Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	POU5F1	Gene	0	3.88	2.97	14.42	23.83	1.45	7.43	12.53	17.27	11.40	12.37	4.08	4.35	4.34	1.73	2.14	2.11	3.55	4.06	2.24	3.90	1.85	2.05	0.49	1.40	1.51	1.15	2.57	4.01	9.96
2	259915	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00
3	461401	Transcript	0	4.11	2.63	1.43	2.36	1.63	0.35	0.93	3.43	4.27	9.19	2.47	0.95	1.45	3.40	5.18	2.64	1.92	4.20	0.78	1.11	0.43	1.34	0.42	1.97	0.32	1.99	6.09	1.18	3.17
4	424624	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.59	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.02
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6	471529	Transcript	0	1.92	3.11	0.00	3.85	0.00	0.14	0.00	3.39	1.71	2.66	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	441888	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
8	428184	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
9	461332	Transcript	0	0.00	0.94	4.01	1.04	0.00	0.59	2.02	8.15	3.85	1.86	0.00	1.24	0.93	0.52	0.00	1.08	0.14	0.00	0.00	1.61	0.00	2.32	0.00	0.61	0.41	0.00	0.00	0.00	0.19
10	IG25	Intergenic	0	0.64	0.60	0.66	0.40	0.00	0.96	0.57	2.83	1.15	4.15	0.47	2.35	0.17	0.03	0.61	0.89	0.28	5.79	0.48	4.10	0.72	0.14	0.24	0.24	0.21	0.24	0.03	4.65	0.13
11	IG25_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.64	0.60	0.66	0.40	0.00	0.96	0.57	2.84	1.15	4.15	0.47	2.35	0.17	0.03	0.61	0.89	0.28	5.79	0.48	4.11	0.72	0.14	0.24	0.24	0.21	0.24	0.03	4.66	0.13
12	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00
13	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00	1.80	0.00	2.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.25	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.99	0.00
14	ER1b	ExonRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.19	0.00	1.37	0.00	6.44	0.00	0.04	0.00	2.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.30	0.00	0.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.71	0.00
15	E1_Ac	KnownBoundary	0	7.85	3.59	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	4.68	5.94	0.00	0.00	4.94	0.00	1.00	0.00	0.00	5.85	4.62	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00	2.45	1.48	0.00	0.00	2.29	1.39
16	ER1c	ExonRegion	0	0.44	0.00	0.55	1.15	0.00	0.97	1.32	1.72	0.09	1.89	0.08	1.28	0.56	0.00	0.00	0.00	0.32	2.37	0.00	3.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	1.44	0.00
17	E1_Da	KnownBoundary	0	10.85	0.00	1.54	0.00	0.00	3.15	0.00	0.00	2.77	0.00	0.00	1.36	1.50	2.06	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	0.00	2.39	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00
18	E1a_E1d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	1.17	0.00	0.00	3.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05
19	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	7.25	0.00	0.00	3.73	4.87	3.37	0.00	0.00	8.67	5.27	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	3.10
