Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	FGFRL1	Gene	0	8.18	12.65	13.39	4.50	1.76	28.82	3.48	10.90	6.97	21.65	4.65	26.47	12.61	17.33	14.06	25.47	70.22	13.72	7.42	3.07	8.80	28.31	13.00	45.20	15.56	17.55	8.31	4.76	12.76
2	398484	Transcript	0	0.00	0.00	0.70	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.32	2.59	0.00	0.53	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.01	0.50	0.00	0.32	0.00	0.00
3	264748	Transcript	0	0.00	0.47	0.03	0.00	0.00	0.29	0.86	0.53	0.83	0.83	0.00	0.32	0.27	0.00	0.00	0.36	0.64	0.06	1.29	0.00	1.12	1.67	0.65	1.28	0.00	0.22	3.53	0.00	0.00
4	IG17_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	5.05	0.41	2.17	0.34	1.83	1.94	0.11	0.26	0.95	0.19	0.28	0.76	0.30	9.79	16.96	3.85	9.81	2.35	0.29	1.98	0.81	0.34	0.51	3.23	2.31	3.00	0.15	12.60	0.53
5	IG17_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	12.92	0.97	0.76	0.00	0.00	2.59	2.02	0.00	0.00	0.21	0.00	1.24	1.03	13.23	10.87	1.94	12.52	0.64	0.27	0.00	4.78	0.00	0.00	11.51	6.26	6.29	0.48	35.62	0.91
6	IG17_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	2.41	1.02	0.00	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.61	0.31	0.52	0.27	0.00	0.34	3.02	4.85	2.06	0.42	0.00	1.19	0.24	1.18	0.00	1.88	0.31	0.00	0.00	0.36	0.00
7	IG17_SR2	SilentIntergenicRegion	0	1.11	0.12	0.34	0.48	0.00	3.84	0.95	0.37	0.68	1.14	0.16	0.33	0.35	0.83	5.79	3.22	7.68	1.76	0.26	0.27	0.60	0.37	0.00	4.25	0.64	0.43	0.00	0.25	0.00
8	IG17_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	1.04	0.72	0.00	0.00	0.00	2.99	0.91	0.41	0.50	1.41	0.00	0.00	0.00	2.29	3.31	3.34	6.25	0.43	1.30	0.62	0.00	0.81	0.41	5.69	0.44	1.06	0.00	0.28	0.30
9	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.15	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	5.18	0.00	1.05	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	1.01	0.00	0.64	0.00	0.00
10	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E2b	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.99	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.11	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	ER2b	ExonRegion	0	3.49	1.75	2.82	0.00	0.00	3.73	1.09	0.06	0.23	0.78	0.00	1.74	1.16	3.19	2.50	6.81	2.59	4.18	1.73	0.00	1.17	6.23	0.98	5.13	1.41	2.09	0.00	0.00	1.21
14	E2_Da	NovelBoundary	0	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.17	0.00	0.00	5.41	0.00	0.00	2.62	0.00	0.00	4.55	1.97	1.82	0.00	3.14	3.15	0.00	0.00	0.00	4.09	4.76	0.00	15.37	1.44	2.10	0.00	0.00	4.29
16	ER3a	ExonRegion	0	4.37	1.60	6.93	0.00	0.62	12.16	0.38	3.56	0.76	2.95	1.73	5.27	5.32	8.67	0.12	13.61	14.38	8.10	2.27	0.94	3.09	13.18	5.42	11.77	4.30	3.92	2.31	0.91	3.36
17	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	3.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E3a_E4a	KnownJunction	0	11.15	0.00	6.28	0.00	6.48	23.44	0.00	6.47	1.31	7.47	4.65	8.40	7.42	13.21	0.00	14.08	24.92	14.38	16.18	3.31	0.00	15.61	9.41	13.82	12.84	14.63	2.14	0.00	5.02
19	ER4a	ExonRegion	0	10.14	3.16	5.93	0.00	0.98	22.98	1.52	3.00	0.00	8.43	2.63	6.11	5.63	11.84	5.46	16.25	21.42	15.80	2.51	0.31	5.21	25.26	8.17	17.66	12.18	12.18	0.45	0.34	2.65
20	E4a_E5a	KnownJunction	0	11.38	8.34	5.81	0.00	0.00	15.92	2.35	2.39	0.00	6.91	3.10	10.72	4.33	14.20	9.17	28.23	23.77	4.62	0.00	0.00	8.06	26.93	4.78	33.08	3.41	2.02	3.98	2.16	1.45
21	ER5a	ExonRegion	0	10.97	6.14	12.40	0.00	1.03	23.42	1.37	3.70	1.10	11.56	2.85	12.43	6.83	16.08	12.07	19.17	30.38	13.00	2.97	1.27	3.94	23.99	11.00	28.89	10.69	8.77	1.05	1.18	6.55
22	E5a_E6a	KnownJunction	0	11.03	4.36	12.41	0.00	5.89	12.20	0.00	4.58	0.00	22.49	1.49	16.48	11.34	18.77	24.91	21.04	38.60	9.63	0.00	2.98	4.01	36.80	7.88	36.25	3.52	6.05	2.44	2.25	6.37
