Summary page for 'HMGA1' (ENSG00000137309) - Project: DLBCL_ABC_GCB
Basic Gene Stats
Species: Human
Gene Name: 'HMGA1' (HUGO: HMGA1)
ALEXA Gene ID: 7545 (ALEXA_hs_57_37b)
EnsEMBL Gene ID: ENSG00000137309
Entrez Gene Record(s): HMGA1
Ensembl Gene Record: ENSG00000137309
Evidence: Known Gene
Gene Type: protein_coding
Location: chr6 34204577-34214008 (+): 6p21
Size (bp): 9432
Description: high mobility group AT-hook 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:5010]
Data links for each library (displays expression data in UCSC Genome Browser)
Comparison: HS0932_vs_HS1181
ABC_RG049 (HS0932) has 28,591 total reads for 'HMGA1'. UCSC data links: (C | P)
GCB_RG069 (HS1181) has 66,018 total reads for 'HMGA1'. UCSC data links: (C | P)
Link to other genes in the same chromosome region as 'HMGA1'
Features defined for this gene: 129
Gene: 1
Transcript: 12
ExonRegion: 16
Junction: 39
KnownJunction: 12
NovelJunction: 27
Boundary: 20
KnownBoundary: 6
NovelBoundary: 14
Intron: 6
ActiveIntronRegion: 9
SilentIntronRegion: 18
Intergenic: 2
ActiveIntergenicRegion: 3
SilentIntergenicRegion: 4
Summary of transcript specific features for 'HMGA1' (ENSG00000137309)
ENST00000360434: | NA |
ENST00000401473: | NA |
ENST00000374117: | E5b_E7a |
ENST00000447654: | NA |
ENST00000327014: | NA |
ENST00000357318: | NA |
ENST00000374116: | ER3a, E3a_E4a |
ENST00000395004: | E5a_E7a |
ENST00000478214: | NA |
ENST00000311487: | NA |
ENST00000430198: | NA |
ENST00000347617: | E1a_E4a |
Summary of known expressed features
Expressed above background
Library | Exon Regions (Expressed/Total) | Known Junctions (Expressed/Total) |
ABC_RG012: | 14/16 | 8/12 |
ABC_RG016: | 14/16 | 7/12 |
ABC_RG015: | 11/16 | 7/12 |
ABC_RG046: | 11/16 | 7/12 |
ABC_RG047: | 14/16 | 7/12 |
ABC_RG048: | 14/16 | 9/12 |
ABC_RG049: | 11/16 | 7/12 |
ABC_RG058: | 14/16 | 7/12 |
ABC_RG059: | 14/16 | 8/12 |
ABC_RG061: | 14/16 | 8/12 |
ABC_RG073: | 14/16 | 8/12 |
ABC_RG074: | 14/16 | 8/12 |
ABC_RG086: | 10/16 | 7/12 |
GCB_RG003: | 11/16 | 7/12 |
GCB_RG005: | 13/16 | 8/12 |
GCB_RG006: | 15/16 | 7/12 |
GCB_RG007: | 11/16 | 7/12 |
GCB_RG010: | 11/16 | 6/12 |
GCB_RG014: | 14/16 | 7/12 |
GCB_RG045: | 13/16 | 7/12 |
GCB_RG050: | 14/16 | 9/12 |
GCB_RG055: | 14/16 | 8/12 |
GCB_RG062: | 11/16 | 7/12 |
GCB_RG063: | 14/16 | 8/12 |
GCB_RG064: | 14/16 | 7/12 |
GCB_RG071: | 14/16 | 8/12 |
GCB_RG072: | 14/16 | 7/12 |
GCB_RG069: | 14/16 | 8/12 |
GCB_RG085: | 13/16 | 8/12 |
Detected at any level above 0
Library | Exon Regions (Detected/Total) | Known Junctions (Detected/Total) |
ABC_RG012: | 16/16 | 8/12 |
ABC_RG016: | 16/16 | 7/12 |
ABC_RG015: | 16/16 | 9/12 |
ABC_RG046: | 15/16 | 7/12 |
ABC_RG047: | 16/16 | 7/12 |
ABC_RG048: | 16/16 | 10/12 |
ABC_RG049: | 16/16 | 8/12 |
ABC_RG058: | 16/16 | 7/12 |
ABC_RG059: | 16/16 | 8/12 |
ABC_RG061: | 16/16 | 9/12 |
ABC_RG073: | 16/16 | 8/12 |
ABC_RG074: | 16/16 | 8/12 |
ABC_RG086: | 16/16 | 10/12 |
GCB_RG003: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG005: | 15/16 | 8/12 |
GCB_RG006: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG007: | 16/16 | 9/12 |
GCB_RG010: | 16/16 | 7/12 |
GCB_RG014: | 16/16 | 7/12 |
GCB_RG045: | 15/16 | 7/12 |
GCB_RG050: | 16/16 | 9/12 |
GCB_RG055: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG062: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG063: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG064: | 16/16 | 7/12 |
GCB_RG071: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG072: | 16/16 | 8/12 |
GCB_RG069: | 16/16 | 9/12 |
GCB_RG085: | 16/16 | 8/12 |
Normalized expression data for each known or novel expressed feature of 'HMGA1'
The following table summarizes the expression values of all known features of the gene 'HMGA1' in each library. Known features (i.e. those that correspond to one or more EnsEMBL transcripts) are included regardless of their expression level. Novel features are only reported in this table if they are expressed above the level of intergenic background noise. The 'FID' column reports the unique Feature ID for the gene, transcript, exon region, exon junction, etc. The 'Name' column reports the Feature Name for the feature (e.g. E5a_E6a is the name of an exon junction corresponding to the connection of exons 5 and 6). The 'Type' column reports the type of the feature and may be one of the following: Gene, Transcript, Exon Region, Known Junction, Novel Junction, Known Boundary, Novel Boundary, Silent or Active Intronic Regions, and Silent or Active Intergenic Regions (see our manuscript for more details). The 'Base Count' column reports the number of nucleotide bases for the feature followed by the percent of these that do NOT correspond to repeats and the percent that are known to be protein coding in one or more EnsEMBL transcripts. The 'Supporting ESTs/mRNAs' column reports the number of ESTs and mRNAs that when aligned to the human genome support the expression of a feature (i.e. the sequence alignment coordinates match an exon junction or boundaries of an exon, retained intron, etc.). The 'Conserved Species' column reports the number of 'other' species for which there was at least 1 supporting EST/mRNA alignment. Finally, the remaining columns report the log2 expression value for each feature in each library. Bold values indicate expression above background. Each expression value is also a hyperlink to a view of the feature's corresponding genomic region in the UCSC genome browser. Expression data will automatically be loaded as custom GFF and wiggle tracks.
