Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AL445309.1	Gene	0	4.10	1.77	0.85	2.08	0.95	3.32	1.32	1.16	5.12	3.07	0.69	1.48	1.10	2.12	5.45	3.07	4.15	2.91	2.47	1.24	4.93	1.18	0.96	2.76	2.28	2.39	1.06	2.17	1.68
2	499159	Transcript	0	1.67	0.65	0.31	0.76	0.35	1.22	0.48	0.42	1.87	1.13	0.25	0.54	0.40	0.78	2.00	1.12	1.53	1.06	0.91	0.45	1.81	0.43	0.35	1.02	0.84	0.88	0.39	0.79	0.73
3	ER1a	ExonRegion	0	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	19.68	2.82	2.86	3.38	1.11	6.67	1.20	2.57	3.22	5.75	1.89	4.47	1.42	10.61	2.27	4.38	13.06	5.30	9.37	1.32	17.19	0.69	1.33	1.73	1.95	2.19	0.99	4.18	1.33
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	19.26	2.77	2.73	3.80	1.15	6.83	1.15	2.35	2.96	5.65	1.95	3.95	1.28	10.14	2.34	3.85	12.46	5.37	8.95	1.30	16.98	0.67	1.31	1.53	1.79	2.10	0.72	4.26	1.45
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	23.21	3.24	3.90	0.00	0.78	5.45	1.60	4.35	5.34	6.55	1.39	8.69	2.59	14.44	1.74	8.74	18.01	4.69	12.79	1.51	18.93	0.86	1.44	3.36	3.22	3.00	3.20	3.55	0.43
10	I1	Intron	0	11.42	2.68	1.10	1.18	0.40	2.25	0.83	1.36	0.60	3.91	0.59	1.26	0.11	3.89	1.13	6.14	9.06	1.92	3.41	1.13	9.01	0.15	0.30	1.23	0.47	1.03	0.00	1.74	0.55
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	9.43	2.80	0.42	0.00	1.22	3.06	1.15	1.32	0.84	3.67	0.03	2.06	0.00	3.30	3.44	3.04	5.05	2.04	4.75	1.37	11.03	0.11	0.45	1.15	1.42	2.00	0.00	1.11	0.52
12	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	12.46	2.64	1.44	1.76	0.00	1.87	0.67	1.38	0.48	4.05	0.86	0.88	0.16	4.21	0.00	7.70	11.08	1.87	2.76	1.02	8.05	0.17	0.22	1.28	0.00	0.56	0.00	2.06	0.57
13	Ix	Intron	0	2.54	1.10	0.88	0.47	0.00	0.99	0.20	0.24	2.01	1.57	0.23	0.67	0.21	1.65	1.72	1.47	3.97	0.32	0.52	0.16	2.67	0.18	0.12	0.64	0.28	1.03	0.78	1.12	0.26
14	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.54	1.11	0.88	0.47	0.00	1.00	0.20	0.24	2.01	1.57	0.23	0.67	0.21	1.65	1.73	1.47	3.98	0.32	0.53	0.16	2.68	0.18	0.12	0.64	0.28	1.03	0.78	1.13	0.26
15	Ix	Intron	0	1.43	0.85	1.03	0.30	0.10	1.27	0.29	0.38	2.88	1.58	0.31	0.59	0.23	1.03	1.36	0.76	3.74	0.26	0.86	0.20	2.82	0.39	0.36	1.25	0.77	0.47	0.30	0.22	0.24
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.68	0.94	1.34	1.02	0.37	1.72	0.23	0.78	4.00	1.12	0.18	0.43	0.40	1.51	3.10	1.11	5.07	0.00	0.83	0.00	3.08	0.88	0.00	1.24	1.20	0.34	0.40	0.19	0.34
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.29	0.67	2.25	0.30	0.00	1.71	0.00	0.00	3.71	1.03	0.00	0.07	0.00	1.12	2.32	1.27	4.51	0.00	0.58	0.00	3.33	0.61	0.00	0.96	0.21	0.09	0.89	0.48	0.16
18	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.65	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	0.00
20	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	1.43	5.39	0.00	0.00	0.00
21	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	1.81	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	3.92	0.00	0.00	0.00	1.43	6.29	0.00	0.00	0.00
22	Ix_SR4	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	2.17	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	1.12	0.72	1.93	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	2.13	0.00	4.24	0.00	7.13	0.00	0.00	0.00	0.09	5.11	0.00	0.00	0.00
23	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.24	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.90	1.83	2.38	0.00	0.00	0.91	0.00	0.00	3.47	0.00	4.53	0.00	9.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	2.20	0.00	0.00	2.84	7.33	1.01	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	3.16	0.00	0.00	0.42	5.17	0.00	0.00	4.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	Ix_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.84	1.01	0.00	0.00	1.76	0.00	0.60	2.65	3.48	0.52	0.00	0.00	1.68	1.42	0.76	7.86	0.00	1.23	2.01	4.24	0.00	1.11	1.67	0.44	1.45	0.00	0.00	0.41
