14	5.71	0.80	3.85	1.91	4.95	3.42	0.81	9.16	1.19