FID | Name | Type | Base Count (% unmasked | % coding) | Supporting Human ESTs/mRNAs | Conserved Species | ABC_RG012 Log2 Expression | ABC_RG016 Log2 Expression | ABC_RG015 Log2 Expression | ABC_RG046 Log2 Expression | ABC_RG047 Log2 Expression | ABC_RG048 Log2 Expression | ABC_RG049 Log2 Expression | ABC_RG058 Log2 Expression | ABC_RG059 Log2 Expression | ABC_RG061 Log2 Expression | ABC_RG073 Log2 Expression | ABC_RG074 Log2 Expression | ABC_RG086 Log2 Expression | GCB_RG003 Log2 Expression | GCB_RG005 Log2 Expression | GCB_RG006 Log2 Expression | GCB_RG007 Log2 Expression | GCB_RG010 Log2 Expression | GCB_RG014 Log2 Expression | GCB_RG045 Log2 Expression | GCB_RG050 Log2 Expression | GCB_RG055 Log2 Expression | GCB_RG062 Log2 Expression | GCB_RG063 Log2 Expression | GCB_RG064 Log2 Expression | GCB_RG071 Log2 Expression | GCB_RG072 Log2 Expression | GCB_RG069 Log2 Expression | GCB_RG085 Log2 Expression |
G7545 | HMGA1 | Gene | 2575 (92% | 41%) | N/A | N/A | 10.99 (C | P) | 10.43 (C | P) | 11.19 (C | P) | 9.67 (C | P) | 9.68 (C | P) | 10.83 (C | P) | 10.16 (C | P) | 10.37 (C | P) | 10.49 (C | P) | 9.87 (C | P) | 10.11 (C | P) | 11.09 (C | P) | 11.78 (C | P) | 10.53 (C | P) | 10.08 (C | P) | 11.05 (C | P) | 9.98 (C | P) | 11.56 (C | P) | 11.02 (C | P) | 9.72 (C | P) | 12.04 (C | P) | 11.74 (C | P) | 12.40 (C | P) | 9.90 (C | P) | 10.55 (C | P) | 11.46 (C | P) | 10.80 (C | P) | 11.06 (C | P) | 11.18 (C | P) |
T44071 | ENST00000311487 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44079 | ENST00000401473 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44078 | ENST00000395004 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
T44077 | ENST00000374117 | Transcript | 62 (100% | 100%) | N/A | N/A | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.93 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 1.39 (C | P) |
T44080 | ENST00000430198 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44081 | ENST00000447654 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44074 | ENST00000357318 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44073 | ENST00000347617 | Transcript | 62 (100% | 0%) | N/A | N/A | 6.03 (C | P) | 5.55 (C | P) | 7.87 (C | P) | 4.90 (C | P) | 7.05 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.10 (C | P) | 4.25 (C | P) | 5.52 (C | P) | 5.58 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.40 (C | P) | 8.76 (C | P) | 6.50 (C | P) | 5.50 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.12 (C | P) | 7.14 (C | P) | 6.83 (C | P) | 5.65 (C | P) | 7.68 (C | P) | 5.80 (C | P) | 8.85 (C | P) | 4.70 (C | P) | 4.84 (C | P) | 8.32 (C | P) | 9.77 (C | P) | 7.21 (C | P) | 9.59 (C | P) |
T44072 | ENST00000327014 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44082 | ENST00000478214 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
T44076 | ENST00000374116 | Transcript | 229 (100% | 0%) | N/A | N/A | 4.52 (C | P) | 3.02 (C | P) | 2.70 (C | P) | 2.43 (C | P) | 2.46 (C | P) | 3.17 (C | P) | 3.33 (C | P) | 1.28 (C | P) | 2.24 (C | P) | 2.76 (C | P) | 1.50 (C | P) | 3.34 (C | P) | 2.42 (C | P) | 2.62 (C | P) | 3.71 (C | P) | 3.49 (C | P) | 3.68 (C | P) | 3.48 (C | P) | 3.15 (C | P) | 1.18 (C | P) | 3.73 (C | P) | 1.80 (C | P) | 1.41 (C | P) | 3.17 (C | P) | 1.87 (C | P) | 2.64 (C | P) | 1.45 (C | P) | 2.41 (C | P) | 1.32 (C | P) |
T44075 | ENST00000360434 | Transcript | N/A (N/A% | N/A%) | N/A | N/A | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) | NA (C | P) |
AIG62667 | IG36_AR2 | ActiveIntergenicRegion | 70 (100% | 0%) | 2 | 0 | 0.00 (C | P) | 1.93 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.39 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.70 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.58 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.22 (C | P) | 0.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 1.90 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.00 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.03 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.42 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.55 (C | P) |
SIG62650 | IG36_SR3 | SilentIntergenicRegion | 258 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.51 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.37 (C | P) | 2.65 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.96 (C | P) | 0.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.68 (C | P) | 0.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.69 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.89 (C | P) | 2.05 (C | P) | 2.44 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.59 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.11 (C | P) | 0.44 (C | P) | 0.89 (C | P) | 0.65 (C | P) | 0.39 (C | P) | 0.70 (C | P) | 0.71 (C | P) | 1.14 (C | P) |
ER341968 | ER1a | ExonRegion | 74 (100% | 0%) | 2 | 0 | 2.76 (C | P) | 1.38 (C | P) | 2.04 (C | P) | 3.78 (C | P) | 2.56 (C | P) | 2.41 (C | P) | 2.76 (C | P) | 1.05 (C | P) | 2.20 (C | P) | 2.40 (C | P) | 0.57 (C | P) | 2.55 (C | P) | 3.62 (C | P) | 1.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.97 (C | P) | 0.80 (C | P) | 3.51 (C | P) | 2.45 (C | P) | 0.34 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.31 (C | P) | 3.92 (C | P) | 1.19 (C | P) | 1.11 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.58 (C | P) | 1.93 (C | P) | 1.84 (C | P) |
EB244625 | E1_Ab | KnownBoundary | 62 (100% | 0%) | 4 | 1 | 4.90 (C | P) | 3.10 (C | P) | 4.18 (C | P) | 6.08 (C | P) | 5.04 (C | P) | 4.26 (C | P) | 4.84 (C | P) | 2.48 (C | P) | 4.03 (C | P) | 3.84 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.37 (C | P) | 5.72 (C | P) | 3.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 6.13 (C | P) | 2.05 (C | P) | 5.58 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.80 (C | P) | 5.56 (C | P) | 5.79 (C | P) | 3.13 (C | P) | 2.22 (C | P) | 3.63 (C | P) | 3.22 (C | P) | 4.22 (C | P) | 3.75 (C | P) |
ER341969 | ER1b | ExonRegion | 90 (100% | 0%) | 291 | 6 | 9.80 (C | P) | 8.91 (C | P) | 10.11 (C | P) | 9.32 (C | P) | 9.29 (C | P) | 9.92 (C | P) | 9.35 (C | P) | 8.55 (C | P) | 8.64 (C | P) | 8.68 (C | P) | 7.80 (C | P) | 8.93 (C | P) | 10.08 (C | P) | 8.57 (C | P) | 8.48 (C | P) | 11.28 (C | P) | 8.53 (C | P) | 10.53 (C | P) | 9.81 (C | P) | 7.48 (C | P) | 11.18 (C | P) | 11.14 (C | P) | 11.91 (C | P) | 8.28 (C | P) | 9.22 (C | P) | 10.36 (C | P) | 9.87 (C | P) | 9.71 (C | P) | 10.58 (C | P) |
