Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	APOBEC2	Gene	0	1.66	0.64	0.95	2.92	0.99	1.56	1.31	0.67	4.81	1.47	0.68	1.48	2.00	2.12	3.66	2.87	9.17	1.96	1.17	0.90	1.62	1.47	0.51	2.71	1.34	0.96	0.30	0.93	1.69
2	426505	Transcript	0	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.00	0.05	0.00	0.00	0.73	0.00	1.10	0.47	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	244669	Transcript	0	1.35	0.49	0.69	2.50	0.63	1.51	1.55	0.57	4.27	1.67	0.68	1.46	2.00	1.99	3.60	2.71	8.59	1.92	1.09	1.03	1.22	1.40	0.46	2.57	0.97	0.75	0.29	1.01	1.53
4	ER1a	ExonRegion	0	2.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.71	0.00	0.11	0.00	0.00	1.45	0.00	2.20	0.94	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1_Ab	KnownBoundary	0	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	9.97	0.00	8.10	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1b	ExonRegion	0	1.13	0.00	0.07	2.10	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	0.42	0.35	0.30	0.01	0.27	0.74	0.00	0.92	0.00	0.94	0.00	0.97	0.00	0.00	0.63	0.42	0.00	0.00	0.96	0.39
7	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	1.36	0.00	1.31	0.00	0.00	3.60	0.00	0.00	4.05	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.52	0.00
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	1.55	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.42	1.46	0.39	0.91	0.00	3.40	1.53	0.46	2.56	6.79	1.96	2.48	1.90	2.33	3.17	5.83	9.53	1.38	0.59	1.74	4.55	0.23	0.89	4.94	1.90	0.45	1.43	1.67	0.89
11	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	2.12	1.47	0.27	0.00	0.00	2.75	0.61	0.00	3.89	2.76	1.09	2.49	0.64	2.19	4.94	3.17	12.72	2.10	1.95	1.56	1.45	0.55	0.41	2.78	0.87	0.36	0.70	0.99	1.95
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.74	2.23	0.58	0.00	0.00	2.38	0.70	0.00	4.07	5.01	0.41	3.63	2.24	0.94	9.91	3.44	9.84	1.34	0.00	3.82	0.00	0.00	0.63	0.00	1.49	1.09	0.00	3.96	2.32
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.55	0.00	6.93	0.00	0.00	0.00	6.09	0.00	1.36	6.72	0.00	1.84	0.00	10.40	16.81	0.00	0.00	0.00	1.89	2.43	0.00	14.71	0.00	6.05	0.00	2.16	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	4.08	1.37	0.56	0.00	3.89	0.00	1.99	0.12	2.04	2.87	6.06	0.75	12.09	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19
15	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.73	2.75	0.00	5.85	0.00	0.00	0.00	2.90	2.42	16.34	3.75	24.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	1.75
16	E2a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	ER2b	ExonRegion	0	1.32	0.00	1.02	0.00	0.00	2.45	2.56	0.88	3.61	2.47	0.43	2.44	4.05	2.29	5.76	4.30	12.71	2.93	1.52	1.31	1.39	2.06	0.00	4.18	0.00	0.00	0.00	1.52	0.28
18	E2_Ab	KnownBoundary	0	2.65	0.00	3.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.90	2.04	1.39	3.10	0.00	1.22	0.00	10.40	9.88	9.25	0.00	0.00	0.00	2.43	0.00	8.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	ER2c	ExonRegion	0	1.47	0.59	2.42	1.83	2.49	1.77	1.74	0.94	7.66	0.52	0.07	2.31	4.14	2.59	1.40	6.90	12.03	2.74	1.63	0.70	2.65	2.93	0.46	3.54	0.99	1.14	0.00	0.85	0.85
