Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-69L16.3	Gene	0	1.96	1.31	0.00	0.73	0.50	1.68	3.29	0.94	1.65	0.59	0.49	0.75	0.13	0.83	1.88	1.19	1.37	2.19	4.24	1.69	4.51	0.00	0.55	1.10	0.15	0.16	1.31	0.67	0.27
2	379928	Transcript	0	0.68	0.46	0.00	0.25	0.17	0.64	1.54	0.33	0.94	0.20	0.17	0.26	0.05	0.29	0.68	0.41	0.48	0.76	1.47	2.14	1.57	0.00	0.19	1.30	0.05	0.06	0.45	0.23	0.10
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.51	0.07	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.40
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.45	0.15	2.62	1.34	0.88	0.34	0.00	5.36	1.01	0.64	0.92	0.59	1.20	1.51	1.58	2.09	0.00	1.75	0.19	1.82	0.00	0.81	2.16	0.65	0.29	0.67	1.75	4.44
7	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	1.51	0.52	2.24	0.00	0.00	1.37	1.73	10.28	3.77	1.91	1.09	2.43	1.67	4.84	0.78	2.78	0.00	1.00	0.84	1.79	1.13	1.20	3.37	1.34	1.48	1.72	5.61	5.64
8	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	8.32	36.84	7.25	47.45	12.97	38.98	5.15	2.44	26.34	39.47	54.76	26.20	11.69	30.53	35.68	9.18	32.32	18.49	24.28	7.61	73.40	1.90	17.58	12.62	9.58	7.42	58.05	12.22	13.77
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.62	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.91	0.02	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E2_Da	NovelBoundary	0	8.20	30.15	14.43	32.57	26.38	57.70	13.85	7.56	70.01	35.31	67.22	48.55	9.17	37.40	8.37	26.62	36.15	18.49	153.76	2.98	122.98	0.00	11.77	33.44	12.31	6.44	42.14	2.25	7.06
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix	Intron	0	2.97	1.78	0.08	2.65	0.48	3.33	0.65	0.59	2.79	1.78	1.09	0.91	0.48	1.29	1.70	3.42	2.77	2.53	7.33	0.72	4.82	0.22	0.27	0.85	0.46	0.39	0.41	0.36	0.21
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.02	2.16	0.00	2.19	0.66	3.22	0.91	0.74	3.93	2.54	2.10	1.42	0.53	1.86	2.36	5.88	5.06	3.52	10.47	0.91	5.97	0.56	0.30	1.37	0.77	0.21	0.33	0.55	0.27
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.22	0.71	0.35	1.88	0.00	3.38	0.29	0.40	0.74	1.98	0.37	0.58	0.89	1.48	0.98	3.13	1.10	1.01	3.55	0.29	2.87	0.07	0.48	1.49	0.45	0.33	0.67	0.17	0.14
16	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.83	2.21	0.00	3.77	0.64	3.62	0.66	0.61	3.09	1.05	0.63	0.69	0.21	0.71	1.63	1.42	1.77	2.43	7.15	0.86	5.25	0.00	0.12	0.00	0.19	0.62	0.36	0.32	0.22
18	Ix	Intron	0	2.97	2.51	0.07	1.28	1.53	2.03	1.62	0.49	3.16	1.55	1.65	1.24	0.72	1.48	1.03	1.49	3.21	2.17	7.86	1.60	6.25	0.40	0.40	1.35	0.38	0.35	0.00	0.44	0.30
19	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.98	2.52	0.07	1.29	1.53	2.03	1.63	0.50	3.17	1.55	1.66	1.24	0.72	1.48	1.03	1.49	3.21	2.17	7.88	1.61	6.27	0.40	0.41	1.35	0.38	0.35	0.00	0.44	0.30
20	Ix	Intron	0	4.58	0.86	0.45	0.00	0.00	3.12	1.61	0.25	3.29	1.93	1.75	0.50	0.86	3.03	4.54	1.32	2.99	5.49	5.54	0.74	8.38	0.48	0.72	0.86	0.57	0.63	0.73	0.87	2.77
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	5.36	0.81	0.42	0.00	0.00	4.47	2.52	0.46	3.92	1.80	1.49	0.31	0.80	2.84	4.83	0.00	3.36	5.38	6.39	0.00	9.98	0.45	0.90	0.54	0.36	1.18	1.37	0.41	4.01
22	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.77	0.94	0.49	0.00	0.00	1.61	0.59	0.00	2.63	2.12	2.09	0.73	0.95	3.30	4.28	2.91	2.63	5.74	4.68	1.62	6.69	0.53	0.53	1.26	0.84	0.00	0.00	1.43	1.37
23	Ix	Intron	0	3.42	0.86	0.00	0.00	2.17	3.05	1.25	0.00	1.94	0.26	0.63	0.55	0.75	1.40	2.20	1.76	2.25	2.08	5.38	0.98	7.34	0.16	0.64	1.14	0.13	0.00	0.32	0.58	0.30
24	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.43	0.86	0.00	0.00	2.17	3.06	1.26	0.00	1.95	0.26	0.63	0.55	0.75	1.41	2.21	1.77	2.26	2.09	5.40	0.98	7.36	0.16	0.64	1.15	0.13	0.00	0.33	0.58	0.30
25	E3_Aa	NovelBoundary	0	2.71	0.00	1.52	0.00	29.47	3.76	2.63	2.54	0.00	1.88	3.23	1.72	3.57	0.00	8.57	6.50	1.37	5.39	8.09	0.00	7.42	0.00	0.00	5.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER3a	ExonRegion	0	3.41	2.28	0.00	1.27	0.86	2.68	5.00	1.63	2.54	1.02	0.84	1.31	0.23	1.44	3.23	2.07	2.38	3.81	7.35	2.69	7.83	0.00	0.96	0.38	0.25	0.28	2.27	1.15	0.48