EB244624 | E1_Da | KnownBoundary | 62 (95% | 0%) | 7 | 0 | 5.38 (C | P) | 2.37 (C | P) | 5.89 (C | P) | 4.38 (C | P) | 5.10 (C | P) | 4.39 (C | P) | 1.72 (C | P) | 3.49 (C | P) | 3.90 (C | P) | 1.60 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.91 (C | P) | 5.21 (C | P) | 3.56 (C | P) | 3.46 (C | P) | 5.15 (C | P) | 1.21 (C | P) | 3.88 (C | P) | 4.66 (C | P) | 3.60 (C | P) | 7.18 (C | P) | 7.10 (C | P) | 6.75 (C | P) | 2.62 (C | P) | 4.03 (C | P) | 3.54 (C | P) | 4.57 (C | P) | 2.77 (C | P) | 4.99 (C | P) |
EJ1488925 | E1a_E1c | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 649 | 9 | 9.99 (C | P) | 8.95 (C | P) | 11.04 (C | P) | 8.90 (C | P) | 9.43 (C | P) | 10.07 (C | P) | 9.24 (C | P) | 8.65 (C | P) | 9.11 (C | P) | 8.71 (C | P) | 7.51 (C | P) | 9.52 (C | P) | 10.46 (C | P) | 9.11 (C | P) | 8.80 (C | P) | 11.47 (C | P) | 9.75 (C | P) | 10.06 (C | P) | 9.30 (C | P) | 7.51 (C | P) | 11.45 (C | P) | 11.33 (C | P) | 12.18 (C | P) | 8.74 (C | P) | 9.27 (C | P) | 10.43 (C | P) | 9.32 (C | P) | 10.65 (C | P) | 10.99 (C | P) |
EJ1488926 | E1a_E2a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1488928 | E1a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 63 | 1 | 6.03 (C | P) | 5.55 (C | P) | 7.87 (C | P) | 4.90 (C | P) | 7.05 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.10 (C | P) | 4.25 (C | P) | 5.52 (C | P) | 5.58 (C | P) | 5.89 (C | P) | 6.40 (C | P) | 8.76 (C | P) | 6.50 (C | P) | 5.50 (C | P) | 7.07 (C | P) | 6.12 (C | P) | 7.14 (C | P) | 6.83 (C | P) | 5.65 (C | P) | 7.68 (C | P) | 5.80 (C | P) | 8.85 (C | P) | 4.70 (C | P) | 4.84 (C | P) | 8.32 (C | P) | 9.77 (C | P) | 7.21 (C | P) | 9.59 (C | P) |
ER341970 | ER1c | ExonRegion | 241 (83% | 0%) | 0 | 0 | 6.24 (C | P) | 4.93 (C | P) | 4.75 (C | P) | 6.20 (C | P) | 6.42 (C | P) | 5.77 (C | P) | 4.87 (C | P) | 4.26 (C | P) | 4.11 (C | P) | 4.56 (C | P) | 3.92 (C | P) | 4.77 (C | P) | 5.75 (C | P) | 5.05 (C | P) | 6.07 (C | P) | 6.90 (C | P) | 2.80 (C | P) | 5.26 (C | P) | 4.78 (C | P) | 4.62 (C | P) | 7.55 (C | P) | 7.24 (C | P) | 7.73 (C | P) | 4.21 (C | P) | 5.01 (C | P) | 6.83 (C | P) | 5.46 (C | P) | 6.22 (C | P) | 5.61 (C | P) |
EB244627 | E1_Ac | KnownBoundary | 62 (100% | 0%) | 4 | 1 | 8.57 (C | P) | 7.52 (C | P) | 8.54 (C | P) | 9.25 (C | P) | 9.26 (C | P) | 8.34 (C | P) | 7.62 (C | P) | 6.77 (C | P) | 6.75 (C | P) | 7.24 (C | P) | 6.75 (C | P) | 8.07 (C | P) | 7.86 (C | P) | 8.03 (C | P) | 7.33 (C | P) | 9.36 (C | P) | 7.44 (C | P) | 6.24 (C | P) | 6.36 (C | P) | 6.57 (C | P) | 9.52 (C | P) | 9.37 (C | P) | 10.31 (C | P) | 6.35 (C | P) | 7.44 (C | P) | 9.95 (C | P) | 8.14 (C | P) | 9.31 (C | P) | 8.01 (C | P) |
ER341971 | ER1d | ExonRegion | 113 (100% | 0%) | 666 | 5 | 9.23 (C | P) | 7.65 (C | P) | 9.22 (C | P) | 8.89 (C | P) | 9.42 (C | P) | 8.47 (C | P) | 7.85 (C | P) | 8.05 (C | P) | 7.32 (C | P) | 7.40 (C | P) | 7.07 (C | P) | 8.91 (C | P) | 9.42 (C | P) | 8.24 (C | P) | 7.95 (C | P) | 9.66 (C | P) | 7.78 (C | P) | 9.49 (C | P) | 8.29 (C | P) | 7.29 (C | P) | 9.46 (C | P) | 10.39 (C | P) | 10.45 (C | P) | 7.45 (C | P) | 7.65 (C | P) | 9.10 (C | P) | 8.65 (C | P) | 9.27 (C | P) | 8.95 (C | P) |
EB244626 | E1_Db | NovelBoundary | 62 (63% | 0%) | 0 | 0 | 2.68 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1488935 | E1b_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 792 | 6 | 10.30 (C | P) | 8.98 (C | P) | 8.11 (C | P) | 7.76 (C | P) | 7.41 (C | P) | 9.33 (C | P) | 8.27 (C | P) | 9.37 (C | P) | 8.39 (C | P) | 7.89 (C | P) | 7.86 (C | P) | 8.70 (C | P) | 10.18 (C | P) | 9.40 (C | P) | 9.11 (C | P) | 10.03 (C | P) | 7.69 (C | P) | 10.39 (C | P) | 9.15 (C | P) | 8.41 (C | P) | 10.40 (C | P) | 12.02 (C | P) | 10.79 (C | P) | 8.95 (C | P) | 8.96 (C | P) | 9.66 (C | P) | 8.12 (C | P) | 9.19 (C | P) | 9.40 (C | P) |
EB244628 | E2_Aa | NovelBoundary | 62 (79% | 0%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 2.55 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.09 (C | P) | 3.17 (C | P) | 2.27 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.78 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER341972 | ER2a | ExonRegion | 175 (82% | 0%) | 0 | 0 | 2.61 (C | P) | 0.96 (C | P) | 1.99 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.63 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.10 (C | P) | 0.04 (C | P) | 1.58 (C | P) | 1.82 (C | P) | 0.03 (C | P) | 2.22 (C | P) | 1.27 (C | P) | 0.96 (C | P) | 1.38 (C | P) | 2.57 (C | P) | 0.91 (C | P) | 2.18 (C | P) | 0.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.50 (C | P) | 2.14 (C | P) | 3.61 (C | P) | 0.70 (C | P) | 1.46 (C | P) | 1.06 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.36 (C | P) | 1.05 (C | P) |
EB244629 | E2_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.50 (C | P) | 2.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.75 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.42 (C | P) | 1.46 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.88 (C | P) | 3.55 (C | P) | 4.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.35 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.98 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.31 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1488941 | E2a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN184441 | I2 | Intron | 1000 (90% | 0%) | 0 | 0 | 4.20 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.52 (C | P) | 2.90 (C | P) | 3.13 (C | P) | 3.45 (C | P) | 2.74 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.44 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.31 (C | P) | 3.31 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.11 (C | P) | 3.48 (C | P) | 4.04 (C | P) | 4.18 (C | P) | 4.16 (C | P) | 3.45 (C | P) | 1.44 (C | P) | 4.10 (C | P) | 1.01 (C | P) | 2.16 (C | P) | 2.90 (C | P) | 2.92 (C | P) | 2.07 (C | P) | 1.10 (C | P) | 2.88 (C | P) | 1.67 (C | P) |
SIN264720 | I2_SR1 | SilentIntronRegion | 217 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.16 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.80 (C | P) | 1.90 (C | P) | 2.72 (C | P) | 1.50 (C | P) | 1.49 (C | P) | 2.56 (C | P) | 2.17 (C | P) | 0.20 (C | P) | 2.34 (C | P) | 1.37 (C | P) | 2.84 (C | P) | 2.69 (C | P) | 3.57 (C | P) | 3.67 (C | P) | 3.99 (C | P) | 2.77 (C | P) | 1.27 (C | P) | 3.16 (C | P) | 1.64 (C | P) | 1.65 (C | P) | 2.19 (C | P) | 1.34 (C | P) | 1.17 (C | P) | 0.58 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.95 (C | P) |
AIN186898 | I2_AR1 | ActiveIntronRegion | 603 (84% | 0%) | 1 | 0 | 3.93 (C | P) | 2.67 (C | P) | 2.26 (C | P) | 2.25 (C | P) | 2.91 (C | P) | 3.49 (C | P) | 2.84 (C | P) | 1.62 (C | P) | 2.29 (C | P) | 2.44 (C | P) | 1.10 (C | P) | 3.00 (C | P) | 1.89 (C | P) | 2.80 (C | P) | 3.20 (C | P) | 3.74 (C | P) | 3.94 (C | P) | 3.93 (C | P) | 3.65 (C | P) | 1.36 (C | P) | 4.13 (C | P) | 0.79 (C | P) | 2.19 (C | P) | 2.45 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.35 (C | P) | 0.73 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.83 (C | P) |