20	E2_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	9.14	0.00	1.36	1.87	5.51	6.34	0.00	0.00	15.62	4.62	0.00	0.00	3.85	3.60	0.00	2.51	1.59	3.18	0.00	0.00	0.00
21	ER2d	ExonRegion	0	2.22	0.60	0.93	5.57	2.53	1.04	2.40	0.48	7.78	1.85	1.53	1.56	2.33	3.08	2.39	4.56	10.73	2.62	1.65	1.43	1.72	1.98	0.94	2.35	0.85	1.24	0.47	1.69	2.95
22	E2_Dc	NovelBoundary	0	4.60	0.00	1.40	0.00	12.82	0.00	2.52	0.00	15.93	0.00	1.49	1.54	1.24	6.71	18.34	0.00	29.53	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	2.36	2.75	0.00	0.00	0.00	3.77	5.22
23	E2c_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix	Intron	0	1.67	0.79	0.39	0.68	1.15	1.49	1.62	0.30	7.59	2.83	1.38	2.37	1.86	2.13	4.23	2.71	11.18	1.20	0.38	2.05	2.22	0.38	0.30	5.44	1.69	0.78	0.30	0.96	1.89
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.00	1.36	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.51	0.15	0.56	0.00	2.04	2.57	2.51	0.31	9.79	2.80	0.65	3.19	1.41	3.68	3.98	3.66	10.93	1.06	0.80	3.19	3.19	0.75	0.45	8.20	2.35	1.05	0.46	1.22	2.18
27	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.59	0.60	0.00	0.00	2.91	1.81	1.07	0.37	7.50	1.66	2.81	2.33	4.85	2.96	6.58	1.73	13.93	1.79	0.00	0.71	4.37	0.00	0.36	3.77	2.22	0.40	0.00	0.00	0.45
28	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.36	0.90	0.00	0.00	0.00	0.07	1.76	0.00	10.79	1.52	5.92	0.68	1.92	2.81	6.58	2.21	18.23	4.23	0.00	2.81	4.10	0.00	0.00	1.56	2.68	1.38	0.00	0.00	2.68
29	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	7.39	0.00	0.00	0.00	1.37	2.02	0.00	5.76	2.89	4.76	0.00	2.60	0.91	11.20	2.53	19.53	1.71	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.68
30	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.94	3.45	0.11	2.09	0.00	0.96	1.05	0.74	7.24	3.33	1.53	1.92	1.40	1.20	2.16	1.76	14.11	1.65	0.47	0.08	0.82	0.00	0.00	3.96	0.42	0.46	0.00	1.90	1.82
31	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.55	0.00	0.23	1.24	0.42	0.24	1.22	0.20	6.11	2.61	0.82	2.16	1.72	1.27	1.74	3.57	9.02	1.05	0.28	3.45	1.22	0.31	0.00	5.07	0.74	0.41	0.63	0.56	2.07
32	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	2.10	0.00	0.65	0.00	0.00	1.75	1.24	0.00	5.11	5.38	2.33	2.82	1.48	1.01	9.44	2.19	7.63	0.00	0.00	0.65	1.52	0.00	1.18	5.36	2.58	1.99	0.00	2.13	1.57
33	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.69	1.21	0.00	8.99	4.48	0.60	0.00	0.00	1.81	5.60	0.25	15.73	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	4.30	1.43	0.94	0.00	0.00	1.74
34	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	2.76	1.38	1.90	0.00	2.09	3.53	2.59	0.00	7.93	2.48	1.48	1.32	0.56	0.85	11.25	0.00	11.06	0.83	0.00	0.00	2.17	1.55	0.77	3.67	4.46	1.35	0.00	0.00	3.25
35	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	12.64	0.00	5.16	2.98	6.91	0.00	0.00	3.82	14.88	0.00	8.09	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER3a	ExonRegion	0	1.87	1.37	0.82	4.45	0.00	2.57	1.25	0.91	5.70	2.35	0.74	1.83	1.61	2.59	6.27	1.98	10.92	2.14	1.19	1.37	1.77	1.57	0.90	3.74	3.02	1.78	0.68	0.81	2.91