Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP1-257A7.1	Gene	0	5.72	0.31	0.45	0.00	1.30	1.28	1.08	1.47	1.05	1.73	3.02	1.65	0.17	3.08	1.35	4.45	3.59	1.33	1.28	0.00	1.33	0.72	0.48	2.01	0.57	0.84	0.24	0.65	0.00
2	399446	Transcript	0	3.38	0.19	0.27	0.00	2.07	0.77	0.66	0.87	0.61	1.01	1.78	0.98	0.09	1.77	0.77	3.26	2.04	0.81	0.81	0.00	0.78	0.93	0.28	1.21	0.35	0.51	0.15	0.73	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	4.65	0.00	0.02	0.00	0.00	0.50	0.00	1.33	1.21	2.10	2.58	1.11	0.47	4.43	1.99	3.34	5.95	0.00	0.00	0.00	1.55	0.65	0.65	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	5.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.95	0.00	7.57	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	11.95	0.48	2.22	1.32	0.54	2.18	1.86	1.90	2.56	4.69	2.64	4.00	0.67	7.52	2.20	11.11	12.36	1.16	0.83	1.57	4.37	0.47	0.73	1.19	1.37	0.64	1.01	0.60	0.67
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	11.95	0.48	2.22	1.32	0.54	2.18	1.86	1.90	2.56	4.69	2.64	4.00	0.67	7.52	2.20	11.11	12.36	1.16	0.83	1.57	4.37	0.47	0.73	1.19	1.37	0.64	1.01	0.60	0.67
8	E2_Aa	NovelBoundary	0	17.64	12.89	3.59	0.00	0.00	8.40	0.00	0.00	26.77	20.81	5.44	11.48	0.00	10.92	18.14	28.15	37.21	0.00	0.00	3.64	17.97	2.04	0.00	2.51	3.41	2.10	6.11	15.77	1.45
9	ER2a	ExonRegion	0	12.17	0.95	1.34	0.00	3.51	3.37	3.29	2.93	1.83	2.91	6.31	3.78	0.00	4.43	1.88	8.93	4.25	4.06	2.43	0.00	2.33	1.07	0.74	5.27	1.75	2.56	0.75	2.00	0.00
10	E2_Da	NovelBoundary	0	18.93	0.00	26.43	0.00	0.00	11.66	0.00	5.08	15.62	8.15	11.07	8.16	5.48	28.36	7.77	3.52	20.62	0.00	0.00	0.00	14.24	14.88	4.83	0.00	9.66	2.19	2.44	6.87	11.69
11	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	0.00
12	Ix	Intron	0	9.39	2.72	1.19	2.63	1.29	2.61	2.14	1.84	3.48	4.71	3.83	3.49	0.98	5.98	3.49	7.61	9.71	1.56	1.11	1.10	5.12	0.62	0.52	2.59	1.05	0.58	0.86	0.56	1.04
13	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	9.22	1.09	2.90	0.00	0.00	0.00	0.00	1.29	1.72	0.29	1.49	1.30	0.00	4.47	0.00	1.52	2.54	0.00	0.00	2.34	1.64	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33
14	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	15.16	4.27	2.15	4.78	1.63	1.46	2.28	2.98	2.59	5.79	9.73	4.24	1.95	9.22	1.54	8.88	14.22	2.96	0.00	3.53	3.92	0.60	1.16	3.64	1.69	2.04	0.38	2.34	1.76
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	9.11	3.06	1.93	4.71	2.53	3.52	2.88	2.48	3.04	5.22	3.41	3.99	0.82	5.89	4.29	10.79	14.48	3.67	0.81	2.34	6.88	1.74	0.44	1.43	0.99	1.17	1.58	0.76	1.02
16	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	12.98	4.07	0.99	3.55	2.87	2.88	3.99	2.61	4.47	6.78	3.78	4.28	1.10	7.94	7.60	7.56	13.70	1.62	1.36	1.32	8.17	1.13	1.10	5.26	2.31	0.70	2.12	0.28	1.53
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.52	2.36	0.58	2.06	0.28	3.00	1.62	1.38	4.16	4.57	4.45	3.55	1.12	5.67	1.96	7.69	8.07	0.66	1.10	0.39	3.28	0.10	0.31	1.98	0.66	0.27	0.21	0.47	0.84
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	6.32	0.83	1.50	0.00	0.00	1.23	0.00	0.71	1.58	1.67	1.07	1.74	0.41	2.78	1.18	4.77	1.91	1.07	1.64	0.00	3.84	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.42	0.26
19	Ix	Intron	0	15.53	0.44	1.45	0.98	0.22	2.63	1.75	1.09	3.73	8.03	2.06	3.91	1.27	10.39	5.70	10.88	12.18	1.43	1.02	0.61	5.92	0.41	0.41	1.47	1.30	0.36	0.42	0.67	1.89
20	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	15.55	0.44	1.45	0.98	0.22	2.63	1.75	1.09	3.74	8.04	2.06	3.91	1.27	10.40	5.70	10.89	12.19	1.44	1.02	0.61	5.92	0.41	0.41	1.47	1.30	0.36	0.42	0.67	1.89
21	E3_Aa	NovelBoundary	0	18.82	9.70	3.44	0.00	0.00	0.00	2.92	5.08	1.28	3.79	4.59	9.01	4.17	8.93	0.00	21.73	11.82	0.00	0.00	3.31	3.45	0.00	2.51	5.44	1.70	0.00	0.00	0.00	3.96
22	ER3a	ExonRegion	0	0.07	0.00	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.98	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00