SIN264721 | I2_SR2 | SilentIntronRegion | 178 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.79 (C | P) | 4.13 (C | P) | 3.58 (C | P) | 4.33 (C | P) | 4.20 (C | P) | 3.95 (C | P) | 3.36 (C | P) | 2.19 (C | P) | 2.68 (C | P) | 4.08 (C | P) | 2.35 (C | P) | 4.41 (C | P) | 3.02 (C | P) | 3.94 (C | P) | 4.50 (C | P) | 4.95 (C | P) | 5.03 (C | P) | 4.82 (C | P) | 3.53 (C | P) | 1.82 (C | P) | 4.72 (C | P) | 0.60 (C | P) | 2.56 (C | P) | 4.06 (C | P) | 3.81 (C | P) | 3.50 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.48 (C | P) | 1.91 (C | P) |
EB244630 | E3_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 5.15 (C | P) | 4.44 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.35 (C | P) | 3.29 (C | P) | 3.12 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.45 (C | P) | 3.98 (C | P) | 1.97 (C | P) | 4.26 (C | P) | 3.43 (C | P) | 3.57 (C | P) | 4.15 (C | P) | 4.76 (C | P) | 4.83 (C | P) | 3.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.12 (C | P) | 1.63 (C | P) | 3.80 (C | P) | 2.78 (C | P) | 3.50 (C | P) | 3.75 (C | P) | 2.26 (C | P) | 3.98 (C | P) | 2.23 (C | P) |
ER341973 | ER3a | ExonRegion | 167 (100% | 0%) | 2 | 0 | 4.98 (C | P) | 3.92 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.29 (C | P) | 3.33 (C | P) | 3.72 (C | P) | 3.03 (C | P) | 1.94 (C | P) | 2.81 (C | P) | 3.41 (C | P) | 2.22 (C | P) | 3.88 (C | P) | 3.03 (C | P) | 3.50 (C | P) | 4.03 (C | P) | 4.43 (C | P) | 4.17 (C | P) | 4.42 (C | P) | 4.06 (C | P) | 1.82 (C | P) | 4.09 (C | P) | 1.82 (C | P) | 1.21 (C | P) | 3.51 (C | P) | 2.66 (C | P) | 2.60 (C | P) | 2.16 (C | P) | 2.93 (C | P) | 1.99 (C | P) |
EB244631 | E3_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.32 (C | P) | 3.70 (C | P) | 3.32 (C | P) | 3.39 (C | P) | 3.85 (C | P) | 3.52 (C | P) | 1.97 (C | P) | 1.82 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.60 (C | P) | 2.40 (C | P) | 3.21 (C | P) | 1.23 (C | P) | 2.72 (C | P) | 3.23 (C | P) | 4.95 (C | P) | 4.36 (C | P) | 4.84 (C | P) | 4.10 (C | P) | 0.00 (C | P) | 5.05 (C | P) | 2.49 (C | P) | 3.42 (C | P) | 2.77 (C | P) | 2.68 (C | P) | 3.10 (C | P) | 1.72 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.30 (C | P) |
EJ1488946 | E3a_E4a | KnownJunction | 62 (100% | 0%) | 2 | 0 | 3.83 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.25 (C | P) | 3.58 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.32 (C | P) | 1.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.46 (C | P) | 1.37 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.94 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.24 (C | P) | 1.78 (C | P) | 1.57 (C | P) | 2.74 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.67 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN184442 | I3 | Intron | 1779 (84% | 0%) | 0 | 0 | 5.02 (C | P) | 3.85 (C | P) | 3.23 (C | P) | 3.72 (C | P) | 3.66 (C | P) | 4.41 (C | P) | 2.76 (C | P) | 2.60 (C | P) | 3.65 (C | P) | 3.38 (C | P) | 3.03 (C | P) | 3.92 (C | P) | 2.22 (C | P) | 3.60 (C | P) | 4.57 (C | P) | 4.82 (C | P) | 5.13 (C | P) | 4.49 (C | P) | 4.05 (C | P) | 1.70 (C | P) | 4.60 (C | P) | 1.96 (C | P) | 2.55 (C | P) | 3.43 (C | P) | 3.40 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.30 (C | P) | 3.12 (C | P) | 2.27 (C | P) |
SIN264722 | I3_SR1 | SilentIntronRegion | 312 (96% | 0%) | 0 | 0 | 4.54 (C | P) | 4.02 (C | P) | 2.81 (C | P) | 4.18 (C | P) | 3.84 (C | P) | 4.35 (C | P) | 2.91 (C | P) | 1.81 (C | P) | 3.74 (C | P) | 3.89 (C | P) | 2.87 (C | P) | 3.31 (C | P) | 2.18 (C | P) | 3.51 (C | P) | 4.54 (C | P) | 4.71 (C | P) | 4.91 (C | P) | 4.49 (C | P) | 4.25 (C | P) | 2.10 (C | P) | 4.72 (C | P) | 0.94 (C | P) | 2.41 (C | P) | 3.45 (C | P) | 3.46 (C | P) | 2.79 (C | P) | 1.17 (C | P) | 2.83 (C | P) | 1.77 (C | P) |
AIN186899 | I3_AR1 | ActiveIntronRegion | 784 (67% | 0%) | 1 | 0 | 5.11 (C | P) | 4.02 (C | P) | 3.21 (C | P) | 3.75 (C | P) | 4.04 (C | P) | 4.81 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.56 (C | P) | 3.52 (C | P) | 3.27 (C | P) | 3.35 (C | P) | 4.18 (C | P) | 2.14 (C | P) | 3.66 (C | P) | 4.32 (C | P) | 4.71 (C | P) | 5.04 (C | P) | 4.67 (C | P) | 4.03 (C | P) | 2.11 (C | P) | 4.85 (C | P) | 2.42 (C | P) | 2.54 (C | P) | 3.72 (C | P) | 3.48 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.81 (C | P) | 3.15 (C | P) | 2.08 (C | P) |
AIN186900 | I3_AR2 | ActiveIntronRegion | 370 (100% | 0%) | 1 | 0 | 5.37 (C | P) | 3.92 (C | P) | 3.66 (C | P) | 3.68 (C | P) | 3.64 (C | P) | 3.95 (C | P) | 3.01 (C | P) | 3.16 (C | P) | 3.95 (C | P) | 3.30 (C | P) | 2.83 (C | P) | 4.36 (C | P) | 2.45 (C | P) | 3.62 (C | P) | 4.89 (C | P) | 5.15 (C | P) | 5.54 (C | P) | 4.39 (C | P) | 4.02 (C | P) | 0.99 (C | P) | 4.36 (C | P) | 1.80 (C | P) | 3.05 (C | P) | 3.64 (C | P) | 3.74 (C | P) | 3.50 (C | P) | 2.33 (C | P) | 3.26 (C | P) | 2.82 (C | P) |
SIN264723 | I3_SR2 | SilentIntronRegion | 207 (96% | 0%) | 0 | 0 | 4.70 (C | P) | 2.75 (C | P) | 2.97 (C | P) | 2.46 (C | P) | 2.32 (C | P) | 3.82 (C | P) | 2.36 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.27 (C | P) | 3.16 (C | P) | 2.72 (C | P) | 2.88 (C | P) | 2.18 (C | P) | 3.45 (C | P) | 4.72 (C | P) | 4.65 (C | P) | 4.75 (C | P) | 4.11 (C | P) | 3.76 (C | P) | 0.77 (C | P) | 3.97 (C | P) | 2.37 (C | P) | 1.78 (C | P) | 2.18 (C | P) | 2.43 (C | P) | 3.00 (C | P) | 1.74 (C | P) | 2.82 (C | P) | 1.81 (C | P) |
AIN186901 | I3_AR3 | ActiveIntronRegion | 6 (100% | 0%) | 2 | 0 | 5.33 (C | P) | 2.92 (C | P) | 4.05 (C | P) | 5.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.18 (C | P) | 0.42 (C | P) | 1.51 (C | P) | 3.40 (C | P) | 2.76 (C | P) | 1.76 (C | P) | 2.62 (C | P) | 2.29 (C | P) | 3.78 (C | P) | 5.07 (C | P) | 4.41 (C | P) | 5.56 (C | P) | 4.60 (C | P) | 4.37 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 2.41 (C | P) | 3.29 (C | P) | 2.51 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.75 (C | P) | 3.14 (C | P) |
SIN264724 | I3_SR3 | SilentIntronRegion | 97 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.81 (C | P) | 3.77 (C | P) | 3.05 (C | P) | 3.59 (C | P) | 1.84 (C | P) | 4.59 (C | P) | 2.06 (C | P) | 2.74 (C | P) | 3.51 (C | P) | 2.77 (C | P) | 2.84 (C | P) | 3.44 (C | P) | 1.77 (C | P) | 3.75 (C | P) | 4.03 (C | P) | 4.64 (C | P) | 5.02 (C | P) | 4.55 (C | P) | 4.10 (C | P) | 1.29 (C | P) | 4.62 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.94 (C | P) | 2.16 (C | P) | 2.45 (C | P) | 2.78 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.66 (C | P) | 2.68 (C | P) |
