Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	ZNF876P	Gene	0	1.79	6.13	0.67	151.76	4.52	2.17	6.22	1.61	5.40	2.67	2.27	44.24	0.58	2.05	6.41	3.97	8.51	6.42	20.94	3.26	17.84	11.65	4.04	4.96	2.15	2.91	14.53	5.15	2.39
2	356347	Transcript	0	2.21	3.46	1.22	130.97	3.42	1.22	4.68	0.93	4.32	1.47	1.41	29.11	0.49	1.22	3.15	2.89	7.66	6.11	12.30	2.95	13.72	20.33	3.40	3.89	1.47	2.14	9.08	5.45	1.48
3	397097	Transcript	0	0.20	2.42	1.13	2.56	0.45	0.62	3.07	0.00	1.13	0.46	0.11	1.02	0.26	0.81	1.44	0.78	1.17	2.07	3.88	0.43	0.77	0.00	0.57	0.29	0.45	0.64	0.00	2.09	0.00
4	IG5_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	5.15	2.80	9.21	44.48	14.49	6.58	11.39	1.82	5.70	3.47	8.20	3.56	4.02	5.50	4.81	4.44	6.06	15.92	25.27	8.99	2.02	2.80	12.01	6.99	4.64	3.55	4.40	23.63	3.36
5	ER1a	ExonRegion	0	1.68	3.11	2.31	180.14	3.26	0.00	4.70	1.23	1.28	0.96	1.35	25.45	1.30	1.21	0.00	3.90	6.82	3.41	4.05	2.76	10.01	24.55	4.41	1.69	1.50	3.11	8.07	8.83	1.11
6	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	9.92	0.00	1.57	0.00	0.00	4.26	0.00	0.00	1.17	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.56	5.69	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00
8	E1a_E4a	KnownJunction	0	2.65	0.00	1.12	38.39	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	1.49	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	5.72	4.62	0.00	0.00	10.99	30.53	2.31	2.93	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00
9	I1	Intron	0	0.37	1.12	3.55	3.23	1.49	2.46	2.17	0.59	1.71	1.18	1.56	2.51	0.37	2.59	0.94	3.04	1.48	5.31	6.69	1.57	1.41	0.21	3.26	0.69	0.98	2.13	1.73	6.24	0.54
10	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.34	0.93	4.45	2.86	1.55	1.57	1.80	0.41	1.11	1.16	1.80	2.09	0.37	2.99	0.32	3.51	1.62	5.79	6.88	2.46	0.97	0.29	3.82	0.69	1.04	2.54	1.04	7.13	0.55
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.69	1.61	0.53	0.78	2.10	1.17	1.16	2.34	1.29	0.25	1.19	0.63	3.67	3.08	1.19	1.35	4.43	6.87	1.11	1.25	0.00	3.72	0.31	1.61	0.25	1.75	3.98	1.38
12	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	3.04	2.78	6.36	0.00	4.79	2.91	0.00	5.51	2.51	0.53	3.46	0.00	1.44	0.83	0.00	0.00	5.31	8.30	1.25	0.00	0.00	3.62	0.32	1.51	0.00	6.61	4.86	2.19
13	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.16	1.96	0.00	0.00	6.95	3.14	0.00	1.69	1.03	0.62	4.28	0.97	2.63	0.00	0.00	0.00	6.14	2.70	4.11	0.00	0.00	2.16	1.78	1.15	0.00	4.79	3.20	3.30
14	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.61	1.53	3.20	4.21	1.54	3.60	2.46	0.66	2.27	1.14	1.73	3.24	0.07	2.27	1.33	2.64	1.75	5.01	6.84	0.81	2.22	0.24	2.69	0.45	0.65	1.79	2.52	6.21	0.24
15	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.24	0.47	2.81	4.57	2.34	2.30	3.83	0.88	1.61	1.15	1.47	3.07	1.14	1.00	0.74	5.14	0.48	5.05	5.84	0.00	1.48	0.00	2.31	1.83	1.14	3.95	1.17	5.18	0.07
