Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC022108.1	Gene	0	6.25	2.18	0.60	9.07	0.77	5.33	1.34	1.07	0.99	10.97	5.57	0.71	0.78	2.74	1.72	4.09	3.91	10.81	2.63	6.25	3.11	0.33	1.67	3.08	1.53	0.52	1.45	1.73	2.13
2	500779	Transcript	0	2.83	0.62	0.88	3.39	0.20	1.45	0.40	0.74	1.36	2.77	2.04	0.25	0.35	1.74	0.49	0.94	1.09	3.33	0.60	2.65	0.93	0.24	1.26	0.83	0.91	0.13	0.40	1.76	0.92
3	ER1a	ExonRegion	0	0.77	0.00	1.56	0.00	0.00	0.25	0.36	0.33	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	2.56	0.00	0.69	0.00	0.99	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00	0.66	0.88	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	201.79	39.36	77.31	335.83	74.42	75.81	96.41	62.46	6.36	24.53	26.32	4.76	20.16	48.01	34.28	29.45	56.50	77.06	32.37	159.44	49.94	53.87	103.08	7.78	55.12	40.64	19.18	29.65	7.66
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER2a	ExonRegion	0	0.87	0.00	1.11	0.00	1.15	1.52	0.00	0.28	0.96	0.34	0.56	0.02	0.00	1.13	0.00	0.00	0.73	1.33	0.00	0.65	0.11	0.00	0.42	0.51	1.15	0.00	0.00	1.16	0.01
7	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E2a_E3a	KnownJunction	0	10.03	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	2.44	4.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.86	4.62	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E3_Aa	NovelBoundary	0	11.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	5.27	0.00	1.72	0.00	2.35	0.00	7.65	2.41	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.82	0.00	0.00
10	ER3a	ExonRegion	0	4.53	2.32	1.14	6.23	0.00	0.35	0.84	3.35	1.81	7.85	5.02	1.25	0.00	3.25	0.00	0.00	1.00	4.92	2.67	3.46	0.99	1.51	4.57	0.90	2.73	0.00	0.00	3.45	0.81
11	E3_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	7.71	7.24	0.00	0.00	4.21	0.00	3.21	0.00	18.49	0.00	3.56	3.61	0.00	18.62	15.79	0.00	0.00	4.67	6.65	3.40
12	E3a_E4a	KnownJunction	0	5.43	0.00	2.74	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	4.32	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I3	Intron	0	2.64	2.95	0.21	0.88	1.80	1.35	0.99	0.23	0.69	10.14	3.81	0.38	0.00	2.06	0.00	0.92	1.84	5.93	0.39	4.07	3.34	0.00	6.46	5.83	3.35	0.00	3.84	0.80	2.71
14	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.67	2.98	0.21	0.89	1.82	1.37	1.00	0.23	0.70	10.24	3.85	0.38	0.00	2.08	0.00	0.93	1.86	5.99	0.40	4.11	3.37	0.00	6.52	5.89	3.38	0.00	3.87	0.81	2.74
15	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.77	0.00	0.00	0.00	0.00	5.87	0.00	3.83	0.00	18.41	0.00	1.33	0.00	1.00	0.00	3.60	1.06	9.25	0.00	2.98	8.98	2.48	15.27	0.00	10.76	0.00	5.07	0.00	0.00
16	ER4a	ExonRegion	0	2.55	1.47	1.66	6.40	0.00	3.66	0.92	1.26	1.40	7.56	10.54	0.70	0.80	4.00	3.35	2.26	1.47	9.77	0.00	6.45	2.60	0.41	9.04	3.43	3.25	0.72	2.08	6.34	2.41
17	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	14.80	1.33	0.00	1.93	0.00	11.25	1.40	4.62	0.00	7.11	1.89	0.00	18.47	2.51	0.00	0.00	5.07	0.00	1.68
18	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.43	2.01
19	E4a_E6a	NovelJunction	0	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	I4	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.96	0.00	3.85	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.06	0.00	4.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E5_Aa	NovelBoundary	0	99.80	154.25	3.54	108.06	46.42	204.92	38.96	52.30	62.46	246.10	349.02	34.94	85.15	73.18	160.45	60.36	50.87	150.01	121.16	181.03	147.25	25.72	265.16	265.40	99.87	16.35	104.12	30.55	147.47