20	ER1d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	3.37	0.00	1.19	2.47	3.90	0.00	0.00	0.00	1.00	2.73	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00
21	ER1e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	1.78	1.08	2.42	2.99	0.00	0.70	1.51	3.87	0.09	0.00	0.00	1.00	6.32	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.38	0.00	1.11	0.00
22	E1_Db	KnownBoundary	0	3.01	4.85	1.35	8.41	0.00	5.10	4.81	5.08	4.81	2.04	0.00	0.00	15.57	4.50	9.97	0.00	13.73	9.76	0.00	4.05	0.00	0.00	0.00	8.91	0.00	0.00	0.00	14.96	0.00
23	ER1f	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	6.53	0.00	2.40	5.15	12.46	0.12	0.00	0.00	1.24	0.97	0.91	0.00	0.00	0.13	4.12	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00
24	E1_Dc	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00	2.14	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	2.48	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
25	E1c_E3d	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	1.76	2.40	20.80	4.20	8.03	3.07	11.75	1.50	2.35	0.00	10.94	10.13	4.62	0.00	0.00	10.23	0.00	0.00	2.99	11.02	2.19	0.00	4.36	4.99
26	I1	Intron	0	0.77	0.00	0.60	3.88	0.00	0.99	0.73	1.66	0.61	1.82	0.00	1.55	0.82	0.00	0.99	0.89	0.54	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.33	0.88	0.24
27	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.78	0.00	0.61	3.90	0.00	1.00	0.73	1.67	0.61	1.83	0.00	1.56	0.82	0.00	1.00	0.90	0.54	1.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.33	0.89	0.24
28	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	I2	Intron	0	1.69	1.70	1.16	2.25	0.46	2.17	1.84	4.87	4.60	9.32	1.69	1.78	1.02	0.58	0.00	1.31	1.17	4.12	3.62	1.13	0.85	0.62	0.40	1.02	0.67	0.69	1.10	1.54	0.48
30	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.97	0.15	1.36	1.30	0.66	2.37	2.10	6.26	3.00	7.66	1.78	2.23	0.50	0.20	0.00	1.09	0.61	4.44	2.32	1.25	0.71	0.24	0.25	0.49	0.65	0.64	0.08	1.62	0.49
31	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.33	5.24	0.69	4.44	0.00	1.72	1.25	1.72	8.30	13.16	1.48	0.77	2.20	1.45	0.00	1.80	2.46	3.42	6.62	0.86	1.18	1.49	0.75	2.23	0.74	0.81	3.42	1.35	0.49
32	E3_Aa	NovelBoundary	0	3.01	18.03	1.25	0.00	0.00	7.06	5.03	2.44	7.77	19.17	1.27	0.00	1.43	3.28	0.00	6.73	4.05	0.00	8.09	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	7.12	1.72	0.00	4.04	2.05
33	E3_Ab	NovelBoundary	0	8.49	12.41	2.92	8.63	0.00	1.96	0.00	7.27	8.92	11.90	12.75	1.54	2.99	1.13	0.00	7.34	2.79	0.00	8.09	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	5.64	8.67	9.99	0.00	3.73
34	ER3a	ExonRegion	0	1.92	3.11	0.00	3.85	0.00	0.14	0.00	3.39	1.71	2.66	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER3b	ExonRegion	0	3.94	5.04	0.30	3.40	0.00	6.97	2.88	5.27	12.78	22.14	0.24	0.73	8.07	1.69	0.00	4.33	3.17	9.90	9.10	1.86	1.44	1.59	0.00	0.00	0.85	0.93	8.41	2.08	4.56
36	E3_Ac	KnownBoundary	0	8.32	0.00	1.32	0.00	0.00	12.47	2.92	4.43	25.09	41.18	2.91	0.00	3.41	1.82	0.00	0.00	10.78	4.62	0.00	0.00	4.81	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	4.58	3.27
