Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	NDUFS6	Gene	0	311.14	189.91	176.07	670.84	1673.09	251.73	383.86	385.90	299.16	251.55	173.15	352.07	536.31	237.05	432.51	206.03	198.69	252.18	287.55	285.58	263.45	608.32	469.70	254.57	264.84	547.10	252.12	652.51	590.48
2	274137	Transcript	0	334.71	249.94	495.67	1254.74	6414.25	326.37	392.84	399.64	295.04	249.75	142.67	221.21	381.77	253.17	415.66	192.49	159.90	259.16	440.04	388.33	266.82	555.82	362.87	339.24	281.15	361.03	169.09	501.68	334.10
3	469176	Transcript	0	0.46	0.83	0.65	0.09	2.22	0.01	0.06	0.01	2.15	0.93	0.70	0.95	0.45	0.48	1.39	0.00	1.17	0.26	2.28	1.13	0.32	0.05	0.05	1.94	0.01	0.76	0.08	1.17	0.48
4	IG26	Intergenic	0	4.25	0.79	1.96	3.95	10.04	2.57	4.74	2.03	2.96	2.12	1.62	4.10	3.43	4.58	10.85	4.23	3.67	2.00	5.51	3.78	2.62	1.85	5.84	4.11	6.04	5.19	9.75	9.40	3.12
5	IG26_SR1	SilentIntergenicRegion	0	6.05	1.13	1.36	4.54	5.70	3.61	5.41	1.62	2.90	2.00	1.45	2.23	2.92	4.66	10.08	3.86	2.50	3.87	8.48	5.09	0.97	1.49	8.31	3.67	5.99	3.51	9.61	6.96	2.53
6	IG26_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	6.50	3.28	2.84	4.63	4.98	4.03	7.12	2.33	2.73	3.27	0.32	2.60	2.25	5.68	6.72	2.87	6.01	7.28	5.88	5.81	2.38	4.51	7.11	4.80	6.53	9.32	15.45	9.56	5.86
7	IG26_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	7.56	0.00	5.75	0.00	7.97	1.62	3.58	3.13	6.63	3.21	0.36	5.57	4.55	4.78	4.90	6.26	8.51	0.00	8.60	5.20	1.46	4.06	9.13	3.23	4.61	2.55	17.54	6.11	2.75
8	IG26_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	3.22	0.61	2.18	4.05	13.38	2.14	4.61	2.28	2.99	2.20	1.92	5.37	3.89	4.74	12.38	4.64	4.20	0.99	4.01	3.10	3.76	1.94	4.59	4.61	6.45	6.41	9.71	11.46	3.55
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	17.52	0.27	81.48	363.18	2.68	12.29	3.59	0.00	0.28	1.36	0.00	1.42	1.94	25.60	22.05	0.43	57.31	16.59	6.16	3.06	3.78	14.98	0.00	0.00	3.89	3.31	3.18	0.00
10	ER1b	ExonRegion	0	262.66	212.73	345.15	1388.97	2343.22	220.44	450.38	362.05	265.61	291.59	169.30	489.66	674.25	224.23	537.12	273.60	299.74	339.68	348.32	203.56	268.72	582.94	736.70	208.47	222.55	784.06	300.48	915.62	823.16
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	377.27	169.57	71.11	197.14	429.00	274.17	366.98	399.77	277.21	298.11	154.19	235.21	489.13	261.18	314.33	118.42	103.23	237.47	274.92	260.92	270.83	603.54	421.23	290.34	208.14	446.52	181.94	482.11	465.66
12	I1	Intron	0	3.32	2.85	0.45	2.41	1.64	1.02	0.41	0.74	0.30	0.58	0.08	0.33	0.83	0.85	0.68	1.84	1.00	1.30	1.93	1.30	1.06	0.49	0.24	0.58	0.77	0.32	0.25	1.75	1.66
13	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	3.73	3.01	0.00	4.30	0.00	0.84	0.00	1.54	1.69	0.75	0.00	0.00	0.00	0.96	0.00	0.60	0.19	1.89	3.03	0.10	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	2.57	0.74