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.49	8.41	0.00	12.66	8.01	6.82	0.00	0.00	1.55	19.46	0.00	2.26	8.37	11.47	0.00	0.00	16.18	0.00	4.09	0.00	2.51	5.92	3.45	0.00	7.60	8.09	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	0.79	0.69	0.79	2.63	1.79	1.01	3.29	0.00	2.38	1.06	0.44	3.39	0.00	0.16	5.64	1.82	1.28	2.12	7.03	1.74	1.57	0.00	1.33	0.00	1.05	1.73	0.00	3.82	0.00
18	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	3.49	4.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	2.85	1.75	0.00	4.28	0.00	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	3.13	0.00	0.00	2.75	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	4.85	1.32	0.00	0.00	0.00	5.21	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00
20	E2a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.42	0.00	0.00	0.00	0.00	4.18	2.83	1.60	0.00	5.42	0.00	2.28	0.00	0.00	3.53	0.00	7.87	0.00	2.05	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39
22	ER3a	ExonRegion	0	0.00	4.14	2.41	7.62	0.00	1.47	3.80	0.00	1.03	0.77	0.00	0.67	1.03	1.93	0.12	1.32	2.11	6.14	8.49	0.00	1.52	0.00	0.96	1.14	0.76	0.83	0.00	2.24	0.00
23	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	4.16	0.00	0.00	5.22	2.92	2.44	9.07	0.00	0.00	3.86	0.00	0.93	8.37	0.00	2.68	4.62	0.00	2.98	3.61	0.00	2.41	0.00	1.48	0.00	0.00	3.95	2.05
24	E3a_E4a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E3a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	8.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER4a	ExonRegion	0	2.55	6.48	1.08	265.61	9.31	2.42	11.72	0.58	10.16	2.55	1.84	64.01	0.13	1.78	5.52	2.93	13.41	12.55	34.31	6.25	23.71	23.13	5.08	7.59	3.16	1.86	22.98	8.07	2.88
28	E4_Ab	KnownBoundary	0	18.34	4.65	14.45	359.77	19.60	14.85	30.67	4.68	20.13	36.95	17.18	73.04	3.15	27.92	15.15	35.80	48.28	9.25	32.37	32.17	39.31	28.64	21.67	10.89	12.16	12.57	49.10	27.54	24.36
29	ER4b	ExonRegion	0	1.51	10.33	0.27	276.82	7.62	2.29	9.44	2.35	7.78	4.04	5.15	80.15	0.83	2.97	8.15	4.26	13.22	7.57	34.04	2.80	31.32	17.52	7.32	7.56	3.31	3.05	27.84	6.11	3.67
30	E4_Da	KnownBoundary	0	0.00	22.40	1.22	126.83	0.00	1.65	0.00	0.00	3.23	0.00	4.46	35.57	0.00	2.35	0.00	0.00	11.39	0.00	16.18	0.00	5.33	4.96	2.51	2.63	0.00	4.03	10.14	0.00	5.12
31	ER4c	ExonRegion	0	1.94	4.25	0.38	39.75	1.11	2.48	2.28	1.92	2.92	2.36	0.97	21.40	0.53	1.88	7.08	4.74	4.67	3.85	10.82	2.80	10.18	3.10	1.80	3.34	1.23	3.58	5.29	3.09	1.94
32	IG6	Intergenic	0	0.31	2.09	0.35	22.45	0.44	0.93	0.58	0.24	1.30	0.92	0.63	16.19	0.05	0.68	0.96	2.15	4.90	2.52	6.88	1.23	8.04	0.96	1.19	1.49	0.47	1.05	2.37	2.88	1.25
33	IG6_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	3.20	0.00	12.60	0.00	0.46	0.76	0.00	0.75	0.00	0.03	11.44	0.00	0.24	0.00	1.66	2.23	1.15	5.60	0.00	9.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.53	0.00	1.09	0.67
34	IG6_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.83	0.00	0.32	20.52	0.95	0.53	1.13	0.00	0.76	0.28	0.67	17.52	0.00	0.12	0.00	4.83	4.21	0.89	2.96	0.00	7.71	0.00	0.35	0.00	0.00	0.61	0.00	4.11	0.00
35	IG6_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	11.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62	7.71	0.00	0.00	0.00	2.48	3.88	1.00	1.66	0.00	3.71	0.94	0.00	0.00	0.00	1.64	6.67	5.09	0.00
