Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	GFOD1	Gene	0	9.46	10.63	28.96	2.77	20.20	35.68	2.95	2.28	19.55	18.98	6.65	5.50	5.09	25.61	18.85	15.99	31.13	37.85	29.25	18.54	50.44	28.33	41.22	35.48	5.76	8.04	85.71	4.85	79.96
2	379287	Transcript	0	16.83	1.67	34.55	0.00	11.91	16.13	3.72	0.26	5.73	12.12	0.50	4.28	4.88	22.95	3.32	8.14	28.86	50.54	10.43	11.76	24.66	37.73	64.33	15.57	2.58	9.26	15.50	5.68	37.74
3	379284	Transcript	0	0.00	0.00	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.16	0.00	0.00	0.00	0.20	1.03	0.00	1.00	0.43	0.00	0.01	0.16	0.20	0.00	0.24	0.00	0.18	0.20	0.00	0.15
4	IG48_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.04	0.00	2.41	0.00	2.35	1.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	1.19	0.00	12.05	1.54	1.91	1.37	3.47	0.87	0.00	0.00	0.76	7.03	0.78	6.77
5	ER1a	ExonRegion	0	8.95	3.35	25.21	0.00	3.33	15.07	2.52	0.51	4.29	7.67	0.99	2.45	3.77	15.28	6.64	8.94	16.22	52.40	12.99	16.98	21.88	37.19	37.65	8.77	1.49	5.85	10.93	2.14	27.94
6	E1_Da	NovelBoundary	0	2.65	0.00	1.54	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	3.60	0.00	4.62	0.00	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.82
7	E1a_E3a	KnownJunction	0	24.71	0.00	43.90	0.00	20.48	17.19	4.92	0.00	7.16	16.58	0.00	6.11	5.99	30.62	0.00	7.34	41.51	48.68	7.87	6.53	27.44	38.26	91.01	22.37	3.67	12.66	20.08	9.21	47.54
8	Ix	Intron	0	0.43	0.23	0.73	0.00	0.08	0.47	0.06	0.01	0.76	0.55	0.04	0.08	0.10	0.25	0.49	0.31	0.97	1.07	2.00	0.43	3.14	0.60	0.23	0.25	0.04	0.04	0.43	0.09	0.56
9	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.71	0.23	0.83	0.00	0.07	0.74	0.12	0.00	0.73	0.48	0.00	0.12	0.08	0.23	0.15	0.41	0.99	1.70	2.16	0.49	3.33	0.65	0.16	0.19	0.09	0.05	0.08	0.05	0.64
10	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.49	0.26	0.99	0.00	0.56	1.17	0.00	0.00	0.38	0.49	0.00	0.42	0.50	0.39	0.53	0.00	0.17	1.10	1.45	0.00	5.08	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94
11	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.93	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	0.28	0.91	0.38	0.00	0.00	0.42	1.07	2.67	0.00	4.20	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.48	0.29	0.83	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	1.10	0.91	0.32	0.06	0.00	0.37	1.28	0.00	1.34	0.95	2.72	0.62	4.22	0.73	0.16	0.68	0.00	0.00	0.49	0.29	0.27
13	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.43	0.57	1.34	0.32	0.40	0.76	0.15	0.02	1.74	0.73	0.21	0.25	0.23	0.69	1.37	0.39	1.94	2.04	1.53	0.55	4.19	1.27	1.64	0.73	0.08	0.24	3.58	0.30	2.59
14	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.54	0.12	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	1.40	0.77	0.21	0.00	0.00	0.16	0.41	0.00	1.54	0.52	0.00	0.00	2.79	0.93	0.37	0.00	0.00	0.00	0.82	0.11	1.19
15	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.17	0.12	0.17	0.00	0.14	0.25	0.11	0.00	1.26	0.39	0.22	0.20	0.11	0.18	1.76	0.06	1.39	0.19	0.39	0.57	2.76	0.37	0.20	0.48	0.02	0.44	0.78	0.12	0.83
16	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	4.92	1.80	0.00	0.15	0.54	0.84	7.61	0.00	7.01	0.72	1.32	0.25	4.43	2.49	0.45	3.66	0.00	0.39	3.32	0.20	7.95
17	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	6.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.06	1.30	0.00	0.00	0.00	0.23	4.62	0.00	14.35	2.12	0.00	0.00	6.88	3.43	0.00	1.88	0.00	0.00	3.16	1.59	13.52