14	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	3.08	5.10	0.67	1.44	0.00	1.66	0.40	0.59	0.23	1.11	0.24	0.74	0.39	1.37	2.03	1.99	1.80	1.30	1.92	1.66	1.43	1.45	0.36	0.02	1.72	0.00	0.37	1.77	2.95
15	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.01	8.34	0.00	0.00	6.34	0.00	4.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	1.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER2a	ExonRegion	0	981.59	412.68	87.17	227.91	411.81	665.11	590.24	1069.80	664.50	395.43	262.07	406.82	883.50	520.75	606.63	340.05	203.44	366.57	435.90	760.70	758.07	1949.63	459.23	809.67	711.28	564.42	154.76	466.55	747.96
17	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.49	0.00	0.00	0.00	3.84	0.00	1.84	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	2.19	8.77	13.85	0.00	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	1500.53	910.07	94.70	294.20	388.47	1316.85	1028.55	1804.91	1396.55	697.33	367.47	657.07	1383.54	733.98	1285.81	870.94	364.11	635.99	574.34	1352.63	1485.13	2817.18	735.35	1210.90	1336.21	1141.26	147.95	730.09	1315.49
19	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.48	1.96	2.23	1.89	2.71	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	1.72	2.24	3.77	0.00
20	I2	Intron	0	4.72	2.77	1.47	1.96	2.17	3.34	0.92	0.78	1.73	2.52	1.86	1.76	0.61	3.72	2.88	4.62	6.21	5.79	4.12	0.96	2.82	0.40	0.81	1.37	1.68	0.49	0.60	3.11	1.12
21	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.67	0.02	0.00	0.00	0.93	2.28	0.00	0.00	0.33	1.28	1.13	0.00	0.00	0.90	0.00	3.42	1.47	4.47	3.99	1.05	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	2.45	6.57	0.00	0.00	0.00	4.12	0.00	0.00	1.12	3.51	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	5.78	5.72	2.73	4.53	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	4.29	6.57	0.00	0.00	0.00	3.71	0.00	0.00	1.12	4.33	0.00	0.00	0.00	1.45	0.00	7.59	6.41	3.82	4.07	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00
24	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	2.92	3.08	1.24	0.98	1.74	2.34	0.55	0.40	0.91	2.90	1.37	1.25	0.32	3.02	0.40	3.09	4.55	4.20	3.93	0.71	3.42	0.64	0.69	0.24	0.81	0.34	0.15	2.94	0.51
25	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	3.38	1.79	1.80	0.00	1.27	3.19	0.52	1.20	1.53	2.70	2.48	1.02	0.34	3.62	0.00	1.85	4.77	3.84	0.90	0.36	1.56	0.23	1.41	0.00	0.83	0.00	0.48	4.75	0.88
26	I2_SR3	SilentIntronRegion	0	5.26	1.11	3.02	0.94	1.91	2.56	0.26	1.36	0.14	1.45	1.38	0.59	1.22	5.07	1.10	5.06	4.53	4.13	2.01	0.72	1.22	0.24	0.24	0.28	0.60	0.98	0.96	2.80	0.34
27	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	6.61	1.91	2.32	0.71	1.94	1.90	1.20	0.98	0.62	2.29	1.19	0.55	0.23	4.22	0.08	2.56	4.63	3.88	1.59	0.67	1.56	0.00	0.36	0.43	1.76	0.34	0.55	3.96	0.40
28	I2_SR4	SilentIntronRegion	0	5.72	3.24	0.99	2.51	1.87	4.12	0.49	0.59	1.26	2.24	1.64	1.68	0.54	4.06	2.14	5.77	6.64	7.21	4.19	0.90	3.08	0.22	0.98	1.04	1.68	0.41	1.00	2.48	0.76