EB244632 | E4_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 0%) | 0 | 0 | 5.02 (C | P) | 3.76 (C | P) | 3.65 (C | P) | 4.45 (C | P) | 3.83 (C | P) | 5.52 (C | P) | 3.60 (C | P) | 2.23 (C | P) | 3.25 (C | P) | 3.83 (C | P) | 3.42 (C | P) | 3.12 (C | P) | 1.37 (C | P) | 3.53 (C | P) | 4.15 (C | P) | 5.30 (C | P) | 5.32 (C | P) | 5.08 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.64 (C | P) | 3.23 (C | P) | 2.54 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.52 (C | P) | 4.19 (C | P) | 1.76 (C | P) | 3.98 (C | P) | 2.17 (C | P) |
ER341974 | ER4a | ExonRegion | 45 (100% | 2%) | 874 | 6 | 11.27 (C | P) | 10.35 (C | P) | 9.37 (C | P) | 8.76 (C | P) | 8.61 (C | P) | 10.95 (C | P) | 9.90 (C | P) | 10.22 (C | P) | 9.92 (C | P) | 9.80 (C | P) | 9.59 (C | P) | 9.98 (C | P) | 11.59 (C | P) | 10.36 (C | P) | 9.76 (C | P) | 11.59 (C | P) | 9.15 (C | P) | 11.36 (C | P) | 10.93 (C | P) | 9.49 (C | P) | 12.13 (C | P) | 12.31 (C | P) | 12.11 (C | P) | 9.98 (C | P) | 10.95 (C | P) | 11.44 (C | P) | 9.89 (C | P) | 10.52 (C | P) | 11.18 (C | P) |
EB244635 | E4_Ab | KnownBoundary | 62 (100% | 50%) | 877 | 6 | 11.61 (C | P) | 10.95 (C | P) | 9.81 (C | P) | 9.40 (C | P) | 8.84 (C | P) | 11.71 (C | P) | 10.80 (C | P) | 10.55 (C | P) | 10.70 (C | P) | 10.52 (C | P) | 10.02 (C | P) | 10.59 (C | P) | 12.03 (C | P) | 10.69 (C | P) | 10.51 (C | P) | 12.37 (C | P) | 9.87 (C | P) | 12.07 (C | P) | 11.68 (C | P) | 9.96 (C | P) | 12.92 (C | P) | 12.30 (C | P) | 12.70 (C | P) | 10.40 (C | P) | 11.58 (C | P) | 12.11 (C | P) | 9.77 (C | P) | 10.95 (C | P) | 11.63 (C | P) |
ER341975 | ER4b | ExonRegion | 101 (100% | 100%) | 858 | 14 | 11.49 (C | P) | 10.48 (C | P) | 11.06 (C | P) | 9.35 (C | P) | 9.12 (C | P) | 11.22 (C | P) | 10.49 (C | P) | 10.70 (C | P) | 10.21 (C | P) | 10.27 (C | P) | 10.08 (C | P) | 10.96 (C | P) | 11.78 (C | P) | 10.88 (C | P) | 10.42 (C | P) | 11.89 (C | P) | 10.13 (C | P) | 11.90 (C | P) | 11.29 (C | P) | 10.10 (C | P) | 12.33 (C | P) | 12.07 (C | P) | 12.99 (C | P) | 10.32 (C | P) | 11.14 (C | P) | 11.89 (C | P) | 10.34 (C | P) | 11.23 (C | P) | 11.48 (C | P) |
EB244633 | E4_Da | KnownBoundary | 62 (100% | 100%) | 651 | 8 | 11.03 (C | P) | 9.18 (C | P) | 11.34 (C | P) | 9.13 (C | P) | 9.47 (C | P) | 10.22 (C | P) | 9.65 (C | P) | 9.89 (C | P) | 9.19 (C | P) | 9.41 (C | P) | 9.38 (C | P) | 10.79 (C | P) | 11.01 (C | P) | 10.58 (C | P) | 9.51 (C | P) | 10.78 (C | P) | 9.80 (C | P) | 11.35 (C | P) | 10.09 (C | P) | 9.95 (C | P) | 11.48 (C | P) | 11.35 (C | P) | 12.10 (C | P) | 9.53 (C | P) | 9.71 (C | P) | 10.46 (C | P) | 10.21 (C | P) | 10.48 (C | P) | 10.62 (C | P) |
EJ1488951 | E4a_E5a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 232 | 11 | 9.42 (C | P) | 8.72 (C | P) | 9.96 (C | P) | 8.11 (C | P) | 7.85 (C | P) | 9.02 (C | P) | 7.97 (C | P) | 8.30 (C | P) | 8.51 (C | P) | 8.34 (C | P) | 8.46 (C | P) | 9.92 (C | P) | 10.08 (C | P) | 9.16 (C | P) | 8.75 (C | P) | 9.34 (C | P) | 8.73 (C | P) | 9.86 (C | P) | 9.06 (C | P) | 8.18 (C | P) | 9.94 (C | P) | 10.17 (C | P) | 11.11 (C | P) | 8.28 (C | P) | 8.66 (C | P) | 9.59 (C | P) | 9.56 (C | P) | 10.47 (C | P) | 9.39 (C | P) |
ER341976 | ER4c | ExonRegion | 33 (100% | 100%) | 657 | 8 | 11.06 (C | P) | 9.57 (C | P) | 11.47 (C | P) | 9.29 (C | P) | 9.77 (C | P) | 10.35 (C | P) | 9.62 (C | P) | 10.13 (C | P) | 9.39 (C | P) | 9.40 (C | P) | 9.75 (C | P) | 11.06 (C | P) | 11.33 (C | P) | 10.71 (C | P) | 9.51 (C | P) | 10.79 (C | P) | 9.89 (C | P) | 11.35 (C | P) | 10.28 (C | P) | 9.90 (C | P) | 11.58 (C | P) | 11.43 (C | P) | 12.23 (C | P) | 9.72 (C | P) | 10.06 (C | P) | 10.63 (C | P) | 10.64 (C | P) | 10.71 (C | P) | 10.99 (C | P) |
EB244634 | E4_Db | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 2.79 (C | P) | 2.26 (C | P) | 3.62 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.08 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.31 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.21 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.27 (C | P) | 2.21 (C | P) | 2.49 (C | P) | 3.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.80 (C | P) | 1.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.18 (C | P) | 1.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.40 (C | P) | 1.35 (C | P) |
EJ1488954 | E4b_E5a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 650 | 8 | 11.21 (C | P) | 9.93 (C | P) | 11.61 (C | P) | 9.80 (C | P) | 10.24 (C | P) | 10.56 (C | P) | 9.61 (C | P) | 10.24 (C | P) | 9.75 (C | P) | 9.48 (C | P) | 10.06 (C | P) | 11.32 (C | P) | 11.61 (C | P) | 10.90 (C | P) | 9.76 (C | P) | 10.84 (C | P) | 10.18 (C | P) | 11.58 (C | P) | 10.35 (C | P) | 9.93 (C | P) | 11.77 (C | P) | 11.55 (C | P) | 12.40 (C | P) | 10.07 (C | P) | 10.36 (C | P) | 10.84 (C | P) | 11.00 (C | P) | 11.01 (C | P) | 11.30 (C | P) |
EJ1488955 | E4b_E6a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.23 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.66 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
IN184443 | I4 | Intron | 1796 (77% | 0%) | 0 | 0 | 3.60 (C | P) | 2.91 (C | P) | 2.57 (C | P) | 1.87 (C | P) | 0.93 (C | P) | 3.53 (C | P) | 1.52 (C | P) | 2.18 (C | P) | 2.07 (C | P) | 2.31 (C | P) | 1.76 (C | P) | 1.55 (C | P) | 2.15 (C | P) | 2.71 (C | P) | 3.28 (C | P) | 3.63 (C | P) | 3.56 (C | P) | 4.21 (C | P) | 2.84 (C | P) | 1.92 (C | P) | 3.44 (C | P) | 1.14 (C | P) | 1.52 (C | P) | 1.89 (C | P) | 2.53 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.40 (C | P) | 1.10 (C | P) | 1.50 (C | P) |
SIN264725 | I4_SR1 | SilentIntronRegion | 201 (100% | 0%) | 0 | 0 | 2.90 (C | P) | 2.52 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.21 (C | P) | 1.16 (C | P) | 3.17 (C | P) | 1.76 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.44 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.06 (C | P) | 1.34 (C | P) | 1.10 (C | P) | 3.08 (C | P) | 2.40 (C | P) | 3.59 (C | P) | 2.90 (C | P) | 4.37 (C | P) | 3.22 (C | P) | 2.03 (C | P) | 3.26 (C | P) | 1.18 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.67 (C | P) | 2.06 (C | P) | 0.84 (C | P) | 1.92 (C | P) | 1.86 (C | P) | 2.17 (C | P) |
AIN186902 | I4_AR1 | ActiveIntronRegion | 7 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.73 (C | P) | 3.56 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.90 (C | P) | 1.59 (C | P) | 2.23 (C | P) | 0.71 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.30 (C | P) | 0.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.60 (C | P) | 2.72 (C | P) | 3.88 (C | P) | 3.40 (C | P) | 4.65 (C | P) | 4.26 (C | P) | 3.24 (C | P) | 3.46 (C | P) | 1.49 (C | P) | 2.21 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.23 (C | P) | 2.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.09 (C | P) | 3.85 (C | P) |