26	Ix_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	7.39	1.12	0.00	0.00	1.20	0.00	1.84	2.72	3.25	1.39	0.00	0.00	1.47	0.00	2.32	7.47	0.00	4.53	2.69	4.16	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	Ix_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.13	0.00	0.00	4.17	0.00	1.40	2.48	2.09	0.00	0.00	0.00	1.47	0.00	2.36	7.01	0.00	0.16	0.00	0.84	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	Ix_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.84	3.88	1.17	0.00	0.00	1.53	0.00	1.48	4.07	1.25	0.00	0.44	0.00	2.21	0.00	0.00	5.21	0.00	2.00	1.11	4.56	0.72	0.20	1.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54
29	Ix_AR12	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.95	0.00	1.09	2.25	0.95	0.00	0.19	0.00	0.91	0.00	0.00	3.60	0.00	2.12	0.00	10.74	0.00	1.81	1.82	0.00	0.00	1.20	0.00	0.00
30	Ix_AR13	ActiveIntronRegion	0	1.53	0.00	1.67	0.00	0.00	0.27	0.00	1.71	3.27	1.70	0.00	0.52	0.00	1.07	0.00	0.00	5.50	0.71	2.28	0.35	3.98	1.29	1.33	0.50	0.00	0.00	0.37	0.58	0.17
31	Ix_AR14	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	1.78	1.32	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	2.73	0.00	2.81	7.61	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
32	Ix_SR5	SilentIntronRegion	0	0.79	0.79	0.55	0.00	0.00	1.06	0.50	0.04	2.12	1.85	0.33	0.72	0.32	0.50	0.48	0.41	2.37	0.43	0.39	0.12	2.28	0.11	0.56	0.72	0.69	0.58	0.34	0.15	0.14
33	Ix_AR15	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.90	0.56	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	2.78	1.25	0.00	1.58	0.00	1.30	0.00	0.05	2.13	1.41	0.00	0.00	1.91	0.00	0.00	3.06	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00
34	Ix_SR6	SilentIntronRegion	0	0.87	0.44	0.89	0.00	0.00	0.74	0.41	0.12	2.55	1.56	0.64	1.05	0.09	0.91	0.94	1.18	3.09	0.39	1.51	0.19	2.10	0.12	0.49	2.34	0.69	0.43	0.00	0.44	0.36
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.08	1.62	0.01	0.00	0.00	0.59	0.51	0.00	1.41	1.17	0.00	0.31	0.00	0.68	0.00	0.00	2.62	0.00	1.07	0.50	3.91	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	1.23	0.67
36	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.38	0.00	1.08	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	1.67	2.00	0.00	1.05	0.00	0.16	0.00	1.77	1.89	0.69	0.95	0.49	2.57	1.29	0.32	0.38	0.00	0.00	0.00	0.88	1.24
37	Ix	Intron	0	0.58	0.99	0.64	0.27	0.00	1.16	0.23	0.07	1.53	1.00	0.14	0.64	0.00	0.47	1.94	0.86	1.83	0.89	1.10	0.21	1.97	0.21	0.35	0.91	0.99	0.78	0.00	0.31	0.46
38	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.42	0.60	0.16	0.00	0.00	1.81	0.19	0.17	1.05	0.54	0.00	0.41	0.00	0.26	2.85	0.93	2.62	1.27	1.19	0.00	2.08	0.00	0.17	1.16	0.81	0.15	0.00	0.46	0.63
39	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.96	2.21	0.96	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	2.18	0.83	0.41	0.49	0.00	0.98	1.78	0.28	1.08	0.66	1.47	0.00	1.88	0.41	0.83	0.55	1.47	2.16	0.00	0.19	0.46
40	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.32	0.00	1.01	1.08	0.00	1.45	0.61	0.00	1.43	1.95	0.00	1.21	0.00	0.14	0.69	1.49	1.57	0.58	0.48	0.83	1.93	0.27	0.00	0.97	0.65	0.00	0.00	0.25	0.20
41	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	2.04	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.85	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER2a	ExonRegion	0	4.44	1.94	0.93	2.29	1.04	3.65	1.44	1.27	5.62	3.38	0.76	1.62	1.21	2.33	5.99	3.37	4.56	3.19	2.72	1.36	5.42	1.29	1.06	3.02	2.51	2.63	1.17	2.38	1.81