Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-301L8.1	Gene	0	0.06	0.09	0.29	31.07	236.13	0.27	0.06	1.05	1.04	0.33	0.17	0.28	0.07	0.21	2.75	0.42	0.13	7.28	1.37	0.64	0.49	0.72	4.28	2.08	0.41	0.54	0.21	0.42	0.76
2	411847	Transcript	0	0.09	0.02	0.62	21.73	305.10	0.11	0.05	1.87	0.23	0.12	0.03	0.15	0.02	0.04	2.31	0.67	0.03	5.26	1.88	0.87	0.48	0.51	2.63	0.80	0.24	0.32	0.28	0.27	0.25
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.72	39.34	409.74	0.00	0.36	2.23	0.20	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	1.57	0.45	0.00	4.85	2.12	0.16	1.23	0.65	4.53	2.72	0.00	0.85	0.33	0.00	0.85
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	55.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.72	35.80	844.59	0.00	0.00	7.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.77	0.00	0.00	0.00	8.09	3.89	1.48	0.00	6.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	0.17	0.00	0.00	3.49	34.06	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	1.56	0.00	0.00	0.12	0.00	0.44	0.87	0.23	0.00	0.00	0.13	0.00
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.97	19.58	0.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.27	0.00	0.00	0.20	0.00	0.50	1.19	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.42	0.00	0.00	4.25	55.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.43	0.00	0.00	0.00	0.32	0.00
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	57.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.87	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	2.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.71	26.56	574.25	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.96	3.33	0.00	15.98	0.71	1.26	0.23	1.21	1.38	0.00	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00
11	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	31.49	150.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.76	2.51	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	9.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.35	78.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	0.24	0.00	0.00	18.73	174.18	0.00	0.00	0.42	0.96	0.33	0.00	0.14	0.00	0.00	1.15	0.28	0.00	7.26	0.36	0.45	0.65	1.02	1.64	2.69	0.00	0.89	0.62	0.74	0.30
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.24	0.00	0.00	18.80	174.91	0.00	0.00	0.42	0.96	0.33	0.00	0.14	0.00	0.00	1.15	0.28	0.00	7.29	0.36	0.45	0.65	1.03	1.65	2.70	0.00	0.90	0.63	0.74	0.31
16	Ix	Intron	0	0.28	0.00	0.31	12.57	94.44	0.25	0.00	0.34	0.41	0.23	0.09	0.26	0.00	0.09	0.63	0.19	0.39	6.40	0.67	0.29	0.15	0.05	1.18	3.21	0.49	0.21	0.43	0.17	0.00
17	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.23	0.00	0.32	12.30	94.05	0.25	0.00	0.31	0.43	0.21	0.10	0.23	0.00	0.10	0.51	0.16	0.37	6.31	0.61	0.30	0.16	0.00	1.21	3.18	0.51	0.22	0.45	0.18	0.00
18	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.22	0.00	0.00	15.13	135.19	1.09	0.00	2.54	0.00	1.44	0.00	1.24	0.00	0.00	5.21	2.53	1.00	10.35	0.00	0.00	0.00	1.31	1.81	5.64	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.83	0.00	0.00	20.61	88.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.83	0.00	0.00	2.24	0.00	0.62	7.39	2.96	0.00	0.00	0.95	0.00	2.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	27.61	263.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.87	0.00	0.00	0.00	0.00	6.85	4.67	3.64	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	0.64	0.00	0.00	8.80	113.50	0.41	0.00	1.09	0.00	0.43	0.00	0.37	0.00	0.00	1.63	0.74	0.00	8.89	0.95	0.00	0.00	1.07	1.61	0.64	1.27	0.91	1.63	1.39	0.00
22	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	10.57	77.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	3.79	0.00	0.00	0.00	0.00
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	8.43	113.32	0.00	0.00	0.39	1.14	0.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.22	0.34	0.59	1.22	0.00	0.39	2.99	0.31	0.17	0.78	0.52	0.21
25	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	8.69	122.25	0.00	0.00	0.46	1.24	0.36	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.40	0.69	1.42	0.00	0.45	3.18	0.36	0.20	0.91	0.61	0.25
26	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	6.99	60.52	0.00	0.00	0.00	0.50	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.30	22.01	13.95	9.92	108.61	11.51	18.14	24.29	27.50	11.90	5.66	10.84	20.13	7.67	17.14	10.86	14.05	4.62	0.00	15.05	22.50	4.04	26.45	16.03	4.62	9.40	29.07	7.73	37.40
28	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.13	0.20	32.53	193.59	0.33	0.00	0.75	1.43	0.41	0.24	0.25	0.11	0.29	3.27	0.20	0.18	7.08	1.29	0.80	0.40	0.66	4.76	2.26	0.41	0.45	0.00	0.40	0.89