36	IG6_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.36	1.24	0.00	11.25	0.00	1.06	0.46	0.29	0.00	0.00	0.00	9.14	0.00	0.70	0.00	0.96	2.27	0.74	4.08	0.32	5.96	0.00	0.70	0.07	1.00	0.00	0.00	1.84	0.00
37	IG6_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	2.14	0.00	0.00	7.31	0.00	0.00	2.02	1.84	0.00	0.00	0.00	6.54	0.00	0.00	0.00	0.00	4.72	1.17	17.46	2.81	5.71	0.00	0.00	2.15	1.43	0.00	0.00	0.93	0.00
38	IG6_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	2.14	0.00	0.00	7.31	0.00	0.00	3.86	1.84	0.00	0.00	0.00	6.70	0.00	0.45	0.00	0.00	4.01	2.73	7.54	2.81	4.28	0.00	0.00	2.15	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00
39	IG6_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.71	0.00	0.00	14.63	0.00	0.00	2.02	0.82	0.00	0.00	0.00	7.28	0.00	1.71	0.00	0.00	4.01	2.73	7.04	0.00	5.86	0.00	0.00	2.15	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00
40	IG6_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	20.80	0.00	0.69	1.51	0.00	0.00	1.13	0.00	6.69	0.00	1.81	11.20	3.01	4.23	1.45	4.81	0.00	10.48	0.00	0.00	0.74	2.86	0.00	0.00	0.00	0.00
41	IG6_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	3.09	0.77	21.86	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.36	0.00	6.47	0.00	1.03	1.02	2.07	2.95	1.60	5.62	0.00	7.91	0.00	0.00	2.72	1.08	0.00	3.77	0.76	0.00
42	IG6_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	0.30	0.81	0.13	12.64	0.00	0.39	0.85	0.00	0.51	0.91	0.67	9.90	0.00	0.24	0.65	2.74	4.65	2.48	8.15	0.97	7.33	0.00	0.25	1.44	0.30	0.33	1.42	1.02	0.70
43	IG6_AR9	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.06	0.00	0.00	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	0.00	1.90	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.35	0.00
44	IG6_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.31	2.64	0.49	29.66	0.43	1.30	0.66	0.22	0.89	1.41	0.81	21.58	0.06	1.01	0.84	3.16	7.24	3.13	7.73	1.72	9.28	1.89	1.85	1.91	0.61	1.84	4.47	3.00	1.14
45	IG6_AR10	ActiveIntergenicRegion	0	0.88	0.75	0.58	30.41	0.28	1.20	0.12	0.32	1.44	1.09	0.69	20.24	0.00	0.85	0.27	1.15	7.18	3.42	7.45	0.96	4.64	1.62	2.03	1.00	0.55	1.77	2.51	4.89	1.22
46	IG6_SR4	SilentIntergenicRegion	0	0.13	1.31	0.61	23.51	0.72	0.67	0.37	0.33	1.91	1.40	1.08	18.12	0.04	0.87	0.84	1.95	3.65	2.98	3.95	0.58	10.47	0.87	1.20	2.22	0.40	0.19	1.77	3.91	1.21
47	IG6_AR11	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.68	0.70	17.92	3.66	1.16	0.00	0.00	0.78	1.51	0.75	17.42	0.68	0.70	0.00	0.90	1.15	3.25	5.80	0.89	7.87	0.76	2.21	3.17	1.26	1.32	3.09	1.52	1.52
48	IG6_SR5	SilentIntergenicRegion	0	0.00	4.25	0.07	20.13	0.20	0.94	0.81	0.37	2.11	0.35	0.33	10.12	0.00	0.33	1.29	0.87	2.82	1.74	8.33	1.88	8.05	0.51	0.74	0.95	0.19	0.95	1.25	2.35	2.17
49	IG6_AR12	ActiveIntergenicRegion	0	0.38	2.71	0.00	8.95	0.00	0.49	0.36	0.33	3.10	0.26	0.00	20.99	0.23	1.05	5.40	3.54	5.06	1.72	7.98	2.18	8.14	0.64	0.97	2.30	0.76	0.28	0.98	2.03	2.50