Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC099557.2	Gene	0	2.62	2.40	2.58	7.62	5.45	3.78	9.00	3.30	2.08	5.39	2.58	5.88	1.82	1.76	3.98	2.48	4.44	2.19	0.86	1.79	3.22	2.73	0.89	2.98	2.44	1.11	0.92	2.85	1.71
2	501623	Transcript	0	2.18	0.59	1.81	8.58	13.01	2.58	6.18	1.74	2.10	2.83	1.68	1.24	2.64	1.56	5.59	3.60	5.72	0.13	0.17	3.33	1.24	4.21	0.18	2.24	2.89	1.69	0.26	0.53	1.04
3	502134	Transcript	0	0.51	3.15	2.49	5.93	3.63	1.87	3.38	2.37	0.26	6.20	2.89	3.48	0.61	1.21	2.68	2.19	1.18	1.91	1.79	0.61	1.13	0.91	0.77	1.51	0.90	0.74	0.00	1.58	1.36
4	500554	Transcript	0	0.24	2.71	1.80	1.13	2.47	0.90	2.81	1.33	1.20	1.69	0.57	2.89	1.74	0.72	0.16	0.60	1.36	2.48	0.20	0.07	2.00	0.51	0.88	1.43	0.53	0.32	1.18	0.99	0.34
5	ER1a	ExonRegion	0	0.07	0.00	1.38	0.00	21.85	0.00	6.83	1.07	0.00	0.88	0.00	1.12	0.00	0.88	1.99	1.55	0.58	0.00	0.00	0.00	0.41	0.52	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.95	0.87
6	ER1b	ExonRegion	0	5.72	4.88	7.82	47.20	57.36	4.62	31.15	5.02	1.57	7.31	2.24	11.36	4.57	3.55	5.60	4.91	4.77	6.37	1.37	0.85	1.73	9.51	0.00	1.83	1.82	1.95	0.00	11.90	2.85
7	E1_Ac	KnownBoundary	0	14.39	12.51	12.71	149.26	68.68	12.05	35.30	8.71	3.84	14.26	7.43	25.96	10.48	5.41	7.57	6.27	8.60	18.49	8.09	3.31	3.57	15.95	0.00	8.25	8.11	7.68	0.00	21.88	6.01
8	ER1c	ExonRegion	0	12.13	6.55	8.40	55.88	37.81	9.32	37.68	4.85	3.71	8.71	9.27	14.97	4.02	5.55	6.96	6.52	9.44	4.83	2.18	3.21	9.74	9.43	2.17	3.35	3.62	1.13	2.99	10.57	4.34
9	E1_Da	NovelBoundary	0	5.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.88	9.73	0.00	3.23	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E1a_E2a	KnownJunction	0	15.87	4.85	2.14	0.00	0.00	6.18	18.77	6.62	9.32	12.70	7.15	14.91	5.73	8.46	15.15	3.82	6.42	4.62	8.09	3.89	4.01	22.85	9.95	8.97	8.30	0.00	0.00	4.31	5.02
11	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.18	0.00	0.00	1.98	0.00	0.38	4.45	0.00	0.31	0.40	0.98	2.89	0.36	0.50	0.00	0.00	1.65	1.14	0.00	0.55	1.57	0.50	0.00	0.00	0.39	0.00	0.50	0.00	0.74
12	ER2a	ExonRegion	0	16.65	12.17	11.33	14.63	15.60	24.66	81.41	20.79	13.83	36.54	16.39	38.24	10.08	12.78	33.18	15.69	20.09	10.56	9.16	10.12	20.09	17.66	7.03	19.12	17.71	6.60	2.61	26.02	5.68
13	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.09	0.00	0.00	0.00	2.40	0.00	2.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	5.17	2.04	0.00	2.57	3.56	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	8.34	3.56	0.00	5.89	0.00	2.92	2.54	0.00	0.00	0.00	2.56	3.38	1.09	0.00	0.00	0.86	4.62	0.00	0.00	1.80	0.00	2.51	2.75	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00
15	E2a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	6.63	0.00	6.78	4.87	8.18	7.12	0.00	5.51	9.11	5.69	0.00	2.17	8.57	3.82	0.00	4.62	8.09	0.00	0.00	2.48	2.51	2.45	3.49	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	2.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.71	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2a_E8a	KnownJunction	0	3.01	0.00	2.49	20.49	12.82	3.41	5.21	0.00	4.84	4.03	3.16	0.00	6.50	2.13	8.97	6.96	10.83	0.00	0.00	6.78	1.76	8.99	0.00	3.05	5.27	4.38	0.00	0.00	0.00
19	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	0.39	1.46	0.30	0.00	0.00	1.86	1.28	0.17	0.51	1.96	0.54	2.01	0.12	0.25	1.33	0.45	2.03	0.17	0.00	0.00	1.93	0.16	0.00	0.00	0.90	0.00	0.00	0.15	0.36