37	ER3c	ExonRegion	0	6.14	9.29	2.32	4.75	2.13	3.90	1.55	4.94	16.73	20.24	3.18	3.59	5.09	1.45	3.49	4.89	9.00	5.67	10.10	3.48	3.91	2.56	0.00	0.00	4.50	1.88	7.84	3.51	2.39
38	E3_Ad	KnownBoundary	0	6.02	3.49	4.91	10.78	0.00	3.88	2.17	7.61	10.78	9.87	1.61	4.22	10.41	1.02	17.54	6.81	6.82	4.62	24.28	7.53	0.00	6.37	1.82	0.00	3.79	10.73	19.98	0.00	5.41
39	ER3d	ExonRegion	0	4.08	1.38	4.05	6.77	0.05	5.59	1.76	18.53	15.03	22.84	4.27	4.17	4.13	2.67	5.66	4.02	7.68	8.73	6.15	7.31	1.44	3.07	0.93	3.42	1.23	4.86	10.57	2.30	6.98
40	E3_Da	KnownBoundary	0	6.02	0.00	10.07	28.47	0.00	0.00	10.81	34.29	17.02	15.70	1.52	2.92	7.39	3.83	15.55	10.10	12.38	4.62	16.18	21.67	12.55	6.71	6.55	2.39	3.37	8.07	7.45	8.99	12.38
41	E3a_E3e	KnownJunction	0	8.43	4.46	5.95	0.00	0.00	3.76	2.80	9.16	11.79	9.43	1.46	1.87	1.94	3.23	16.94	3.67	15.51	4.88	0.00	7.94	7.50	8.99	4.68	8.49	3.37	4.16	0.00	4.40	10.60
42	E3_Db	KnownBoundary	0	5.25	4.85	1.54	0.00	7.37	0.00	0.00	2.04	11.79	10.47	11.07	1.87	4.04	3.23	8.17	0.00	5.96	4.62	0.00	0.00	1.64	6.47	0.00	0.00	0.00	2.19	9.99	0.00	1.45
43	E3b_E3f	KnownJunction	0	5.72	3.97	13.48	60.83	7.37	14.04	2.80	58.52	21.96	18.06	2.53	11.60	12.67	5.10	19.13	3.14	12.83	10.79	8.09	14.14	3.33	11.23	6.55	21.29	3.41	23.99	0.00	6.16	6.01
44	ER3e	ExonRegion	0	5.72	1.09	5.24	43.88	4.98	3.67	2.02	36.21	19.10	17.33	12.30	4.95	1.30	4.54	3.73	2.53	10.02	3.64	4.53	19.67	5.71	6.01	3.62	2.87	0.48	4.19	7.33	2.17	10.29
45	ER3f	ExonRegion	0	10.72	4.93	8.72	44.21	4.98	6.81	3.30	41.09	23.85	20.87	8.98	5.23	3.01	5.61	12.98	1.04	12.52	8.31	4.73	17.12	9.34	11.23	4.03	7.24	0.52	6.29	7.33	4.15	9.82
46	ER3g	ExonRegion	0	4.11	2.63	1.43	2.36	1.63	0.35	0.93	3.43	4.27	9.19	2.47	0.95	1.45	3.40	5.18	2.64	1.92	4.20	0.78	1.11	0.43	1.34	0.42	1.97	0.32	1.99	6.09	1.18	3.17
47	E3_Af	NovelBoundary	0	2.30	3.78	0.00	10.35	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49	5.55	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	3.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00
48	E3_Dc	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.99	3.48	0.00	0.00	4.90	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	ER3h	ExonRegion	0	4.29	0.00	6.73	36.56	0.00	9.62	2.02	42.34	12.36	11.55	1.19	6.18	5.20	1.81	5.60	0.00	2.00	8.19	13.58	8.43	7.13	5.41	5.42	6.45	0.00	4.71	0.00	6.52	2.68
50	ER3i	ExonRegion	0	1.36	2.78	34.09	24.94	1.93	3.51	4.27	22.69	7.73	8.88	0.36	6.45	4.47	0.89	2.69	1.75	2.53	4.19	2.77	4.36	0.92	3.95	1.33	4.57	0.55	0.58	2.17	3.08	0.97
51	E3_Dd	NovelBoundary	0	2.89	0.00	1.94	0.00	0.00	0.00	2.92	2.54	8.34	16.62	0.00	4.49	0.00	1.35	0.00	0.00	2.79	5.39	0.00	0.00	0.00	7.10	0.00	0.00	0.00	2.19	0.00	8.49	3.04
52	E3d_E4b	KnownJunction	0	11.38	14.54	22.02	10.35	0.00	3.84	8.24	64.10	28.23	28.56	1.33	15.33	6.43	12.47	8.97	14.31	20.96	0.00	0.00	23.49	13.92	0.00	0.00	24.17	6.86	8.15	0.00	2.07	6.34