23	ER5a	ExonRegion	0	0.01	0.00	0.44	1.12	0.00	0.00	0.54	0.00	1.52	0.03	0.68	0.00	0.79	0.36	0.00	0.04	0.02	2.01	0.00	3.28	0.77	0.53	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	1.24	0.97
24	E5_Da	NovelBoundary	0	158.91	162.88	6.65	167.59	21.07	207.42	23.40	61.86	75.64	261.72	264.72	46.75	138.14	108.21	170.82	76.12	49.63	184.81	48.55	281.76	133.21	45.41	230.78	457.11	109.34	11.03	143.82	42.37	157.71
25	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.78	0.00	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.68
26	Ix	Intron	0	11.99	5.58	0.48	11.31	2.10	7.49	3.04	1.98	1.41	17.40	11.01	1.55	2.09	3.80	1.72	5.19	5.78	20.82	2.29	5.14	4.71	0.13	3.89	9.41	4.92	1.13	2.50	1.40	4.03
27	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	12.02	5.60	0.48	11.35	2.11	7.52	3.04	1.99	1.41	17.45	11.05	1.55	2.09	3.81	1.72	5.20	5.80	20.87	2.30	5.15	4.72	0.13	3.90	9.44	4.94	1.13	2.50	1.41	4.04
28	E6_Aa	NovelBoundary	0	16.10	0.00	0.00	19.84	0.00	3.80	0.00	4.88	1.31	42.54	6.30	1.54	1.97	2.33	8.37	0.00	16.52	27.74	0.00	7.61	7.74	0.00	9.51	9.15	1.74	2.19	0.00	1.89	4.82
29	ER6a	ExonRegion	0	9.12	3.26	0.53	12.10	1.14	8.76	2.01	1.38	1.15	17.84	8.39	1.07	1.06	3.73	2.69	6.57	6.28	16.82	4.20	8.72	4.91	0.36	1.99	4.90	2.00	0.84	2.35	1.30	3.10
30	E6_Da	NovelBoundary	0	20.53	8.63	0.00	0.00	0.00	13.04	2.57	2.54	1.28	23.33	9.33	1.60	1.62	5.34	0.00	14.00	7.32	32.36	0.00	3.80	15.24	0.00	5.02	0.00	1.59	0.00	0.00	1.89	0.00
31	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	Ix	Intron	0	8.25	5.07	0.00	3.14	0.85	7.58	0.71	0.48	1.28	11.11	3.75	0.92	0.34	2.33	0.81	6.92	3.00	19.89	4.19	10.99	7.74	0.00	0.95	2.26	0.75	0.00	0.80	1.43	0.64
33	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	8.28	5.09	0.00	3.15	0.86	7.60	0.71	0.48	1.28	11.15	3.76	0.92	0.34	2.34	0.81	6.94	3.01	19.95	4.21	11.02	7.76	0.00	0.95	2.27	0.75	0.00	0.80	1.43	0.64
34	Ix	Intron	0	3.23	0.81	0.08	1.31	0.33	2.17	0.18	0.13	0.75	2.67	2.04	0.20	0.15	0.86	1.57	1.09	1.09	2.44	0.44	1.66	0.65	0.08	0.33	0.93	0.82	0.22	0.17	1.64	0.79
35	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.20	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00
36	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	3.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.17	1.19	0.00	0.00	1.09	0.56	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	3.66	0.00	0.00
37	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	7.91	1.23	0.21	2.64	0.00	1.75	0.00	0.00	0.92	3.80	2.13	0.47	0.00	1.07	4.04	1.89	1.33	5.11	0.41	3.15	0.36	0.23	0.46	0.82	2.28	0.74	0.82	2.70	1.36
38	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.93	1.53	0.00	3.40	0.00	1.57	0.00	0.03	0.53	2.26	2.11	0.00	0.51	0.58	0.94	0.87	0.63	1.88	0.50	0.79	0.57	0.00	0.22	0.34	0.75	0.56	0.00	1.80	0.42
39	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	1.29	1.64	0.00	0.00	0.76	2.64	0.00	0.85	3.42	1.36	2.72	0.00	1.44	3.48	0.00	2.04	2.01	3.51	1.66	0.26	1.11	0.00	0.20	0.00	0.09	0.00	0.00	0.85	0.00
40	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	4.55	0.63	0.16	0.70	1.28	3.44	0.59	0.18	0.56	2.90	3.23	0.12	0.04	1.10	2.05	0.70	1.82	2.65	0.62	0.44	1.07	0.00	0.35	1.25	0.26	0.00	0.00	2.85	1.04
41	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.05	26.75	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	2.04	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	10.02	0.00	4.05	6.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.60	1.89	0.00
42	ER7a	ExonRegion	0	3.54	1.01	0.30	7.46	0.35	0.94	0.51	0.59	0.64	2.18	1.28	0.24	0.51	1.17	0.36	0.84	1.24	3.17	0.92	3.44	0.87	0.26	0.32	0.62	0.72	0.11	0.13	2.10	1.01