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	5.60	0.00	0.00	0.00	0.00	4.64	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	1.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	ER3a	ExonRegion	0	0.96	1.31	2.69	3.20	1.71	1.93	4.74	2.12	1.77	3.51	1.63	6.49	1.10	0.69	0.63	1.36	3.47	2.45	0.22	0.28	2.87	1.55	0.85	1.38	1.18	0.97	1.16	2.91	0.87
22	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	1.16	1.56	0.00	4.04	1.85	0.00	0.00	0.00	3.62	9.25	0.00	0.00	11.43	0.00	0.00	0.00	1.74	0.00	0.00	3.32	0.00
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	8.14	4.46	0.00	0.00	7.33	5.21	0.00	2.38	3.64	0.00	7.80	0.00	1.82	0.00	7.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER4a	ExonRegion	0	0.00	1.20	0.93	1.33	2.27	1.66	3.56	0.67	3.02	3.23	0.66	2.52	2.47	1.09	0.00	1.02	1.12	2.86	0.59	0.00	3.32	0.50	0.17	1.60	0.93	0.29	1.02	1.06	0.50
26	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45
27	ER5a	ExonRegion	0	2.66	7.45	3.96	30.55	14.98	4.92	8.22	3.20	0.98	10.90	6.98	7.94	3.65	2.82	4.63	3.95	1.85	4.79	2.62	0.84	4.04	2.02	1.76	5.62	1.42	3.34	0.03	2.60	2.71
28	E5_Da	NovelBoundary	0	2.95	0.00	5.51	0.00	7.37	7.37	2.57	2.39	1.52	1.64	21.54	10.54	2.93	5.34	0.00	6.35	12.18	13.87	0.00	2.98	1.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.94	14.96	12.05
29	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	8.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER6a	ExonRegion	0	0.00	2.16	0.73	3.79	0.00	0.00	1.06	0.61	0.00	2.12	0.00	0.26	0.00	0.74	0.00	0.20	0.44	0.31	0.00	1.50	0.01	0.00	0.00	0.59	0.00	0.00	0.00	0.38	0.59
31	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.47	0.00	0.00	0.00	0.00	2.09	0.00	11.70	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	2.75	1.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.45	3.37
32	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	ER7a	ExonRegion	0	0.37	1.12	2.16	1.25	0.00	1.44	2.84	1.22	0.58	6.97	1.25	5.64	0.00	0.24	2.88	2.42	2.85	1.74	0.00	1.31	2.74	0.94	0.32	0.38	0.50	1.10	0.00	2.03	1.50
34	E7_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.50	5.84	0.00	0.00	8.99	0.00	6.36	0.00	2.42	0.00	0.00	3.33	5.39	0.00	0.00	6.14	2.38	0.00	2.81	3.49	0.00	0.00	1.98	0.00
35	Ix	Intron	0	0.50	1.51	1.22	4.15	0.38	0.58	3.11	0.43	0.99	5.12	1.19	5.30	0.62	1.25	1.07	1.15	2.01	1.11	0.74	0.90	1.32	1.46	0.35	1.16	0.99	0.67	1.41	3.96	1.03
36	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.50	1.51	1.23	4.15	0.38	0.58	3.11	0.43	0.99	5.12	1.19	5.30	0.62	1.26	1.07	1.15	2.02	1.11	0.74	0.90	1.32	1.46	0.35	1.16	0.99	0.67	1.41	3.96	1.03
37	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.29	1.61	0.34	4.38	5.35	0.85	3.57	1.01	0.31	5.00	2.53	3.29	0.80	1.02	2.01	1.31	2.45	0.40	0.87	0.38	2.49	1.10	0.50	2.21	1.56	0.22	2.26	2.45	1.74
38	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.46	1.03	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00	1.84	1.84	1.02	1.86	0.28	0.45	1.57	0.98	1.75	0.48	0.00	0.68	2.44	0.00	0.58	1.46	0.66	0.34	0.78	0.26	0.00
39	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	2.27	0.41	0.00	0.44	0.03	0.00	0.00	1.81	0.31	0.37	0.00	0.00	0.38	0.18	0.00	0.45	4.24	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00
40	ER8a	ExonRegion	0	3.46	1.77	1.56	5.25	4.37	4.32	6.52	4.14	1.47	3.56	1.89	2.59	1.41	1.68	5.82	2.28	5.74	0.38	0.52	3.22	1.54	3.12	0.53	3.66	3.39	0.71	0.77	0.64	2.24