SIN264726 | I4_SR2 | SilentIntronRegion | 346 (27% | 0%) | 0 | 0 | 3.23 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.83 (C | P) | 2.28 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.66 (C | P) | 1.77 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.13 (C | P) | 2.78 (C | P) | 0.68 (C | P) | 0.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.82 (C | P) | 2.14 (C | P) | 3.54 (C | P) | 2.89 (C | P) | 4.45 (C | P) | 3.25 (C | P) | 2.80 (C | P) | 3.84 (C | P) | 0.11 (C | P) | 1.59 (C | P) | 3.18 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.63 (C | P) | 2.46 (C | P) |
SIN264727 | I4_SR3 | SilentIntronRegion | 117 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.21 (C | P) | 2.40 (C | P) | 2.54 (C | P) | 1.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.86 (C | P) | 2.05 (C | P) | 2.19 (C | P) | 1.97 (C | P) | 2.89 (C | P) | 2.03 (C | P) | 1.48 (C | P) | 2.66 (C | P) | 3.16 (C | P) | 2.57 (C | P) | 3.57 (C | P) | 3.34 (C | P) | 4.74 (C | P) | 3.35 (C | P) | 2.16 (C | P) | 3.55 (C | P) | 0.80 (C | P) | 2.30 (C | P) | 1.53 (C | P) | 1.89 (C | P) | 1.90 (C | P) | 1.97 (C | P) | 0.77 (C | P) | 0.92 (C | P) |
SIN264728 | I4_SR4 | SilentIntronRegion | 172 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.66 (C | P) | 2.05 (C | P) | 3.14 (C | P) | 2.58 (C | P) | 1.96 (C | P) | 3.59 (C | P) | 1.57 (C | P) | 2.74 (C | P) | 2.65 (C | P) | 2.51 (C | P) | 1.64 (C | P) | 1.94 (C | P) | 2.53 (C | P) | 2.44 (C | P) | 3.38 (C | P) | 3.59 (C | P) | 3.72 (C | P) | 4.49 (C | P) | 2.51 (C | P) | 2.25 (C | P) | 2.84 (C | P) | 1.38 (C | P) | 1.84 (C | P) | 1.96 (C | P) | 2.43 (C | P) | 2.15 (C | P) | 0.20 (C | P) | 0.60 (C | P) | 1.41 (C | P) |
SIN264729 | I4_SR5 | SilentIntronRegion | 937 (82% | 0%) | 0 | 0 | 3.66 (C | P) | 3.19 (C | P) | 2.63 (C | P) | 1.54 (C | P) | 0.72 (C | P) | 3.53 (C | P) | 1.30 (C | P) | 2.21 (C | P) | 2.15 (C | P) | 2.06 (C | P) | 1.97 (C | P) | 1.60 (C | P) | 2.30 (C | P) | 2.55 (C | P) | 3.59 (C | P) | 3.68 (C | P) | 3.76 (C | P) | 3.94 (C | P) | 2.61 (C | P) | 1.56 (C | P) | 3.54 (C | P) | 1.21 (C | P) | 1.29 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.79 (C | P) | 1.79 (C | P) | 1.43 (C | P) | 0.89 (C | P) | 1.11 (C | P) |
EB244636 | E5_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 3.52 (C | P) | 3.83 (C | P) | 2.82 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.94 (C | P) | 1.74 (C | P) | 1.80 (C | P) | 2.48 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.90 (C | P) | 2.42 (C | P) | 3.06 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.90 (C | P) | 4.45 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.33 (C | P) | 1.81 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.52 (C | P) | 2.38 (C | P) | 2.57 (C | P) | 1.72 (C | P) | 1.21 (C | P) |
ER341977 | ER5a | ExonRegion | 67 (100% | 100%) | 832 | 15 | 11.96 (C | P) | 11.07 (C | P) | 11.96 (C | P) | 10.37 (C | P) | 11.01 (C | P) | 11.63 (C | P) | 11.01 (C | P) | 11.21 (C | P) | 11.06 (C | P) | 10.92 (C | P) | 11.08 (C | P) | 12.28 (C | P) | 12.78 (C | P) | 11.79 (C | P) | 10.76 (C | P) | 11.86 (C | P) | 11.07 (C | P) | 12.45 (C | P) | 11.78 (C | P) | 10.68 (C | P) | 12.74 (C | P) | 12.53 (C | P) | 13.59 (C | P) | 10.86 (C | P) | 11.51 (C | P) | 12.44 (C | P) | 11.82 (C | P) | 12.23 (C | P) | 12.26 (C | P) |
EB244638 | E5_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 77%) | 0 | 0 | 10.29 (C | P) | 9.37 (C | P) | 10.98 (C | P) | 8.81 (C | P) | 9.62 (C | P) | 10.01 (C | P) | 9.85 (C | P) | 9.47 (C | P) | 10.09 (C | P) | 9.68 (C | P) | 9.23 (C | P) | 11.25 (C | P) | 11.97 (C | P) | 10.69 (C | P) | 9.40 (C | P) | 10.65 (C | P) | 10.53 (C | P) | 9.52 (C | P) | 7.93 (C | P) | 9.19 (C | P) | 11.09 (C | P) | 11.07 (C | P) | 12.21 (C | P) | 9.22 (C | P) | 9.94 (C | P) | 10.85 (C | P) | 9.65 (C | P) | 10.52 (C | P) | 11.50 (C | P) |
EJ1488957 | E5a_E6a | NovelJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 1 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.20 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.86 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1488958 | E5a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 1 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.34 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.40 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.05 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.02 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) |
EJ1488960 | E5b_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 0 | 0 | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.38 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.93 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.18 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.32 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.55 (C | P) | 1.39 (C | P) |
EB244637 | E5_Dc | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 1.89 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.30 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.53 (C | P) | 1.38 (C | P) | 1.16 (C | P) | 1.28 (C | P) | 2.52 (C | P) | 1.91 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.02 (C | P) | 3.06 (C | P) | 2.49 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.15 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.77 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.33 (C | P) | 2.39 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.59 (C | P) | 2.20 (C | P) |
EJ1488961 | E5c_E6a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 798 | 14 | 13.07 (C | P) | 12.15 (C | P) | 11.54 (C | P) | 11.09 (C | P) | 11.65 (C | P) | 12.96 (C | P) | 11.92 (C | P) | 12.10 (C | P) | 12.15 (C | P) | 11.57 (C | P) | 11.61 (C | P) | 12.56 (C | P) | 13.38 (C | P) | 12.46 (C | P) | 11.44 (C | P) | 12.70 (C | P) | 11.30 (C | P) | 13.25 (C | P) | 12.73 (C | P) | 11.47 (C | P) | 14.11 (C | P) | 13.50 (C | P) | 13.99 (C | P) | 11.48 (C | P) | 12.28 (C | P) | 13.29 (C | P) | 12.52 (C | P) | 12.73 (C | P) | 12.78 (C | P) |
ER341978 | ER5b | ExonRegion | 1 (100% | 100%) | 865 | 14 | 12.66 (C | P) | 11.91 (C | P) | 11.75 (C | P) | 10.84 (C | P) | 11.56 (C | P) | 12.58 (C | P) | 11.79 (C | P) | 11.90 (C | P) | 11.89 (C | P) | 11.53 (C | P) | 11.45 (C | P) | 12.56 (C | P) | 13.35 (C | P) | 12.28 (C | P) | 11.34 (C | P) | 12.50 (C | P) | 11.32 (C | P) | 13.26 (C | P) | 12.72 (C | P) | 11.22 (C | P) | 13.68 (C | P) | 13.13 (C | P) | 13.98 (C | P) | 11.32 (C | P) | 12.20 (C | P) | 13.16 (C | P) | 12.30 (C | P) | 12.65 (C | P) | 12.75 (C | P) |
