Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-40E16.5	Gene	0	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.19	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.26	0.26	0.31	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
2	447644	Transcript	0	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.08	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.11	0.13	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.24	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.33	0.34	0.40	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	255.11	31.02	30.84	96.41	40.82	70.63	71.29	201.25	28.53	54.09	73.65	38.98	69.87	67.89	44.05	45.36	101.07	14.64	97.11	96.76	94.86	89.75	84.81	74.47	62.89	23.90	36.78	60.88	59.46
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	2.24	1.14	0.63	1.59	0.00	1.53	0.09	0.86	0.66	2.24	0.45	1.05	0.32	0.96	1.02	1.27	7.95	1.15	0.50	0.43	2.60	0.00	0.20	0.81	0.73	0.14	0.08	0.61	1.20
7	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	2.88	1.79	0.88	1.26	0.00	2.82	0.00	0.00	1.40	3.61	1.05	1.08	0.23	1.39	0.00	0.87	10.70	0.87	0.00	0.00	1.35	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	1.05	0.94
8	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	1.69	2.73	0.48	1.26	0.00	1.13	0.00	0.14	0.00	1.74	0.60	0.82	0.47	1.20	0.00	1.31	5.79	1.93	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	1.13	0.28	0.15	0.00	1.24	0.24
9	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.37	0.00	3.01	0.00	2.89	0.32	1.41	1.30	0.00	4.33	2.07	6.74	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	1.57	0.00	0.22	0.00
10	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.22	0.52	0.83	2.92	0.00	1.12	0.04	1.03	1.00	2.53	0.48	1.14	0.43	0.93	1.35	0.74	10.94	0.78	1.30	0.45	4.07	0.00	0.00	0.70	0.63	0.26	0.00	0.39	2.12
11	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	1.64	0.00	2.09	0.00	1.24	1.30	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	4.12	2.02	3.68	0.00	2.89	1.19	2.06	1.30	0.91	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	4.12	2.02	3.68	0.00	2.53	1.19	2.47	1.30	0.91	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00	2.85	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	4.12	0.17	3.68	0.00	1.44	1.19	1.55	1.30	0.53	0.00	0.84	4.01	0.00	0.00	0.00	3.57	0.00	0.00	5.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.46	0.00	0.53	1.71	0.00	1.39	0.16	1.59	0.17	1.15	0.00	1.40	0.02	0.86	0.00	2.31	5.61	1.22	0.25	0.00	2.72	0.00	0.29	1.16	1.36	0.12	0.00	0.26	1.70
16	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	3.11	0.00	0.96	4.42	0.00	1.67	0.00	0.19	0.23	1.19	1.71	1.53	0.23	0.37	0.00	1.26	5.16	2.51	1.31	0.00	3.07	0.00	0.74	0.44	1.34	0.00	0.00	0.34	1.10
17	E2_Aa	NovelBoundary	0	7.67	3.88	2.94	8.41	0.00	7.21	0.00	6.97	0.00	7.23	1.46	1.51	0.00	0.86	0.00	6.96	22.76	10.02	0.00	7.03	18.89	1.85	0.00	14.89	5.11	0.00	0.00	0.00	3.86
18	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00