Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	Z93017.2	Gene	0	1.94	1.49	3.91	4.57	0.26	1.61	3.43	0.39	2.00	3.37	2.53	2.88	2.79	1.61	2.39	9.14	19.27	1.65	1.70	1.89	1.52	0.96	0.48	1.14	1.37	5.26	1.46	0.78	2.24
2	432722	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	374458	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00
4	IG26	Intergenic	0	1.46	3.28	2.70	3.56	0.00	3.16	2.75	1.48	8.38	4.66	2.00	2.26	1.53	2.30	3.94	10.94	18.90	1.91	3.77	1.20	3.18	0.89	0.22	2.40	3.46	5.27	0.11	1.92	1.29
5	IG26_SR1	SilentIntergenicRegion	0	1.46	3.29	2.70	3.57	0.00	3.16	2.75	1.49	8.40	4.67	2.00	2.26	1.53	2.31	3.95	10.96	18.93	1.92	3.78	1.20	3.19	0.90	0.22	2.41	3.47	5.27	0.11	1.92	1.29
6	ER1a	ExonRegion	0	1.31	1.83	2.05	2.20	0.00	1.05	1.23	0.00	2.58	3.10	0.55	1.13	1.29	1.60	3.80	4.45	23.08	2.70	1.96	1.69	1.73	0.00	0.28	1.01	1.75	3.14	0.00	0.25	0.41
7	E1_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	1.12	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	3.29	0.00	0.00	1.72	1.46	2.22	7.97	6.58	21.25	5.39	0.00	0.00	3.25	0.00	0.00	2.75	3.86	0.00	0.00	2.11	4.56
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	I1	Intron	0	3.49	3.00	3.76	2.78	0.00	3.20	3.60	1.00	5.53	6.72	2.96	2.49	0.76	3.23	5.58	18.03	44.84	3.14	2.23	0.21	4.76	0.42	0.56	1.84	2.44	7.44	0.28	0.63	0.99
10	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	3.89	3.15	3.29	2.91	0.00	3.42	4.39	0.92	6.00	7.15	2.66	2.02	0.78	3.13	5.75	17.64	47.15	2.97	2.55	0.04	4.83	0.39	0.54	1.68	2.91	7.76	0.23	0.40	1.27
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.09	6.01	9.83	5.70	0.00	4.03	0.24	0.97	4.36	5.26	5.04	5.30	1.67	4.58	7.97	23.55	48.86	5.09	1.00	2.05	5.68	1.28	0.00	5.83	1.96	6.10	1.21	1.05	0.00
12	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	1.45	0.04	2.51	0.00	0.00	1.36	1.22	1.56	3.61	5.33	3.34	3.43	0.00	2.99	2.93	16.93	28.97	2.89	1.24	0.00	3.80	0.00	1.10	0.00	0.00	6.62	0.00	1.75	0.00
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.78	3.68	6.65	0.00	0.00	1.96	2.23	0.00	7.58	3.20	1.23	4.13	1.50	5.23	7.77	44.37	42.72	0.00	8.09	7.36	2.05	2.14	0.00	0.00	8.22	17.68	2.14	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	2.90	5.81	0.01	0.00	0.00	3.10	4.55	0.78	2.28	3.86	0.54	2.78	1.18	2.63	0.00	7.84	12.31	4.35	1.44	3.38	1.33	0.13	0.82	0.91	0.00	4.87	0.00	0.72	1.51
15	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	8.34	2.42	0.00	0.00	1.96	2.80	0.00	6.94	3.64	1.30	2.50	3.09	3.46	8.37	36.18	43.35	4.62	8.09	0.00	3.77	0.00	1.87	0.00	1.86	3.69	9.94	0.00	0.00
16	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	I2	Intron	0	1.37	4.11	2.13	4.57	0.00	3.07	3.86	0.00	0.00	4.14	1.14	1.18	1.03	1.73	2.94	15.37	15.22	1.84	0.00	3.51	0.45	1.15	0.58	0.00	1.37	9.52	0.00	1.04	1.07
18	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	1.38	4.16	2.16	4.63	0.00	3.11	3.90	0.00	0.00	4.19	1.15	1.20	1.04	1.75	2.98	15.57	15.40	1.87	0.00	3.56	0.46	1.16	0.58	0.00	1.38	9.64	0.00	1.05	1.08
19	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	1.84	5.55	0.00	7.92	0.00	1.49	3.31	0.00	4.76	0.00	3.29	25.46	5.39	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	2.10	0.00	0.00	1.29
20	ER3a	ExonRegion	0	2.93	0.00	1.81	4.91	0.00	0.00	4.80	0.04	2.11	4.04	1.63	1.27	2.90	1.70	3.46	9.72	17.69	0.00	2.07	1.72	0.98	1.14	0.62	1.47	0.98	1.66	0.00	1.07	0.46
21	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.17	3.64	1.27	3.43	0.00	1.00	18.34	7.65	15.04	9.25	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	2.57	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00
22	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I3	Intron	0	0.98	0.74	0.77	0.00	0.00	2.84	1.85	0.85	1.93	1.99	2.19	1.13	0.74	1.87	0.00	12.88	18.18	0.44	0.00	0.00	1.64	0.83	0.83	0.49	0.33	4.33	0.42	0.37	0.77
24	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.17	1.01	1.05	0.00	0.00	2.65	2.52	0.76	2.04	2.26	2.69	1.26	1.01	1.86	0.00	15.60	24.32	0.60	0.00	0.00	1.83	0.45	1.02	0.26	0.45	5.90	0.57	0.51	1.05
25	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00	5.45	0.00	1.84	2.25	1.83	1.19	1.24	0.00	3.17	0.00	9.34	2.70	0.00	0.00	0.00	1.98	3.19	0.70	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.51	0.00	0.00	3.76	7.09	3.78	4.87	0.00	0.00	3.01	1.69	3.04	0.00	7.34	4.91	0.00	16.18	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	6.14
27	ER4a	ExonRegion	0	4.97	1.24	21.22	22.16	1.89	5.84	12.49	2.13	3.69	8.87	14.71	14.29	11.72	3.50	3.90	37.50	51.41	1.49	3.84	4.62	3.86	5.57	1.40	3.32	4.42	23.68	10.61	3.21	13.46
28	E4_Da	NovelBoundary	0	2.54	0.00	1.00	10.78	6.78	12.01	2.80	4.63	2.47	4.91	1.46	6.14	5.60	0.00	8.37	23.41	5.33	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.07	1.80	0.00
29	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00	3.37	0.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	E5a_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.18	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.85	0.00	0.00	0.00	1.69	2.92	0.00	0.00	0.00	1.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	5.37	0.00	0.00	3.05	0.00	1.89	7.60	0.00	0.00
37	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00
38	E6_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER6b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00