ER341979 | ER5c | ExonRegion | 16 (100% | 100%) | 841 | 14 | 12.86 (C | P) | 11.97 (C | P) | 11.68 (C | P) | 10.88 (C | P) | 11.57 (C | P) | 12.74 (C | P) | 11.83 (C | P) | 12.00 (C | P) | 11.96 (C | P) | 11.55 (C | P) | 11.52 (C | P) | 12.54 (C | P) | 13.41 (C | P) | 12.39 (C | P) | 11.35 (C | P) | 12.56 (C | P) | 11.31 (C | P) | 13.30 (C | P) | 12.72 (C | P) | 11.32 (C | P) | 13.85 (C | P) | 13.34 (C | P) | 13.99 (C | P) | 11.38 (C | P) | 12.23 (C | P) | 13.23 (C | P) | 12.39 (C | P) | 12.71 (C | P) | 12.81 (C | P) |
IN184444 | I5 | Intron | 672 (97% | 0%) | 0 | 0 | 3.36 (C | P) | 2.08 (C | P) | 1.57 (C | P) | 2.13 (C | P) | 0.82 (C | P) | 2.29 (C | P) | 1.08 (C | P) | 1.60 (C | P) | 1.88 (C | P) | 1.43 (C | P) | 1.15 (C | P) | 1.24 (C | P) | 1.56 (C | P) | 1.84 (C | P) | 2.57 (C | P) | 3.23 (C | P) | 2.83 (C | P) | 2.83 (C | P) | 1.70 (C | P) | 0.56 (C | P) | 2.20 (C | P) | 0.99 (C | P) | 0.89 (C | P) | 2.01 (C | P) | 1.65 (C | P) | 1.45 (C | P) | 0.66 (C | P) | 1.42 (C | P) | 1.45 (C | P) |
SIN264730 | I5_SR1 | SilentIntronRegion | 155 (100% | 0%) | 0 | 0 | 2.60 (C | P) | 1.64 (C | P) | 1.69 (C | P) | 0.12 (C | P) | 1.71 (C | P) | 2.06 (C | P) | 1.20 (C | P) | 0.65 (C | P) | 1.96 (C | P) | 1.08 (C | P) | 0.86 (C | P) | 0.95 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.59 (C | P) | 2.01 (C | P) | 3.38 (C | P) | 2.73 (C | P) | 1.54 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.47 (C | P) | 0.80 (C | P) | 1.29 (C | P) | 1.83 (C | P) | 1.27 (C | P) | 1.17 (C | P) | 1.49 (C | P) | 1.03 (C | P) | 1.90 (C | P) |
SIN264731 | I5_SR2 | SilentIntronRegion | 103 (100% | 0%) | 0 | 0 | 3.98 (C | P) | 2.86 (C | P) | 1.42 (C | P) | 2.93 (C | P) | 1.11 (C | P) | 3.28 (C | P) | 1.41 (C | P) | 1.10 (C | P) | 2.75 (C | P) | 2.13 (C | P) | 2.09 (C | P) | 0.08 (C | P) | 2.50 (C | P) | 2.60 (C | P) | 2.28 (C | P) | 3.76 (C | P) | 3.80 (C | P) | 2.79 (C | P) | 2.06 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.19 (C | P) | 1.55 (C | P) | 1.47 (C | P) | 2.13 (C | P) | 2.53 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.83 (C | P) | 2.01 (C | P) | 2.05 (C | P) |
SIN264732 | I5_SR3 | SilentIntronRegion | 281 (92% | 0%) | 0 | 0 | 3.22 (C | P) | 2.22 (C | P) | 1.68 (C | P) | 1.29 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.86 (C | P) | 1.18 (C | P) | 2.03 (C | P) | 1.66 (C | P) | 1.36 (C | P) | 0.63 (C | P) | 1.30 (C | P) | 1.32 (C | P) | 1.61 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.76 (C | P) | 2.46 (C | P) | 3.20 (C | P) | 1.18 (C | P) | 0.64 (C | P) | 1.96 (C | P) | 0.88 (C | P) | 0.51 (C | P) | 2.07 (C | P) | 1.46 (C | P) | 1.24 (C | P) | 0.04 (C | P) | 1.20 (C | P) | 1.08 (C | P) |
AIN186903 | I5_AR1 | ActiveIntronRegion | 123 (100% | 0%) | 1 | 0 | 3.69 (C | P) | 1.23 (C | P) | 1.20 (C | P) | 3.31 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.15 (C | P) | 0.04 (C | P) | 1.72 (C | P) | 0.87 (C | P) | 1.21 (C | P) | 1.28 (C | P) | 1.93 (C | P) | 1.06 (C | P) | 1.77 (C | P) | 2.08 (C | P) | 3.32 (C | P) | 2.39 (C | P) | 3.12 (C | P) | 2.93 (C | P) | 1.20 (C | P) | 2.19 (C | P) | 0.81 (C | P) | 0.10 (C | P) | 2.01 (C | P) | 1.48 (C | P) | 1.56 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.60 (C | P) | 0.64 (C | P) |
EB244640 | E6_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 4.67 (C | P) | 3.22 (C | P) | 1.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.46 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.82 (C | P) | 2.32 (C | P) | 2.34 (C | P) | 1.37 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.91 (C | P) | 2.41 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.95 (C | P) | 4.24 (C | P) | 3.36 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.57 (C | P) | 1.78 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.76 (C | P) | 2.13 (C | P) | 1.37 (C | P) | 2.60 (C | P) | 2.19 (C | P) | 0.00 (C | P) |
ER341980 | ER6a | ExonRegion | 51 (100% | 100%) | 534 | 14 | 12.53 (C | P) | 11.17 (C | P) | 11.31 (C | P) | 9.99 (C | P) | 10.32 (C | P) | 12.01 (C | P) | 11.03 (C | P) | 11.29 (C | P) | 11.39 (C | P) | 10.75 (C | P) | 10.85 (C | P) | 12.05 (C | P) | 12.80 (C | P) | 12.01 (C | P) | 10.63 (C | P) | 11.95 (C | P) | 10.92 (C | P) | 12.34 (C | P) | 11.56 (C | P) | 10.82 (C | P) | 13.19 (C | P) | 13.22 (C | P) | 13.29 (C | P) | 10.85 (C | P) | 11.40 (C | P) | 12.28 (C | P) | 11.38 (C | P) | 11.69 (C | P) | 12.18 (C | P) |
EB244641 | E6_Da | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 4 | 0 | 5.50 (C | P) | 2.29 (C | P) | 3.73 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.90 (C | P) | 4.94 (C | P) | 4.49 (C | P) | 1.78 (C | P) | 3.65 (C | P) | 4.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.24 (C | P) | 3.43 (C | P) | 5.03 (C | P) | 5.24 (C | P) | 5.62 (C | P) | 5.62 (C | P) | 4.66 (C | P) | 3.18 (C | P) | 3.01 (C | P) | 5.51 (C | P) | 3.65 (C | P) | 3.35 (C | P) | 3.17 (C | P) | 3.26 (C | P) | 4.53 (C | P) | 2.42 (C | P) | 2.46 (C | P) | 3.96 (C | P) |
EJ1488963 | E6a_E7a | KnownJunction | 62 (100% | 100%) | 591 | 14 | 11.87 (C | P) | 10.82 (C | P) | 11.09 (C | P) | 10.10 (C | P) | 10.23 (C | P) | 11.21 (C | P) | 10.36 (C | P) | 10.63 (C | P) | 11.07 (C | P) | 10.35 (C | P) | 10.23 (C | P) | 11.50 (C | P) | 12.41 (C | P) | 11.56 (C | P) | 10.56 (C | P) | 11.59 (C | P) | 10.43 (C | P) | 12.10 (C | P) | 11.39 (C | P) | 10.35 (C | P) | 12.56 (C | P) | 12.61 (C | P) | 12.78 (C | P) | 10.40 (C | P) | 11.09 (C | P) | 11.61 (C | P) | 10.66 (C | P) | 10.97 (C | P) | 11.80 (C | P) |
IN184445 | I6 | Intron | 1312 (88% | 0%) | 0 | 0 | 5.28 (C | P) | 3.50 (C | P) | 2.90 (C | P) | 2.68 (C | P) | 2.01 (C | P) | 4.12 (C | P) | 3.07 (C | P) | 2.96 (C | P) | 3.73 (C | P) | 3.09 (C | P) | 2.08 (C | P) | 3.37 (C | P) | 2.95 (C | P) | 4.09 (C | P) | 4.61 (C | P) | 5.19 (C | P) | 5.02 (C | P) | 4.87 (C | P) | 3.81 (C | P) | 2.93 (C | P) | 4.77 (C | P) | 2.54 (C | P) | 3.03 (C | P) | 3.73 (C | P) | 3.54 (C | P) | 2.98 (C | P) | 2.34 (C | P) | 3.10 (C | P) | 3.02 (C | P) |
AIN186904 | I6_AR1 | ActiveIntronRegion | 664 (82% | 0%) | 1 | 0 | 5.57 (C | P) | 3.83 (C | P) | 2.80 (C | P) | 2.96 (C | P) | 1.72 (C | P) | 4.58 (C | P) | 3.44 (C | P) | 3.46 (C | P) | 4.10 (C | P) | 3.03 (C | P) | 2.26 (C | P) | 3.28 (C | P) | 2.73 (C | P) | 4.55 (C | P) | 4.59 (C | P) | 5.13 (C | P) | 5.21 (C | P) | 5.00 (C | P) | 4.15 (C | P) | 3.33 (C | P) | 5.19 (C | P) | 2.64 (C | P) | 3.32 (C | P) | 3.86 (C | P) | 3.84 (C | P) | 3.16 (C | P) | 2.84 (C | P) | 3.39 (C | P) | 3.01 (C | P) |