18	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.77	0.80	0.35	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	2.66	0.70	0.00	0.16	0.37	0.27	4.49	0.18	4.64	0.16	0.69	0.34	2.86	0.83	1.04	1.86	0.00	0.90	0.53	0.03	3.43
19	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.52	0.00	0.00	0.82	0.00	0.00	0.45	2.02	0.00	1.24	0.00	0.91	5.60	0.00	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.79	0.54	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	1.49	1.07	0.00	1.37	0.00	0.31	4.45	0.00	0.80	0.00	0.00	1.93	0.82	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	1.12	3.05
21	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.13	0.45	0.47	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	1.42	0.24	0.00	0.05	0.46	0.00	1.40	0.00	1.14	0.00	0.88	0.00	3.23	0.50	0.75	1.19	0.00	0.00	1.05	1.57	0.97
22	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	1.49	0.72	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	4.03	0.00	0.30	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I1_SR5	SilentIntronRegion	0	0.18	0.00	0.16	0.12	0.00	0.48	0.06	0.00	1.19	0.33	0.00	0.00	0.00	0.22	0.91	0.00	0.44	0.25	0.68	0.60	2.53	0.23	0.21	0.39	0.05	0.05	0.32	0.13	0.80
24	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.39	0.20	0.87	0.00	0.99	0.54	0.00	2.11	0.00	0.00	0.30	0.16	0.61	2.91	0.00	1.82	0.23	2.33	1.25	3.80	0.28	1.54	0.52	0.00	0.00	0.31	0.20	0.16
25	I1_SR6	SilentIntronRegion	0	0.50	0.15	0.47	0.00	0.00	0.06	0.09	0.17	3.87	0.88	0.28	0.00	0.48	0.25	3.06	0.58	4.66	1.16	0.15	1.02	1.30	0.59	0.50	1.53	0.20	0.07	0.94	0.30	1.21
26	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	1.14	0.00	0.00	6.51	0.70	0.33	0.00	0.36	0.25	5.93	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	0.58	0.57	1.00	3.16	0.00	2.17	0.76	0.45	2.19
27	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	3.94	1.87	0.00	0.26	0.27	0.00	5.86	0.00	2.33	0.81	0.00	0.00	1.85	3.35	0.38	1.30	0.00	0.24	2.10	0.34	1.38
28	I1_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.14	0.00	0.18	1.84	0.58	0.00	0.00	0.12	0.27	1.01	0.00	2.21	0.42	0.00	0.60	2.13	0.54	0.18	0.66	0.00	0.00	0.18	0.32	1.34
29	I1_SR10	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.31	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	2.38	0.23	1.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I1_SR11	SilentIntronRegion	0	0.78	0.00	0.16	0.00	0.36	0.27	0.05	0.09	2.97	0.31	0.17	0.09	0.49	0.33	3.58	0.04	2.32	0.20	0.16	0.93	2.43	0.79	0.53	0.84	0.07	0.34	1.16	0.28	2.01
31	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.63	0.00	0.00	0.00	1.97	0.00	0.00	0.00	1.35	4.62	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.49
32	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.32	0.00	0.00	0.00	0.41	2.06	0.00	2.00	0.86	0.00	0.01	0.32	0.40	0.00	0.48	0.00	0.35	0.41	0.00	0.29
33	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.91
34	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.37	1.49	8.06	0.82	0.00	9.36	0.67	0.40	3.23	2.77	0.99	0.61	0.95	4.56	0.00	4.97	3.79	24.57	10.58	16.17	19.03	20.88	9.89	1.98	0.28	0.63	22.04	1.08	6.61
36	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58
37	ER3a	ExonRegion	0	9.80	11.79	30.21	3.17	22.76	39.13	3.09	2.55	21.90	20.85	7.51	6.01	5.39	27.56	20.76	17.28	33.72	37.22	32.01	19.26	55.24	28.11	42.83	39.63	6.42	8.52	96.96	5.31	88.37