Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AL353597.1	Gene	0	0.06	2.63	7.85	0.19	0.00	2.19	0.32	0.44	0.86	12.78	1.65	0.45	0.63	4.84	7.86	38.75	8.56	0.94	0.34	1.03	2.35	0.84	0.92	7.82	3.13	11.03	2.03	0.68	1.44
2	373404	Transcript	0	0.07	3.24	2.90	2.07	0.00	2.42	1.16	0.06	1.03	14.16	1.41	0.14	0.22	2.41	4.12	7.21	5.26	0.59	0.09	1.16	1.19	0.78	0.13	3.91	1.78	9.31	0.70	1.01	0.23
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	1.12	2.79	1.25	0.00	0.24	0.70	0.00	0.00	8.45	1.16	0.22	0.00	1.66	1.62	0.00	4.12	0.66	0.00	0.00	1.24	0.63	0.00	1.87	0.00	2.35	0.00	0.26	0.23
6	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.57	33.28	0.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.25	0.00	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	0.00	2.53	3.49	1.46	0.00	0.90	1.93	0.00	0.00	25.55	0.83	0.00	0.91	2.25	6.72	11.82	3.73	2.81	0.00	2.41	6.17	1.31	0.00	6.05	0.59	10.40	1.33	0.33	0.00
8	E2_Da	NovelBoundary	0	8.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.03	0.00	0.00	0.00	0.93	8.17	17.37	3.49	0.00	0.00	0.00	4.09	0.00	0.00	0.00	0.00	6.57	9.94	0.00	0.00
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	8.73	4.53	9.71	0.00	1.57	5.32	0.00	1.74	22.81	0.00	0.00	0.00	1.33	7.77	0.00	5.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	1.93	3.82	0.00	0.00	0.00
10	I2	Intron	0	0.59	1.34	0.46	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.17	0.18	0.38	8.77	11.71	0.62	0.27	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.89	0.99	0.43	2.28	0.45	0.19
11	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.59	1.34	0.46	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.17	0.18	0.38	8.77	11.71	0.62	0.27	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.89	0.99	0.43	2.28	0.45	0.19
12	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	4.75	1.52	0.00	0.00	7.83	0.00	0.00	1.71	25.05	5.98	0.00	0.00	5.36	0.00	0.00	9.54	0.00	0.00	3.72	0.00	2.33	0.00	5.50	3.86	29.27	0.00	4.49	0.00
13	ER3a	ExonRegion	0	0.00	7.75	4.85	7.31	0.00	6.38	2.82	0.00	1.12	28.30	2.33	0.15	0.00	3.45	1.79	0.71	10.14	0.00	0.00	2.81	0.11	1.66	0.00	3.27	4.29	21.37	0.00	3.26	0.00
14	I3	Intron	0	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.16	0.00	0.00	0.84	4.74	48.21	2.18	0.00	0.00	0.37	0.76	0.00	0.72	0.85	1.51	2.08	6.55	0.65	1.51
15	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.18	0.00	0.00	0.85	5.55	47.89	2.48	0.00	0.00	0.43	0.88	0.00	0.64	0.78	1.75	2.03	7.40	0.75	1.46
16	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00	50.94	0.40	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	1.22	1.33	0.13	2.43	1.60	0.06	1.85
17	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	3.35	8.77	71.76	2.68	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.81	2.19	2.53	0.00	2.05
18	ER4a	ExonRegion	0	0.00	2.92	9.61	0.15	0.00	2.38	0.34	0.56	0.58	14.01	1.87	0.49	0.74	5.63	8.30	48.61	9.61	0.93	0.38	1.20	2.62	0.94	1.17	8.65	3.75	12.88	2.21	0.80	1.80
19	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	4.46	15.40	0.00	0.00	5.22	0.00	0.00	0.00	19.17	1.49	3.07	1.62	12.61	0.00	48.96	9.50	0.00	0.00	6.45	4.05	0.00	2.12	11.25	0.00	21.11	0.00	0.00	1.62
20	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	I4	Intron	0	0.39	7.81	10.19	1.32	0.00	3.16	1.05	0.39	1.65	23.35	4.96	0.89	2.02	12.04	8.59	29.09	12.25	2.57	0.00	1.56	3.58	0.55	2.22	22.60	4.55	17.09	4.94	0.80	1.39
22	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.17	8.24	12.54	0.00	0.00	2.83	1.51	0.00	2.93	22.98	3.32	0.63	1.38	12.76	14.39	116.55	12.99	2.72	0.00	2.11	1.64	0.00	0.98	27.05	4.69	26.08	4.18	1.34	1.58
23	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.27	8.10	10.25	1.62	0.00	3.37	1.01	0.49	1.49	24.30	5.40	0.98	2.24	12.41	7.76	14.25	12.70	2.66	0.00	1.53	4.11	0.68	2.48	22.61	4.64	16.01	5.31	0.74	1.42
24	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.60	1.90	0.00	0.00	1.45	3.68	3.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	5.14	2.28	5.01	0.00	0.00	0.00
25	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.77	8.14	10.41	0.00	0.00	3.41	0.00	0.00	12.85	16.74	1.52	4.19	11.62	9.00	24.52	13.62	16.14	0.00	0.00	7.36	5.70	6.61	2.17	23.93	6.59	17.38	6.51	2.07	3.10
26	ER5a	ExonRegion	0	0.59	2.44	2.12	0.00	0.00	2.67	0.00	0.00	4.10	11.64	1.65	0.60	0.36	3.67	12.51	3.41	9.10	1.60	0.44	0.27	1.78	0.75	0.00	9.25	1.58	6.10	2.79	0.23	0.28