AIN186905 | I6_AR2 | ActiveIntronRegion | 15 (73% | 0%) | 2 | 0 | 2.45 (C | P) | 1.13 (C | P) | 0.50 (C | P) | 1.22 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.17 (C | P) | 2.33 (C | P) | 2.06 (C | P) | 2.29 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.52 (C | P) | 1.89 (C | P) | 0.31 (C | P) | 2.26 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.70 (C | P) | 2.38 (C | P) | 1.99 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.94 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.57 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.95 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 1.88 (C | P) |
SIN264733 | I6_SR1 | SilentIntronRegion | 52 (100% | 0%) | 0 | 0 | 5.05 (C | P) | 3.05 (C | P) | 2.30 (C | P) | 2.95 (C | P) | 3.98 (C | P) | 3.51 (C | P) | 3.43 (C | P) | 2.17 (C | P) | 3.47 (C | P) | 2.81 (C | P) | 1.43 (C | P) | 3.95 (C | P) | 3.37 (C | P) | 3.97 (C | P) | 4.74 (C | P) | 5.57 (C | P) | 4.86 (C | P) | 4.02 (C | P) | 3.23 (C | P) | 2.41 (C | P) | 4.38 (C | P) | 0.73 (C | P) | 3.70 (C | P) | 2.68 (C | P) | 2.43 (C | P) | 2.97 (C | P) | 0.00 (C | P) | 3.28 (C | P) | 3.92 (C | P) |
SIN264734 | I6_SR2 | SilentIntronRegion | 160 (100% | 0%) | 0 | 0 | 4.89 (C | P) | 2.94 (C | P) | 2.52 (C | P) | 1.72 (C | P) | 2.30 (C | P) | 3.13 (C | P) | 2.80 (C | P) | 1.34 (C | P) | 3.14 (C | P) | 3.24 (C | P) | 1.61 (C | P) | 2.96 (C | P) | 2.96 (C | P) | 3.56 (C | P) | 4.67 (C | P) | 5.15 (C | P) | 4.94 (C | P) | 4.80 (C | P) | 2.54 (C | P) | 2.35 (C | P) | 4.27 (C | P) | 1.94 (C | P) | 2.85 (C | P) | 3.40 (C | P) | 2.99 (C | P) | 2.97 (C | P) | 2.37 (C | P) | 2.59 (C | P) | 2.29 (C | P) |
SIN264735 | I6_SR3 | SilentIntronRegion | 280 (87% | 0%) | 0 | 0 | 4.82 (C | P) | 3.29 (C | P) | 3.54 (C | P) | 2.59 (C | P) | 1.56 (C | P) | 3.71 (C | P) | 2.31 (C | P) | 2.62 (C | P) | 3.28 (C | P) | 3.35 (C | P) | 2.05 (C | P) | 3.59 (C | P) | 3.26 (C | P) | 3.50 (C | P) | 4.77 (C | P) | 5.29 (C | P) | 4.91 (C | P) | 4.90 (C | P) | 3.40 (C | P) | 2.65 (C | P) | 4.32 (C | P) | 3.00 (C | P) | 2.51 (C | P) | 3.93 (C | P) | 3.34 (C | P) | 2.65 (C | P) | 1.66 (C | P) | 2.71 (C | P) | 3.29 (C | P) |
AIN186906 | I6_AR3 | ActiveIntronRegion | 129 (100% | 0%) | 1 | 0 | 5.32 (C | P) | 3.09 (C | P) | 2.46 (C | P) | 2.45 (C | P) | 1.55 (C | P) | 3.69 (C | P) | 2.56 (C | P) | 2.55 (C | P) | 3.49 (C | P) | 2.71 (C | P) | 2.10 (C | P) | 3.49 (C | P) | 2.97 (C | P) | 3.28 (C | P) | 4.31 (C | P) | 5.19 (C | P) | 4.48 (C | P) | 4.76 (C | P) | 4.23 (C | P) | 2.21 (C | P) | 4.06 (C | P) | 2.11 (C | P) | 2.16 (C | P) | 3.60 (C | P) | 3.54 (C | P) | 2.79 (C | P) | 0.78 (C | P) | 2.97 (C | P) | 2.71 (C | P) |
EB244642 | E7_Aa | NovelBoundary | 62 (100% | 50%) | 0 | 0 | 5.95 (C | P) | 5.27 (C | P) | 3.50 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.06 (C | P) | 0.00 (C | P) | 0.00 (C | P) | 4.73 (C | P) | 2.62 (C | P) | 1.38 (C | P) | 2.56 (C | P) | 2.85 (C | P) | 4.40 (C | P) | 6.05 (C | P) | 4.78 (C | P) | 5.02 (C | P) | 5.56 (C | P) | 5.06 (C | P) | 3.69 (C | P) | 4.38 (C | P) | 2.91 (C | P) | 2.57 (C | P) | 3.32 (C | P) | 4.52 (C | P) | 2.61 (C | P) | 1.78 (C | P) | 3.71 (C | P) | 3.39 (C | P) |
ER341981 | ER7a | ExonRegion | 321 (73% | 100%) | 76 | 0 | 11.54 (C | P) | 10.57 (C | P) | 11.40 (C | P) | 10.10 (C | P) | 9.91 (C | P) | 10.94 (C | P) | 10.34 (C | P) | 10.55 (C | P) | 10.39 (C | P) | 10.06 (C | P) | 10.12 (C | P) | 11.47 (C | P) | 11.94 (C | P) | 11.07 (C | P) | 10.42 (C | P) | 11.41 (C | P) | 10.21 (C | P) | 12.22 (C | P) | 11.27 (C | P) | 10.13 (C | P) | 12.14 (C | P) | 12.22 (C | P) | 12.86 (C | P) | 10.03 (C | P) | 10.66 (C | P) | 11.38 (C | P) | 10.48 (C | P) | 11.04 (C | P) | 11.21 (C | P) |
EB244643 | E7_Da | KnownBoundary | 62 (100% | 100%) | 85 | 2 | 11.34 (C | P) | 10.18 (C | P) | 11.91 (C | P) | 10.51 (C | P) | 10.46 (C | P) | 10.97 (C | P) | 10.22 (C | P) | 10.63 (C | P) | 10.27 (C | P) | 9.92 (C | P) | 10.15 (C | P) | 11.25 (C | P) | 11.73 (C | P) | 10.54 (C | P) | 10.40 (C | P) | 11.19 (C | P) | 10.07 (C | P) | 11.85 (C | P) | 11.04 (C | P) | 9.94 (C | P) | 12.24 (C | P) | 11.94 (C | P) | 12.63 (C | P) | 10.14 (C | P) | 10.73 (C | P) | 11.37 (C | P) | 11.18 (C | P) | 11.15 (C | P) | 11.09 (C | P) |
ER341982 | ER7b | ExonRegion | 1079 (95% | 43%) | 8 | 0 | 11.41 (C | P) | 11.14 (C | P) | 11.92 (C | P) | 10.27 (C | P) | 10.23 (C | P) | 11.44 (C | P) | 10.79 (C | P) | 11.02 (C | P) | 11.28 (C | P) | 10.49 (C | P) | 10.84 (C | P) | 11.72 (C | P) | 12.45 (C | P) | 11.00 (C | P) | 10.72 (C | P) | 11.49 (C | P) | 10.61 (C | P) | 12.06 (C | P) | 11.68 (C | P) | 10.29 (C | P) | 12.68 (C | P) | 12.19 (C | P) | 12.89 (C | P) | 10.53 (C | P) | 11.16 (C | P) | 12.13 (C | P) | 11.58 (C | P) | 11.74 (C | P) | 11.80 (C | P) |
ER341983 | ER7c | ExonRegion | 1 (100% | 0%) | 12 | 0 | 2.89 (C | P) | 4.12 (C | P) | 4.33 (C | P) | 0.00 (C | P) | 2.58 (C | P) | 3.41 (C | P) | 1.59 (C | P) | 1.51 (C | P) | 2.73 (C | P) | 3.04 (C | P) | 2.53 (C | P) | 3.27 (C | P) | 1.20 (C | P) | 2.88 (C | P) | 2.72 (C | P) | 4.23 (C | P) | 2.00 (C | P) | 4.51 (C | P) | 4.56 (C | P) | 1.93 (C | P) | 3.02 (C | P) | 2.20 (C | P) | 4.11 (C | P) | 2.90 (C | P) | 1.95 (C | P) | 4.06 (C | P) | 4.40 (C | P) | 4.36 (C | P) | 2.33 (C | P) |
Figures displaying gene and feature expression levels in each library
The following figures illustrate the expression of the gene 'HMGA1' and its component features for each library. First, a simple gene model is depicted. In this model, features that are alternatively expressed in at least one comparison are marked red (see below for the actual expression levels of each feature). Next, the expression values are displayed for only the exons and known (or expressed novel) exon junctions. This first display consists of a single plot with one colored line per library (as indicated in the legend). Next, the expression of the gene relative to the distribution of all gene expression values is displayed as a histogram. In these figures (one for each library) the expression of the current gene is indicated by a dotted red line. Estimated cutoffs for background expression level corresponding to intergenic and intragenic noise are indicated by dotted black lines. The bar plots following these histograms display the expression level of all individual features. The color of the bars correspond to different feature types (enumerated as colored boxes in the legend). As in the histograms, the estimated cutoffs level for intergenic and intragenic noise are indicated as dotted lines. For genes with low expression values, these cutoffs converge to a single value. Features with significant alternative expression values are highlighted yellow in the line plot, and marked with a pink asterix below. *If you can not see the figure below, click here
Download gene data file (HMGA1): ENSG00000137309.txt