23	ER6a	ExonRegion	0	10.06	5.18	14.59	4.13	1.28	18.30	2.84	7.00	2.67	15.49	1.64	15.22	8.78	16.72	14.82	29.57	43.67	13.43	3.15	2.83	8.16	30.89	11.33	27.73	11.97	13.52	0.79	2.45	6.40
24	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.27	1.21	1.33	0.00	0.00	3.33	4.50	0.00	0.00	0.00	7.15	2.22	0.00	0.00	5.28	0.00	0.00	0.00
25	E6a_E7a	KnownJunction	0	2.77	0.00	13.55	0.00	0.00	7.25	2.29	11.00	0.00	7.27	1.52	6.30	3.60	9.84	14.75	20.81	33.45	4.62	0.00	0.00	5.21	9.38	15.91	22.61	8.45	15.79	2.44	1.66	8.88
26	I6	Intron	0	1.37	0.00	0.71	0.00	0.00	1.17	0.86	0.39	0.00	0.92	0.25	0.65	0.69	1.16	0.00	1.05	0.63	0.41	0.68	0.00	1.21	4.60	0.38	3.20	0.61	0.67	0.00	0.35	0.29
27	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.22	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	1.80	0.00	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	I6_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.99	0.26	2.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	3.61	0.00	4.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	I6_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.44	0.00	1.24	1.30	3.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	7.21	0.00	6.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I6_AR4	ActiveIntronRegion	0	3.22	0.00	1.12	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	1.24	1.30	3.63	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	1.43	7.21	0.00	7.26	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00
31	I6_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.95	0.00	2.24	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	2.89	0.00	1.24	1.30	2.27	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.41	0.00	7.80	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00
32	I6_AR6	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	2.24	0.00	0.00	1.37	2.02	0.00	0.00	1.44	1.19	2.47	0.00	0.15	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	1.43	1.20	0.00	3.23	1.43	0.52	0.00	0.82	0.00
33	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	2.14	0.00	1.12	0.00	0.00	1.37	2.02	0.00	0.00	1.44	1.19	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	2.15	1.43	1.57	0.00	1.63	0.00
34	I6_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.78	0.00	0.27	0.00	0.00	1.47	1.16	0.63	0.00	0.51	0.21	0.20	0.67	0.63	0.00	1.71	0.70	0.66	1.10	0.00	1.29	4.97	0.62	2.30	0.53	0.96	0.00	0.42	0.46
35	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.62	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.05	4.86	2.17	5.62	1.93	2.10	0.00	0.00	5.55
36	ER7a	ExonRegion	0	8.83	18.44	16.17	6.62	2.38	37.64	4.82	15.42	10.61	30.18	6.56	37.71	17.04	21.17	17.88	30.77	99.60	16.15	10.64	4.19	11.67	34.18	16.53	62.13	20.54	23.88	12.89	7.04	18.14
37	ER7b	ExonRegion	0	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	0.59	1.73	1.05	1.61	1.65	0.00	0.53	0.37	0.00	0.00	0.72	1.29	0.00	2.59	0.00	2.24	3.35	1.29	2.46	0.00	0.45	7.06	0.00	0.00
38	IG18_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	1.05	1.06	0.32	1.37	0.93	2.36	0.39	0.70	0.96	0.83	0.00	0.24	1.48	0.00	1.11	2.11	1.14	0.00	0.00	2.63	0.00	0.69	1.04	1.64	0.57	1.50	0.00	0.00	0.89
39	IG18_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.65	0.00	0.28	0.00	2.95	0.41	1.82	1.67	0.68	1.74	0.00	0.37	0.00	0.00	2.78	0.75	1.35	0.58	0.96	0.83	0.86	0.00	1.64	3.82	0.43	0.47	0.00	0.00	0.27
40	IG18_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	2.19	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	0.00	0.75	2.95	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.37	0.20	0.00	0.00	3.75	0.13	1.23	0.00	1.46	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00