29	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	6.45	1.00	1.50	4.26	4.36	3.81	1.91	1.17	2.70	4.69	3.12	2.14	0.17	3.58	3.79	4.59	8.72	8.11	6.29	0.97	3.69	0.47	0.69	0.55	2.25	0.80	0.00	6.50	1.03
30	I2_AR6	ActiveIntronRegion	0	8.57	0.00	3.37	0.00	0.00	2.75	2.02	0.00	1.12	3.07	3.87	4.33	0.00	4.99	33.60	11.39	11.52	12.28	5.66	5.62	7.49	1.80	0.00	0.00	1.79	0.00	0.00	6.52	0.50
31	I2_SR5	SilentIntronRegion	0	7.76	1.62	0.96	5.40	6.13	2.94	0.71	0.46	0.96	1.51	1.65	2.88	0.97	3.63	5.24	6.72	7.63	5.08	2.59	1.70	4.17	0.81	1.82	1.62	3.69	0.00	0.00	1.44	1.83
32	I2_SR6	SilentIntronRegion	0	3.42	3.68	2.17	2.99	2.29	4.82	2.40	1.31	4.95	2.50	3.81	3.50	0.73	4.15	10.77	5.21	10.04	7.49	7.62	1.48	2.64	0.65	1.19	5.50	3.56	1.12	0.98	3.78	4.54
33	I2_AR8	ActiveIntronRegion	0	7.58	4.35	2.54	2.90	4.05	3.19	2.72	1.75	5.53	2.92	1.49	4.73	3.16	4.30	10.10	7.85	8.12	5.60	4.31	2.23	1.54	0.73	0.24	5.55	3.13	0.85	0.49	3.76	1.37
34	E3_Aa	NovelBoundary	0	10.32	9.11	2.62	0.00	13.26	1.88	7.27	2.04	4.69	1.88	3.04	1.75	1.53	4.81	0.00	17.67	5.94	0.00	8.09	11.74	7.22	0.00	0.00	0.00	5.04	0.00	0.00	2.29	1.32
35	ER3a	ExonRegion	0	711.09	434.62	282.21	381.45	2006.02	690.66	1170.36	890.57	821.74	814.93	601.59	1169.63	1669.30	626.41	1216.29	589.27	645.48	682.78	785.91	652.05	742.14	1124.97	1546.75	600.89	776.82	1915.14	1000.45	2396.67	2069.67
36	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	3.97	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.65	0.00	2.94	0.00	0.00	2.37	8.37	0.00	2.05	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	E3a_E4a	KnownJunction	0	685.29	525.57	1239.42	2348.67	15429.35	758.91	868.92	789.54	598.39	583.25	313.94	463.49	792.99	521.74	831.36	401.01	366.77	501.39	1034.94	805.49	623.19	933.40	831.24	767.67	641.47	823.87	389.38	1197.83	749.11
38	ER3b	ExonRegion	0	0.46	0.83	0.65	0.09	2.22	0.01	0.06	0.01	2.15	0.93	0.70	0.95	0.45	0.48	1.39	0.00	1.17	0.26	2.28	1.13	0.32	0.05	0.05	1.94	0.01	0.76	0.08	1.17	0.48
39	E3_Db	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.32	0.00	13.26	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	4.65	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	1.69	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
41	ER4a	ExonRegion	0	318.84	206.72	247.32	1334.06	3450.23	217.52	297.32	405.80	286.72	165.72	112.70	200.16	350.89	235.82	390.01	154.41	112.50	218.77	268.58	353.35	174.21	730.29	242.40	250.04	201.98	255.33	114.57	304.03	253.20
42	IG27_SR3	SilentIntergenicRegion	0	1.18	2.15	1.83	1.97	2.09	0.75	3.10	0.00	2.02	0.66	0.65	1.71	1.24	1.12	3.70	0.68	0.00	1.67	3.50	2.55	2.66	0.00	0.00	4.37	0.39	0.86	0.50	0.00	0.00
43	IG27_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	2.12	0.74	0.25	0.00	1.04	0.96	1.31	0.00	0.67	0.64	0.35	2.50	1.94	0.48	1.86	0.37	1.71	0.29	0.95	1.36	0.04	0.27	0.27	1.28	0.42	0.63	0.00	0.62	1.45