53	I3	Intron	0	2.36	3.97	2.76	1.32	0.00	4.29	2.96	6.08	3.60	11.39	1.31	1.47	2.02	1.41	0.00	0.46	1.64	2.53	2.34	0.00	0.79	2.65	1.00	1.58	0.79	1.44	1.01	2.99	0.74
54	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	2.48	4.19	3.27	1.56	0.00	4.66	3.29	6.75	3.71	11.92	1.55	1.60	2.31	1.51	0.00	0.54	1.94	3.00	1.96	0.00	0.93	3.13	1.18	1.76	0.93	1.56	1.19	3.43	0.87
55	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	1.74	2.84	0.00	0.00	0.00	2.19	1.09	2.34	3.04	8.12	0.00	0.74	0.35	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	4.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.76	0.00	0.48	0.00
56	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.25	0.00	0.00	3.38	0.00	4.88	6.09	0.00	1.49	3.25	4.43	0.00	8.37	3.82	2.23	4.62	0.00	0.00	0.00	2.48	4.58	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	E4_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.47	3.11	3.52	0.00	0.00	1.59	0.84	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.07	2.84
58	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.94	4.01	1.04	0.00	0.59	2.02	8.15	3.85	1.86	0.00	1.24	0.93	0.52	0.00	1.08	0.14	0.00	0.00	1.61	0.00	2.32	0.00	0.61	0.41	0.00	0.00	0.00	0.19
59	ER4b	ExonRegion	0	2.60	2.25	35.28	80.16	5.42	9.34	29.42	38.15	18.87	15.04	3.45	5.70	6.88	1.29	5.03	2.53	4.69	1.24	0.00	4.55	2.23	2.53	0.58	3.24	2.06	1.42	0.38	4.79	31.75
60	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.17	1.27	0.00	7.22	3.91	2.29	0.00	5.97	3.67	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	6.43	3.58	4.62	0.00	0.00	0.00	1.94	0.00	0.00	1.63	4.16	0.00	0.00	4.69
61	E4a_E5a	KnownJunction	0	7.96	4.85	30.42	10.78	7.37	9.40	15.05	48.72	41.96	9.35	4.40	6.99	10.13	3.77	24.91	7.65	22.42	0.00	0.00	14.14	9.55	4.47	0.00	8.43	7.88	1.76	2.44	4.27	11.65
62	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	1.46	15.18	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
63	ER5a	ExonRegion	0	7.63	6.58	42.76	42.01	1.29	14.04	39.88	37.80	25.44	19.15	10.74	10.79	8.23	2.15	0.17	2.82	6.27	4.02	0.00	6.06	2.94	2.70	0.35	1.31	2.92	0.56	0.82	9.95	30.31
64	E5_Da	KnownBoundary	0	25.01	4.36	52.79	94.26	14.44	19.84	37.48	38.02	14.71	24.29	24.67	9.88	8.88	5.81	7.77	3.75	14.92	0.00	0.00	7.86	5.74	0.00	0.00	5.62	9.43	6.05	0.00	14.78	20.30
65	ER5b	ExonRegion	0	6.89	2.72	16.72	52.83	2.06	22.60	23.59	27.62	16.97	19.08	9.87	6.32	6.82	3.24	1.62	2.43	3.84	3.39	3.72	4.36	4.53	3.47	1.05	0.88	3.27	1.02	0.36	6.31	12.39
66	ER5c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
67	IG24	Intergenic	0	5.94	8.93	0.00	3.97	0.00	5.33	1.12	4.08	6.84	8.00	5.28	1.71	3.23	1.51	5.11	3.74	0.83	1.07	3.54	1.53	3.16	6.00	3.01	0.00	1.58	1.74	1.02	3.61	0.74
68	IG24_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	6.01	9.02	0.00	4.02	0.00	5.39	1.13	4.13	6.91	8.09	5.34	1.73	3.27	1.53	5.17	3.78	0.84	1.08	3.58	1.54	3.20	6.06	3.02	0.00	1.60	1.76	1.03	3.65	0.75